Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V1CBW5

Protein Details
Accession A0A2V1CBW5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MSEYWKSTPKYWCKHCKTYVRDTKLEKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
285-295KKRKAKNIRQK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR040023  WBP4  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06220  zf-U1  
Amino Acid Sequences MSEYWKSTPKYWCKHCKTYVRDTKLEKTNHEATPKHQGNLKRFLRDLHRGHEKDEKDKERSKTEVERLKGLVSGGGSSSAASSSSPVLGRGPTPSAPKPQATEASRKKQLAQLAEMGISIPGELRSGMAMPGEWQVTSERVIEPEGTEKKPEALALGVRKRVVDEEEAELNEAKKRRWGSTYRTHPTEDGDDDLDALLSNATRKGKELATKVEVKEEVKQEFSEPKSEDSSSDPKGDTKPFDAAEPAGIKRELSDGDTKAIDSLPPIEGDKQGANEQSGPGVIFKKRKAKNIRQK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.86
3 0.86
4 0.84
5 0.85
6 0.85
7 0.82
8 0.81
9 0.77
10 0.77
11 0.75
12 0.72
13 0.65
14 0.61
15 0.61
16 0.58
17 0.59
18 0.51
19 0.47
20 0.53
21 0.53
22 0.48
23 0.45
24 0.47
25 0.47
26 0.56
27 0.58
28 0.53
29 0.5
30 0.53
31 0.56
32 0.59
33 0.56
34 0.54
35 0.59
36 0.54
37 0.56
38 0.6
39 0.55
40 0.54
41 0.6
42 0.58
43 0.55
44 0.62
45 0.63
46 0.61
47 0.61
48 0.58
49 0.57
50 0.59
51 0.6
52 0.55
53 0.54
54 0.48
55 0.45
56 0.4
57 0.31
58 0.24
59 0.16
60 0.14
61 0.1
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.11
77 0.12
78 0.14
79 0.15
80 0.2
81 0.22
82 0.28
83 0.31
84 0.32
85 0.32
86 0.32
87 0.37
88 0.35
89 0.42
90 0.44
91 0.5
92 0.54
93 0.52
94 0.51
95 0.47
96 0.48
97 0.41
98 0.35
99 0.29
100 0.24
101 0.23
102 0.21
103 0.18
104 0.13
105 0.1
106 0.07
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.14
132 0.16
133 0.16
134 0.17
135 0.16
136 0.16
137 0.16
138 0.16
139 0.1
140 0.08
141 0.1
142 0.16
143 0.19
144 0.2
145 0.2
146 0.2
147 0.2
148 0.2
149 0.18
150 0.14
151 0.12
152 0.14
153 0.15
154 0.15
155 0.15
156 0.15
157 0.13
158 0.15
159 0.14
160 0.12
161 0.16
162 0.18
163 0.2
164 0.25
165 0.3
166 0.35
167 0.44
168 0.54
169 0.55
170 0.56
171 0.55
172 0.49
173 0.46
174 0.42
175 0.33
176 0.24
177 0.19
178 0.16
179 0.15
180 0.14
181 0.11
182 0.07
183 0.06
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.08
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.14
192 0.18
193 0.24
194 0.27
195 0.3
196 0.34
197 0.39
198 0.38
199 0.4
200 0.38
201 0.34
202 0.35
203 0.34
204 0.31
205 0.27
206 0.27
207 0.25
208 0.3
209 0.3
210 0.31
211 0.27
212 0.28
213 0.3
214 0.3
215 0.28
216 0.28
217 0.32
218 0.28
219 0.3
220 0.28
221 0.27
222 0.31
223 0.34
224 0.32
225 0.29
226 0.31
227 0.28
228 0.29
229 0.28
230 0.24
231 0.24
232 0.24
233 0.22
234 0.2
235 0.2
236 0.19
237 0.17
238 0.19
239 0.16
240 0.17
241 0.22
242 0.2
243 0.22
244 0.23
245 0.22
246 0.21
247 0.2
248 0.17
249 0.12
250 0.13
251 0.11
252 0.12
253 0.14
254 0.15
255 0.16
256 0.19
257 0.2
258 0.2
259 0.23
260 0.23
261 0.23
262 0.23
263 0.22
264 0.2
265 0.19
266 0.17
267 0.16
268 0.18
269 0.22
270 0.28
271 0.35
272 0.44
273 0.5
274 0.59
275 0.68