Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V1BYP0

Protein Details
Accession A0A2V1BYP0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
282-303TTTTNGGRRKKRKGALTNPSSYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
289-294RRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPRKKWIDKKTATHFTVLHRPQNDPLIHNASASSMILNPTVPLNSTKTKKIDDLASELGSEVEHIRDNEGEAANHGIYYDDTEYDYMQHMRDLGSGSGDAYFVEAPTTQNKGKAKQQSLEDALKNVSLDERARMLLDDEILPSKNLRKVTYQAQQDVPDVLAGFQPDMDPRLREVLVALEDDAYVDDDDDVFGELAKDGEEIEEDEFDQGAWDDEDGGWESDDTAKPTKEYREAPQSTPEMVNDDREDHGDGTWLADFIKRDQQKTSAPRATPSDVQSSMMTTTTNGGRRKKRKGALTNPSSYSMSSSSMFRTEGLTTLDARFERIEEQYNEDMDDMASVSMASSTASSVTGPVRGDFDGIMDDFLGNYSMSGKKFVKKGKYQSGMEQLDEVRKGLGPAIIRSQRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.62
3 0.63
4 0.6
5 0.58
6 0.5
7 0.51
8 0.5
9 0.55
10 0.52
11 0.43
12 0.44
13 0.43
14 0.4
15 0.38
16 0.33
17 0.26
18 0.24
19 0.22
20 0.16
21 0.1
22 0.11
23 0.12
24 0.12
25 0.11
26 0.11
27 0.12
28 0.12
29 0.14
30 0.18
31 0.26
32 0.3
33 0.36
34 0.4
35 0.43
36 0.45
37 0.46
38 0.47
39 0.43
40 0.45
41 0.41
42 0.37
43 0.33
44 0.3
45 0.25
46 0.19
47 0.16
48 0.11
49 0.08
50 0.1
51 0.11
52 0.12
53 0.13
54 0.14
55 0.17
56 0.18
57 0.16
58 0.15
59 0.17
60 0.16
61 0.15
62 0.14
63 0.1
64 0.09
65 0.11
66 0.11
67 0.09
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.14
73 0.13
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.13
79 0.14
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.08
93 0.11
94 0.16
95 0.15
96 0.21
97 0.25
98 0.28
99 0.36
100 0.44
101 0.46
102 0.47
103 0.49
104 0.51
105 0.53
106 0.54
107 0.47
108 0.39
109 0.35
110 0.3
111 0.26
112 0.19
113 0.15
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.12
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.1
123 0.11
124 0.1
125 0.09
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.14
131 0.17
132 0.19
133 0.2
134 0.22
135 0.25
136 0.33
137 0.39
138 0.39
139 0.39
140 0.4
141 0.39
142 0.37
143 0.34
144 0.26
145 0.19
146 0.14
147 0.11
148 0.09
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.03
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.08
209 0.08
210 0.1
211 0.12
212 0.12
213 0.13
214 0.15
215 0.18
216 0.21
217 0.24
218 0.26
219 0.35
220 0.38
221 0.38
222 0.41
223 0.39
224 0.36
225 0.34
226 0.29
227 0.22
228 0.19
229 0.2
230 0.16
231 0.16
232 0.15
233 0.15
234 0.16
235 0.13
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.19
247 0.21
248 0.22
249 0.24
250 0.28
251 0.34
252 0.4
253 0.48
254 0.46
255 0.43
256 0.45
257 0.48
258 0.47
259 0.44
260 0.4
261 0.35
262 0.29
263 0.31
264 0.27
265 0.24
266 0.21
267 0.17
268 0.14
269 0.09
270 0.11
271 0.14
272 0.2
273 0.25
274 0.33
275 0.42
276 0.51
277 0.61
278 0.68
279 0.71
280 0.75
281 0.79
282 0.82
283 0.83
284 0.82
285 0.78
286 0.71
287 0.67
288 0.57
289 0.47
290 0.38
291 0.29
292 0.23
293 0.18
294 0.17
295 0.16
296 0.17
297 0.17
298 0.15
299 0.16
300 0.14
301 0.15
302 0.16
303 0.16
304 0.16
305 0.16
306 0.19
307 0.17
308 0.18
309 0.17
310 0.15
311 0.16
312 0.17
313 0.23
314 0.21
315 0.28
316 0.28
317 0.29
318 0.28
319 0.25
320 0.23
321 0.16
322 0.15
323 0.09
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.08
337 0.09
338 0.12
339 0.13
340 0.13
341 0.15
342 0.15
343 0.16
344 0.14
345 0.13
346 0.13
347 0.12
348 0.12
349 0.1
350 0.09
351 0.08
352 0.09
353 0.09
354 0.06
355 0.06
356 0.09
357 0.13
358 0.14
359 0.2
360 0.23
361 0.29
362 0.36
363 0.45
364 0.52
365 0.58
366 0.67
367 0.72
368 0.77
369 0.75
370 0.75
371 0.77
372 0.7
373 0.61
374 0.55
375 0.46
376 0.43
377 0.41
378 0.33
379 0.24
380 0.21
381 0.21
382 0.19
383 0.2
384 0.17
385 0.2
386 0.29