FuNGI

A0A316YSX5

Protein Details

Accession

A0A316YSX5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
65-102	AEMKAKQKRQGSQNASPKRRATSKKTTKSKAKATPVLG	Hydrophilic
424-451	KLEGREVTPPKKRTKKSKADDGPKKDAE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
70-96	KQKRQGSQNASPKRRATSKKTTKSKAK
432-448	PPKKRTKKSKADDGPKK

Subcellular Location(s)

cyto 9.5, cyto_nucl 9.5, nucl 8.5, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR022898 RNase_HII IPR001352 RNase_HII/HIII IPR024567 RNase_HII/HIII_dom IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0046872 F:metal ion binding GO:0003723 F:RNA binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity GO:0006401 P:RNA catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF01351 RNase_HII
PROSITE	View protein in PROSITE PS51975 RNASE_H_2
CDD	cd07182 RNase_HII_bacteria_HII_like

Amino Acid Sequences

MPPQARSRRAAASAASASISEAYDLTRRGARLEEKAPKAVKRNREVADEAEVETNGKPGEHCEGAEMKAKQKRQGSQNASPKRRATSKKTTKSKAKATPVLGTSEDPGEEIETAAGDELSGAAKELSTLISQNDVGALESWIAQEEATSPSVGPKTKDKATEALLKRAKKERDLMVKERNRLAKLLHYERAIVASAKLEEHVEEEVGEVEPIYIAGTDEVGVGPLAGPIVACAVILPSPSSIPDSGLRWWKGLDDSKRVHKSKRAEMAQSIKEHALAWSVGIVEAKEVDELNNYQGSIEAMRRAIEGLAIRPDHLLVDARDIPDVRLPPRKEAVASRKKEDEEEIGQTALISGDRLSQSIAAASIIAKVTRDAMMDTIHLSYPEYNFLENKGYGTAHHMKALREIGPCPHHRFSFRPVAEAQAKLEGREVTPPKKRTKKSKADDGPKKDAEGKPLLTTLTNWLTLPWKKGEGDAKDQGQADAAPVVEA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.29
3	0.23
4	0.2
5	0.18
6	0.16
7	0.1
8	0.09
9	0.1
10	0.13
11	0.14
12	0.16
13	0.19
14	0.19
15	0.2
16	0.26
17	0.3
18	0.33
19	0.42
20	0.49
21	0.49
22	0.56
23	0.6
24	0.6
25	0.65
26	0.66
27	0.66
28	0.64
29	0.69
30	0.65
31	0.66
32	0.63
33	0.56
34	0.54
35	0.46
36	0.4
37	0.32
38	0.28
39	0.24
40	0.21
41	0.19
42	0.13
43	0.12
44	0.1
45	0.11
46	0.17
47	0.17
48	0.17
49	0.19
50	0.21
51	0.23
52	0.31
53	0.3
54	0.32
55	0.37
56	0.41
57	0.44
58	0.49
59	0.55
60	0.56
61	0.65
62	0.66
63	0.7
64	0.76
65	0.8
66	0.79
67	0.78
68	0.73
69	0.68
70	0.69
71	0.68
72	0.66
73	0.67
74	0.72
75	0.76
76	0.82
77	0.85
78	0.86
79	0.87
80	0.88
81	0.86
82	0.84
83	0.81
84	0.75
85	0.71
86	0.63
87	0.57
88	0.48
89	0.39
90	0.31
91	0.25
92	0.21
93	0.14
94	0.13
95	0.1
96	0.09
97	0.08
98	0.07
99	0.06
100	0.06
101	0.06
102	0.05
103	0.04
104	0.03
105	0.04
106	0.04
107	0.04
108	0.04
109	0.04
110	0.04
111	0.04
112	0.05
113	0.06
114	0.06
115	0.07
116	0.07
117	0.09
118	0.09
119	0.09
120	0.09
121	0.08
122	0.08
123	0.08
124	0.08
125	0.06
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.06
130	0.06
131	0.05
132	0.06
133	0.08
134	0.09
135	0.09
136	0.08
137	0.11
138	0.14
139	0.16
140	0.17
141	0.21
142	0.26
143	0.3
144	0.34
145	0.33
146	0.34
147	0.37
148	0.44
149	0.4
150	0.45
151	0.46
152	0.45
153	0.47
154	0.52
155	0.51
156	0.46
157	0.49
158	0.47
159	0.52
160	0.57
161	0.6
162	0.62
163	0.64
164	0.64
165	0.63
166	0.6
167	0.5
168	0.44
169	0.39
170	0.35
171	0.37
172	0.39
173	0.37
174	0.32
175	0.32
176	0.31
177	0.3
178	0.24
179	0.17
180	0.11
181	0.09
182	0.09
183	0.08
184	0.09
185	0.08
186	0.07
187	0.08
188	0.08
189	0.06
190	0.06
191	0.06
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.03
204	0.03
205	0.04
206	0.03
207	0.04
208	0.03
209	0.03
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.02
214	0.02
215	0.02
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.02
220	0.03
221	0.03
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.05
227	0.06
228	0.06
229	0.07
230	0.09
231	0.1
232	0.13
233	0.19
234	0.19
235	0.18
236	0.18
237	0.17
238	0.2
239	0.25
240	0.26
241	0.27
242	0.29
243	0.38
244	0.46
245	0.48
246	0.47
247	0.48
248	0.5
249	0.52
250	0.58
251	0.52
252	0.47
253	0.49
254	0.53
255	0.51
256	0.46
257	0.39
258	0.3
259	0.27
260	0.24
261	0.19
262	0.14
263	0.09
264	0.07
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.04
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.05
275	0.05
276	0.06
277	0.07
278	0.08
279	0.09
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.08
284	0.08
285	0.08
286	0.09
287	0.08
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.09
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.13
296	0.13
297	0.13
298	0.12
299	0.13
300	0.11
301	0.11
302	0.12
303	0.08
304	0.13
305	0.14
306	0.15
307	0.16
308	0.16
309	0.16
310	0.17
311	0.19
312	0.18
313	0.25
314	0.26
315	0.3
316	0.32
317	0.33
318	0.31
319	0.38
320	0.45
321	0.46
322	0.49
323	0.48
324	0.5
325	0.5
326	0.5
327	0.44
328	0.38
329	0.32
330	0.32
331	0.28
332	0.23
333	0.22
334	0.2
335	0.18
336	0.12
337	0.09
338	0.05
339	0.04
340	0.08
341	0.08
342	0.09
343	0.09
344	0.09
345	0.09
346	0.09
347	0.09
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.09
357	0.1
358	0.1
359	0.09
360	0.1
361	0.1
362	0.11
363	0.12
364	0.11
365	0.11
366	0.1
367	0.11
368	0.11
369	0.11
370	0.16
371	0.16
372	0.16
373	0.16
374	0.18
375	0.21
376	0.2
377	0.19
378	0.16
379	0.16
380	0.15
381	0.22
382	0.28
383	0.25
384	0.29
385	0.31
386	0.3
387	0.35
388	0.39
389	0.35
390	0.29
391	0.3
392	0.32
393	0.37
394	0.42
395	0.45
396	0.46
397	0.46
398	0.48
399	0.5
400	0.51
401	0.54
402	0.48
403	0.45
404	0.4
405	0.44
406	0.45
407	0.42
408	0.36
409	0.34
410	0.33
411	0.3
412	0.33
413	0.26
414	0.23
415	0.3
416	0.35
417	0.36
418	0.45
419	0.51
420	0.59
421	0.68
422	0.76
423	0.78
424	0.83
425	0.85
426	0.85
427	0.9
428	0.9
429	0.91
430	0.92
431	0.9
432	0.88
433	0.79
434	0.73
435	0.7
436	0.62
437	0.58
438	0.54
439	0.48
440	0.41
441	0.4
442	0.38
443	0.31
444	0.29
445	0.29
446	0.25
447	0.24
448	0.21
449	0.21
450	0.28
451	0.31
452	0.35
453	0.32
454	0.33
455	0.32
456	0.39
457	0.46
458	0.44
459	0.49
460	0.52
461	0.51
462	0.51
463	0.51
464	0.45
465	0.38
466	0.32
467	0.25
468	0.18

A0A316YSX5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer