Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V1CKM6

Protein Details
Accession A0A2V1CKM6    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-106RTLKAGKRKRADKEGDGKKPKEAKRDKKKRARRDDDEDPDGBasic
108-131VLDGKRTKKPKSVRSDREKGDKPRBasic
158-180MDAALKNPNKRRRKKDEVDLEEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-98KAGKRKRADKEGDGKKPKEAKRDKKKRARR
111-137GKRTKKPKSVRSDREKGDKPRERRPPT
149-172RRRRALDKAMDAALKNPNKRRRKK
425-428GKKR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDEERDTPPPPAADPDLDMDNEENDVSDNESELSEVDEAEFAEFDPTTVALEDRPLVGIDEDVARTLKAGKRKRADKEGDGKKPKEAKRDKKKRARRDDDEDPDGQVLDGKRTKKPKSVRSDREKGDKPRERRPPTPENEENLTPDERRRRALDKAMDAALKNPNKRRRKKDEVDLEEAFDDEIAALKIRMEQACEADNSAREQGKPALQKLKMLPEVVALLNRNTVQHSIVDPDTNFLQSVKFFLEPLNDGSLPAYNIQRDLFAALTKLPIEKEALLSSGIGKVVLYYTKSKKPEIGIKRTAERLLGEWSRPILKRSDDYKKRKVVTREFDHQAAALAHRPSGTQSSQMAPSQRIALSQKELERERVLAQPNRSTRARVESGNTSYTIAPKSTFDASKGLDPSSRPIGAGGMEAFRKMTAKQGKKRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.28
4 0.26
5 0.25
6 0.25
7 0.2
8 0.17
9 0.16
10 0.13
11 0.11
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.1
16 0.1
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.09
21 0.11
22 0.09
23 0.08
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.09
28 0.09
29 0.07
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.09
38 0.07
39 0.09
40 0.1
41 0.1
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.15
55 0.18
56 0.25
57 0.34
58 0.43
59 0.52
60 0.61
61 0.69
62 0.74
63 0.78
64 0.78
65 0.8
66 0.8
67 0.81
68 0.82
69 0.75
70 0.73
71 0.74
72 0.7
73 0.71
74 0.71
75 0.72
76 0.74
77 0.84
78 0.87
79 0.89
80 0.94
81 0.94
82 0.95
83 0.94
84 0.92
85 0.89
86 0.89
87 0.85
88 0.8
89 0.69
90 0.59
91 0.49
92 0.4
93 0.31
94 0.23
95 0.16
96 0.17
97 0.21
98 0.23
99 0.29
100 0.38
101 0.42
102 0.48
103 0.57
104 0.6
105 0.66
106 0.75
107 0.79
108 0.8
109 0.85
110 0.82
111 0.82
112 0.81
113 0.79
114 0.79
115 0.77
116 0.73
117 0.74
118 0.79
119 0.77
120 0.75
121 0.75
122 0.74
123 0.72
124 0.75
125 0.71
126 0.64
127 0.62
128 0.55
129 0.49
130 0.41
131 0.37
132 0.28
133 0.29
134 0.33
135 0.3
136 0.32
137 0.35
138 0.36
139 0.4
140 0.47
141 0.47
142 0.43
143 0.43
144 0.42
145 0.39
146 0.35
147 0.32
148 0.32
149 0.3
150 0.31
151 0.37
152 0.45
153 0.53
154 0.63
155 0.71
156 0.73
157 0.79
158 0.82
159 0.84
160 0.85
161 0.81
162 0.78
163 0.68
164 0.59
165 0.48
166 0.4
167 0.3
168 0.19
169 0.12
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.1
181 0.11
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.14
189 0.13
190 0.12
191 0.14
192 0.15
193 0.19
194 0.21
195 0.23
196 0.27
197 0.26
198 0.3
199 0.3
200 0.34
201 0.31
202 0.29
203 0.25
204 0.18
205 0.2
206 0.17
207 0.16
208 0.11
209 0.09
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.12
221 0.11
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.1
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.11
236 0.13
237 0.15
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.13
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.09
250 0.1
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.11
263 0.1
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.09
269 0.09
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.08
275 0.09
276 0.15
277 0.2
278 0.27
279 0.3
280 0.31
281 0.34
282 0.38
283 0.46
284 0.49
285 0.53
286 0.54
287 0.55
288 0.58
289 0.57
290 0.53
291 0.45
292 0.36
293 0.28
294 0.28
295 0.26
296 0.23
297 0.21
298 0.22
299 0.26
300 0.26
301 0.26
302 0.24
303 0.25
304 0.3
305 0.37
306 0.46
307 0.51
308 0.59
309 0.67
310 0.71
311 0.73
312 0.74
313 0.76
314 0.75
315 0.75
316 0.74
317 0.72
318 0.68
319 0.64
320 0.57
321 0.47
322 0.39
323 0.3
324 0.24
325 0.21
326 0.17
327 0.16
328 0.16
329 0.16
330 0.16
331 0.2
332 0.19
333 0.18
334 0.2
335 0.22
336 0.26
337 0.28
338 0.29
339 0.26
340 0.26
341 0.26
342 0.24
343 0.25
344 0.25
345 0.26
346 0.28
347 0.31
348 0.33
349 0.36
350 0.38
351 0.39
352 0.38
353 0.36
354 0.34
355 0.35
356 0.4
357 0.39
358 0.42
359 0.46
360 0.49
361 0.53
362 0.52
363 0.49
364 0.45
365 0.47
366 0.46
367 0.41
368 0.41
369 0.43
370 0.45
371 0.45
372 0.41
373 0.35
374 0.32
375 0.32
376 0.29
377 0.22
378 0.2
379 0.19
380 0.22
381 0.25
382 0.26
383 0.24
384 0.27
385 0.28
386 0.33
387 0.34
388 0.32
389 0.29
390 0.29
391 0.32
392 0.34
393 0.32
394 0.26
395 0.24
396 0.24
397 0.22
398 0.22
399 0.19
400 0.16
401 0.16
402 0.16
403 0.16
404 0.16
405 0.16
406 0.15
407 0.23
408 0.3
409 0.4