FuNGI

A0A0D1DW92

Protein Details

Accession

A0A0D1DW92

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
521-544	DEEVREREERRRKRDEEKAEADRM	Acidic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
126-139	RGGRGRGRGGARPP
243-259	KESKKDKQKAADARQKK
530-534	RRRKR

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
KEGG	uma:UMAG_04870 -
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSDPSQQTSGSSSTGQTNDGAPSGRLTRPARPLPGVASLRGAAPLRGGPGRGAFVSSSASMVPSRSSYASSAPGAPGPATMGSGTRMQFRPVMPQRRKASESPAPPSSNTIESSNASSPSSHSGIRGGRGRGRGGARPPRQPVQMTASGPFALGPSARPTGKKIVPLGPGGSSLTPAGSADSSRSNTPAKLDPDRASYRNPDKLKDAEQYSDPEDGDIEIVDLDEVHILDELAPRALPRVAEKESKKDKQKAADARQKKVDGRILKEERDANPSAAIRVKSEDPDDIMASLEPSSTVISSASVTPQPEDASKINSADALDLSESEGEELMDDLVDDFVFHDDDDVNPENRLYLFQFPQLFPHFKPLKKSKATDIKATTSTTDASAKRRNVSFAEGTTGGPGLTGKDDPSATASSSEIDSDSDSSIADSEADDKKHKSKLSTSSKAEGLIGKLNVYRDGRVFLRFGQDLVMEVTGGSQSTFLQQVMLLDSTNSTATNLGELHRKFIVSPEVDCMLNDISLYDEEVREREERRRKRDEEKAEADRMRYGGAGSGFGGLGGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.24
3	0.22
4	0.22
5	0.21
6	0.21
7	0.21
8	0.16
9	0.18
10	0.22
11	0.22
12	0.29
13	0.31
14	0.37
15	0.45
16	0.51
17	0.53
18	0.52
19	0.53
20	0.48
21	0.54
22	0.48
23	0.4
24	0.36
25	0.31
26	0.28
27	0.29
28	0.26
29	0.17
30	0.16
31	0.17
32	0.18
33	0.19
34	0.19
35	0.17
36	0.19
37	0.21
38	0.19
39	0.2
40	0.16
41	0.15
42	0.17
43	0.15
44	0.14
45	0.12
46	0.13
47	0.12
48	0.12
49	0.13
50	0.12
51	0.15
52	0.15
53	0.17
54	0.17
55	0.19
56	0.22
57	0.23
58	0.23
59	0.21
60	0.21
61	0.2
62	0.18
63	0.16
64	0.13
65	0.12
66	0.11
67	0.1
68	0.1
69	0.11
70	0.15
71	0.15
72	0.21
73	0.21
74	0.22
75	0.26
76	0.26
77	0.35
78	0.41
79	0.51
80	0.51
81	0.59
82	0.64
83	0.68
84	0.72
85	0.64
86	0.63
87	0.6
88	0.61
89	0.59
90	0.59
91	0.53
92	0.49
93	0.5
94	0.44
95	0.38
96	0.33
97	0.28
98	0.24
99	0.23
100	0.27
101	0.25
102	0.23
103	0.21
104	0.19
105	0.19
106	0.21
107	0.22
108	0.18
109	0.17
110	0.21
111	0.23
112	0.28
113	0.32
114	0.31
115	0.34
116	0.37
117	0.37
118	0.38
119	0.39
120	0.39
121	0.43
122	0.5
123	0.5
124	0.55
125	0.59
126	0.58
127	0.59
128	0.55
129	0.5
130	0.46
131	0.47
132	0.41
133	0.36
134	0.33
135	0.28
136	0.27
137	0.22
138	0.15
139	0.1
140	0.08
141	0.08
142	0.1
143	0.14
144	0.15
145	0.16
146	0.2
147	0.27
148	0.3
149	0.33
150	0.34
151	0.36
152	0.38
153	0.38
154	0.36
155	0.29
156	0.27
157	0.23
158	0.19
159	0.14
160	0.11
161	0.09
162	0.08
163	0.07
164	0.07
165	0.06
166	0.06
167	0.07
168	0.11
169	0.13
170	0.13
171	0.16
172	0.17
173	0.17
174	0.2
175	0.24
176	0.26
177	0.29
178	0.33
179	0.33
180	0.38
181	0.42
182	0.41
183	0.38
184	0.41
185	0.42
186	0.46
187	0.46
188	0.41
189	0.41
190	0.42
191	0.43
192	0.41
193	0.37
194	0.31
195	0.31
196	0.31
197	0.29
198	0.27
199	0.23
200	0.17
201	0.15
202	0.13
203	0.11
204	0.08
205	0.06
206	0.04
207	0.04
208	0.03
209	0.03
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.04
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.07
223	0.08
224	0.08
225	0.09
226	0.13
227	0.16
228	0.24
229	0.26
230	0.34
231	0.42
232	0.49
233	0.55
234	0.57
235	0.58
236	0.58
237	0.65
238	0.65
239	0.66
240	0.69
241	0.67
242	0.64
243	0.65
244	0.61
245	0.54
246	0.49
247	0.46
248	0.41
249	0.39
250	0.45
251	0.43
252	0.4
253	0.42
254	0.41
255	0.36
256	0.36
257	0.33
258	0.24
259	0.22
260	0.21
261	0.19
262	0.19
263	0.18
264	0.13
265	0.14
266	0.14
267	0.14
268	0.15
269	0.14
270	0.11
271	0.12
272	0.12
273	0.1
274	0.09
275	0.08
276	0.07
277	0.06
278	0.05
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.05
286	0.05
287	0.06
288	0.07
289	0.08
290	0.08
291	0.08
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.12
296	0.12
297	0.13
298	0.14
299	0.14
300	0.13
301	0.13
302	0.13
303	0.1
304	0.09
305	0.07
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.03
317	0.03
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.1
331	0.12
332	0.12
333	0.12
334	0.12
335	0.12
336	0.12
337	0.13
338	0.11
339	0.13
340	0.13
341	0.17
342	0.2
343	0.2
344	0.24
345	0.27
346	0.28
347	0.24
348	0.33
349	0.35
350	0.34
351	0.43
352	0.47
353	0.52
354	0.56
355	0.58
356	0.57
357	0.62
358	0.63
359	0.63
360	0.59
361	0.53
362	0.49
363	0.48
364	0.39
365	0.29
366	0.27
367	0.21
368	0.22
369	0.2
370	0.24
371	0.3
372	0.32
373	0.36
374	0.36
375	0.38
376	0.34
377	0.37
378	0.34
379	0.27
380	0.28
381	0.25
382	0.23
383	0.21
384	0.19
385	0.13
386	0.1
387	0.1
388	0.06
389	0.07
390	0.08
391	0.08
392	0.1
393	0.1
394	0.1
395	0.13
396	0.14
397	0.12
398	0.13
399	0.13
400	0.11
401	0.12
402	0.12
403	0.09
404	0.08
405	0.09
406	0.09
407	0.09
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.08
412	0.07
413	0.06
414	0.05
415	0.1
416	0.13
417	0.15
418	0.18
419	0.21
420	0.26
421	0.32
422	0.35
423	0.35
424	0.39
425	0.47
426	0.55
427	0.61
428	0.61
429	0.6
430	0.58
431	0.55
432	0.49
433	0.4
434	0.32
435	0.28
436	0.23
437	0.2
438	0.2
439	0.21
440	0.24
441	0.24
442	0.23
443	0.19
444	0.23
445	0.23
446	0.24
447	0.24
448	0.21
449	0.25
450	0.24
451	0.23
452	0.2
453	0.19
454	0.17
455	0.17
456	0.16
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.07
461	0.07
462	0.06
463	0.05
464	0.05
465	0.08
466	0.09
467	0.09
468	0.09
469	0.09
470	0.1
471	0.12
472	0.13
473	0.11
474	0.09
475	0.1
476	0.11
477	0.11
478	0.1
479	0.08
480	0.09
481	0.09
482	0.11
483	0.11
484	0.12
485	0.2
486	0.2
487	0.23
488	0.23
489	0.23
490	0.21
491	0.25
492	0.32
493	0.26
494	0.27
495	0.28
496	0.29
497	0.28
498	0.28
499	0.26
500	0.19
501	0.16
502	0.15
503	0.1
504	0.1
505	0.1
506	0.13
507	0.12
508	0.11
509	0.13
510	0.14
511	0.17
512	0.19
513	0.22
514	0.3
515	0.4
516	0.49
517	0.57
518	0.66
519	0.7
520	0.77
521	0.84
522	0.84
523	0.83
524	0.83
525	0.81
526	0.8
527	0.76
528	0.67
529	0.6
530	0.51
531	0.41
532	0.32
533	0.25
534	0.2
535	0.18
536	0.17
537	0.14
538	0.15
539	0.13

A0A0D1DW92

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer