Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4PCY0

Protein Details
Accession Q4PCY0    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-79GVTAHKRKRSPTRSVSSRSTSSRSPSRSRSPPPRSRRRRRSSRDRSQSSNSDEHydrophilic
722-775YSSRSYSSRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSPSEHQRHGRRRARSASYSHydrophilic
783-807SSSSSSSRSRSRSRSRSRSFSRSLTHydrophilic
810-851GSYSRSCSRSPVPRRRAPRSRSRSADPRKRSSRRSPSVSSYSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-69HKRKRSPTRSVSSRSTSSRSPSRSRSPPPRSRRRRRSSR
730-771RSRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSPSEHQRHGRRRARS
790-800RSRSRSRSRSR
818-843RSPVPRRRAPRSRSRSADPRKRSSRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11, plas 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003891  Initiation_fac_eIF4g_MI  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG uma:UMAG_11905  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02847  MA3  
PF02854  MIF4G  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51366  MI  
Amino Acid Sequences MPSRERSPSSGLGFQSDSSRSSPPDAGVTAHKRKRSPTRSVSSRSTSSRSPSRSRSPPPRSRRRRRSSRDRSQSSNSDESTEERKNTTRAREALEQNAKTLEIAAKGEALRSTLAQLSATKSGGAYVPPARLKALMAEAAAADPGSVEYQRMSWDALKKSITGLVNKVAVENIKSIVPELFGGANLIRGRGLYCRSIMRAQALSLSFTPVFAALTAIVNTKLPMIGELLAVRLVSQFRRSFKRNDKAVCNSTAMFLAHLVNQRVVHEVLALEILVLLLEKPTDDSVEIAVGFMREVGAFLTEEAPKANNSIFDRFRAVLYEGEISKRVQYMIEVLSQVRREGFKENPRIPDALDLVEEDDQITHRISLDDQLNIEEGLNVFKMDPEFVENEERYRSIKAEILGENSDSDKTGSEADSESGSSSDDSSDDEAGEGPDDAQRQLEIHDRTETNLINLRRTIYLTIMSSLDFEESVHKLLKLEVPEGQDIELCNMIVECCSQERTYSKFYGNMGERFCKLHRKWADTFAQSFSNYYDTIHRYETNRLRNIARFFGHLFSTDSISWASMSVIHMNEEDTTSSSRIFVKIMFQEMQQQLGLKELAERFKEPSLQENWKGLFPTDNPKSTRFSINYFTSIGLGVLTEEMREYLKNAPKLLLAQRQAALAARGSDNSDSDSSSVLSSSTGSRSRTSYSSYSRSSRSYSSGSGSYSSRSRSSRSYSSRSYSSRSYSSRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSPSEHQRHGRRRARSASYSSYSSRSRSSSSSSSRSRSRSRSRSRSFSRSLTPRGSYSRSCSRSPVPRRRAPRSRSRSADPRKRSSRRSPSVSSYSGSETDDSISRSPSPRAGYVDRRSHRHSRSASPARR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.35
3 0.3
4 0.27
5 0.24
6 0.26
7 0.24
8 0.28
9 0.29
10 0.26
11 0.28
12 0.27
13 0.26
14 0.33
15 0.4
16 0.46
17 0.5
18 0.54
19 0.54
20 0.62
21 0.71
22 0.71
23 0.72
24 0.72
25 0.77
26 0.8
27 0.83
28 0.82
29 0.78
30 0.76
31 0.71
32 0.65
33 0.59
34 0.57
35 0.59
36 0.58
37 0.6
38 0.61
39 0.66
40 0.7
41 0.76
42 0.79
43 0.81
44 0.84
45 0.87
46 0.9
47 0.92
48 0.94
49 0.95
50 0.94
51 0.95
52 0.95
53 0.96
54 0.96
55 0.96
56 0.96
57 0.92
58 0.88
59 0.85
60 0.82
61 0.78
62 0.74
63 0.63
64 0.55
65 0.49
66 0.45
67 0.44
68 0.41
69 0.35
70 0.32
71 0.35
72 0.39
73 0.45
74 0.49
75 0.5
76 0.49
77 0.53
78 0.58
79 0.59
80 0.63
81 0.65
82 0.58
83 0.51
84 0.48
85 0.41
86 0.32
87 0.3
88 0.22
89 0.15
90 0.15
91 0.14
92 0.16
93 0.16
94 0.18
95 0.16
96 0.15
97 0.13
98 0.13
99 0.14
100 0.13
101 0.14
102 0.14
103 0.15
104 0.18
105 0.19
106 0.19
107 0.17
108 0.15
109 0.16
110 0.15
111 0.14
112 0.15
113 0.15
114 0.21
115 0.23
116 0.24
117 0.24
118 0.23
119 0.23
120 0.21
121 0.21
122 0.17
123 0.15
124 0.14
125 0.14
126 0.13
127 0.12
128 0.09
129 0.06
130 0.04
131 0.05
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.08
137 0.1
138 0.11
139 0.13
140 0.16
141 0.23
142 0.26
143 0.3
144 0.3
145 0.29
146 0.29
147 0.33
148 0.31
149 0.27
150 0.27
151 0.27
152 0.28
153 0.28
154 0.27
155 0.23
156 0.21
157 0.19
158 0.17
159 0.14
160 0.12
161 0.12
162 0.13
163 0.12
164 0.11
165 0.1
166 0.1
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.08
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.14
178 0.17
179 0.15
180 0.17
181 0.2
182 0.23
183 0.26
184 0.27
185 0.28
186 0.26
187 0.24
188 0.26
189 0.24
190 0.23
191 0.2
192 0.22
193 0.18
194 0.16
195 0.16
196 0.12
197 0.11
198 0.09
199 0.09
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.1
222 0.16
223 0.2
224 0.25
225 0.32
226 0.36
227 0.44
228 0.53
229 0.62
230 0.63
231 0.66
232 0.69
233 0.7
234 0.7
235 0.64
236 0.56
237 0.46
238 0.39
239 0.34
240 0.26
241 0.17
242 0.14
243 0.12
244 0.13
245 0.16
246 0.16
247 0.16
248 0.17
249 0.17
250 0.19
251 0.18
252 0.15
253 0.12
254 0.11
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.04
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.03
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.12
296 0.15
297 0.21
298 0.22
299 0.23
300 0.26
301 0.25
302 0.25
303 0.22
304 0.21
305 0.15
306 0.16
307 0.17
308 0.14
309 0.15
310 0.16
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.12
315 0.09
316 0.09
317 0.11
318 0.11
319 0.12
320 0.12
321 0.12
322 0.14
323 0.15
324 0.15
325 0.13
326 0.13
327 0.13
328 0.16
329 0.23
330 0.29
331 0.38
332 0.42
333 0.44
334 0.45
335 0.44
336 0.4
337 0.36
338 0.29
339 0.2
340 0.16
341 0.12
342 0.11
343 0.11
344 0.11
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.07
354 0.11
355 0.12
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.12
360 0.12
361 0.11
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.08
374 0.09
375 0.13
376 0.13
377 0.14
378 0.15
379 0.15
380 0.14
381 0.15
382 0.14
383 0.11
384 0.14
385 0.13
386 0.17
387 0.17
388 0.18
389 0.17
390 0.17
391 0.16
392 0.14
393 0.13
394 0.09
395 0.09
396 0.06
397 0.06
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.07
406 0.06
407 0.07
408 0.06
409 0.06
410 0.05
411 0.05
412 0.06
413 0.06
414 0.07
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.05
421 0.04
422 0.05
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.07
429 0.13
430 0.13
431 0.14
432 0.17
433 0.17
434 0.18
435 0.2
436 0.19
437 0.14
438 0.19
439 0.18
440 0.17
441 0.17
442 0.17
443 0.15
444 0.16
445 0.15
446 0.11
447 0.12
448 0.11
449 0.11
450 0.1
451 0.1
452 0.09
453 0.09
454 0.08
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.07
459 0.09
460 0.09
461 0.09
462 0.09
463 0.1
464 0.13
465 0.12
466 0.12
467 0.14
468 0.15
469 0.16
470 0.15
471 0.14
472 0.13
473 0.11
474 0.11
475 0.08
476 0.06
477 0.06
478 0.05
479 0.05
480 0.04
481 0.05
482 0.04
483 0.05
484 0.07
485 0.07
486 0.09
487 0.12
488 0.16
489 0.2
490 0.22
491 0.22
492 0.24
493 0.24
494 0.29
495 0.3
496 0.3
497 0.28
498 0.28
499 0.28
500 0.27
501 0.28
502 0.31
503 0.28
504 0.34
505 0.37
506 0.42
507 0.43
508 0.48
509 0.53
510 0.46
511 0.47
512 0.4
513 0.36
514 0.3
515 0.28
516 0.21
517 0.17
518 0.14
519 0.13
520 0.15
521 0.15
522 0.17
523 0.18
524 0.2
525 0.21
526 0.29
527 0.36
528 0.4
529 0.41
530 0.42
531 0.43
532 0.45
533 0.46
534 0.42
535 0.35
536 0.29
537 0.27
538 0.26
539 0.24
540 0.19
541 0.18
542 0.15
543 0.17
544 0.14
545 0.14
546 0.12
547 0.12
548 0.11
549 0.09
550 0.08
551 0.06
552 0.07
553 0.09
554 0.09
555 0.1
556 0.1
557 0.1
558 0.1
559 0.1
560 0.09
561 0.08
562 0.1
563 0.1
564 0.1
565 0.1
566 0.11
567 0.11
568 0.11
569 0.11
570 0.14
571 0.15
572 0.18
573 0.18
574 0.17
575 0.25
576 0.25
577 0.25
578 0.21
579 0.2
580 0.16
581 0.17
582 0.17
583 0.09
584 0.12
585 0.13
586 0.17
587 0.18
588 0.19
589 0.2
590 0.22
591 0.26
592 0.23
593 0.27
594 0.29
595 0.33
596 0.35
597 0.37
598 0.36
599 0.34
600 0.34
601 0.28
602 0.25
603 0.21
604 0.28
605 0.28
606 0.32
607 0.33
608 0.35
609 0.39
610 0.39
611 0.44
612 0.37
613 0.36
614 0.36
615 0.37
616 0.37
617 0.33
618 0.31
619 0.24
620 0.22
621 0.18
622 0.11
623 0.08
624 0.06
625 0.05
626 0.05
627 0.05
628 0.04
629 0.05
630 0.06
631 0.06
632 0.08
633 0.15
634 0.21
635 0.24
636 0.25
637 0.26
638 0.26
639 0.3
640 0.35
641 0.35
642 0.31
643 0.32
644 0.31
645 0.31
646 0.3
647 0.26
648 0.21
649 0.14
650 0.13
651 0.11
652 0.11
653 0.12
654 0.13
655 0.12
656 0.14
657 0.14
658 0.12
659 0.12
660 0.13
661 0.11
662 0.11
663 0.1
664 0.08
665 0.07
666 0.08
667 0.09
668 0.13
669 0.16
670 0.18
671 0.19
672 0.21
673 0.25
674 0.26
675 0.29
676 0.31
677 0.34
678 0.39
679 0.42
680 0.44
681 0.44
682 0.45
683 0.43
684 0.4
685 0.37
686 0.35
687 0.32
688 0.31
689 0.3
690 0.28
691 0.27
692 0.25
693 0.24
694 0.23
695 0.24
696 0.26
697 0.26
698 0.28
699 0.32
700 0.38
701 0.45
702 0.5
703 0.53
704 0.54
705 0.58
706 0.61
707 0.59
708 0.56
709 0.52
710 0.49
711 0.49
712 0.46
713 0.47
714 0.48
715 0.54
716 0.58
717 0.6
718 0.64
719 0.67
720 0.74
721 0.8
722 0.82
723 0.84
724 0.86
725 0.9
726 0.92
727 0.93
728 0.94
729 0.94
730 0.94
731 0.94
732 0.94
733 0.94
734 0.94
735 0.94
736 0.94
737 0.94
738 0.94
739 0.93
740 0.93
741 0.92
742 0.9
743 0.89
744 0.87
745 0.87
746 0.85
747 0.85
748 0.85
749 0.85
750 0.86
751 0.88
752 0.87
753 0.84
754 0.84
755 0.82
756 0.81
757 0.77
758 0.74
759 0.71
760 0.67
761 0.63
762 0.57
763 0.53
764 0.48
765 0.43
766 0.4
767 0.35
768 0.34
769 0.33
770 0.37
771 0.4
772 0.44
773 0.51
774 0.53
775 0.56
776 0.61
777 0.65
778 0.67
779 0.69
780 0.72
781 0.74
782 0.79
783 0.83
784 0.85
785 0.88
786 0.88
787 0.87
788 0.82
789 0.78
790 0.77
791 0.74
792 0.72
793 0.68
794 0.63
795 0.59
796 0.59
797 0.58
798 0.52
799 0.51
800 0.55
801 0.53
802 0.51
803 0.52
804 0.54
805 0.59
806 0.66
807 0.7
808 0.69
809 0.74
810 0.81
811 0.86
812 0.88
813 0.86
814 0.86
815 0.85
816 0.85
817 0.83
818 0.82
819 0.82
820 0.83
821 0.85
822 0.84
823 0.85
824 0.86
825 0.88
826 0.88
827 0.89
828 0.89
829 0.88
830 0.87
831 0.83
832 0.81
833 0.79
834 0.73
835 0.63
836 0.55
837 0.49
838 0.42
839 0.37
840 0.29
841 0.22
842 0.22
843 0.23
844 0.23
845 0.2
846 0.21
847 0.23
848 0.26
849 0.28
850 0.31
851 0.33
852 0.34
853 0.4
854 0.45
855 0.51
856 0.57
857 0.65
858 0.66
859 0.68
860 0.71
861 0.75
862 0.73
863 0.72
864 0.69
865 0.68
866 0.72