FuNGI

A0A2V1C8H0

Protein Details

Accession

A0A2V1C8H0

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
30-51	ADPLVARKKPVRRQNVLPNAAG	Hydrophilic
538-562	SSGNESSRKKLKKKHQSSRASGSST	Hydrophilic
623-644	MSDGGKKKKAIKLRFNNTPNGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
24-63	VRKPKAADPLVARKKPVRRQNVLPNAAGPKRNGPAPGAAR
429-449	KEQEKRRKLGKEVTKALRKRE
482-554	KKDEEAKNKAKLESASKLPSGASSKGTSTPSGRPKHSDPLKKVKSLKRPGSPNLSESSGNESSRKKLKKKHQS
628-632	KKKKA

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSASPSGQSNGPTPNGGPPRGQFVRKPKAADPLVARKKPVRRQNVLPNAAGPKRNGPAPGAARKLPQYPVNGVNAPRGVGPGTMQQRNGTGAEPENGGWTNPPVGSFTDFPLVTSKKALREGLRYHIARFASKKGVDPSDQNEFTRPVLLHRRDPRQILPGKGVKDEDTIMTDNPIDSKERERQEILKAEKEAQKAADLAQIAPTGNNASALAAKKNQSFRNEKTTQVHRLDKTEEQKKLSDLKYEEALPWHLEDADNKNTWVGNYEAALSDTNVILVVEGSTFKMIPVEKWYKFTSKGKFTPFTTEEAEAQFAKKIKESRWVMKSNEEKENAKMAQESKKAMSNLFTVKAESSTFKNAGKSEVQDMDELDFEEGDLFQDDDEMVTVEPDNDEDTKDAQDRVKRDRQAANVFDKANEADVDEEEEEEKKEQEKRRKLGKEVTKALRKRERNFIYNSDSDHPYSESSDDDTSDEEKQKEIDRKKDEEAKNKAKLESASKLPSGASSKGTSTPSGRPKHSDPLKKVKSLKRPGSPNLSESSGNESSRKKLKKKHQSSRASGSSTPIPGSRPMSPEPAGSQSPRKSSIVKLTVNPNKVSNIQSAPPNPSPVRSGATSDGEATGGEMSDGGKKKKAIKLRFNNTPNGSRAGSPVPVAGGSRSGSPAAGSGSPGRAQSPATGQVQAHEVLAALPASGITLKDLLKGFSGRVQTEQDKKHFINLVKENSKYGPDKLLRPK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.37
3	0.37
4	0.37
5	0.33
6	0.41
7	0.45
8	0.48
9	0.47
10	0.51
11	0.6
12	0.61
13	0.65
14	0.6
15	0.64
16	0.62
17	0.61
18	0.59
19	0.59
20	0.65
21	0.62
22	0.63
23	0.6
24	0.68
25	0.71
26	0.72
27	0.72
28	0.69
29	0.75
30	0.82
31	0.85
32	0.8
33	0.72
34	0.67
35	0.64
36	0.62
37	0.56
38	0.47
39	0.43
40	0.41
41	0.43
42	0.39
43	0.34
44	0.37
45	0.42
46	0.48
47	0.47
48	0.46
49	0.46
50	0.48
51	0.5
52	0.46
53	0.43
54	0.4
55	0.4
56	0.42
57	0.44
58	0.44
59	0.41
60	0.42
61	0.37
62	0.33
63	0.28
64	0.24
65	0.19
66	0.16
67	0.16
68	0.19
69	0.25
70	0.28
71	0.29
72	0.29
73	0.3
74	0.32
75	0.32
76	0.25
77	0.2
78	0.19
79	0.2
80	0.2
81	0.18
82	0.19
83	0.18
84	0.17
85	0.15
86	0.14
87	0.15
88	0.14
89	0.14
90	0.13
91	0.14
92	0.18
93	0.18
94	0.19
95	0.22
96	0.21
97	0.22
98	0.27
99	0.27
100	0.24
101	0.29
102	0.3
103	0.29
104	0.35
105	0.39
106	0.36
107	0.43
108	0.46
109	0.48
110	0.54
111	0.5
112	0.46
113	0.46
114	0.43
115	0.4
116	0.39
117	0.36
118	0.36
119	0.36
120	0.39
121	0.4
122	0.43
123	0.41
124	0.42
125	0.41
126	0.42
127	0.43
128	0.39
129	0.36
130	0.34
131	0.32
132	0.32
133	0.27
134	0.24
135	0.32
136	0.36
137	0.42
138	0.49
139	0.57
140	0.57
141	0.62
142	0.59
143	0.58
144	0.59
145	0.54
146	0.54
147	0.51
148	0.47
149	0.46
150	0.43
151	0.35
152	0.31
153	0.29
154	0.22
155	0.2
156	0.19
157	0.17
158	0.16
159	0.15
160	0.13
161	0.13
162	0.13
163	0.12
164	0.12
165	0.18
166	0.25
167	0.28
168	0.32
169	0.34
170	0.37
171	0.42
172	0.48
173	0.47
174	0.45
175	0.43
176	0.45
177	0.47
178	0.45
179	0.39
180	0.32
181	0.29
182	0.24
183	0.23
184	0.19
185	0.15
186	0.14
187	0.14
188	0.14
189	0.12
190	0.12
191	0.11
192	0.09
193	0.09
194	0.09
195	0.07
196	0.07
197	0.1
198	0.12
199	0.14
200	0.16
201	0.19
202	0.23
203	0.3
204	0.34
205	0.38
206	0.44
207	0.46
208	0.53
209	0.52
210	0.53
211	0.53
212	0.55
213	0.57
214	0.56
215	0.59
216	0.5
217	0.52
218	0.51
219	0.51
220	0.53
221	0.52
222	0.5
223	0.45
224	0.45
225	0.45
226	0.48
227	0.43
228	0.41
229	0.34
230	0.32
231	0.32
232	0.31
233	0.29
234	0.23
235	0.22
236	0.16
237	0.15
238	0.13
239	0.11
240	0.11
241	0.13
242	0.16
243	0.19
244	0.19
245	0.19
246	0.19
247	0.19
248	0.18
249	0.18
250	0.13
251	0.09
252	0.09
253	0.1
254	0.09
255	0.1
256	0.1
257	0.08
258	0.08
259	0.07
260	0.07
261	0.06
262	0.05
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.03
267	0.04
268	0.04
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.07
273	0.07
274	0.08
275	0.15
276	0.22
277	0.23
278	0.27
279	0.29
280	0.3
281	0.35
282	0.41
283	0.41
284	0.42
285	0.47
286	0.49
287	0.51
288	0.49
289	0.52
290	0.46
291	0.42
292	0.37
293	0.33
294	0.28
295	0.24
296	0.25
297	0.17
298	0.16
299	0.15
300	0.14
301	0.13
302	0.15
303	0.18
304	0.18
305	0.28
306	0.32
307	0.37
308	0.43
309	0.47
310	0.45
311	0.5
312	0.56
313	0.51
314	0.52
315	0.48
316	0.42
317	0.38
318	0.42
319	0.34
320	0.27
321	0.25
322	0.22
323	0.26
324	0.27
325	0.27
326	0.23
327	0.27
328	0.27
329	0.25
330	0.24
331	0.19
332	0.19
333	0.19
334	0.18
335	0.15
336	0.14
337	0.15
338	0.14
339	0.12
340	0.12
341	0.14
342	0.15
343	0.16
344	0.18
345	0.17
346	0.19
347	0.19
348	0.19
349	0.18
350	0.19
351	0.18
352	0.17
353	0.16
354	0.14
355	0.13
356	0.12
357	0.09
358	0.06
359	0.05
360	0.05
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.03
365	0.03
366	0.04
367	0.03
368	0.03
369	0.03
370	0.04
371	0.03
372	0.03
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.05
378	0.05
379	0.06
380	0.06
381	0.07
382	0.09
383	0.1
384	0.12
385	0.13
386	0.17
387	0.2
388	0.27
389	0.33
390	0.35
391	0.39
392	0.43
393	0.46
394	0.49
395	0.5
396	0.48
397	0.44
398	0.41
399	0.36
400	0.32
401	0.26
402	0.2
403	0.15
404	0.1
405	0.07
406	0.07
407	0.08
408	0.08
409	0.08
410	0.07
411	0.08
412	0.08
413	0.08
414	0.09
415	0.1
416	0.17
417	0.25
418	0.34
419	0.43
420	0.49
421	0.59
422	0.64
423	0.66
424	0.68
425	0.7
426	0.69
427	0.69
428	0.7
429	0.69
430	0.66
431	0.7
432	0.7
433	0.68
434	0.63
435	0.66
436	0.63
437	0.6
438	0.62
439	0.58
440	0.55
441	0.49
442	0.48
443	0.41
444	0.37
445	0.32
446	0.29
447	0.24
448	0.19
449	0.18
450	0.15
451	0.12
452	0.12
453	0.12
454	0.12
455	0.11
456	0.12
457	0.13
458	0.15
459	0.18
460	0.16
461	0.16
462	0.17
463	0.22
464	0.3
465	0.34
466	0.4
467	0.43
468	0.47
469	0.52
470	0.6
471	0.61
472	0.62
473	0.66
474	0.66
475	0.67
476	0.66
477	0.61
478	0.54
479	0.5
480	0.46
481	0.41
482	0.37
483	0.33
484	0.3
485	0.3
486	0.26
487	0.27
488	0.24
489	0.21
490	0.19
491	0.17
492	0.19
493	0.22
494	0.24
495	0.23
496	0.23
497	0.29
498	0.35
499	0.4
500	0.4
501	0.42
502	0.45
503	0.53
504	0.59
505	0.6
506	0.59
507	0.64
508	0.67
509	0.69
510	0.74
511	0.72
512	0.74
513	0.75
514	0.76
515	0.73
516	0.75
517	0.74
518	0.75
519	0.69
520	0.61
521	0.53
522	0.47
523	0.39
524	0.33
525	0.35
526	0.28
527	0.27
528	0.29
529	0.27
530	0.3
531	0.39
532	0.46
533	0.46
534	0.52
535	0.62
536	0.7
537	0.79
538	0.84
539	0.86
540	0.88
541	0.88
542	0.87
543	0.83
544	0.75
545	0.65
546	0.57
547	0.51
548	0.42
549	0.36
550	0.27
551	0.23
552	0.23
553	0.25
554	0.25
555	0.26
556	0.27
557	0.31
558	0.31
559	0.3
560	0.29
561	0.3
562	0.29
563	0.28
564	0.34
565	0.33
566	0.37
567	0.39
568	0.38
569	0.36
570	0.39
571	0.45
572	0.45
573	0.44
574	0.44
575	0.51
576	0.56
577	0.58
578	0.54
579	0.46
580	0.42
581	0.41
582	0.4
583	0.34
584	0.3
585	0.29
586	0.33
587	0.35
588	0.39
589	0.38
590	0.41
591	0.37
592	0.36
593	0.36
594	0.32
595	0.33
596	0.27
597	0.29
598	0.26
599	0.29
600	0.27
601	0.25
602	0.23
603	0.19
604	0.18
605	0.15
606	0.11
607	0.07
608	0.06
609	0.05
610	0.06
611	0.12
612	0.17
613	0.19
614	0.23
615	0.27
616	0.35
617	0.42
618	0.51
619	0.55
620	0.62
621	0.7
622	0.76
623	0.82
624	0.79
625	0.81
626	0.77
627	0.73
628	0.64
629	0.58
630	0.5
631	0.4
632	0.39
633	0.34
634	0.29
635	0.24
636	0.21
637	0.18
638	0.17
639	0.17
640	0.14
641	0.13
642	0.12
643	0.13
644	0.14
645	0.14
646	0.13
647	0.12
648	0.13
649	0.13
650	0.13
651	0.13
652	0.14
653	0.17
654	0.19
655	0.19
656	0.19
657	0.18
658	0.18
659	0.19
660	0.22
661	0.25
662	0.25
663	0.28
664	0.27
665	0.28
666	0.29
667	0.27
668	0.22
669	0.16
670	0.13
671	0.1
672	0.11
673	0.09
674	0.06
675	0.06
676	0.05
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.07
681	0.1
682	0.11
683	0.15
684	0.17
685	0.17
686	0.2
687	0.21
688	0.21
689	0.23
690	0.28
691	0.25
692	0.28
693	0.34
694	0.38
695	0.46
696	0.53
697	0.53
698	0.56
699	0.55
700	0.59
701	0.59
702	0.56
703	0.57
704	0.58
705	0.62
706	0.6
707	0.61
708	0.57
709	0.53
710	0.55
711	0.49
712	0.43
713	0.43
714	0.42

A0A2V1C8H0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer