Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YVP0

Protein Details
Accession A0A316YVP0    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-34MASQQQRQQQQKQQRQKQPQQQQQQQQQHQHLAAHydrophilic
938-963SGIVGEDGKRKKKKPKQEEGDYVCTDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
946-953KRKKKKPK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000014  PAS  
IPR035965  PAS-like_dom_sf  
IPR013767  PAS_fold  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PF00989  PAS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
PS50112  PAS  
CDD cd00130  PAS  
cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MASQQQRQQQQKQQRQKQPQQQQQQQQQHQHLAAAALANQMSGGQFYQPNNAAMEEGGASNSNMGFEWASTPQPSSSQQPQQQRLSGNNNSFQSGLAFDQMGFGGPNGFSYAAGQDADVELEAILSNYQPKVNASSRTPADQLMYDGRRLASSSMPSTTATAATAAADNLDPATAAAAAAAYGHLGYGGVGGTVPGRALANWSAVPLSSSAAPAGAAAQGGGATTSGSNHSGSGHLPYATATSYPNSSSLRPDTSAAGHLGGSSGHGNSSGGGVGGGVGGASGAGGGYEGDASNSNTSSAQTPGEMSSGTEDSASGKRRRVTLSGGGLDTPIDVASSSRLSPQSMFMQQQQQRFDQSLAAGNLNNVNGQPSLGLRGAPHHRPAMVHQPSSTVDSAHLEELATAGFRRASEDNKRAIPHHPSAMMNHHHQLDPSSSVSSSSSTPFFNVGNNVEHSVRPTYRHRRSHSGSMAMGGSSGNTSFFGATGAGRPAIAPTKRLSHPSSGSSSATPGSGGGPLLGGHAASHPPGLGSQVLRGADGTASGSNAATDFTKRKGWPNRIVEELLDFVHVLDAHGRVLFASPSVQTLTGWKSEDLRGREIAEFIHQDDVAVVLRELSRAMQERSELTMYYRFRRKPQSAADKRRIQDQREANANNARSRSGSSSGNDSSSAQSTTTGPAGATVSSSLRNQDEEDDAETNMFRDDWEDKYVIFEATGHPYFPPDGVGPYGGGVTIDEEGEEDDAEGGKDIKREFGSPSKLRASMGTGDGGIQDKGGGDSAVDESSSNSEMQCFFCSCRVYPTKNVGMLDSFLELKLENERLRMLLSELSVSETPQHPLRQQHTGGGASSTEAGSDGRRSLDEGAAGYNPDFQSFDMDGTPHFPQHAQMQPSAPNRRDSMAAVPPLASAPTSPIMGQSLERTATKDTAAGEESDDATSPSSGIVGEDGKRKKKKPKQEEGDYVCTDCGRVDSPEWRKGPLGPKTLCNACGLRWAKKVKRSGGDPNAIAMAAKPTKGQIKAQAAAARAQKQNQQFQAENADLTATGPPPANMMGHTDEPTSPTFASPTSSSFAPSAYDHNTWPPPQLLGLPQHSQQVHNPQGGGAGGNNTSSFMGQQYNGSSFNLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.91
3 0.92
4 0.93
5 0.93
6 0.93
7 0.92
8 0.92
9 0.91
10 0.91
11 0.91
12 0.89
13 0.88
14 0.84
15 0.8
16 0.71
17 0.62
18 0.52
19 0.42
20 0.34
21 0.26
22 0.2
23 0.15
24 0.14
25 0.12
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.09
30 0.08
31 0.09
32 0.14
33 0.15
34 0.22
35 0.25
36 0.26
37 0.26
38 0.26
39 0.23
40 0.19
41 0.19
42 0.13
43 0.11
44 0.1
45 0.1
46 0.09
47 0.1
48 0.1
49 0.09
50 0.08
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.12
55 0.12
56 0.15
57 0.16
58 0.17
59 0.17
60 0.21
61 0.23
62 0.27
63 0.34
64 0.41
65 0.47
66 0.56
67 0.63
68 0.66
69 0.68
70 0.65
71 0.64
72 0.63
73 0.64
74 0.59
75 0.58
76 0.53
77 0.5
78 0.46
79 0.38
80 0.31
81 0.24
82 0.19
83 0.14
84 0.13
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.09
97 0.1
98 0.11
99 0.1
100 0.11
101 0.1
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.08
114 0.09
115 0.11
116 0.12
117 0.13
118 0.2
119 0.25
120 0.3
121 0.31
122 0.38
123 0.4
124 0.43
125 0.42
126 0.37
127 0.34
128 0.29
129 0.29
130 0.29
131 0.28
132 0.25
133 0.26
134 0.25
135 0.23
136 0.24
137 0.22
138 0.18
139 0.2
140 0.22
141 0.22
142 0.23
143 0.23
144 0.23
145 0.22
146 0.18
147 0.14
148 0.12
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.04
176 0.03
177 0.03
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.09
186 0.1
187 0.12
188 0.12
189 0.13
190 0.13
191 0.12
192 0.13
193 0.1
194 0.1
195 0.08
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.07
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.14
221 0.14
222 0.13
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.13
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.12
232 0.15
233 0.16
234 0.17
235 0.21
236 0.24
237 0.26
238 0.26
239 0.26
240 0.25
241 0.25
242 0.26
243 0.21
244 0.18
245 0.14
246 0.13
247 0.12
248 0.1
249 0.09
250 0.08
251 0.07
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.03
264 0.03
265 0.02
266 0.02
267 0.02
268 0.02
269 0.02
270 0.01
271 0.02
272 0.02
273 0.02
274 0.02
275 0.03
276 0.03
277 0.04
278 0.06
279 0.07
280 0.08
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.1
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.1
293 0.09
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.08
299 0.11
300 0.15
301 0.22
302 0.22
303 0.26
304 0.29
305 0.33
306 0.36
307 0.36
308 0.37
309 0.38
310 0.41
311 0.39
312 0.37
313 0.33
314 0.3
315 0.27
316 0.21
317 0.13
318 0.07
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.06
323 0.07
324 0.08
325 0.11
326 0.12
327 0.13
328 0.14
329 0.17
330 0.2
331 0.22
332 0.24
333 0.24
334 0.33
335 0.36
336 0.4
337 0.41
338 0.37
339 0.36
340 0.35
341 0.32
342 0.24
343 0.21
344 0.21
345 0.19
346 0.18
347 0.16
348 0.15
349 0.16
350 0.15
351 0.14
352 0.09
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.06
358 0.09
359 0.09
360 0.1
361 0.08
362 0.15
363 0.2
364 0.22
365 0.25
366 0.23
367 0.24
368 0.24
369 0.28
370 0.33
371 0.33
372 0.31
373 0.28
374 0.29
375 0.29
376 0.32
377 0.28
378 0.18
379 0.13
380 0.14
381 0.15
382 0.13
383 0.12
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.07
388 0.05
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.09
394 0.1
395 0.16
396 0.24
397 0.3
398 0.33
399 0.36
400 0.38
401 0.36
402 0.39
403 0.4
404 0.34
405 0.32
406 0.31
407 0.28
408 0.29
409 0.33
410 0.32
411 0.29
412 0.28
413 0.27
414 0.25
415 0.24
416 0.23
417 0.19
418 0.17
419 0.16
420 0.14
421 0.12
422 0.13
423 0.13
424 0.13
425 0.12
426 0.11
427 0.11
428 0.11
429 0.12
430 0.12
431 0.12
432 0.12
433 0.13
434 0.14
435 0.14
436 0.15
437 0.16
438 0.16
439 0.16
440 0.17
441 0.18
442 0.17
443 0.19
444 0.27
445 0.36
446 0.44
447 0.53
448 0.56
449 0.61
450 0.66
451 0.71
452 0.66
453 0.59
454 0.5
455 0.43
456 0.38
457 0.28
458 0.23
459 0.13
460 0.09
461 0.05
462 0.05
463 0.04
464 0.04
465 0.05
466 0.04
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.06
472 0.07
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.07
477 0.12
478 0.13
479 0.13
480 0.14
481 0.2
482 0.21
483 0.26
484 0.27
485 0.26
486 0.29
487 0.3
488 0.32
489 0.28
490 0.28
491 0.24
492 0.22
493 0.18
494 0.15
495 0.12
496 0.09
497 0.07
498 0.06
499 0.06
500 0.05
501 0.04
502 0.04
503 0.05
504 0.04
505 0.04
506 0.03
507 0.04
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.04
512 0.04
513 0.05
514 0.05
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.09
522 0.08
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.04
531 0.04
532 0.05
533 0.04
534 0.06
535 0.08
536 0.1
537 0.15
538 0.16
539 0.24
540 0.33
541 0.4
542 0.48
543 0.52
544 0.53
545 0.51
546 0.5
547 0.42
548 0.34
549 0.27
550 0.18
551 0.12
552 0.09
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.05
557 0.05
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.04
566 0.05
567 0.05
568 0.06
569 0.06
570 0.07
571 0.06
572 0.08
573 0.1
574 0.11
575 0.12
576 0.11
577 0.13
578 0.16
579 0.22
580 0.22
581 0.23
582 0.22
583 0.23
584 0.23
585 0.21
586 0.18
587 0.15
588 0.13
589 0.11
590 0.12
591 0.09
592 0.09
593 0.09
594 0.09
595 0.07
596 0.06
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.05
602 0.05
603 0.07
604 0.09
605 0.1
606 0.1
607 0.11
608 0.12
609 0.15
610 0.15
611 0.13
612 0.12
613 0.18
614 0.19
615 0.24
616 0.3
617 0.3
618 0.35
619 0.44
620 0.45
621 0.46
622 0.54
623 0.6
624 0.64
625 0.71
626 0.75
627 0.73
628 0.7
629 0.72
630 0.68
631 0.6
632 0.57
633 0.54
634 0.5
635 0.51
636 0.51
637 0.44
638 0.44
639 0.43
640 0.38
641 0.31
642 0.27
643 0.2
644 0.21
645 0.21
646 0.19
647 0.2
648 0.18
649 0.23
650 0.23
651 0.23
652 0.22
653 0.2
654 0.18
655 0.16
656 0.16
657 0.1
658 0.11
659 0.11
660 0.11
661 0.1
662 0.09
663 0.08
664 0.08
665 0.08
666 0.07
667 0.07
668 0.06
669 0.07
670 0.08
671 0.09
672 0.1
673 0.1
674 0.11
675 0.11
676 0.12
677 0.13
678 0.13
679 0.15
680 0.14
681 0.13
682 0.13
683 0.12
684 0.1
685 0.09
686 0.08
687 0.05
688 0.07
689 0.09
690 0.11
691 0.13
692 0.13
693 0.13
694 0.15
695 0.16
696 0.13
697 0.11
698 0.1
699 0.09
700 0.14
701 0.15
702 0.13
703 0.12
704 0.13
705 0.14
706 0.13
707 0.13
708 0.08
709 0.08
710 0.09
711 0.09
712 0.08
713 0.08
714 0.08
715 0.06
716 0.06
717 0.04
718 0.05
719 0.05
720 0.04
721 0.04
722 0.04
723 0.05
724 0.05
725 0.05
726 0.04
727 0.04
728 0.04
729 0.04
730 0.05
731 0.05
732 0.06
733 0.09
734 0.09
735 0.12
736 0.13
737 0.14
738 0.18
739 0.25
740 0.32
741 0.32
742 0.37
743 0.38
744 0.38
745 0.37
746 0.33
747 0.3
748 0.24
749 0.23
750 0.18
751 0.14
752 0.14
753 0.14
754 0.14
755 0.1
756 0.07
757 0.06
758 0.06
759 0.06
760 0.06
761 0.05
762 0.04
763 0.05
764 0.06
765 0.06
766 0.06
767 0.06
768 0.06
769 0.08
770 0.1
771 0.09
772 0.08
773 0.09
774 0.1
775 0.12
776 0.13
777 0.13
778 0.13
779 0.17
780 0.2
781 0.19
782 0.26
783 0.3
784 0.33
785 0.37
786 0.43
787 0.45
788 0.46
789 0.46
790 0.38
791 0.33
792 0.3
793 0.24
794 0.18
795 0.13
796 0.1
797 0.1
798 0.09
799 0.08
800 0.11
801 0.15
802 0.14
803 0.15
804 0.15
805 0.15
806 0.16
807 0.16
808 0.14
809 0.11
810 0.11
811 0.11
812 0.1
813 0.13
814 0.13
815 0.12
816 0.14
817 0.13
818 0.15
819 0.19
820 0.21
821 0.22
822 0.29
823 0.33
824 0.37
825 0.37
826 0.38
827 0.37
828 0.36
829 0.32
830 0.26
831 0.22
832 0.15
833 0.15
834 0.11
835 0.08
836 0.07
837 0.07
838 0.07
839 0.09
840 0.09
841 0.1
842 0.1
843 0.12
844 0.13
845 0.14
846 0.13
847 0.12
848 0.13
849 0.13
850 0.13
851 0.12
852 0.14
853 0.13
854 0.13
855 0.13
856 0.11
857 0.16
858 0.16
859 0.17
860 0.13
861 0.13
862 0.13
863 0.16
864 0.17
865 0.12
866 0.13
867 0.12
868 0.13
869 0.2
870 0.27
871 0.25
872 0.27
873 0.29
874 0.35
875 0.44
876 0.5
877 0.45
878 0.43
879 0.42
880 0.41
881 0.4
882 0.35
883 0.33
884 0.31
885 0.31
886 0.27
887 0.26
888 0.24
889 0.23
890 0.21
891 0.14
892 0.08
893 0.09
894 0.1
895 0.1
896 0.1
897 0.11
898 0.12
899 0.13
900 0.14
901 0.13
902 0.14
903 0.15
904 0.16
905 0.17
906 0.18
907 0.19
908 0.18
909 0.18
910 0.16
911 0.17
912 0.18
913 0.16
914 0.15
915 0.15
916 0.16
917 0.14
918 0.13
919 0.11
920 0.1
921 0.1
922 0.09
923 0.07
924 0.06
925 0.06
926 0.06
927 0.07
928 0.09
929 0.12
930 0.2
931 0.28
932 0.37
933 0.45
934 0.53
935 0.62
936 0.69
937 0.77
938 0.81
939 0.85
940 0.86
941 0.89
942 0.92
943 0.89
944 0.87
945 0.77
946 0.67
947 0.56
948 0.45
949 0.35
950 0.24
951 0.19
952 0.13
953 0.13
954 0.16
955 0.25
956 0.32
957 0.4
958 0.41
959 0.41
960 0.41
961 0.44
962 0.5
963 0.49
964 0.52
965 0.46
966 0.49
967 0.53
968 0.55
969 0.5
970 0.45
971 0.38
972 0.29
973 0.37
974 0.37
975 0.37
976 0.41
977 0.5
978 0.53
979 0.59
980 0.67
981 0.66
982 0.69
983 0.7
984 0.73
985 0.72
986 0.72
987 0.65
988 0.58
989 0.5
990 0.42
991 0.35
992 0.25
993 0.23
994 0.17
995 0.17
996 0.16
997 0.19
998 0.26
999 0.29
1000 0.33
1001 0.35
1002 0.41
1003 0.43
1004 0.48
1005 0.48
1006 0.43
1007 0.45
1008 0.47
1009 0.45
1010 0.41
1011 0.42
1012 0.44
1013 0.48
1014 0.55
1015 0.56
1016 0.56
1017 0.5
1018 0.49
1019 0.53
1020 0.47
1021 0.39
1022 0.31
1023 0.25
1024 0.18
1025 0.17
1026 0.17
1027 0.1
1028 0.11
1029 0.11
1030 0.11
1031 0.13
1032 0.14
1033 0.14
1034 0.12
1035 0.16
1036 0.18
1037 0.2
1038 0.22
1039 0.22
1040 0.21
1041 0.23
1042 0.24
1043 0.23
1044 0.19
1045 0.17
1046 0.17
1047 0.16
1048 0.19
1049 0.18
1050 0.19
1051 0.2
1052 0.19
1053 0.21
1054 0.2
1055 0.2
1056 0.19
1057 0.18
1058 0.2
1059 0.23
1060 0.25
1061 0.24
1062 0.31
1063 0.36
1064 0.34
1065 0.37
1066 0.33
1067 0.29
1068 0.28
1069 0.3
1070 0.28
1071 0.3
1072 0.35
1073 0.34
1074 0.34
1075 0.4
1076 0.4
1077 0.4
1078 0.41
1079 0.44
1080 0.45
1081 0.44
1082 0.43
1083 0.36
1084 0.36
1085 0.34
1086 0.28
1087 0.19
1088 0.15
1089 0.13
1090 0.13
1091 0.13
1092 0.13
1093 0.13
1094 0.12
1095 0.12
1096 0.11
1097 0.14
1098 0.14
1099 0.16
1100 0.19
1101 0.21
1102 0.23