Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316Z1P7

Protein Details
Accession A0A316Z1P7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
203-230AKSSPVTSKYQRRRSTRSRSRSRSATPSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019321  Nucleoporin_Nup88  
IPR037700  NUP88/NUP82  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005643  C:nuclear pore  
GO:0017056  F:structural constituent of nuclear pore  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
GO:0000056  P:ribosomal small subunit export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF10168  Nup88  
Amino Acid Sequences MTLLGADASPDPTMPDVSWLATLPSHPIFETASPSAPRPPRRAMAIRNTDLLVATGGEIRMASLLEVKHHGSGGITPQKSSYKILTSSKLDFNVVSLLVNPTGKLLIAVGTHRVAVVVLPRPGTVSSVGSSIAVNAGLIGRYWHHESSGRMGAVADCKWHPWGFNGTSLMILTKNGQLREYDVSEDTEEPVQTLSLLPSSSTAKSSPVTSKYQRRRSTRSRSRSRSATPSASVMKRTGSHALPRSVRSGSSRIGLDISDEEEDFEDIGDASLQTQRKCNGAGTDKSAVAFTFGLDTRSMGKKWNGQDDEGQSSATSSSVPLDWNPLTVFGLRRDGDVYAICPFLPKRASIPSAYIHALSSYVSLTSSTSITSSSSMLQRDLQLRFLSSILKQAQISRGQNAAKRRRSTSVEPQLSRRRRSVSATPMSIDPRASEPPEDEWDVEIEEDVLIEAPTAPIVPSLPQLQGPFLFTPEPHELSTERESNATDMFFARVVPSEQEEGQAVHVFGIVGDDGRLDLCVLLDSLSPKWPKGAKSTMKVHSSGRYALSDTDDEDSDLDMQSQAEQSLPSLLVYETVDLGVLEAVGGIGTATLDNIDAALTYSTAAFEPDPLYSDTIYVHHILGVHAINFGKWARLLAAAVSSLDEEDRPTSVRTPTKNGSGQGPSALERFLHRSVPTDIACIVKTAPPSFGDVSNTAIPVVGVAIVSDIYLSYSFLALTVHGRLVSLELDLRSEEEDDEDQAREAANNTSLASSSQSWQQQRPPVYTSLLGDGPAFKVPEPFSQGSGLPSHPRSALGKAGGSGELRVTPETLRLLATTVEELRLEMRKLVRGGNVTQARLDLEVRELARQLSKLVEANNRAGGEGTDSSIRQRMERVMERQRKLMKRTDGMLQKLMEKHHPQLSIYEEQWFQELDGLSREVGEQGGERGNRSGLTAKVEQLQHQFSLLKPDLEELKREQSDRSSIGQRSSATLGTKQLNAVERLLSSESNLLIEARNKVQELNHRIAQEARADVLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.15
3 0.14
4 0.15
5 0.17
6 0.16
7 0.16
8 0.15
9 0.15
10 0.17
11 0.18
12 0.18
13 0.17
14 0.18
15 0.19
16 0.19
17 0.25
18 0.22
19 0.25
20 0.26
21 0.28
22 0.35
23 0.42
24 0.48
25 0.48
26 0.53
27 0.54
28 0.61
29 0.67
30 0.67
31 0.7
32 0.72
33 0.68
34 0.64
35 0.59
36 0.5
37 0.42
38 0.34
39 0.23
40 0.13
41 0.11
42 0.11
43 0.1
44 0.09
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.1
52 0.13
53 0.16
54 0.18
55 0.18
56 0.18
57 0.18
58 0.15
59 0.17
60 0.24
61 0.3
62 0.29
63 0.28
64 0.32
65 0.36
66 0.37
67 0.38
68 0.34
69 0.3
70 0.36
71 0.41
72 0.44
73 0.46
74 0.48
75 0.5
76 0.47
77 0.42
78 0.36
79 0.31
80 0.27
81 0.22
82 0.17
83 0.14
84 0.14
85 0.15
86 0.15
87 0.14
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.1
92 0.08
93 0.08
94 0.1
95 0.11
96 0.13
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.13
101 0.11
102 0.1
103 0.14
104 0.17
105 0.18
106 0.19
107 0.19
108 0.21
109 0.21
110 0.22
111 0.18
112 0.15
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.13
117 0.13
118 0.11
119 0.1
120 0.08
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.11
129 0.16
130 0.16
131 0.18
132 0.21
133 0.23
134 0.29
135 0.34
136 0.3
137 0.26
138 0.26
139 0.26
140 0.26
141 0.25
142 0.21
143 0.16
144 0.17
145 0.21
146 0.21
147 0.2
148 0.2
149 0.27
150 0.26
151 0.3
152 0.3
153 0.27
154 0.27
155 0.26
156 0.23
157 0.15
158 0.14
159 0.11
160 0.14
161 0.18
162 0.18
163 0.19
164 0.19
165 0.22
166 0.26
167 0.26
168 0.24
169 0.21
170 0.22
171 0.23
172 0.23
173 0.21
174 0.19
175 0.17
176 0.14
177 0.13
178 0.11
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.13
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.16
191 0.17
192 0.2
193 0.25
194 0.26
195 0.33
196 0.4
197 0.5
198 0.58
199 0.67
200 0.72
201 0.74
202 0.79
203 0.82
204 0.85
205 0.86
206 0.86
207 0.87
208 0.86
209 0.86
210 0.84
211 0.8
212 0.78
213 0.74
214 0.68
215 0.58
216 0.55
217 0.54
218 0.48
219 0.44
220 0.36
221 0.32
222 0.28
223 0.29
224 0.3
225 0.26
226 0.32
227 0.35
228 0.41
229 0.42
230 0.42
231 0.42
232 0.38
233 0.37
234 0.33
235 0.32
236 0.26
237 0.26
238 0.25
239 0.22
240 0.21
241 0.19
242 0.17
243 0.14
244 0.14
245 0.11
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.08
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.05
258 0.1
259 0.12
260 0.13
261 0.17
262 0.19
263 0.2
264 0.22
265 0.23
266 0.26
267 0.3
268 0.32
269 0.34
270 0.35
271 0.34
272 0.33
273 0.31
274 0.24
275 0.18
276 0.15
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.14
284 0.17
285 0.18
286 0.19
287 0.22
288 0.28
289 0.32
290 0.41
291 0.39
292 0.38
293 0.43
294 0.42
295 0.43
296 0.37
297 0.32
298 0.22
299 0.2
300 0.18
301 0.13
302 0.09
303 0.05
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.12
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.13
314 0.14
315 0.15
316 0.13
317 0.19
318 0.18
319 0.18
320 0.18
321 0.17
322 0.17
323 0.16
324 0.15
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.13
331 0.14
332 0.13
333 0.15
334 0.2
335 0.23
336 0.22
337 0.25
338 0.22
339 0.24
340 0.24
341 0.22
342 0.16
343 0.14
344 0.13
345 0.1
346 0.09
347 0.06
348 0.06
349 0.05
350 0.05
351 0.06
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.12
362 0.13
363 0.14
364 0.15
365 0.17
366 0.21
367 0.21
368 0.22
369 0.2
370 0.19
371 0.19
372 0.19
373 0.17
374 0.12
375 0.18
376 0.16
377 0.18
378 0.18
379 0.19
380 0.23
381 0.28
382 0.29
383 0.24
384 0.28
385 0.28
386 0.31
387 0.39
388 0.44
389 0.45
390 0.47
391 0.49
392 0.5
393 0.53
394 0.57
395 0.58
396 0.59
397 0.59
398 0.57
399 0.61
400 0.66
401 0.67
402 0.63
403 0.56
404 0.5
405 0.45
406 0.49
407 0.49
408 0.48
409 0.47
410 0.45
411 0.42
412 0.4
413 0.39
414 0.34
415 0.26
416 0.18
417 0.15
418 0.16
419 0.16
420 0.14
421 0.14
422 0.16
423 0.19
424 0.19
425 0.16
426 0.14
427 0.14
428 0.13
429 0.12
430 0.09
431 0.06
432 0.05
433 0.04
434 0.03
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.04
446 0.06
447 0.07
448 0.08
449 0.1
450 0.1
451 0.11
452 0.11
453 0.12
454 0.11
455 0.11
456 0.11
457 0.09
458 0.14
459 0.16
460 0.17
461 0.15
462 0.16
463 0.16
464 0.2
465 0.23
466 0.2
467 0.17
468 0.16
469 0.16
470 0.16
471 0.16
472 0.12
473 0.09
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.06
479 0.06
480 0.07
481 0.07
482 0.08
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.09
489 0.09
490 0.08
491 0.06
492 0.06
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.04
497 0.03
498 0.03
499 0.03
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.03
504 0.03
505 0.03
506 0.03
507 0.03
508 0.04
509 0.04
510 0.05
511 0.06
512 0.11
513 0.11
514 0.11
515 0.15
516 0.17
517 0.19
518 0.23
519 0.32
520 0.33
521 0.39
522 0.47
523 0.49
524 0.49
525 0.49
526 0.45
527 0.39
528 0.36
529 0.31
530 0.25
531 0.2
532 0.18
533 0.17
534 0.17
535 0.13
536 0.12
537 0.12
538 0.1
539 0.1
540 0.09
541 0.09
542 0.07
543 0.07
544 0.06
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.06
554 0.06
555 0.05
556 0.06
557 0.05
558 0.06
559 0.06
560 0.07
561 0.06
562 0.05
563 0.05
564 0.04
565 0.05
566 0.03
567 0.03
568 0.02
569 0.02
570 0.02
571 0.02
572 0.02
573 0.02
574 0.02
575 0.02
576 0.02
577 0.02
578 0.02
579 0.02
580 0.02
581 0.03
582 0.03
583 0.03
584 0.03
585 0.03
586 0.03
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.06
595 0.06
596 0.08
597 0.09
598 0.1
599 0.09
600 0.1
601 0.09
602 0.09
603 0.11
604 0.1
605 0.09
606 0.09
607 0.09
608 0.09
609 0.1
610 0.1
611 0.09
612 0.09
613 0.09
614 0.08
615 0.09
616 0.1
617 0.08
618 0.07
619 0.08
620 0.07
621 0.08
622 0.08
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.07
628 0.06
629 0.05
630 0.05
631 0.05
632 0.05
633 0.06
634 0.06
635 0.08
636 0.09
637 0.11
638 0.17
639 0.22
640 0.24
641 0.3
642 0.32
643 0.37
644 0.4
645 0.38
646 0.38
647 0.35
648 0.32
649 0.28
650 0.26
651 0.2
652 0.18
653 0.17
654 0.12
655 0.11
656 0.16
657 0.16
658 0.17
659 0.17
660 0.2
661 0.22
662 0.26
663 0.25
664 0.21
665 0.21
666 0.19
667 0.19
668 0.16
669 0.14
670 0.12
671 0.14
672 0.13
673 0.14
674 0.13
675 0.16
676 0.17
677 0.17
678 0.18
679 0.17
680 0.19
681 0.19
682 0.18
683 0.14
684 0.13
685 0.11
686 0.08
687 0.08
688 0.04
689 0.03
690 0.03
691 0.03
692 0.03
693 0.03
694 0.03
695 0.03
696 0.04
697 0.04
698 0.04
699 0.04
700 0.05
701 0.05
702 0.05
703 0.05
704 0.05
705 0.07
706 0.07
707 0.08
708 0.07
709 0.08
710 0.08
711 0.09
712 0.08
713 0.07
714 0.08
715 0.08
716 0.08
717 0.09
718 0.09
719 0.09
720 0.09
721 0.09
722 0.09
723 0.1
724 0.11
725 0.12
726 0.12
727 0.11
728 0.11
729 0.11
730 0.09
731 0.1
732 0.1
733 0.1
734 0.1
735 0.1
736 0.1
737 0.1
738 0.11
739 0.12
740 0.12
741 0.12
742 0.16
743 0.22
744 0.26
745 0.29
746 0.35
747 0.39
748 0.42
749 0.44
750 0.42
751 0.38
752 0.37
753 0.35
754 0.3
755 0.26
756 0.23
757 0.2
758 0.17
759 0.15
760 0.14
761 0.14
762 0.13
763 0.1
764 0.14
765 0.15
766 0.19
767 0.25
768 0.25
769 0.24
770 0.26
771 0.26
772 0.24
773 0.24
774 0.23
775 0.21
776 0.22
777 0.22
778 0.2
779 0.22
780 0.23
781 0.23
782 0.26
783 0.22
784 0.22
785 0.21
786 0.21
787 0.21
788 0.19
789 0.16
790 0.13
791 0.12
792 0.13
793 0.12
794 0.12
795 0.11
796 0.13
797 0.14
798 0.14
799 0.13
800 0.12
801 0.12
802 0.12
803 0.12
804 0.12
805 0.11
806 0.12
807 0.11
808 0.11
809 0.13
810 0.16
811 0.15
812 0.17
813 0.18
814 0.22
815 0.24
816 0.27
817 0.28
818 0.28
819 0.3
820 0.35
821 0.37
822 0.33
823 0.32
824 0.3
825 0.27
826 0.25
827 0.24
828 0.14
829 0.12
830 0.16
831 0.16
832 0.17
833 0.17
834 0.17
835 0.19
836 0.18
837 0.17
838 0.15
839 0.17
840 0.18
841 0.22
842 0.28
843 0.29
844 0.31
845 0.34
846 0.32
847 0.3
848 0.28
849 0.23
850 0.2
851 0.17
852 0.16
853 0.14
854 0.14
855 0.16
856 0.2
857 0.21
858 0.18
859 0.2
860 0.24
861 0.3
862 0.38
863 0.44
864 0.51
865 0.6
866 0.61
867 0.66
868 0.71
869 0.7
870 0.68
871 0.69
872 0.66
873 0.62
874 0.62
875 0.63
876 0.61
877 0.58
878 0.57
879 0.49
880 0.46
881 0.45
882 0.45
883 0.45
884 0.41
885 0.43
886 0.44
887 0.44
888 0.4
889 0.4
890 0.43
891 0.4
892 0.36
893 0.35
894 0.29
895 0.28
896 0.28
897 0.25
898 0.19
899 0.18
900 0.17
901 0.14
902 0.16
903 0.16
904 0.15
905 0.15
906 0.15
907 0.11
908 0.1
909 0.1
910 0.08
911 0.1
912 0.16
913 0.16
914 0.18
915 0.19
916 0.2
917 0.19
918 0.21
919 0.22
920 0.19
921 0.24
922 0.25
923 0.26
924 0.31
925 0.33
926 0.35
927 0.37
928 0.38
929 0.32
930 0.32
931 0.32
932 0.26
933 0.34
934 0.31
935 0.27
936 0.24
937 0.27
938 0.33
939 0.33
940 0.36
941 0.31
942 0.39
943 0.41
944 0.42
945 0.41
946 0.38
947 0.43
948 0.42
949 0.44
950 0.42
951 0.41
952 0.44
953 0.45
954 0.41
955 0.38
956 0.37
957 0.35
958 0.3
959 0.29
960 0.32
961 0.31
962 0.32
963 0.29
964 0.31
965 0.32
966 0.32
967 0.31
968 0.27
969 0.23
970 0.25
971 0.26
972 0.21
973 0.18
974 0.19
975 0.17
976 0.16
977 0.16
978 0.14
979 0.15
980 0.19
981 0.21
982 0.23
983 0.26
984 0.26
985 0.28
986 0.32
987 0.39
988 0.43
989 0.46
990 0.46
991 0.44
992 0.45
993 0.46
994 0.44
995 0.39
996 0.33