Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V1C0E1

Protein Details
Accession A0A2V1C0E1    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
68-97ARHIPNWRTKNYRPKNPKKWYEVYCKYKKEHydrophilic
331-355QSSSPPAPSSRPKPKPKPSDVISSMHydrophilic
383-402RPMPPKRKEVDIFNRGPKKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
340-348SRPKPKPKP
365-405SSPPPPRMRGSTPPRMGQRPMPPKRKEVDIFNRGPKKRRIG
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPAPSLVDSCTKACIKNIRSLIDVGSFEYWQIRTVLQRVESPEQLHQIELNSPQLLGEDAELWQSFIARHIPNWRTKNYRPKNPKKWYEVYCKYKKEQQEEIARDEEILRNSMMGLKAARETNVSKIVDLKMLPKLPKDPRMIANNGGVPIKKGFRKETPGTLNWTSGSKTKMTDGKSVLVRARREAKEISQMGKLAKPTHRLSGALGQVRKAPEGMVKEYKTAAQPAIKILSKRKPHPTLGNFSGGVTGPSLEEREKRLKAAMAGGAGSKRDASGDVKHTYVGSSDDDLNDFIEDDEDVDDLFDEAPKPKSRPVSSSASSRPPPSRPYQQSSSPPAPSSRPKPKPKPSDVISSMISGPRPGLASSPPPPRMRGSTPPRMGQRPMPPKRKEVDIFNRGPKKRRIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.39
3 0.46
4 0.5
5 0.47
6 0.47
7 0.47
8 0.43
9 0.38
10 0.35
11 0.28
12 0.24
13 0.21
14 0.19
15 0.21
16 0.19
17 0.15
18 0.16
19 0.16
20 0.17
21 0.22
22 0.27
23 0.26
24 0.3
25 0.35
26 0.39
27 0.41
28 0.4
29 0.39
30 0.39
31 0.37
32 0.34
33 0.29
34 0.25
35 0.25
36 0.24
37 0.23
38 0.18
39 0.17
40 0.17
41 0.16
42 0.15
43 0.12
44 0.1
45 0.08
46 0.07
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.1
54 0.16
55 0.15
56 0.18
57 0.27
58 0.33
59 0.42
60 0.48
61 0.52
62 0.55
63 0.62
64 0.71
65 0.72
66 0.77
67 0.79
68 0.84
69 0.89
70 0.91
71 0.92
72 0.89
73 0.88
74 0.85
75 0.85
76 0.84
77 0.83
78 0.82
79 0.78
80 0.74
81 0.72
82 0.71
83 0.67
84 0.65
85 0.63
86 0.64
87 0.62
88 0.62
89 0.57
90 0.49
91 0.42
92 0.35
93 0.3
94 0.21
95 0.19
96 0.14
97 0.12
98 0.13
99 0.15
100 0.14
101 0.12
102 0.11
103 0.11
104 0.14
105 0.14
106 0.15
107 0.15
108 0.16
109 0.19
110 0.25
111 0.24
112 0.21
113 0.24
114 0.24
115 0.24
116 0.23
117 0.22
118 0.2
119 0.24
120 0.25
121 0.24
122 0.31
123 0.35
124 0.43
125 0.45
126 0.44
127 0.45
128 0.5
129 0.51
130 0.45
131 0.42
132 0.36
133 0.33
134 0.29
135 0.23
136 0.19
137 0.18
138 0.2
139 0.19
140 0.21
141 0.25
142 0.29
143 0.37
144 0.39
145 0.44
146 0.46
147 0.45
148 0.48
149 0.45
150 0.4
151 0.33
152 0.31
153 0.24
154 0.21
155 0.2
156 0.15
157 0.14
158 0.18
159 0.22
160 0.24
161 0.28
162 0.27
163 0.29
164 0.3
165 0.32
166 0.31
167 0.31
168 0.29
169 0.28
170 0.35
171 0.31
172 0.33
173 0.32
174 0.31
175 0.34
176 0.35
177 0.33
178 0.26
179 0.27
180 0.25
181 0.25
182 0.24
183 0.2
184 0.21
185 0.25
186 0.25
187 0.27
188 0.27
189 0.26
190 0.25
191 0.27
192 0.28
193 0.26
194 0.25
195 0.22
196 0.24
197 0.24
198 0.22
199 0.16
200 0.13
201 0.12
202 0.14
203 0.18
204 0.21
205 0.21
206 0.22
207 0.22
208 0.23
209 0.21
210 0.2
211 0.18
212 0.14
213 0.14
214 0.15
215 0.19
216 0.19
217 0.2
218 0.25
219 0.31
220 0.35
221 0.41
222 0.48
223 0.5
224 0.54
225 0.61
226 0.6
227 0.6
228 0.57
229 0.55
230 0.45
231 0.39
232 0.36
233 0.26
234 0.2
235 0.13
236 0.1
237 0.06
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.1
242 0.15
243 0.22
244 0.23
245 0.23
246 0.25
247 0.25
248 0.25
249 0.26
250 0.23
251 0.16
252 0.16
253 0.16
254 0.15
255 0.13
256 0.12
257 0.09
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.1
262 0.15
263 0.2
264 0.22
265 0.22
266 0.22
267 0.22
268 0.2
269 0.18
270 0.15
271 0.12
272 0.12
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.11
279 0.09
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.09
294 0.14
295 0.18
296 0.2
297 0.25
298 0.33
299 0.36
300 0.39
301 0.43
302 0.46
303 0.45
304 0.51
305 0.52
306 0.51
307 0.5
308 0.51
309 0.51
310 0.47
311 0.49
312 0.49
313 0.55
314 0.55
315 0.6
316 0.6
317 0.63
318 0.66
319 0.69
320 0.68
321 0.6
322 0.55
323 0.5
324 0.51
325 0.51
326 0.53
327 0.56
328 0.6
329 0.67
330 0.76
331 0.84
332 0.88
333 0.88
334 0.88
335 0.81
336 0.81
337 0.74
338 0.68
339 0.58
340 0.5
341 0.43
342 0.36
343 0.32
344 0.21
345 0.18
346 0.16
347 0.16
348 0.14
349 0.14
350 0.16
351 0.22
352 0.29
353 0.38
354 0.43
355 0.44
356 0.47
357 0.5
358 0.53
359 0.53
360 0.56
361 0.56
362 0.6
363 0.64
364 0.69
365 0.71
366 0.7
367 0.67
368 0.65
369 0.67
370 0.67
371 0.72
372 0.74
373 0.72
374 0.74
375 0.74
376 0.76
377 0.7
378 0.7
379 0.7
380 0.7
381 0.72
382 0.75
383 0.8
384 0.76
385 0.79