Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YMS5

Protein Details
Accession A0A316YMS5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MHPTKKRRRAPEARREDLDDBasic
277-299VQERYRRAVKKTLRKQQQPQASDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-11KKRRRAP
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10, mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MHPTKKRRRAPEARREDLDDDEEEGDASVLGFQALPVADLPLGFDGIPMDGAQYLAVVRQEASGRPKVVQVRNPYAIADVQTPVASSLQSQVGMPSQEWRDTFQTRLKNMRESLNPVVSLGSASEGLVVPKRHDEASWYRFLHGRTLKDEEESSNGRKSGTEGVAEGAVDRDSPASQLGRPDVQLEEHAEPALREPTPALLSRLKTSDILALLEFFPSWFSQSSMASSPSPPTIRHAVDPFHARWVFALLAKLDGRLVGDEISTLRVLARAGIERVVQERYRRAVKKTLRKQQQPQASDDIDGGEVMMSEMGAWMIVCAVSSIWGQHDLWDDARADLAKIAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.78
3 0.7
4 0.62
5 0.55
6 0.45
7 0.37
8 0.3
9 0.25
10 0.2
11 0.17
12 0.13
13 0.09
14 0.08
15 0.05
16 0.05
17 0.05
18 0.04
19 0.04
20 0.06
21 0.06
22 0.07
23 0.07
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.09
28 0.07
29 0.08
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.05
41 0.05
42 0.06
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.09
47 0.11
48 0.15
49 0.21
50 0.25
51 0.26
52 0.26
53 0.31
54 0.37
55 0.43
56 0.46
57 0.48
58 0.51
59 0.53
60 0.53
61 0.47
62 0.4
63 0.35
64 0.3
65 0.23
66 0.16
67 0.13
68 0.12
69 0.12
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.07
74 0.09
75 0.1
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.12
80 0.13
81 0.12
82 0.15
83 0.15
84 0.18
85 0.19
86 0.22
87 0.25
88 0.26
89 0.29
90 0.3
91 0.35
92 0.37
93 0.45
94 0.44
95 0.45
96 0.45
97 0.48
98 0.45
99 0.45
100 0.45
101 0.4
102 0.36
103 0.31
104 0.28
105 0.22
106 0.19
107 0.12
108 0.08
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.12
118 0.14
119 0.13
120 0.13
121 0.18
122 0.23
123 0.27
124 0.33
125 0.31
126 0.31
127 0.33
128 0.34
129 0.37
130 0.33
131 0.31
132 0.28
133 0.32
134 0.31
135 0.3
136 0.3
137 0.23
138 0.23
139 0.23
140 0.22
141 0.19
142 0.19
143 0.18
144 0.17
145 0.18
146 0.19
147 0.17
148 0.15
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.11
154 0.06
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.08
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.11
170 0.1
171 0.11
172 0.13
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.12
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.11
185 0.12
186 0.14
187 0.15
188 0.17
189 0.18
190 0.2
191 0.19
192 0.17
193 0.17
194 0.17
195 0.14
196 0.13
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.1
210 0.12
211 0.13
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.15
216 0.18
217 0.19
218 0.17
219 0.2
220 0.23
221 0.24
222 0.27
223 0.28
224 0.26
225 0.28
226 0.33
227 0.3
228 0.32
229 0.3
230 0.26
231 0.24
232 0.25
233 0.22
234 0.18
235 0.19
236 0.12
237 0.15
238 0.15
239 0.15
240 0.12
241 0.11
242 0.11
243 0.09
244 0.1
245 0.07
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.09
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.1
257 0.11
258 0.12
259 0.14
260 0.14
261 0.15
262 0.17
263 0.21
264 0.21
265 0.23
266 0.28
267 0.32
268 0.41
269 0.44
270 0.47
271 0.52
272 0.59
273 0.66
274 0.71
275 0.76
276 0.77
277 0.83
278 0.88
279 0.87
280 0.87
281 0.79
282 0.74
283 0.71
284 0.61
285 0.52
286 0.43
287 0.34
288 0.24
289 0.2
290 0.15
291 0.08
292 0.07
293 0.06
294 0.05
295 0.04
296 0.03
297 0.04
298 0.03
299 0.04
300 0.03
301 0.03
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.06
308 0.07
309 0.08
310 0.09
311 0.12
312 0.13
313 0.15
314 0.2
315 0.21
316 0.22
317 0.24
318 0.23
319 0.2
320 0.23
321 0.21
322 0.17