Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CFQ4

Protein Details
Accession A0A0D1CFQ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
262-290ASQVTEQKKETKRKVKSEDDNKSKKSKKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-290KETKRKVKSEDDNKSKKSKKV
Subcellular Location(s) nucl 15, mito_nucl 11.999, cyto_nucl 11.333, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
KEGG uma:UMAG_00266  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MSKRSRSDSEASSSSSSTGGSSVEAQTASVSTAKHPASRNPSNIGYRPPRGFERVSFSTSSPFLEKKLSDSKQQQLWAVRIPAGVSPAQLDGVVIDLPHESCDVQTASKPLGTISVPTSTCTDAATYNFYASVPSALKGKSKKSQSSADSQLICMALESASVQSEDDRVAAGVGAASELKSLHLLVPAGDGNEVGKLVMAPVKISRCIHLSIASPAETSRAQKVKETSNTFEEKKLPRQPWHLLKGNFQPAGSRSNTASESASQVTEQKKETKRKVKSEDDNKSKKSKKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.27
3 0.23
4 0.16
5 0.14
6 0.1
7 0.09
8 0.11
9 0.11
10 0.13
11 0.12
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.11
17 0.11
18 0.11
19 0.18
20 0.19
21 0.24
22 0.27
23 0.34
24 0.41
25 0.48
26 0.51
27 0.5
28 0.55
29 0.56
30 0.56
31 0.57
32 0.55
33 0.54
34 0.53
35 0.51
36 0.5
37 0.48
38 0.48
39 0.42
40 0.43
41 0.4
42 0.4
43 0.38
44 0.34
45 0.33
46 0.31
47 0.29
48 0.24
49 0.21
50 0.2
51 0.22
52 0.22
53 0.24
54 0.33
55 0.33
56 0.38
57 0.44
58 0.49
59 0.49
60 0.52
61 0.5
62 0.45
63 0.45
64 0.41
65 0.36
66 0.3
67 0.25
68 0.23
69 0.19
70 0.17
71 0.15
72 0.11
73 0.1
74 0.09
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.05
79 0.06
80 0.06
81 0.04
82 0.04
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.12
97 0.09
98 0.11
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.14
103 0.14
104 0.15
105 0.17
106 0.15
107 0.15
108 0.14
109 0.13
110 0.09
111 0.1
112 0.12
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.1
120 0.07
121 0.07
122 0.09
123 0.1
124 0.14
125 0.17
126 0.22
127 0.26
128 0.32
129 0.35
130 0.38
131 0.44
132 0.43
133 0.46
134 0.47
135 0.45
136 0.39
137 0.34
138 0.31
139 0.24
140 0.21
141 0.15
142 0.1
143 0.05
144 0.04
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.04
182 0.04
183 0.03
184 0.04
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.1
189 0.12
190 0.16
191 0.17
192 0.18
193 0.19
194 0.21
195 0.21
196 0.2
197 0.2
198 0.2
199 0.21
200 0.2
201 0.17
202 0.15
203 0.17
204 0.16
205 0.16
206 0.21
207 0.23
208 0.24
209 0.29
210 0.33
211 0.39
212 0.46
213 0.5
214 0.47
215 0.48
216 0.53
217 0.5
218 0.5
219 0.48
220 0.45
221 0.48
222 0.53
223 0.54
224 0.55
225 0.61
226 0.67
227 0.69
228 0.72
229 0.72
230 0.65
231 0.65
232 0.67
233 0.68
234 0.59
235 0.5
236 0.45
237 0.38
238 0.41
239 0.36
240 0.3
241 0.23
242 0.25
243 0.27
244 0.25
245 0.25
246 0.21
247 0.22
248 0.21
249 0.21
250 0.18
251 0.22
252 0.24
253 0.26
254 0.28
255 0.34
256 0.42
257 0.52
258 0.62
259 0.67
260 0.73
261 0.79
262 0.85
263 0.86
264 0.88
265 0.89
266 0.89
267 0.9
268 0.9
269 0.85
270 0.86