Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V1CH39

Protein Details
Accession A0A2V1CH39    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-51DSSSSQTKPGKGRNFKRVKYDTRSILHydrophilic
100-130PRDLRRRTASHNVKRVPKRLQKRAAKEMKDDBasic
132-153TPTVNSRTRKPGNPRARLRAETHydrophilic
177-215IETREPRPKIRKNVLNDPPKPKSKFRKRQIHKTWLPTHLHydrophilic
602-628ELDERLKKKSNWEKRPKGKRVEWDSLDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-128RRRTASHNVKRVPKRLQKRAAKEMK
136-206NSRTRKPGNPRARLRAETAKRLGILAAKKRAAKEKKVGEVGIETREPRPKIRKNVLNDPPKPKSKFRKRQI
607-621LKKKSNWEKRPKGKR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10, mito 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MPPKISNSVTNSASNTGAKKRKDAPDSSSSQTKPGKGRNFKRVKYDTRSILTSSPDGALKNGELDLQSFLKSREFEIKALQDGMQKSKSSGTTRAFQQVPRDLRRRTASHNVKRVPKRLQKRAAKEMKDDNTPTVNSRTRKPGNPRARLRAETAKRLGILAAKKRAAKEKKVGEVGIETREPRPKIRKNVLNDPPKPKSKFRKRQIHKTWLPTHLWHAKRATMTEPKGPLWRFAIPLTSTQKSYRPTHRASGGRGAVCWDMSYMSTIGLQGPEASLQKLLKAVGVKEEGLWEARGTKWREGKRSWTGWLTREVKEKSIVVSPATVLWCPPQSATASDEASKKRPAQSRIFVRVHPAAFLEVWTELLRLSKLQRPIVHIEDLRFEIGSIEIVGPSSTEALLSVLHPYDELEEHARAFQSLLGITNPGSLPSNSVLSFSVMDPRIRYPPRPVKLPNTNDEEANFTLLELASTWPVDQSTGSSALFDRDARFKATRLPSQKALNRRKALAKPGECPSLQATDPRIPITLITSRSASSSSAQGTWTLLAPWKCILPIWYGLMHCPLSSGSNPRFGGLQELRQIHFERGVPYFPTDLPGTASGFQWELDERLKKKSNWEKRPKGKRVEWDSLDLGAGRKGEVGRGWASDFEKVLGVPPLPASVTSTDTSQETEKAKENISKIEEVPVYHLLCKTFRTLLSSPDSELPRSNAVATVRIALATKGIASPSARIYRLPRAAEHSSSIVSEPSITSSPPTTREQWLALLPPPSHSKLPLNPKSKAGKLPTRIPLNTPLPQRVQLLAQSLLQDPPRQYTQYPSGNHDEDFPLVPDEEDLIGFVTTGEFNLAEGKGVAVGSVVAEKVLEGLRRDGKGKEGRLCIVRNSGEKIGRLARWEVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.34
3 0.37
4 0.42
5 0.42
6 0.47
7 0.53
8 0.6
9 0.65
10 0.66
11 0.64
12 0.65
13 0.68
14 0.66
15 0.66
16 0.57
17 0.57
18 0.56
19 0.56
20 0.55
21 0.59
22 0.64
23 0.66
24 0.75
25 0.78
26 0.83
27 0.82
28 0.84
29 0.84
30 0.83
31 0.81
32 0.8
33 0.77
34 0.72
35 0.7
36 0.62
37 0.55
38 0.5
39 0.42
40 0.35
41 0.29
42 0.26
43 0.23
44 0.22
45 0.21
46 0.17
47 0.17
48 0.15
49 0.15
50 0.13
51 0.14
52 0.16
53 0.15
54 0.16
55 0.16
56 0.17
57 0.2
58 0.2
59 0.22
60 0.28
61 0.3
62 0.3
63 0.36
64 0.38
65 0.37
66 0.38
67 0.37
68 0.33
69 0.33
70 0.38
71 0.34
72 0.32
73 0.3
74 0.33
75 0.37
76 0.36
77 0.41
78 0.39
79 0.41
80 0.45
81 0.52
82 0.49
83 0.47
84 0.5
85 0.51
86 0.56
87 0.58
88 0.62
89 0.56
90 0.61
91 0.66
92 0.62
93 0.61
94 0.64
95 0.66
96 0.68
97 0.76
98 0.75
99 0.78
100 0.82
101 0.82
102 0.81
103 0.81
104 0.81
105 0.82
106 0.85
107 0.85
108 0.86
109 0.89
110 0.88
111 0.83
112 0.79
113 0.78
114 0.73
115 0.7
116 0.63
117 0.56
118 0.5
119 0.47
120 0.43
121 0.41
122 0.43
123 0.38
124 0.42
125 0.48
126 0.5
127 0.58
128 0.64
129 0.67
130 0.71
131 0.78
132 0.82
133 0.81
134 0.82
135 0.76
136 0.73
137 0.72
138 0.68
139 0.66
140 0.61
141 0.54
142 0.47
143 0.44
144 0.39
145 0.34
146 0.35
147 0.34
148 0.38
149 0.4
150 0.43
151 0.46
152 0.55
153 0.57
154 0.58
155 0.59
156 0.6
157 0.64
158 0.65
159 0.62
160 0.53
161 0.5
162 0.44
163 0.39
164 0.33
165 0.26
166 0.26
167 0.33
168 0.33
169 0.36
170 0.44
171 0.49
172 0.57
173 0.66
174 0.69
175 0.7
176 0.79
177 0.81
178 0.81
179 0.8
180 0.78
181 0.76
182 0.77
183 0.74
184 0.73
185 0.75
186 0.76
187 0.79
188 0.81
189 0.84
190 0.85
191 0.91
192 0.92
193 0.92
194 0.88
195 0.87
196 0.84
197 0.79
198 0.74
199 0.64
200 0.62
201 0.6
202 0.54
203 0.49
204 0.44
205 0.41
206 0.39
207 0.4
208 0.38
209 0.37
210 0.39
211 0.4
212 0.4
213 0.39
214 0.44
215 0.43
216 0.39
217 0.34
218 0.33
219 0.29
220 0.27
221 0.29
222 0.23
223 0.29
224 0.32
225 0.3
226 0.3
227 0.3
228 0.34
229 0.35
230 0.41
231 0.44
232 0.46
233 0.48
234 0.52
235 0.58
236 0.57
237 0.55
238 0.57
239 0.53
240 0.45
241 0.41
242 0.37
243 0.3
244 0.26
245 0.22
246 0.13
247 0.09
248 0.08
249 0.1
250 0.08
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.13
269 0.13
270 0.15
271 0.16
272 0.16
273 0.15
274 0.16
275 0.14
276 0.13
277 0.13
278 0.09
279 0.09
280 0.11
281 0.18
282 0.2
283 0.26
284 0.32
285 0.38
286 0.44
287 0.46
288 0.53
289 0.54
290 0.54
291 0.52
292 0.5
293 0.48
294 0.44
295 0.5
296 0.45
297 0.4
298 0.45
299 0.43
300 0.38
301 0.37
302 0.36
303 0.28
304 0.28
305 0.26
306 0.18
307 0.17
308 0.15
309 0.15
310 0.15
311 0.13
312 0.1
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.1
318 0.1
319 0.12
320 0.14
321 0.14
322 0.15
323 0.17
324 0.21
325 0.22
326 0.24
327 0.26
328 0.27
329 0.31
330 0.37
331 0.41
332 0.44
333 0.51
334 0.56
335 0.62
336 0.62
337 0.55
338 0.53
339 0.51
340 0.43
341 0.35
342 0.26
343 0.18
344 0.16
345 0.15
346 0.11
347 0.07
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.06
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.1
356 0.14
357 0.18
358 0.23
359 0.25
360 0.28
361 0.33
362 0.34
363 0.35
364 0.32
365 0.28
366 0.26
367 0.25
368 0.21
369 0.16
370 0.13
371 0.09
372 0.08
373 0.07
374 0.05
375 0.05
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.03
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.06
394 0.06
395 0.07
396 0.08
397 0.09
398 0.09
399 0.1
400 0.09
401 0.09
402 0.08
403 0.08
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.08
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.07
415 0.08
416 0.09
417 0.11
418 0.09
419 0.1
420 0.1
421 0.1
422 0.11
423 0.09
424 0.13
425 0.13
426 0.13
427 0.13
428 0.15
429 0.21
430 0.22
431 0.24
432 0.28
433 0.36
434 0.39
435 0.44
436 0.46
437 0.47
438 0.55
439 0.58
440 0.53
441 0.51
442 0.48
443 0.43
444 0.4
445 0.35
446 0.25
447 0.22
448 0.17
449 0.09
450 0.09
451 0.08
452 0.08
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.04
462 0.05
463 0.06
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.09
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.11
473 0.13
474 0.16
475 0.17
476 0.16
477 0.24
478 0.28
479 0.34
480 0.36
481 0.39
482 0.4
483 0.46
484 0.5
485 0.53
486 0.57
487 0.59
488 0.56
489 0.55
490 0.58
491 0.55
492 0.59
493 0.57
494 0.51
495 0.46
496 0.47
497 0.47
498 0.4
499 0.38
500 0.31
501 0.25
502 0.22
503 0.2
504 0.2
505 0.21
506 0.22
507 0.21
508 0.2
509 0.17
510 0.17
511 0.17
512 0.18
513 0.15
514 0.16
515 0.16
516 0.16
517 0.16
518 0.17
519 0.15
520 0.11
521 0.12
522 0.12
523 0.12
524 0.12
525 0.12
526 0.12
527 0.11
528 0.1
529 0.08
530 0.11
531 0.11
532 0.11
533 0.11
534 0.11
535 0.11
536 0.11
537 0.11
538 0.1
539 0.12
540 0.12
541 0.14
542 0.14
543 0.14
544 0.17
545 0.16
546 0.13
547 0.12
548 0.11
549 0.11
550 0.12
551 0.18
552 0.17
553 0.24
554 0.24
555 0.24
556 0.24
557 0.22
558 0.29
559 0.24
560 0.26
561 0.25
562 0.27
563 0.27
564 0.29
565 0.31
566 0.24
567 0.25
568 0.22
569 0.19
570 0.19
571 0.2
572 0.18
573 0.18
574 0.19
575 0.16
576 0.17
577 0.15
578 0.13
579 0.13
580 0.14
581 0.14
582 0.13
583 0.13
584 0.11
585 0.11
586 0.11
587 0.1
588 0.09
589 0.1
590 0.13
591 0.19
592 0.2
593 0.27
594 0.33
595 0.34
596 0.44
597 0.52
598 0.59
599 0.64
600 0.74
601 0.77
602 0.82
603 0.92
604 0.91
605 0.89
606 0.85
607 0.84
608 0.82
609 0.8
610 0.72
611 0.66
612 0.58
613 0.49
614 0.42
615 0.32
616 0.24
617 0.16
618 0.14
619 0.09
620 0.1
621 0.09
622 0.11
623 0.11
624 0.13
625 0.13
626 0.14
627 0.15
628 0.16
629 0.17
630 0.17
631 0.17
632 0.14
633 0.13
634 0.12
635 0.13
636 0.12
637 0.11
638 0.1
639 0.09
640 0.1
641 0.09
642 0.09
643 0.1
644 0.1
645 0.13
646 0.13
647 0.14
648 0.14
649 0.14
650 0.16
651 0.15
652 0.17
653 0.16
654 0.19
655 0.23
656 0.24
657 0.27
658 0.3
659 0.31
660 0.32
661 0.34
662 0.33
663 0.29
664 0.32
665 0.31
666 0.26
667 0.28
668 0.27
669 0.25
670 0.24
671 0.25
672 0.21
673 0.21
674 0.22
675 0.22
676 0.2
677 0.2
678 0.25
679 0.25
680 0.28
681 0.33
682 0.33
683 0.31
684 0.34
685 0.35
686 0.3
687 0.31
688 0.28
689 0.24
690 0.24
691 0.22
692 0.2
693 0.19
694 0.21
695 0.19
696 0.18
697 0.16
698 0.15
699 0.15
700 0.12
701 0.12
702 0.09
703 0.09
704 0.07
705 0.08
706 0.09
707 0.1
708 0.12
709 0.17
710 0.22
711 0.22
712 0.24
713 0.29
714 0.36
715 0.42
716 0.42
717 0.38
718 0.41
719 0.45
720 0.44
721 0.42
722 0.35
723 0.29
724 0.27
725 0.25
726 0.19
727 0.14
728 0.13
729 0.1
730 0.12
731 0.12
732 0.11
733 0.12
734 0.15
735 0.18
736 0.21
737 0.26
738 0.26
739 0.29
740 0.32
741 0.32
742 0.32
743 0.32
744 0.3
745 0.29
746 0.31
747 0.27
748 0.27
749 0.31
750 0.32
751 0.31
752 0.31
753 0.34
754 0.37
755 0.48
756 0.54
757 0.55
758 0.55
759 0.61
760 0.65
761 0.64
762 0.64
763 0.61
764 0.61
765 0.61
766 0.67
767 0.68
768 0.69
769 0.65
770 0.61
771 0.61
772 0.58
773 0.58
774 0.54
775 0.51
776 0.47
777 0.49
778 0.47
779 0.4
780 0.36
781 0.33
782 0.32
783 0.28
784 0.25
785 0.24
786 0.23
787 0.25
788 0.24
789 0.26
790 0.23
791 0.27
792 0.29
793 0.3
794 0.29
795 0.33
796 0.4
797 0.44
798 0.46
799 0.46
800 0.49
801 0.49
802 0.48
803 0.44
804 0.37
805 0.31
806 0.29
807 0.25
808 0.19
809 0.18
810 0.17
811 0.15
812 0.14
813 0.13
814 0.11
815 0.1
816 0.09
817 0.08
818 0.08
819 0.08
820 0.07
821 0.06
822 0.07
823 0.07
824 0.06
825 0.07
826 0.1
827 0.1
828 0.1
829 0.1
830 0.1
831 0.1
832 0.1
833 0.09
834 0.06
835 0.06
836 0.06
837 0.07
838 0.07
839 0.06
840 0.06
841 0.06
842 0.08
843 0.11
844 0.14
845 0.14
846 0.21
847 0.28
848 0.31
849 0.33
850 0.33
851 0.39
852 0.45
853 0.5
854 0.52
855 0.51
856 0.54
857 0.58
858 0.59
859 0.54
860 0.54
861 0.51
862 0.48
863 0.48
864 0.49
865 0.47
866 0.46
867 0.47
868 0.45
869 0.43
870 0.42