FuNGI

A0A2V1AQX2

Protein Details

Accession

A0A2V1AQX2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
390-409	LRRRHENEKRYQNNDKRRKV	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto 6, mito 5, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSRKYPKIISPVVEDEGDAQYGTEPQYSDPNPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPEHKPAPETEDEMFLDVFKYTDRVLMMARPRKVLVIAVDGVAPRAKMNQQRARRFRAAQEAKIHDEERERQIADAEARGEIIEDSIKGKKKWDSNAITPGTPFMDGLAAALRYWVAYKLASDPGWKDLQVIISDATVPGEGEHKLMSFIRSQRSDPSHDPNTKHCIYGLDADLIFLGLATHEPHFRVLREDVFAQGGGQRNMKYSDQINMTAEEKKALDAKDAKKPFLWLHVNVLREYLEVELKVRMGMQWDVERAIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLSVRDNGIDILVGCWKSIAPRITDYLTCDGKLNLDAVEQLLGALSHKEDDILRRRHENEKRYQNNDKRRKVAQSEEKSLRAQYLSTVSKGKEKAPVTADMNMPLMDTSGKLVDGYAQLTNKDIVQNRDVITKANMANADAAAALKKLLAQKNGEAPAEEPSEQSDASQAEDPKKRSASELETTESEDDPDVDQVKEWEPGYRERYYKIKFSLSTKEEIEQQRRDLVFSYIEGVSWVLLYYYQGCPSWQWYYPYHYAPFAADFTDLGEIFGSQGIKFIEGEPFTPYEQLMSVLPAASGHALPKVFRELMSSPDSEIIDFYPENFKIDMNGAKMSWQGIALLPFIDEHRLLTAVRGKYDLLTDAEKARNTNKKAQLYISSANKNYQKFLQGFDEDKTIPFAAQRTGLAGVVKPVSSFSADGELKFPLNEGDLPHISNSAYLMSWYDFPKSTPGKSMLLNGYIPHVKVLTDDDKFAITGRQRNGPRFQNVSDYVNTGPQGKEPYMAYGMRVGGYRALSHIGSQPDSGRGGRGSGRGGRGNYSNRGNRGRGNYNNRGQNYNNNYNNNYNNQGYNNYNQGYANQGYNNYNQGYQGNNYNQGYNNYGNQGYNQNQGYNQNQGYNQGYRNQGYQNQGYQNQGFQNQGYGNQGYPANQGNQGNQGFSNYNSFGGSYNRNNYGGQR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.62
3	0.66
4	0.66
5	0.61
6	0.58
7	0.56
8	0.52
9	0.44
10	0.38
11	0.32
12	0.27
13	0.24
14	0.17
15	0.12
16	0.1
17	0.12
18	0.13
19	0.13
20	0.12
21	0.13
22	0.21
23	0.23
24	0.28
25	0.3
26	0.32
27	0.31
28	0.33
29	0.33
30	0.26
31	0.26
32	0.22
33	0.2
34	0.17
35	0.16
36	0.14
37	0.13
38	0.12
39	0.1
40	0.09
41	0.08
42	0.08
43	0.09
44	0.1
45	0.12
46	0.17
47	0.22
48	0.26
49	0.33
50	0.4
51	0.45
52	0.51
53	0.51
54	0.51
55	0.49
56	0.49
57	0.42
58	0.39
59	0.33
60	0.28
61	0.25
62	0.2
63	0.17
64	0.13
65	0.12
66	0.08
67	0.1
68	0.08
69	0.11
70	0.11
71	0.12
72	0.14
73	0.2
74	0.29
75	0.36
76	0.38
77	0.38
78	0.38
79	0.38
80	0.38
81	0.35
82	0.27
83	0.25
84	0.23
85	0.21
86	0.22
87	0.2
88	0.2
89	0.18
90	0.15
91	0.1
92	0.13
93	0.19
94	0.26
95	0.36
96	0.45
97	0.54
98	0.65
99	0.73
100	0.78
101	0.79
102	0.76
103	0.72
104	0.74
105	0.71
106	0.67
107	0.68
108	0.65
109	0.62
110	0.62
111	0.56
112	0.48
113	0.46
114	0.45
115	0.42
116	0.41
117	0.36
118	0.32
119	0.33
120	0.34
121	0.3
122	0.27
123	0.22
124	0.17
125	0.16
126	0.16
127	0.15
128	0.11
129	0.1
130	0.08
131	0.07
132	0.1
133	0.16
134	0.22
135	0.22
136	0.27
137	0.33
138	0.39
139	0.47
140	0.55
141	0.56
142	0.58
143	0.66
144	0.64
145	0.58
146	0.51
147	0.45
148	0.36
149	0.28
150	0.21
151	0.12
152	0.1
153	0.09
154	0.09
155	0.09
156	0.08
157	0.08
158	0.08
159	0.07
160	0.07
161	0.08
162	0.08
163	0.07
164	0.08
165	0.09
166	0.13
167	0.17
168	0.18
169	0.2
170	0.2
171	0.23
172	0.25
173	0.24
174	0.21
175	0.19
176	0.21
177	0.19
178	0.18
179	0.15
180	0.13
181	0.13
182	0.12
183	0.11
184	0.08
185	0.07
186	0.06
187	0.08
188	0.08
189	0.08
190	0.09
191	0.08
192	0.1
193	0.11
194	0.12
195	0.16
196	0.21
197	0.28
198	0.3
199	0.31
200	0.37
201	0.41
202	0.46
203	0.46
204	0.49
205	0.51
206	0.54
207	0.56
208	0.53
209	0.57
210	0.51
211	0.46
212	0.39
213	0.32
214	0.28
215	0.3
216	0.26
217	0.21
218	0.2
219	0.19
220	0.18
221	0.16
222	0.13
223	0.08
224	0.06
225	0.03
226	0.04
227	0.05
228	0.07
229	0.08
230	0.09
231	0.13
232	0.14
233	0.15
234	0.19
235	0.2
236	0.21
237	0.23
238	0.23
239	0.21
240	0.2
241	0.19
242	0.15
243	0.16
244	0.18
245	0.17
246	0.19
247	0.18
248	0.19
249	0.23
250	0.23
251	0.23
252	0.2
253	0.24
254	0.24
255	0.26
256	0.25
257	0.23
258	0.24
259	0.25
260	0.23
261	0.2
262	0.17
263	0.16
264	0.19
265	0.17
266	0.22
267	0.26
268	0.31
269	0.39
270	0.41
271	0.41
272	0.38
273	0.41
274	0.36
275	0.37
276	0.38
277	0.3
278	0.36
279	0.38
280	0.39
281	0.35
282	0.35
283	0.26
284	0.21
285	0.2
286	0.13
287	0.1
288	0.09
289	0.1
290	0.1
291	0.1
292	0.1
293	0.09
294	0.08
295	0.09
296	0.1
297	0.12
298	0.13
299	0.14
300	0.14
301	0.14
302	0.14
303	0.12
304	0.13
305	0.11
306	0.09
307	0.08
308	0.08
309	0.08
310	0.07
311	0.07
312	0.05
313	0.05
314	0.06
315	0.07
316	0.06
317	0.06
318	0.08
319	0.07
320	0.08
321	0.08
322	0.08
323	0.07
324	0.08
325	0.12
326	0.14
327	0.15
328	0.14
329	0.15
330	0.15
331	0.14
332	0.14
333	0.09
334	0.06
335	0.06
336	0.09
337	0.08
338	0.07
339	0.08
340	0.08
341	0.09
342	0.14
343	0.15
344	0.15
345	0.16
346	0.19
347	0.21
348	0.22
349	0.24
350	0.24
351	0.23
352	0.21
353	0.2
354	0.18
355	0.16
356	0.16
357	0.14
358	0.08
359	0.08
360	0.07
361	0.07
362	0.07
363	0.06
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.05
373	0.06
374	0.13
375	0.21
376	0.27
377	0.29
378	0.34
379	0.38
380	0.47
381	0.54
382	0.56
383	0.57
384	0.62
385	0.67
386	0.69
387	0.76
388	0.75
389	0.78
390	0.81
391	0.78
392	0.72
393	0.69
394	0.69
395	0.63
396	0.64
397	0.64
398	0.6
399	0.62
400	0.6
401	0.58
402	0.52
403	0.48
404	0.39
405	0.29
406	0.21
407	0.15
408	0.17
409	0.16
410	0.17
411	0.19
412	0.19
413	0.24
414	0.25
415	0.26
416	0.27
417	0.26
418	0.29
419	0.29
420	0.32
421	0.29
422	0.31
423	0.3
424	0.24
425	0.23
426	0.19
427	0.16
428	0.11
429	0.09
430	0.06
431	0.06
432	0.05
433	0.05
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.06
438	0.06
439	0.08
440	0.09
441	0.09
442	0.09
443	0.1
444	0.11
445	0.1
446	0.13
447	0.14
448	0.15
449	0.16
450	0.19
451	0.19
452	0.21
453	0.2
454	0.18
455	0.16
456	0.17
457	0.17
458	0.16
459	0.15
460	0.13
461	0.13
462	0.12
463	0.11
464	0.07
465	0.06
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.03
470	0.06
471	0.11
472	0.13
473	0.16
474	0.17
475	0.19
476	0.24
477	0.27
478	0.25
479	0.2
480	0.18
481	0.18
482	0.19
483	0.17
484	0.12
485	0.11
486	0.12
487	0.11
488	0.11
489	0.09
490	0.08
491	0.09
492	0.12
493	0.12
494	0.17
495	0.22
496	0.24
497	0.25
498	0.27
499	0.26
500	0.24
501	0.26
502	0.26
503	0.26
504	0.26
505	0.24
506	0.24
507	0.24
508	0.23
509	0.2
510	0.15
511	0.1
512	0.09
513	0.07
514	0.08
515	0.08
516	0.07
517	0.07
518	0.08
519	0.09
520	0.11
521	0.1
522	0.12
523	0.12
524	0.17
525	0.22
526	0.24
527	0.24
528	0.25
529	0.32
530	0.33
531	0.36
532	0.34
533	0.34
534	0.32
535	0.35
536	0.41
537	0.36
538	0.36
539	0.33
540	0.31
541	0.33
542	0.36
543	0.39
544	0.32
545	0.31
546	0.33
547	0.33
548	0.32
549	0.26
550	0.22
551	0.16
552	0.14
553	0.16
554	0.1
555	0.1
556	0.1
557	0.08
558	0.07
559	0.06
560	0.06
561	0.03
562	0.03
563	0.04
564	0.06
565	0.07
566	0.08
567	0.08
568	0.09
569	0.09
570	0.13
571	0.15
572	0.15
573	0.18
574	0.19
575	0.25
576	0.29
577	0.31
578	0.29
579	0.26
580	0.24
581	0.21
582	0.21
583	0.15
584	0.12
585	0.09
586	0.08
587	0.08
588	0.09
589	0.08
590	0.07
591	0.06
592	0.05
593	0.05
594	0.07
595	0.07
596	0.05
597	0.07
598	0.07
599	0.08
600	0.08
601	0.08
602	0.11
603	0.11
604	0.12
605	0.11
606	0.13
607	0.13
608	0.13
609	0.12
610	0.09
611	0.09
612	0.09
613	0.08
614	0.07
615	0.07
616	0.06
617	0.06
618	0.06
619	0.06
620	0.06
621	0.06
622	0.05
623	0.07
624	0.07
625	0.08
626	0.09
627	0.12
628	0.12
629	0.12
630	0.16
631	0.15
632	0.19
633	0.22
634	0.21
635	0.18
636	0.2
637	0.2
638	0.16
639	0.15
640	0.11
641	0.11
642	0.1
643	0.11
644	0.13
645	0.13
646	0.15
647	0.15
648	0.14
649	0.13
650	0.16
651	0.17
652	0.14
653	0.15
654	0.13
655	0.14
656	0.14
657	0.14
658	0.11
659	0.09
660	0.07
661	0.07
662	0.09
663	0.08
664	0.08
665	0.07
666	0.07
667	0.08
668	0.09
669	0.08
670	0.07
671	0.07
672	0.08
673	0.08
674	0.11
675	0.17
676	0.17
677	0.17
678	0.18
679	0.18
680	0.17
681	0.18
682	0.17
683	0.13
684	0.13
685	0.14
686	0.17
687	0.2
688	0.2
689	0.21
690	0.26
691	0.32
692	0.35
693	0.44
694	0.47
695	0.5
696	0.51
697	0.52
698	0.51
699	0.48
700	0.5
701	0.47
702	0.44
703	0.41
704	0.44
705	0.46
706	0.42
707	0.39
708	0.35
709	0.34
710	0.3
711	0.32
712	0.32
713	0.29
714	0.3
715	0.29
716	0.3
717	0.24
718	0.24
719	0.23
720	0.18
721	0.15
722	0.14
723	0.14
724	0.12
725	0.13
726	0.13
727	0.12
728	0.13
729	0.14
730	0.13
731	0.12
732	0.12
733	0.12
734	0.12
735	0.1
736	0.09
737	0.1
738	0.1
739	0.11
740	0.09
741	0.16
742	0.16
743	0.17
744	0.18
745	0.18
746	0.17
747	0.16
748	0.16
749	0.08
750	0.1
751	0.11
752	0.1
753	0.15
754	0.16
755	0.17
756	0.17
757	0.17
758	0.15
759	0.14
760	0.13
761	0.09
762	0.07
763	0.07
764	0.08
765	0.08
766	0.11
767	0.12
768	0.14
769	0.14
770	0.15
771	0.23
772	0.25
773	0.25
774	0.28
775	0.3
776	0.3
777	0.31
778	0.36
779	0.31
780	0.3
781	0.29
782	0.24
783	0.25
784	0.24
785	0.23
786	0.18
787	0.15
788	0.13
789	0.13
790	0.19
791	0.2
792	0.19
793	0.2
794	0.2
795	0.2
796	0.2
797	0.2
798	0.2
799	0.18
800	0.24
801	0.26
802	0.34
803	0.38
804	0.44
805	0.52
806	0.54
807	0.56
808	0.54
809	0.53
810	0.52
811	0.5
812	0.48
813	0.42
814	0.37
815	0.31
816	0.29
817	0.28
818	0.22
819	0.2
820	0.18
821	0.22
822	0.19
823	0.21
824	0.19
825	0.22
826	0.23
827	0.23
828	0.21
829	0.2
830	0.2
831	0.18
832	0.18
833	0.15
834	0.14
835	0.15
836	0.14
837	0.13
838	0.14
839	0.14
840	0.15
841	0.19
842	0.19
843	0.2
844	0.21
845	0.21
846	0.21
847	0.23
848	0.22
849	0.19
850	0.17
851	0.18
852	0.2
853	0.21
854	0.23
855	0.26
856	0.31
857	0.33
858	0.34
859	0.35
860	0.39
861	0.42
862	0.43
863	0.47
864	0.48
865	0.5
866	0.56
867	0.55
868	0.55
869	0.57
870	0.6
871	0.61
872	0.65
873	0.67
874	0.69
875	0.74
876	0.7
877	0.67
878	0.61
879	0.61
880	0.61
881	0.62
882	0.61
883	0.57
884	0.59
885	0.6
886	0.62
887	0.56
888	0.52
889	0.44
890	0.4
891	0.37
892	0.38
893	0.36
894	0.35
895	0.36
896	0.32
897	0.31
898	0.28
899	0.27
900	0.28
901	0.26
902	0.26
903	0.21
904	0.24
905	0.25
906	0.27
907	0.31
908	0.27
909	0.25
910	0.24
911	0.24
912	0.24
913	0.23
914	0.29
915	0.29
916	0.35
917	0.35
918	0.36
919	0.37
920	0.37
921	0.39
922	0.34
923	0.33
924	0.29
925	0.3
926	0.28
927	0.28
928	0.32
929	0.3
930	0.34
931	0.33
932	0.31
933	0.32
934	0.37
935	0.38
936	0.38
937	0.37
938	0.35
939	0.34
940	0.37
941	0.39
942	0.38
943	0.38
944	0.36
945	0.39
946	0.37
947	0.4
948	0.41
949	0.41
950	0.43
951	0.46
952	0.47
953	0.48
954	0.5
955	0.51
956	0.48
957	0.46
958	0.44
959	0.41
960	0.36
961	0.3
962	0.31
963	0.27
964	0.27
965	0.28
966	0.25
967	0.22
968	0.24
969	0.24
970	0.21
971	0.23
972	0.26
973	0.24
974	0.28
975	0.29
976	0.28
977	0.36
978	0.35
979	0.33
980	0.29
981	0.3
982	0.27
983	0.26
984	0.3
985	0.23
986	0.22
987	0.21
988	0.21
989	0.19
990	0.23
991	0.28
992	0.3
993	0.35
994	0.39
995	0.4

A0A2V1AQX2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer