Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YW00

Protein Details
Accession A0A316YW00    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
690-719AVLVEKTKQRQEKVKQRRRSSQKMEASPVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-60RRAKNKQPPPAPFREPGSAKRGAGPKKGASARSQPAAAKKGAVPAAPLSKINGKGKRK
194-194R
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031341  Methyltr_RsmF_N  
IPR001678  MeTrfase_RsmB/NOP2  
IPR011023  Nop2p  
IPR023267  RCMT  
IPR023273  RCMT_NOP2  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008173  F:RNA methyltransferase activity  
GO:0008757  F:S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01189  Methyltr_RsmB-F  
PF17125  Methyltr_RsmF_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51686  SAM_MT_RSMB_NOP  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences MGRRAKNKQPPPAPFREPGSAKRGAGPKKGASARSQPAAAKKGAVPAAPLSKINGKGKRKADESDDDSQDESVAREPKKLARTSAKSGLKEERASIFDEDEEDTDEEEEEDDDDEFEGLDAVDLDGSDEEDESDDEVEYSDVDEDAQGGSERDSEEDIAGEVDDREGAEPLDTDEEMAALGLPKKGTKLSNKQRKKALAEAERLEELLKSQGHSLEDDDEAGDLDADDFEGALQEGGADEQDDDEEDDDEEEGEGEEEDEDEEGMKDDFILPTLEDRLREKEQGADLQVVQMRIHEVVAVLNNFKKLATDGRSRSEYVDQLLDDVCNYYGYNRFLAERFFNMFTPSEAIELFEANETPRPVTIRTNTLRTRRRDLAQALINRGVNLEPIAGKWTKVGLQVFESTVPIGATPEYLAGHYILQAASSFLPCIALAPQPNERVLDMASAPGGKSTYLSALMQNTGVVFANDSNKARTKSLSANVHRLGCKNVVVCNYDARQFPKVIGGFDRVLLDSPCSGTGVVSKDPSVKANKSERDLQLLTHLQKQLLLCAIDSVNPKSATGGYVVYSTCSILVDEDEAVVDYALKKRPNVKIVDSGVQVGRDGFTAYRERRFDARMNLAKRVYPHTHNMDGFFYCKLKVEPHKSTKTKAGEEREGRSETSTFKNGTQADRTQKKKGKDASASVFDDDEDAVLVEKTKQRQEKVKQRRRSSQKMEASPVDDDEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.72
3 0.7
4 0.66
5 0.62
6 0.6
7 0.56
8 0.51
9 0.52
10 0.55
11 0.53
12 0.56
13 0.57
14 0.54
15 0.58
16 0.63
17 0.59
18 0.57
19 0.59
20 0.58
21 0.55
22 0.55
23 0.49
24 0.51
25 0.53
26 0.47
27 0.41
28 0.36
29 0.39
30 0.38
31 0.34
32 0.29
33 0.29
34 0.34
35 0.32
36 0.31
37 0.28
38 0.32
39 0.39
40 0.45
41 0.49
42 0.51
43 0.58
44 0.65
45 0.69
46 0.67
47 0.65
48 0.63
49 0.63
50 0.62
51 0.62
52 0.57
53 0.5
54 0.46
55 0.41
56 0.35
57 0.26
58 0.2
59 0.18
60 0.22
61 0.21
62 0.24
63 0.27
64 0.34
65 0.42
66 0.44
67 0.47
68 0.5
69 0.56
70 0.6
71 0.67
72 0.68
73 0.62
74 0.64
75 0.64
76 0.59
77 0.54
78 0.5
79 0.44
80 0.38
81 0.39
82 0.35
83 0.27
84 0.22
85 0.21
86 0.2
87 0.16
88 0.17
89 0.15
90 0.14
91 0.13
92 0.13
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.07
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.05
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.11
172 0.14
173 0.19
174 0.27
175 0.37
176 0.47
177 0.58
178 0.67
179 0.72
180 0.77
181 0.79
182 0.76
183 0.72
184 0.71
185 0.68
186 0.65
187 0.61
188 0.55
189 0.48
190 0.42
191 0.35
192 0.25
193 0.17
194 0.15
195 0.13
196 0.11
197 0.12
198 0.15
199 0.15
200 0.16
201 0.16
202 0.14
203 0.14
204 0.13
205 0.12
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.06
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.1
261 0.11
262 0.11
263 0.14
264 0.19
265 0.2
266 0.22
267 0.21
268 0.22
269 0.23
270 0.24
271 0.23
272 0.19
273 0.17
274 0.18
275 0.19
276 0.16
277 0.14
278 0.11
279 0.11
280 0.1
281 0.1
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.08
294 0.13
295 0.17
296 0.24
297 0.26
298 0.3
299 0.33
300 0.33
301 0.34
302 0.31
303 0.27
304 0.21
305 0.2
306 0.15
307 0.14
308 0.13
309 0.11
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.15
323 0.15
324 0.13
325 0.15
326 0.15
327 0.15
328 0.16
329 0.15
330 0.14
331 0.14
332 0.12
333 0.1
334 0.09
335 0.09
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.1
348 0.13
349 0.15
350 0.21
351 0.23
352 0.3
353 0.34
354 0.42
355 0.48
356 0.49
357 0.54
358 0.5
359 0.5
360 0.49
361 0.46
362 0.44
363 0.42
364 0.41
365 0.36
366 0.34
367 0.32
368 0.26
369 0.25
370 0.18
371 0.12
372 0.1
373 0.08
374 0.05
375 0.05
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.1
382 0.13
383 0.14
384 0.12
385 0.13
386 0.14
387 0.14
388 0.14
389 0.13
390 0.09
391 0.09
392 0.08
393 0.06
394 0.05
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.08
419 0.09
420 0.12
421 0.16
422 0.17
423 0.18
424 0.18
425 0.17
426 0.15
427 0.14
428 0.13
429 0.09
430 0.08
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.06
435 0.06
436 0.05
437 0.05
438 0.06
439 0.07
440 0.08
441 0.09
442 0.1
443 0.11
444 0.11
445 0.11
446 0.1
447 0.09
448 0.08
449 0.08
450 0.06
451 0.06
452 0.07
453 0.1
454 0.12
455 0.13
456 0.15
457 0.2
458 0.22
459 0.23
460 0.22
461 0.24
462 0.27
463 0.34
464 0.41
465 0.4
466 0.46
467 0.48
468 0.51
469 0.49
470 0.43
471 0.39
472 0.31
473 0.3
474 0.23
475 0.23
476 0.22
477 0.23
478 0.23
479 0.24
480 0.24
481 0.25
482 0.26
483 0.26
484 0.25
485 0.24
486 0.23
487 0.25
488 0.25
489 0.23
490 0.22
491 0.23
492 0.21
493 0.21
494 0.22
495 0.16
496 0.16
497 0.14
498 0.13
499 0.1
500 0.1
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.08
505 0.11
506 0.13
507 0.14
508 0.14
509 0.15
510 0.18
511 0.19
512 0.23
513 0.26
514 0.25
515 0.3
516 0.38
517 0.43
518 0.43
519 0.5
520 0.48
521 0.49
522 0.47
523 0.4
524 0.38
525 0.39
526 0.37
527 0.35
528 0.35
529 0.28
530 0.3
531 0.3
532 0.25
533 0.22
534 0.2
535 0.14
536 0.15
537 0.15
538 0.16
539 0.19
540 0.19
541 0.21
542 0.21
543 0.21
544 0.2
545 0.2
546 0.17
547 0.16
548 0.15
549 0.1
550 0.12
551 0.12
552 0.11
553 0.11
554 0.1
555 0.09
556 0.09
557 0.08
558 0.07
559 0.07
560 0.08
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.06
567 0.06
568 0.07
569 0.11
570 0.16
571 0.18
572 0.21
573 0.29
574 0.37
575 0.43
576 0.47
577 0.47
578 0.51
579 0.53
580 0.55
581 0.48
582 0.44
583 0.38
584 0.33
585 0.28
586 0.2
587 0.16
588 0.11
589 0.11
590 0.09
591 0.11
592 0.2
593 0.23
594 0.3
595 0.31
596 0.35
597 0.37
598 0.42
599 0.45
600 0.44
601 0.51
602 0.53
603 0.55
604 0.58
605 0.55
606 0.53
607 0.5
608 0.49
609 0.45
610 0.41
611 0.46
612 0.46
613 0.51
614 0.51
615 0.5
616 0.45
617 0.4
618 0.37
619 0.31
620 0.25
621 0.19
622 0.2
623 0.19
624 0.24
625 0.33
626 0.41
627 0.49
628 0.57
629 0.67
630 0.69
631 0.73
632 0.73
633 0.71
634 0.7
635 0.69
636 0.67
637 0.67
638 0.69
639 0.69
640 0.66
641 0.61
642 0.53
643 0.47
644 0.41
645 0.35
646 0.35
647 0.35
648 0.31
649 0.3
650 0.36
651 0.36
652 0.39
653 0.42
654 0.43
655 0.49
656 0.56
657 0.6
658 0.64
659 0.68
660 0.69
661 0.72
662 0.73
663 0.73
664 0.72
665 0.75
666 0.73
667 0.73
668 0.69
669 0.61
670 0.52
671 0.42
672 0.34
673 0.26
674 0.18
675 0.1
676 0.08
677 0.07
678 0.07
679 0.08
680 0.12
681 0.17
682 0.23
683 0.32
684 0.39
685 0.46
686 0.56
687 0.66
688 0.72
689 0.79
690 0.83
691 0.85
692 0.88
693 0.92
694 0.92
695 0.92
696 0.9
697 0.89
698 0.89
699 0.86
700 0.84
701 0.78
702 0.71
703 0.62
704 0.54