FuNGI

A0A2V1CXE0

Protein Details

Accession

A0A2V1CXE0

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-23	SGNPNMQKLGKKKNSAKQPDWL	Hydrophilic
37-65	ATPTPQTQDRSKNKKDKQLAKDLLKRRAA	Hydrophilic
140-164	EEVAAKKQKVDKKKAKKQESSSSES	Hydrophilic
444-468	PPLPPDPVLKRKKTNEPFSRIPKDI	Hydrophilic
492-520	LIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYKGGYIDVE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
50-53	KKDK
57-57	K
60-63	LKRR
145-156	KKQKVDKKKAKK
499-511	GFTKEKNKKKRGS

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MSGNPNMQKLGKKKNSAKQPDWLFPAAGKPVAAVAVATPTPQTQDRSKNKKDKQLAKDLLKRRAAGEPAKSSPPPQLLELVGAFLTEYEFSGASQALKTEREKRGEKASKVEGIPSLSTVFSEWSTLKGENKVVDKDVGEEVAAKKQKVDKKKAKKQESSSSESSSSSDEDSDEDSDVEMADAPPAMKVTSKRSSSSSSSSSSSSSDSDADDEKEVPVVKAASHKAKVNNLKRKAESSSDSSSSGSDSSSEDEAPKLKKAKTAASSSSDSSSSDSSADSSSDSSSDSSSDEDTKTKKTKDAKKVSDNGSSSSSSDSDSSSSSDSDSDSDSSTNSIAQKTPLPDSDSDSSSSDSDSSDSDSAKDAKKRKPVASSDTSATLSDGPKKSAASSSDSSSDSSSSDSDDDEVRTVTKTVTTTTKDSEGEPKVVKVTKTVTTSKAHELDPPLPPDPVLKRKKTNEPFSRIPKDIKVDDRLASNAYVPYDYAQKAHEDLIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYKGGYIDVEGKKGIKFTD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.75
2	0.82
3	0.85
4	0.81
5	0.8
6	0.79
7	0.76
8	0.72
9	0.65
10	0.55
11	0.46
12	0.46
13	0.39
14	0.32
15	0.25
16	0.19
17	0.17
18	0.16
19	0.15
20	0.1
21	0.07
22	0.1
23	0.1
24	0.1
25	0.1
26	0.1
27	0.14
28	0.17
29	0.21
30	0.25
31	0.36
32	0.47
33	0.56
34	0.66
35	0.74
36	0.79
37	0.85
38	0.87
39	0.87
40	0.85
41	0.86
42	0.85
43	0.84
44	0.86
45	0.84
46	0.83
47	0.77
48	0.7
49	0.61
50	0.59
51	0.55
52	0.52
53	0.52
54	0.49
55	0.48
56	0.52
57	0.5
58	0.45
59	0.45
60	0.43
61	0.37
62	0.32
63	0.31
64	0.26
65	0.28
66	0.26
67	0.21
68	0.15
69	0.13
70	0.11
71	0.08
72	0.08
73	0.06
74	0.06
75	0.06
76	0.06
77	0.06
78	0.08
79	0.08
80	0.09
81	0.09
82	0.1
83	0.11
84	0.15
85	0.2
86	0.28
87	0.34
88	0.41
89	0.44
90	0.47
91	0.56
92	0.61
93	0.6
94	0.58
95	0.57
96	0.55
97	0.52
98	0.5
99	0.41
100	0.35
101	0.32
102	0.26
103	0.22
104	0.15
105	0.15
106	0.13
107	0.12
108	0.09
109	0.11
110	0.1
111	0.11
112	0.14
113	0.15
114	0.18
115	0.2
116	0.22
117	0.24
118	0.28
119	0.28
120	0.27
121	0.27
122	0.24
123	0.24
124	0.22
125	0.18
126	0.14
127	0.14
128	0.14
129	0.2
130	0.22
131	0.2
132	0.22
133	0.29
134	0.36
135	0.43
136	0.53
137	0.56
138	0.65
139	0.75
140	0.83
141	0.86
142	0.89
143	0.87
144	0.86
145	0.83
146	0.79
147	0.72
148	0.65
149	0.56
150	0.47
151	0.4
152	0.3
153	0.24
154	0.17
155	0.14
156	0.11
157	0.11
158	0.12
159	0.12
160	0.11
161	0.1
162	0.09
163	0.09
164	0.08
165	0.07
166	0.06
167	0.05
168	0.04
169	0.05
170	0.05
171	0.05
172	0.05
173	0.05
174	0.07
175	0.1
176	0.17
177	0.24
178	0.26
179	0.28
180	0.31
181	0.35
182	0.37
183	0.39
184	0.35
185	0.31
186	0.3
187	0.29
188	0.27
189	0.24
190	0.21
191	0.17
192	0.15
193	0.13
194	0.12
195	0.12
196	0.13
197	0.13
198	0.12
199	0.12
200	0.1
201	0.11
202	0.11
203	0.1
204	0.09
205	0.08
206	0.08
207	0.12
208	0.16
209	0.19
210	0.21
211	0.25
212	0.27
213	0.34
214	0.44
215	0.49
216	0.56
217	0.58
218	0.61
219	0.59
220	0.59
221	0.55
222	0.49
223	0.42
224	0.38
225	0.35
226	0.31
227	0.3
228	0.27
229	0.24
230	0.2
231	0.17
232	0.12
233	0.08
234	0.07
235	0.08
236	0.09
237	0.09
238	0.09
239	0.09
240	0.12
241	0.13
242	0.16
243	0.18
244	0.18
245	0.21
246	0.23
247	0.29
248	0.31
249	0.34
250	0.33
251	0.33
252	0.35
253	0.32
254	0.31
255	0.25
256	0.21
257	0.17
258	0.15
259	0.11
260	0.09
261	0.08
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.08
276	0.1
277	0.1
278	0.12
279	0.14
280	0.19
281	0.24
282	0.24
283	0.29
284	0.37
285	0.46
286	0.54
287	0.63
288	0.65
289	0.68
290	0.75
291	0.73
292	0.71
293	0.62
294	0.53
295	0.46
296	0.38
297	0.3
298	0.24
299	0.2
300	0.14
301	0.14
302	0.12
303	0.1
304	0.1
305	0.11
306	0.1
307	0.1
308	0.09
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.1
313	0.09
314	0.09
315	0.09
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.1
320	0.1
321	0.11
322	0.11
323	0.12
324	0.15
325	0.17
326	0.19
327	0.19
328	0.2
329	0.2
330	0.25
331	0.26
332	0.24
333	0.24
334	0.22
335	0.21
336	0.19
337	0.18
338	0.14
339	0.11
340	0.1
341	0.09
342	0.11
343	0.11
344	0.11
345	0.11
346	0.13
347	0.16
348	0.2
349	0.26
350	0.31
351	0.37
352	0.46
353	0.52
354	0.55
355	0.6
356	0.62
357	0.63
358	0.62
359	0.59
360	0.52
361	0.47
362	0.43
363	0.34
364	0.29
365	0.23
366	0.19
367	0.23
368	0.22
369	0.21
370	0.22
371	0.22
372	0.23
373	0.24
374	0.25
375	0.24
376	0.24
377	0.25
378	0.27
379	0.27
380	0.27
381	0.23
382	0.22
383	0.16
384	0.15
385	0.13
386	0.11
387	0.11
388	0.1
389	0.11
390	0.12
391	0.12
392	0.12
393	0.12
394	0.11
395	0.11
396	0.12
397	0.11
398	0.12
399	0.12
400	0.14
401	0.19
402	0.23
403	0.25
404	0.27
405	0.31
406	0.29
407	0.3
408	0.36
409	0.33
410	0.34
411	0.32
412	0.31
413	0.32
414	0.34
415	0.33
416	0.28
417	0.29
418	0.3
419	0.34
420	0.37
421	0.36
422	0.38
423	0.41
424	0.45
425	0.44
426	0.39
427	0.38
428	0.39
429	0.4
430	0.4
431	0.41
432	0.35
433	0.32
434	0.31
435	0.33
436	0.36
437	0.41
438	0.45
439	0.48
440	0.56
441	0.63
442	0.74
443	0.78
444	0.82
445	0.81
446	0.8
447	0.82
448	0.83
449	0.83
450	0.76
451	0.71
452	0.66
453	0.63
454	0.61
455	0.58
456	0.54
457	0.51
458	0.48
459	0.46
460	0.42
461	0.37
462	0.31
463	0.27
464	0.22
465	0.19
466	0.18
467	0.15
468	0.15
469	0.19
470	0.19
471	0.18
472	0.17
473	0.19
474	0.2
475	0.21
476	0.22
477	0.18
478	0.18
479	0.24
480	0.27
481	0.25
482	0.25
483	0.26
484	0.25
485	0.29
486	0.34
487	0.37
488	0.44
489	0.55
490	0.64
491	0.73
492	0.82
493	0.85
494	0.9
495	0.91
496	0.9
497	0.9
498	0.88
499	0.87
500	0.86
501	0.82
502	0.72
503	0.64
504	0.62
505	0.53
506	0.47
507	0.38
508	0.31
509	0.27

A0A2V1CXE0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer