Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V1CTZ6

Protein Details
Accession A0A2V1CTZ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-63MGSEKHRSKSEKKSKSSHGEKKRKRDHAEEGPKSKSKKHKSSPRAVESDIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-56KHRSKSEKKSKSSHGEKKRKRDHAEEGPKSKSKKHKSSP
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MSIETTTPSQTATMGSEKHRSKSEKKSKSSHGEKKRKRDHAEEGPKSKSKKHKSSPRAVESDILETPATVSPFHLQTSSLYLPLAPVSQKYPLEGICAEHLSPLLLTYYPPFSGVLLSYSNPRLSEKAFGNDGDEVLLQNHDEYAVSWTWLTAEFLLFKPEKGAWLEGYVNLQNEGHLGLVCWNLFNASIERKRLPSDWKWKDVSDAREGWEGVGETYAEEGMGYYVDGEGKKIEGMVKLRVREIESSHDRERGFLSIEGTMLSEAAEKKLVENEREGVENSRDTAGRRLGGSQGLGATSLGVAVEPDAMDAGIKKHRQRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.24
3 0.33
4 0.36
5 0.4
6 0.47
7 0.5
8 0.54
9 0.62
10 0.69
11 0.7
12 0.75
13 0.79
14 0.81
15 0.84
16 0.87
17 0.86
18 0.86
19 0.87
20 0.89
21 0.91
22 0.92
23 0.91
24 0.87
25 0.85
26 0.84
27 0.84
28 0.86
29 0.84
30 0.8
31 0.77
32 0.75
33 0.7
34 0.68
35 0.67
36 0.66
37 0.68
38 0.72
39 0.76
40 0.8
41 0.88
42 0.91
43 0.89
44 0.83
45 0.74
46 0.67
47 0.58
48 0.52
49 0.41
50 0.32
51 0.23
52 0.18
53 0.18
54 0.16
55 0.15
56 0.1
57 0.12
58 0.13
59 0.14
60 0.15
61 0.14
62 0.12
63 0.13
64 0.19
65 0.19
66 0.16
67 0.15
68 0.14
69 0.14
70 0.14
71 0.15
72 0.08
73 0.09
74 0.1
75 0.15
76 0.16
77 0.16
78 0.18
79 0.16
80 0.19
81 0.18
82 0.17
83 0.15
84 0.16
85 0.15
86 0.13
87 0.13
88 0.1
89 0.09
90 0.08
91 0.06
92 0.05
93 0.06
94 0.07
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.11
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.14
110 0.14
111 0.14
112 0.19
113 0.18
114 0.2
115 0.2
116 0.2
117 0.2
118 0.19
119 0.17
120 0.13
121 0.11
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.07
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.1
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.09
152 0.11
153 0.12
154 0.11
155 0.13
156 0.12
157 0.11
158 0.1
159 0.1
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.06
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.13
176 0.16
177 0.19
178 0.21
179 0.22
180 0.24
181 0.26
182 0.31
183 0.34
184 0.42
185 0.45
186 0.5
187 0.51
188 0.49
189 0.52
190 0.52
191 0.47
192 0.41
193 0.36
194 0.33
195 0.32
196 0.32
197 0.25
198 0.21
199 0.17
200 0.11
201 0.1
202 0.08
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.09
222 0.12
223 0.14
224 0.22
225 0.26
226 0.27
227 0.29
228 0.3
229 0.31
230 0.29
231 0.29
232 0.3
233 0.32
234 0.38
235 0.39
236 0.41
237 0.39
238 0.38
239 0.37
240 0.3
241 0.26
242 0.21
243 0.2
244 0.16
245 0.16
246 0.15
247 0.14
248 0.12
249 0.08
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.1
254 0.12
255 0.11
256 0.13
257 0.2
258 0.24
259 0.23
260 0.25
261 0.27
262 0.26
263 0.28
264 0.29
265 0.26
266 0.25
267 0.24
268 0.23
269 0.22
270 0.22
271 0.22
272 0.27
273 0.27
274 0.26
275 0.26
276 0.26
277 0.26
278 0.27
279 0.26
280 0.21
281 0.18
282 0.15
283 0.15
284 0.13
285 0.1
286 0.08
287 0.07
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.07
299 0.11
300 0.18
301 0.25