FuNGI

A0A316YS15

Protein Details

Accession

A0A316YS15

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-38	ASTASSSKKSKPKSKSRDADSSFS	Hydrophilic
84-108	TLYTNPSLSTKKKRRKSDAAGGPTL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-30	SKKSKPKSKS
94-99	KKKRRK
520-531	KPRQGAAKKGGR

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MAPDVGEKRKHGGDASTASSSKKSKPKSKSRDADSSFSGESSSKGKPKQQGTATLKVSRDDPYRMGPLFVNTADFVPAEDAAFTLYTNPSLSTKKKRRKSDAAGGPTLEDNLILAGETDSIEYVGGNWSAHATVGTDESLRTEARGYSGDYMVGFYDPSTSMVTLRAAPLFTLTRTIKSLNSLSIDAQSQASDWAARKLARRGLGEAFGNRKTKTKARNEDRMKVDTTNMKAVIDTMRSDIEENTKGMANLDSIKEEADRLRPIPPPYFEAMHPADVYPIQSTLIPTNVWNALNVRHLYTTKTPQDLAKKLARIIGPLSPDSWLVSRLWDLSGPLRHSEGTGQDEGASNKITFDDDGQQEKSGGILKASGDTKTDARLKLKACYYAGLLWAFWKQARNLDERSMLTDRLRLKNNPAADLIVDDLLARFSETPRGQTKPVLSTFHETKLLAYSFALCLHVEDFAVEPSTLSKEIGLGASRLVEIFKSLGCGTNTRSVVDSTGTSTRSERRLILKTPLTLPKPRQGAAKKGGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.39
3	0.38
4	0.36
5	0.35
6	0.38
7	0.38
8	0.4
9	0.44
10	0.49
11	0.54
12	0.64
13	0.74
14	0.79
15	0.86
16	0.88
17	0.87
18	0.88
19	0.84
20	0.78
21	0.71
22	0.65
23	0.54
24	0.44
25	0.37
26	0.27
27	0.23
28	0.22
29	0.25
30	0.27
31	0.32
32	0.39
33	0.46
34	0.52
35	0.59
36	0.61
37	0.65
38	0.66
39	0.7
40	0.68
41	0.66
42	0.61
43	0.53
44	0.49
45	0.44
46	0.41
47	0.36
48	0.34
49	0.33
50	0.38
51	0.37
52	0.37
53	0.32
54	0.29
55	0.29
56	0.26
57	0.23
58	0.17
59	0.17
60	0.16
61	0.15
62	0.13
63	0.11
64	0.11
65	0.09
66	0.08
67	0.07
68	0.07
69	0.07
70	0.07
71	0.08
72	0.08
73	0.09
74	0.09
75	0.11
76	0.13
77	0.19
78	0.26
79	0.36
80	0.46
81	0.55
82	0.64
83	0.74
84	0.8
85	0.85
86	0.87
87	0.87
88	0.86
89	0.84
90	0.78
91	0.67
92	0.59
93	0.48
94	0.39
95	0.28
96	0.17
97	0.1
98	0.06
99	0.06
100	0.04
101	0.04
102	0.04
103	0.05
104	0.05
105	0.05
106	0.05
107	0.05
108	0.05
109	0.04
110	0.05
111	0.06
112	0.07
113	0.07
114	0.07
115	0.07
116	0.07
117	0.08
118	0.07
119	0.06
120	0.06
121	0.07
122	0.08
123	0.08
124	0.07
125	0.09
126	0.1
127	0.09
128	0.09
129	0.09
130	0.09
131	0.11
132	0.12
133	0.13
134	0.14
135	0.14
136	0.14
137	0.13
138	0.13
139	0.12
140	0.11
141	0.09
142	0.06
143	0.07
144	0.07
145	0.09
146	0.09
147	0.09
148	0.09
149	0.11
150	0.12
151	0.11
152	0.12
153	0.11
154	0.1
155	0.1
156	0.12
157	0.11
158	0.11
159	0.16
160	0.16
161	0.17
162	0.19
163	0.2
164	0.19
165	0.21
166	0.23
167	0.19
168	0.2
169	0.19
170	0.18
171	0.18
172	0.18
173	0.15
174	0.13
175	0.11
176	0.09
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.09
181	0.1
182	0.12
183	0.15
184	0.18
185	0.22
186	0.27
187	0.3
188	0.3
189	0.31
190	0.31
191	0.31
192	0.29
193	0.28
194	0.27
195	0.27
196	0.28
197	0.26
198	0.28
199	0.29
200	0.34
201	0.41
202	0.47
203	0.53
204	0.58
205	0.68
206	0.71
207	0.75
208	0.73
209	0.67
210	0.59
211	0.49
212	0.44
213	0.38
214	0.34
215	0.29
216	0.24
217	0.21
218	0.19
219	0.19
220	0.17
221	0.13
222	0.12
223	0.09
224	0.09
225	0.1
226	0.11
227	0.1
228	0.12
229	0.13
230	0.12
231	0.12
232	0.12
233	0.12
234	0.12
235	0.11
236	0.08
237	0.09
238	0.09
239	0.08
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.09
245	0.1
246	0.11
247	0.12
248	0.15
249	0.18
250	0.21
251	0.23
252	0.24
253	0.24
254	0.24
255	0.25
256	0.22
257	0.23
258	0.22
259	0.2
260	0.19
261	0.15
262	0.14
263	0.12
264	0.13
265	0.08
266	0.07
267	0.06
268	0.06
269	0.07
270	0.07
271	0.08
272	0.08
273	0.07
274	0.09
275	0.11
276	0.11
277	0.1
278	0.11
279	0.11
280	0.15
281	0.16
282	0.14
283	0.14
284	0.14
285	0.17
286	0.2
287	0.26
288	0.25
289	0.26
290	0.26
291	0.29
292	0.36
293	0.35
294	0.37
295	0.34
296	0.32
297	0.32
298	0.35
299	0.31
300	0.25
301	0.24
302	0.21
303	0.19
304	0.18
305	0.17
306	0.14
307	0.14
308	0.13
309	0.12
310	0.1
311	0.08
312	0.09
313	0.09
314	0.09
315	0.1
316	0.09
317	0.09
318	0.13
319	0.17
320	0.17
321	0.17
322	0.18
323	0.17
324	0.18
325	0.18
326	0.17
327	0.17
328	0.16
329	0.15
330	0.15
331	0.17
332	0.17
333	0.16
334	0.14
335	0.1
336	0.1
337	0.1
338	0.1
339	0.08
340	0.1
341	0.15
342	0.16
343	0.2
344	0.21
345	0.21
346	0.2
347	0.2
348	0.19
349	0.17
350	0.14
351	0.1
352	0.11
353	0.11
354	0.14
355	0.15
356	0.15
357	0.12
358	0.14
359	0.15
360	0.19
361	0.24
362	0.24
363	0.25
364	0.3
365	0.31
366	0.35
367	0.37
368	0.37
369	0.32
370	0.31
371	0.3
372	0.26
373	0.27
374	0.21
375	0.18
376	0.15
377	0.15
378	0.15
379	0.14
380	0.16
381	0.15
382	0.2
383	0.24
384	0.28
385	0.3
386	0.33
387	0.35
388	0.33
389	0.37
390	0.33
391	0.32
392	0.27
393	0.29
394	0.32
395	0.34
396	0.39
397	0.36
398	0.4
399	0.44
400	0.45
401	0.43
402	0.37
403	0.31
404	0.26
405	0.25
406	0.19
407	0.13
408	0.11
409	0.08
410	0.07
411	0.07
412	0.07
413	0.06
414	0.06
415	0.07
416	0.16
417	0.17
418	0.22
419	0.27
420	0.31
421	0.32
422	0.36
423	0.39
424	0.38
425	0.42
426	0.4
427	0.39
428	0.42
429	0.44
430	0.43
431	0.41
432	0.34
433	0.31
434	0.32
435	0.29
436	0.23
437	0.2
438	0.18
439	0.16
440	0.17
441	0.17
442	0.11
443	0.12
444	0.11
445	0.11
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.09
450	0.1
451	0.09
452	0.09
453	0.1
454	0.13
455	0.13
456	0.13
457	0.11
458	0.1
459	0.12
460	0.14
461	0.14
462	0.11
463	0.11
464	0.12
465	0.12
466	0.11
467	0.1
468	0.08
469	0.08
470	0.09
471	0.09
472	0.11
473	0.12
474	0.17
475	0.18
476	0.21
477	0.24
478	0.31
479	0.32
480	0.3
481	0.31
482	0.27
483	0.27
484	0.26
485	0.23
486	0.19
487	0.22
488	0.22
489	0.22
490	0.25
491	0.3
492	0.32
493	0.35
494	0.35
495	0.39
496	0.45
497	0.48
498	0.54
499	0.53
500	0.53
501	0.57
502	0.61
503	0.59
504	0.61
505	0.62
506	0.61
507	0.61
508	0.59
509	0.61
510	0.59
511	0.63

A0A316YS15

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer