Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V1CQ29

Protein Details
Accession A0A2V1CQ29    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-49SSSLPAAKRGRGRPKKVQKTLEETIDHydrophilic
74-99SSPAGPAKRGRGRPKKAQDTSKDTNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-39PAAKRGRGRPKK
79-89PAKRGRGRPKK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MASTRSSQSFSPAPKGTKRAAETSSSLPAAKRGRGRPKKVQKTLEETIDSTMKDKNIEDDAEVAKQIDRDTASSSPAGPAKRGRGRPKKAQDTSKDTNESPENTANGKDNEDVQAIAKQIKTTNDTKTDGNESKTNGVNGEKNALDEVKADTDDVKKAANKEQEAKSKEIMNNNKSVVQDDKREAAIPSSILEKGIVYFFFRGRVGVEDPQGIEDVARSYIVLRPLPLGAKLGEGPLADSGNARLLALPKKMLPKSRQDRFLVFVENPSATIKDLREQFSSNEYATKTFGTSHTPSATPFAEGIYAITSTGRESHLAYHLTVPSSIGEIQKELGLNEKGSFVVSAKNPNAPGPANATLDNPASYPEALQKKFRNLRWMPLEPELLNYQNTQFLIIGEGMNDMGKAVQEMTKDAKDDAKEKPAEELEKLLEEDHDRAEHLKGDDPVFADLGLSSKEYSKMQTTW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.56
3 0.56
4 0.57
5 0.57
6 0.55
7 0.52
8 0.51
9 0.48
10 0.47
11 0.47
12 0.4
13 0.37
14 0.3
15 0.35
16 0.35
17 0.37
18 0.42
19 0.46
20 0.56
21 0.65
22 0.74
23 0.78
24 0.84
25 0.89
26 0.9
27 0.9
28 0.86
29 0.84
30 0.81
31 0.77
32 0.69
33 0.59
34 0.53
35 0.46
36 0.39
37 0.31
38 0.29
39 0.23
40 0.22
41 0.21
42 0.21
43 0.22
44 0.23
45 0.22
46 0.23
47 0.23
48 0.22
49 0.22
50 0.19
51 0.16
52 0.16
53 0.16
54 0.15
55 0.15
56 0.15
57 0.18
58 0.19
59 0.2
60 0.2
61 0.2
62 0.2
63 0.23
64 0.23
65 0.22
66 0.26
67 0.33
68 0.42
69 0.5
70 0.58
71 0.64
72 0.72
73 0.79
74 0.85
75 0.86
76 0.86
77 0.86
78 0.84
79 0.82
80 0.81
81 0.78
82 0.71
83 0.61
84 0.58
85 0.52
86 0.46
87 0.41
88 0.38
89 0.32
90 0.29
91 0.3
92 0.29
93 0.26
94 0.25
95 0.22
96 0.2
97 0.2
98 0.2
99 0.18
100 0.15
101 0.16
102 0.15
103 0.17
104 0.16
105 0.15
106 0.17
107 0.2
108 0.23
109 0.25
110 0.3
111 0.33
112 0.35
113 0.34
114 0.35
115 0.4
116 0.38
117 0.38
118 0.35
119 0.31
120 0.33
121 0.34
122 0.31
123 0.24
124 0.24
125 0.24
126 0.21
127 0.23
128 0.19
129 0.18
130 0.18
131 0.17
132 0.14
133 0.12
134 0.13
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.11
139 0.13
140 0.14
141 0.13
142 0.14
143 0.15
144 0.18
145 0.24
146 0.28
147 0.29
148 0.35
149 0.42
150 0.48
151 0.49
152 0.49
153 0.45
154 0.45
155 0.45
156 0.46
157 0.48
158 0.42
159 0.43
160 0.41
161 0.42
162 0.36
163 0.35
164 0.32
165 0.27
166 0.28
167 0.26
168 0.27
169 0.24
170 0.25
171 0.24
172 0.19
173 0.16
174 0.12
175 0.11
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.12
192 0.14
193 0.14
194 0.15
195 0.14
196 0.14
197 0.14
198 0.14
199 0.11
200 0.08
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.04
206 0.05
207 0.07
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.1
212 0.11
213 0.12
214 0.11
215 0.1
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.09
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.14
237 0.21
238 0.24
239 0.3
240 0.31
241 0.38
242 0.47
243 0.53
244 0.57
245 0.53
246 0.52
247 0.5
248 0.48
249 0.4
250 0.31
251 0.26
252 0.21
253 0.18
254 0.17
255 0.14
256 0.12
257 0.09
258 0.11
259 0.11
260 0.14
261 0.18
262 0.2
263 0.21
264 0.22
265 0.23
266 0.24
267 0.26
268 0.21
269 0.2
270 0.18
271 0.17
272 0.17
273 0.16
274 0.13
275 0.12
276 0.13
277 0.16
278 0.18
279 0.2
280 0.21
281 0.21
282 0.21
283 0.22
284 0.22
285 0.16
286 0.14
287 0.12
288 0.1
289 0.09
290 0.09
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.11
302 0.15
303 0.16
304 0.17
305 0.19
306 0.19
307 0.19
308 0.18
309 0.16
310 0.12
311 0.13
312 0.14
313 0.12
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.12
318 0.12
319 0.11
320 0.14
321 0.14
322 0.15
323 0.15
324 0.15
325 0.13
326 0.13
327 0.14
328 0.09
329 0.13
330 0.14
331 0.21
332 0.22
333 0.25
334 0.26
335 0.26
336 0.29
337 0.25
338 0.24
339 0.23
340 0.26
341 0.24
342 0.24
343 0.24
344 0.23
345 0.23
346 0.22
347 0.16
348 0.13
349 0.13
350 0.12
351 0.12
352 0.18
353 0.25
354 0.27
355 0.34
356 0.37
357 0.46
358 0.54
359 0.57
360 0.6
361 0.54
362 0.62
363 0.63
364 0.64
365 0.58
366 0.54
367 0.55
368 0.44
369 0.45
370 0.39
371 0.31
372 0.27
373 0.24
374 0.21
375 0.2
376 0.2
377 0.18
378 0.15
379 0.13
380 0.14
381 0.13
382 0.12
383 0.09
384 0.1
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.07
393 0.09
394 0.09
395 0.13
396 0.18
397 0.2
398 0.21
399 0.22
400 0.26
401 0.27
402 0.31
403 0.33
404 0.38
405 0.38
406 0.37
407 0.42
408 0.42
409 0.42
410 0.39
411 0.37
412 0.3
413 0.3
414 0.3
415 0.24
416 0.21
417 0.21
418 0.21
419 0.2
420 0.19
421 0.17
422 0.19
423 0.2
424 0.22
425 0.22
426 0.25
427 0.26
428 0.27
429 0.28
430 0.28
431 0.28
432 0.23
433 0.21
434 0.16
435 0.12
436 0.12
437 0.11
438 0.11
439 0.1
440 0.12
441 0.15
442 0.17
443 0.21