Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A8PDN4

Protein Details
Accession A8PDN4    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
400-427AAATTPKQKTKAKRGRPPKRKVDDDDAEHydrophilic
489-518STSTSTTNGQPKKPKRDKPKPETYKQAWSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
220-220R
223-224KK
405-420PKQKTKAKRGRPPKRK
500-508KKPKRDKPK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017930  Myb_dom  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR037830  ZZZ3  
KEGG cci:CC1G_11281  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00249  Myb_DNA-binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51294  HTH_MYB  
PS50090  MYB_LIKE  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MEDLCAPTLEALDEFLSRQKALLARTQSDIERLRQLKKEVVEDPEGFVGNVGERLNDRAFRISEQTDYALHFPKPIQWEVFQGIGMCALPILRHPSTNQAYRYGYHYLSVACTERPNAATTPDPTPLRDLHTQLTQTTLHRARPQKSQRAPLSELQSLVKTARKAIVDPVFEEWGEVSEPECDAPGGPNSTSASSNLSDAEAMRRHAEAMRRQREQEKIRELKKRQIRGGYGYGYGGGGGVRGGLSLPTTSMMGLAGQGWAGKGTEGVFIRRDVEDESLEVVDISDEGDPPPVVGGDAGGGKRLWAGKGAGKGMGKGKHCYAAPPTDGTADAAEDDEEGMDLEVDGDNDHHAGYANGDVDASPYPVPPAPPDPTPDNSYYDYEQPKSSRTRRSTRCAAAAAATTPKQKTKAKRGRPPKRKVDDDDAEYGGGYADPGEGDVDEDVDMDLDIDVYCGGGGGGGKTISPISSRTGSTQSSKSISKSKTQSNSTSTSTTNGQPKKPKRDKPKPETYKQAWSVEEQHLLERLLEEIPDGEKFRWQKISRAMGGRRTPRQVASRVQKYFEKLKRFGVEPG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.15
3 0.17
4 0.16
5 0.16
6 0.19
7 0.21
8 0.24
9 0.31
10 0.33
11 0.33
12 0.37
13 0.4
14 0.37
15 0.41
16 0.42
17 0.38
18 0.41
19 0.43
20 0.46
21 0.49
22 0.52
23 0.51
24 0.51
25 0.54
26 0.49
27 0.5
28 0.5
29 0.45
30 0.43
31 0.39
32 0.35
33 0.28
34 0.23
35 0.18
36 0.12
37 0.14
38 0.11
39 0.1
40 0.11
41 0.15
42 0.19
43 0.2
44 0.22
45 0.24
46 0.26
47 0.27
48 0.32
49 0.3
50 0.29
51 0.28
52 0.28
53 0.25
54 0.25
55 0.26
56 0.25
57 0.23
58 0.23
59 0.21
60 0.25
61 0.29
62 0.3
63 0.3
64 0.27
65 0.32
66 0.32
67 0.32
68 0.27
69 0.22
70 0.19
71 0.16
72 0.14
73 0.09
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.14
79 0.15
80 0.16
81 0.18
82 0.27
83 0.34
84 0.4
85 0.4
86 0.39
87 0.4
88 0.4
89 0.43
90 0.38
91 0.31
92 0.26
93 0.25
94 0.2
95 0.19
96 0.21
97 0.18
98 0.15
99 0.16
100 0.17
101 0.18
102 0.19
103 0.2
104 0.18
105 0.19
106 0.22
107 0.23
108 0.25
109 0.29
110 0.29
111 0.27
112 0.29
113 0.28
114 0.29
115 0.31
116 0.3
117 0.27
118 0.31
119 0.31
120 0.28
121 0.3
122 0.26
123 0.23
124 0.29
125 0.3
126 0.3
127 0.36
128 0.44
129 0.44
130 0.53
131 0.62
132 0.63
133 0.67
134 0.72
135 0.7
136 0.7
137 0.71
138 0.66
139 0.62
140 0.53
141 0.47
142 0.39
143 0.33
144 0.27
145 0.24
146 0.22
147 0.17
148 0.17
149 0.2
150 0.19
151 0.2
152 0.26
153 0.3
154 0.28
155 0.29
156 0.29
157 0.26
158 0.25
159 0.24
160 0.17
161 0.12
162 0.11
163 0.09
164 0.07
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.12
176 0.13
177 0.14
178 0.15
179 0.14
180 0.15
181 0.13
182 0.14
183 0.12
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.14
188 0.13
189 0.13
190 0.14
191 0.13
192 0.14
193 0.17
194 0.23
195 0.27
196 0.36
197 0.43
198 0.44
199 0.47
200 0.51
201 0.58
202 0.58
203 0.57
204 0.57
205 0.58
206 0.62
207 0.69
208 0.67
209 0.67
210 0.69
211 0.68
212 0.63
213 0.61
214 0.57
215 0.53
216 0.54
217 0.47
218 0.39
219 0.32
220 0.26
221 0.2
222 0.16
223 0.11
224 0.06
225 0.04
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.03
245 0.04
246 0.03
247 0.04
248 0.04
249 0.03
250 0.04
251 0.04
252 0.08
253 0.08
254 0.1
255 0.11
256 0.11
257 0.13
258 0.12
259 0.13
260 0.1
261 0.11
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.06
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.03
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.08
291 0.07
292 0.07
293 0.09
294 0.11
295 0.14
296 0.15
297 0.17
298 0.16
299 0.18
300 0.21
301 0.24
302 0.23
303 0.23
304 0.23
305 0.24
306 0.24
307 0.24
308 0.23
309 0.22
310 0.22
311 0.21
312 0.2
313 0.17
314 0.18
315 0.16
316 0.12
317 0.08
318 0.07
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.04
323 0.04
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.07
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.08
352 0.09
353 0.1
354 0.11
355 0.15
356 0.16
357 0.17
358 0.21
359 0.24
360 0.27
361 0.3
362 0.3
363 0.29
364 0.29
365 0.3
366 0.28
367 0.3
368 0.3
369 0.28
370 0.29
371 0.27
372 0.29
373 0.35
374 0.4
375 0.44
376 0.48
377 0.57
378 0.61
379 0.68
380 0.73
381 0.69
382 0.67
383 0.58
384 0.52
385 0.43
386 0.36
387 0.3
388 0.24
389 0.21
390 0.21
391 0.21
392 0.23
393 0.27
394 0.33
395 0.4
396 0.49
397 0.57
398 0.64
399 0.73
400 0.81
401 0.86
402 0.91
403 0.92
404 0.91
405 0.9
406 0.88
407 0.84
408 0.83
409 0.78
410 0.72
411 0.66
412 0.55
413 0.46
414 0.37
415 0.3
416 0.2
417 0.13
418 0.08
419 0.05
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.03
442 0.03
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.08
453 0.09
454 0.13
455 0.16
456 0.17
457 0.2
458 0.24
459 0.26
460 0.3
461 0.31
462 0.31
463 0.32
464 0.34
465 0.34
466 0.39
467 0.39
468 0.43
469 0.46
470 0.52
471 0.56
472 0.6
473 0.62
474 0.59
475 0.61
476 0.56
477 0.53
478 0.44
479 0.39
480 0.36
481 0.35
482 0.39
483 0.4
484 0.44
485 0.52
486 0.61
487 0.69
488 0.76
489 0.8
490 0.83
491 0.88
492 0.92
493 0.92
494 0.93
495 0.92
496 0.9
497 0.91
498 0.85
499 0.84
500 0.8
501 0.75
502 0.65
503 0.59
504 0.57
505 0.5
506 0.5
507 0.4
508 0.35
509 0.32
510 0.31
511 0.27
512 0.21
513 0.18
514 0.13
515 0.12
516 0.11
517 0.1
518 0.11
519 0.13
520 0.15
521 0.15
522 0.21
523 0.24
524 0.29
525 0.38
526 0.38
527 0.44
528 0.51
529 0.59
530 0.6
531 0.67
532 0.67
533 0.66
534 0.74
535 0.75
536 0.73
537 0.7
538 0.67
539 0.65
540 0.66
541 0.63
542 0.64
543 0.66
544 0.68
545 0.65
546 0.66
547 0.64
548 0.63
549 0.67
550 0.65
551 0.64
552 0.57
553 0.62
554 0.64