Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A8NCP3

Protein Details
Accession A8NCP3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-70LSEYRGRKRKEFEERIRRTRGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-60RKRKEF
63-63R
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 10.5, cyto_mito 7.5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG cci:CC1G_03601  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF13431  TPR_17  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MQDGRAPRIKNRAPAAIQITAEQLLREAQERQETAFRAPKQRVEDFEELSEYRGRKRKEFEERIRRTRGSIKEWLQYANWEASQNEFARSRSVFERALDVDPRSIQLWLSYTEMELKNRNVQHARNLFDRAVTLLPRVDQLWYKYVYLEELLQNIPGARQVFERWMQWEPDDKAWQAYIKLEERYQEYDRASAIYERWIAVRPEPRAWVKWAKFEEDRGRLDKAREVFQTALEFFGDDEEQVEKAQAVFGAFARMETRQKEYDRARVIYKFALDRIPRSKSAGLYASYTKFEKQHGTKSTLENTVLGKRRIQYEEELSHDGRNYDAWFDYTRLEEGAWRDLKDEGATAEELEAATGRVREVYERAVAQVPPGGEKRHWRRYIFLWLNYALFEEIETKDYQRAREIYQTAIKLVPHKQFTFAKLWLMYAKFEVRRLELQSARRILGTAIGMCPKEALFKGYIDLEIELREFDRVRTLYEKYLEFDPSNSPAWIKYAELEAQLQDFARCRAIFELGVSQSPLSMPEILWKAYIDFEIEEGEREAARALYERLIALSGHVKVWISYATFEAEPIPLPRAEREEEEDEEEDEEAERKMVPGDPTIARQVFERGYKDLKSKGLKDERVALLEVWKTFEENYGTSETVNKVEGMKPVITKRRHVDPETGGMVEDWDLVFPDDEKEKNPTSFKFLQMAHKWKQSQASKTQTQASESTTSSAPETSRSSMQVDQDEGSVASSDDESS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.61
3 0.55
4 0.5
5 0.42
6 0.39
7 0.31
8 0.29
9 0.21
10 0.16
11 0.13
12 0.14
13 0.15
14 0.16
15 0.18
16 0.25
17 0.26
18 0.29
19 0.33
20 0.34
21 0.38
22 0.44
23 0.46
24 0.47
25 0.51
26 0.54
27 0.56
28 0.6
29 0.58
30 0.58
31 0.58
32 0.52
33 0.49
34 0.46
35 0.39
36 0.36
37 0.36
38 0.29
39 0.32
40 0.37
41 0.39
42 0.42
43 0.5
44 0.58
45 0.64
46 0.74
47 0.76
48 0.8
49 0.86
50 0.87
51 0.88
52 0.79
53 0.72
54 0.7
55 0.67
56 0.63
57 0.63
58 0.6
59 0.58
60 0.59
61 0.56
62 0.48
63 0.43
64 0.39
65 0.33
66 0.29
67 0.24
68 0.23
69 0.23
70 0.28
71 0.26
72 0.27
73 0.25
74 0.24
75 0.27
76 0.28
77 0.28
78 0.26
79 0.29
80 0.28
81 0.26
82 0.31
83 0.29
84 0.32
85 0.32
86 0.3
87 0.28
88 0.26
89 0.27
90 0.23
91 0.2
92 0.16
93 0.15
94 0.15
95 0.14
96 0.16
97 0.15
98 0.14
99 0.21
100 0.23
101 0.25
102 0.27
103 0.28
104 0.34
105 0.36
106 0.43
107 0.41
108 0.42
109 0.49
110 0.51
111 0.51
112 0.48
113 0.5
114 0.42
115 0.37
116 0.35
117 0.27
118 0.23
119 0.2
120 0.18
121 0.15
122 0.15
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.17
127 0.19
128 0.22
129 0.23
130 0.23
131 0.22
132 0.22
133 0.21
134 0.19
135 0.18
136 0.15
137 0.15
138 0.15
139 0.14
140 0.14
141 0.13
142 0.12
143 0.13
144 0.12
145 0.11
146 0.12
147 0.14
148 0.18
149 0.21
150 0.22
151 0.22
152 0.24
153 0.25
154 0.25
155 0.31
156 0.3
157 0.33
158 0.34
159 0.32
160 0.3
161 0.3
162 0.29
163 0.23
164 0.22
165 0.22
166 0.22
167 0.24
168 0.24
169 0.25
170 0.27
171 0.32
172 0.31
173 0.31
174 0.28
175 0.27
176 0.26
177 0.24
178 0.22
179 0.18
180 0.16
181 0.15
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.18
186 0.18
187 0.22
188 0.28
189 0.27
190 0.29
191 0.34
192 0.36
193 0.35
194 0.4
195 0.44
196 0.4
197 0.45
198 0.44
199 0.45
200 0.43
201 0.48
202 0.51
203 0.47
204 0.49
205 0.44
206 0.46
207 0.43
208 0.42
209 0.4
210 0.34
211 0.32
212 0.29
213 0.3
214 0.27
215 0.25
216 0.27
217 0.22
218 0.2
219 0.15
220 0.14
221 0.1
222 0.11
223 0.09
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.06
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.11
242 0.14
243 0.15
244 0.19
245 0.23
246 0.24
247 0.32
248 0.35
249 0.41
250 0.43
251 0.43
252 0.42
253 0.39
254 0.4
255 0.34
256 0.32
257 0.25
258 0.21
259 0.25
260 0.23
261 0.26
262 0.3
263 0.32
264 0.3
265 0.33
266 0.34
267 0.28
268 0.31
269 0.29
270 0.24
271 0.23
272 0.25
273 0.22
274 0.22
275 0.22
276 0.2
277 0.19
278 0.2
279 0.25
280 0.25
281 0.32
282 0.35
283 0.39
284 0.41
285 0.43
286 0.44
287 0.39
288 0.36
289 0.29
290 0.27
291 0.29
292 0.3
293 0.28
294 0.26
295 0.25
296 0.29
297 0.3
298 0.3
299 0.26
300 0.28
301 0.29
302 0.3
303 0.32
304 0.28
305 0.26
306 0.25
307 0.21
308 0.15
309 0.14
310 0.11
311 0.09
312 0.08
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.11
317 0.11
318 0.11
319 0.1
320 0.09
321 0.1
322 0.1
323 0.16
324 0.16
325 0.16
326 0.16
327 0.16
328 0.17
329 0.15
330 0.14
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.07
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.11
352 0.12
353 0.12
354 0.11
355 0.12
356 0.1
357 0.11
358 0.12
359 0.12
360 0.12
361 0.21
362 0.29
363 0.37
364 0.42
365 0.41
366 0.43
367 0.46
368 0.55
369 0.51
370 0.45
371 0.38
372 0.33
373 0.32
374 0.29
375 0.26
376 0.15
377 0.09
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.13
385 0.15
386 0.15
387 0.17
388 0.18
389 0.18
390 0.24
391 0.25
392 0.24
393 0.27
394 0.26
395 0.24
396 0.23
397 0.22
398 0.19
399 0.24
400 0.26
401 0.26
402 0.26
403 0.29
404 0.3
405 0.33
406 0.34
407 0.29
408 0.26
409 0.23
410 0.23
411 0.21
412 0.2
413 0.17
414 0.14
415 0.18
416 0.16
417 0.19
418 0.19
419 0.19
420 0.22
421 0.24
422 0.28
423 0.28
424 0.31
425 0.35
426 0.35
427 0.33
428 0.3
429 0.27
430 0.22
431 0.19
432 0.16
433 0.11
434 0.1
435 0.12
436 0.12
437 0.12
438 0.12
439 0.09
440 0.11
441 0.1
442 0.11
443 0.1
444 0.1
445 0.12
446 0.12
447 0.12
448 0.1
449 0.11
450 0.09
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.06
455 0.08
456 0.07
457 0.07
458 0.12
459 0.12
460 0.14
461 0.18
462 0.2
463 0.22
464 0.25
465 0.26
466 0.22
467 0.24
468 0.25
469 0.21
470 0.21
471 0.19
472 0.19
473 0.2
474 0.18
475 0.16
476 0.14
477 0.15
478 0.15
479 0.13
480 0.1
481 0.11
482 0.12
483 0.13
484 0.14
485 0.12
486 0.12
487 0.12
488 0.11
489 0.1
490 0.1
491 0.1
492 0.13
493 0.12
494 0.13
495 0.13
496 0.15
497 0.14
498 0.14
499 0.18
500 0.15
501 0.16
502 0.15
503 0.14
504 0.12
505 0.12
506 0.11
507 0.08
508 0.08
509 0.07
510 0.12
511 0.15
512 0.15
513 0.15
514 0.15
515 0.14
516 0.14
517 0.14
518 0.1
519 0.08
520 0.08
521 0.09
522 0.09
523 0.09
524 0.09
525 0.1
526 0.09
527 0.09
528 0.09
529 0.07
530 0.07
531 0.08
532 0.09
533 0.09
534 0.1
535 0.1
536 0.1
537 0.11
538 0.1
539 0.1
540 0.12
541 0.12
542 0.11
543 0.12
544 0.12
545 0.11
546 0.12
547 0.12
548 0.09
549 0.09
550 0.1
551 0.12
552 0.12
553 0.12
554 0.12
555 0.11
556 0.11
557 0.12
558 0.13
559 0.12
560 0.13
561 0.15
562 0.18
563 0.2
564 0.22
565 0.26
566 0.28
567 0.29
568 0.32
569 0.31
570 0.27
571 0.25
572 0.23
573 0.17
574 0.13
575 0.12
576 0.09
577 0.08
578 0.07
579 0.07
580 0.08
581 0.12
582 0.13
583 0.14
584 0.19
585 0.2
586 0.22
587 0.29
588 0.28
589 0.24
590 0.24
591 0.26
592 0.25
593 0.28
594 0.28
595 0.26
596 0.29
597 0.32
598 0.36
599 0.37
600 0.41
601 0.43
602 0.45
603 0.51
604 0.57
605 0.58
606 0.56
607 0.6
608 0.55
609 0.5
610 0.47
611 0.37
612 0.32
613 0.3
614 0.28
615 0.22
616 0.2
617 0.18
618 0.17
619 0.21
620 0.19
621 0.16
622 0.19
623 0.2
624 0.2
625 0.19
626 0.22
627 0.2
628 0.19
629 0.19
630 0.17
631 0.16
632 0.18
633 0.22
634 0.22
635 0.23
636 0.26
637 0.34
638 0.42
639 0.43
640 0.48
641 0.5
642 0.57
643 0.62
644 0.61
645 0.6
646 0.56
647 0.59
648 0.54
649 0.49
650 0.39
651 0.31
652 0.28
653 0.2
654 0.17
655 0.09
656 0.07
657 0.07
658 0.08
659 0.08
660 0.08
661 0.11
662 0.14
663 0.16
664 0.18
665 0.23
666 0.27
667 0.32
668 0.37
669 0.36
670 0.41
671 0.44
672 0.46
673 0.47
674 0.46
675 0.51
676 0.55
677 0.61
678 0.6
679 0.64
680 0.62
681 0.6
682 0.66
683 0.63
684 0.62
685 0.64
686 0.66
687 0.64
688 0.66
689 0.69
690 0.62
691 0.57
692 0.51
693 0.46
694 0.41
695 0.35
696 0.34
697 0.27
698 0.26
699 0.23
700 0.23
701 0.19
702 0.19
703 0.23
704 0.24
705 0.26
706 0.27
707 0.3
708 0.32
709 0.36
710 0.36
711 0.34
712 0.31
713 0.29
714 0.28
715 0.23
716 0.2
717 0.15
718 0.12
719 0.1