Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YYC1

Protein Details
Accession A0A316YYC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-34AVPSKDPAKKDKKDEDKEAKVNGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-25KKDKKD
28-28K
Subcellular Location(s) plas 15, nucl 7.5, cyto_nucl 4.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016643  26S_Psome_Rpn1  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR002015  Proteasome/cyclosome_rpt  
IPR041433  RPN1_C  
IPR040892  RPN1_N  
Gene Ontology GO:0008540  C:proteasome regulatory particle, base subcomplex  
GO:0030234  F:enzyme regulator activity  
GO:0042176  P:regulation of protein catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01851  PC_rep  
PF18051  RPN1_C  
PF17781  RPN1_RPN2_N  
Amino Acid Sequences MAGGDAQKQTIAVPSKDPAKKDKKDEDKEAKVNGDAKGKGSADGADGKKDKKEDELSEEDLQLKNELEMLTERLKESDKGLHRPALESLRTLIRTSTSSMTSVPKPLKFLRPHYPDLKEIFETWPSSSDKALFSEILSVLAMTYTDNGQRETLKFRLLASEIGHAEDPGLWGHEYMRHLAAELGEEYNARSLEDESKSTSELIDLALLIVPFSLKHNAEADAVDLLLELESIDKLPQFVDKDTYARACLYMVSCVNLLVPPDDVEFLRTAHDIYRKHDRFAEAMTLALRLGDRELIRSDFEAPSNPVMRTQLAYMLGRQQIPVEWLQDEDDPMRDYKLMDCIYNTHLSSHFIQFAKELDVYEPKSLEDIYKSHLENTRSTLSTTVDSARGNLASTFVNAFVNAGFGNDKLMVGAEEGNSWIYKNKDHGMLSASASLGMSLLWDTEMGLSHVDKYTYSSDENIRAGSLMAYGILHSSVRSEMDAALALLTEHVESKSVPLKISAIVGIGLAYAGSCREDIVPLLLQHVADETTSMEVASMSALALGFIFVGSAHGEITPTILQTMMEREPSQLNDKWARFMSLGLALLFLGQQDASDATIETLKAIEHPISKQAQVLVDMCSYAGTGNVLKVQQMLHHCTEHIGVEREKEEDGQSEGAEAGASGEGAGASASGGAEGDKDESADEDKTNDLYQAFAVMGIALVAMGEDVGAEMTLRHFSHLMHYGEPTIRRAVPLALALLNPSNPQMALLDTLSKYSHDNDLDVAINAILAMGIVGAGTNNARLAQMLRQLAGYYHKEPDSLFMVRVAQGLVHMGKGTIGINPYHTDRQLMSRTAVCGILALLVSFTDARGFVLDKSHWMLYYLVLSMYPRFLITLDEEELQPLPTSVRVGKAVDVVGQAGKPRTISGFQTHTSPVRLGSYERAELGTDEYLSYANVLEGIVILRKNPGYEKED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.38
3 0.43
4 0.46
5 0.49
6 0.54
7 0.61
8 0.67
9 0.74
10 0.75
11 0.8
12 0.87
13 0.87
14 0.86
15 0.84
16 0.79
17 0.71
18 0.65
19 0.6
20 0.54
21 0.51
22 0.42
23 0.38
24 0.39
25 0.37
26 0.33
27 0.29
28 0.26
29 0.21
30 0.28
31 0.28
32 0.3
33 0.33
34 0.34
35 0.38
36 0.4
37 0.39
38 0.38
39 0.45
40 0.42
41 0.46
42 0.5
43 0.5
44 0.5
45 0.5
46 0.45
47 0.38
48 0.34
49 0.27
50 0.22
51 0.16
52 0.16
53 0.15
54 0.14
55 0.14
56 0.18
57 0.2
58 0.21
59 0.22
60 0.21
61 0.24
62 0.23
63 0.25
64 0.3
65 0.33
66 0.39
67 0.43
68 0.46
69 0.45
70 0.45
71 0.48
72 0.46
73 0.41
74 0.35
75 0.33
76 0.34
77 0.35
78 0.33
79 0.29
80 0.23
81 0.24
82 0.26
83 0.26
84 0.21
85 0.21
86 0.23
87 0.27
88 0.27
89 0.33
90 0.35
91 0.34
92 0.38
93 0.42
94 0.49
95 0.51
96 0.56
97 0.59
98 0.6
99 0.65
100 0.68
101 0.66
102 0.63
103 0.59
104 0.56
105 0.47
106 0.42
107 0.38
108 0.34
109 0.31
110 0.27
111 0.28
112 0.26
113 0.25
114 0.24
115 0.24
116 0.22
117 0.22
118 0.24
119 0.19
120 0.17
121 0.2
122 0.18
123 0.16
124 0.14
125 0.12
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.05
130 0.06
131 0.07
132 0.11
133 0.12
134 0.13
135 0.15
136 0.18
137 0.2
138 0.25
139 0.26
140 0.26
141 0.25
142 0.25
143 0.28
144 0.26
145 0.27
146 0.22
147 0.26
148 0.23
149 0.24
150 0.23
151 0.18
152 0.17
153 0.15
154 0.14
155 0.08
156 0.1
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.13
161 0.14
162 0.16
163 0.17
164 0.15
165 0.16
166 0.16
167 0.16
168 0.13
169 0.13
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.12
175 0.12
176 0.1
177 0.09
178 0.11
179 0.17
180 0.19
181 0.2
182 0.21
183 0.22
184 0.23
185 0.22
186 0.2
187 0.14
188 0.12
189 0.11
190 0.08
191 0.07
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.08
200 0.12
201 0.12
202 0.14
203 0.16
204 0.17
205 0.18
206 0.18
207 0.17
208 0.12
209 0.11
210 0.09
211 0.07
212 0.06
213 0.05
214 0.04
215 0.03
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.06
223 0.1
224 0.12
225 0.13
226 0.16
227 0.18
228 0.19
229 0.22
230 0.23
231 0.2
232 0.19
233 0.18
234 0.14
235 0.14
236 0.13
237 0.14
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.13
242 0.13
243 0.12
244 0.11
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.1
250 0.09
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.13
258 0.19
259 0.19
260 0.23
261 0.34
262 0.34
263 0.36
264 0.39
265 0.37
266 0.33
267 0.33
268 0.34
269 0.22
270 0.22
271 0.2
272 0.17
273 0.14
274 0.13
275 0.1
276 0.06
277 0.06
278 0.09
279 0.09
280 0.11
281 0.13
282 0.14
283 0.15
284 0.15
285 0.18
286 0.15
287 0.16
288 0.16
289 0.16
290 0.19
291 0.21
292 0.2
293 0.18
294 0.18
295 0.19
296 0.17
297 0.16
298 0.15
299 0.15
300 0.15
301 0.15
302 0.19
303 0.2
304 0.2
305 0.19
306 0.16
307 0.14
308 0.16
309 0.17
310 0.13
311 0.11
312 0.11
313 0.12
314 0.12
315 0.13
316 0.11
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.16
325 0.16
326 0.15
327 0.15
328 0.17
329 0.2
330 0.22
331 0.21
332 0.16
333 0.16
334 0.18
335 0.2
336 0.2
337 0.22
338 0.19
339 0.19
340 0.18
341 0.18
342 0.18
343 0.16
344 0.15
345 0.11
346 0.15
347 0.17
348 0.17
349 0.16
350 0.14
351 0.14
352 0.14
353 0.13
354 0.11
355 0.1
356 0.12
357 0.16
358 0.17
359 0.2
360 0.24
361 0.25
362 0.25
363 0.29
364 0.29
365 0.25
366 0.26
367 0.23
368 0.2
369 0.19
370 0.18
371 0.15
372 0.13
373 0.13
374 0.13
375 0.12
376 0.11
377 0.11
378 0.09
379 0.09
380 0.07
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.05
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.06
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.12
411 0.14
412 0.18
413 0.18
414 0.19
415 0.19
416 0.2
417 0.19
418 0.17
419 0.15
420 0.11
421 0.1
422 0.09
423 0.06
424 0.04
425 0.04
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.04
433 0.04
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.08
441 0.1
442 0.11
443 0.12
444 0.13
445 0.14
446 0.17
447 0.17
448 0.15
449 0.13
450 0.11
451 0.11
452 0.09
453 0.07
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.03
459 0.04
460 0.03
461 0.03
462 0.04
463 0.04
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.06
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.04
480 0.04
481 0.06
482 0.11
483 0.12
484 0.12
485 0.12
486 0.12
487 0.13
488 0.13
489 0.11
490 0.07
491 0.06
492 0.06
493 0.05
494 0.04
495 0.04
496 0.03
497 0.02
498 0.02
499 0.02
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.04
504 0.04
505 0.05
506 0.07
507 0.08
508 0.08
509 0.09
510 0.09
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.07
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.04
519 0.05
520 0.05
521 0.04
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.03
526 0.03
527 0.03
528 0.03
529 0.03
530 0.03
531 0.03
532 0.03
533 0.02
534 0.02
535 0.02
536 0.03
537 0.03
538 0.03
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.06
544 0.06
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.06
550 0.09
551 0.09
552 0.1
553 0.11
554 0.12
555 0.14
556 0.15
557 0.2
558 0.18
559 0.23
560 0.28
561 0.28
562 0.3
563 0.28
564 0.28
565 0.24
566 0.22
567 0.18
568 0.13
569 0.14
570 0.1
571 0.1
572 0.08
573 0.08
574 0.08
575 0.06
576 0.04
577 0.03
578 0.03
579 0.03
580 0.04
581 0.04
582 0.04
583 0.05
584 0.05
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.05
590 0.06
591 0.07
592 0.08
593 0.09
594 0.1
595 0.15
596 0.17
597 0.17
598 0.18
599 0.18
600 0.17
601 0.17
602 0.17
603 0.14
604 0.12
605 0.12
606 0.11
607 0.09
608 0.08
609 0.06
610 0.05
611 0.05
612 0.05
613 0.05
614 0.08
615 0.08
616 0.08
617 0.09
618 0.09
619 0.12
620 0.16
621 0.2
622 0.2
623 0.21
624 0.21
625 0.21
626 0.22
627 0.19
628 0.18
629 0.17
630 0.15
631 0.17
632 0.18
633 0.18
634 0.18
635 0.17
636 0.15
637 0.13
638 0.14
639 0.12
640 0.11
641 0.11
642 0.1
643 0.09
644 0.08
645 0.06
646 0.05
647 0.04
648 0.04
649 0.03
650 0.03
651 0.03
652 0.03
653 0.03
654 0.02
655 0.02
656 0.03
657 0.03
658 0.02
659 0.03
660 0.03
661 0.03
662 0.04
663 0.05
664 0.05
665 0.05
666 0.05
667 0.06
668 0.09
669 0.1
670 0.09
671 0.09
672 0.1
673 0.11
674 0.12
675 0.12
676 0.1
677 0.09
678 0.09
679 0.09
680 0.08
681 0.07
682 0.06
683 0.05
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.02
688 0.02
689 0.02
690 0.02
691 0.02
692 0.02
693 0.02
694 0.02
695 0.02
696 0.02
697 0.02
698 0.03
699 0.04
700 0.07
701 0.08
702 0.09
703 0.1
704 0.1
705 0.15
706 0.23
707 0.23
708 0.22
709 0.22
710 0.24
711 0.27
712 0.28
713 0.25
714 0.21
715 0.2
716 0.19
717 0.2
718 0.18
719 0.16
720 0.16
721 0.15
722 0.12
723 0.12
724 0.12
725 0.12
726 0.12
727 0.1
728 0.1
729 0.09
730 0.08
731 0.09
732 0.08
733 0.08
734 0.09
735 0.09
736 0.12
737 0.12
738 0.13
739 0.13
740 0.14
741 0.14
742 0.15
743 0.2
744 0.17
745 0.18
746 0.17
747 0.19
748 0.19
749 0.18
750 0.16
751 0.1
752 0.09
753 0.08
754 0.07
755 0.04
756 0.03
757 0.03
758 0.02
759 0.02
760 0.02
761 0.02
762 0.02
763 0.03
764 0.03
765 0.04
766 0.05
767 0.05
768 0.06
769 0.06
770 0.08
771 0.12
772 0.18
773 0.19
774 0.19
775 0.19
776 0.19
777 0.2
778 0.25
779 0.26
780 0.22
781 0.26
782 0.25
783 0.26
784 0.26
785 0.28
786 0.26
787 0.23
788 0.21
789 0.18
790 0.19
791 0.19
792 0.2
793 0.16
794 0.11
795 0.1
796 0.12
797 0.11
798 0.1
799 0.09
800 0.09
801 0.09
802 0.1
803 0.1
804 0.09
805 0.1
806 0.1
807 0.13
808 0.16
809 0.2
810 0.23
811 0.23
812 0.23
813 0.23
814 0.3
815 0.33
816 0.33
817 0.31
818 0.3
819 0.31
820 0.3
821 0.29
822 0.21
823 0.16
824 0.13
825 0.12
826 0.09
827 0.07
828 0.06
829 0.05
830 0.07
831 0.06
832 0.06
833 0.06
834 0.06
835 0.07
836 0.08
837 0.1
838 0.09
839 0.15
840 0.15
841 0.17
842 0.21
843 0.22
844 0.21
845 0.21
846 0.21
847 0.17
848 0.19
849 0.16
850 0.12
851 0.12
852 0.13
853 0.12
854 0.13
855 0.12
856 0.1
857 0.1
858 0.1
859 0.12
860 0.14
861 0.17
862 0.18
863 0.19
864 0.19
865 0.2
866 0.21
867 0.19
868 0.16
869 0.12
870 0.1
871 0.1
872 0.14
873 0.14
874 0.17
875 0.19
876 0.2
877 0.22
878 0.23
879 0.23
880 0.22
881 0.21
882 0.18
883 0.17
884 0.17
885 0.19
886 0.18
887 0.19
888 0.17
889 0.18
890 0.2
891 0.22
892 0.26
893 0.29
894 0.32
895 0.32
896 0.36
897 0.38
898 0.37
899 0.37
900 0.33
901 0.28
902 0.26
903 0.27
904 0.26
905 0.29
906 0.31
907 0.31
908 0.31
909 0.3
910 0.27
911 0.26
912 0.27
913 0.21
914 0.16
915 0.14
916 0.14
917 0.13
918 0.12
919 0.12
920 0.09
921 0.07
922 0.07
923 0.06
924 0.06
925 0.06
926 0.07
927 0.1
928 0.1
929 0.1
930 0.14
931 0.16
932 0.18
933 0.22