Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V1ALG6

Protein Details
Accession A0A2V1ALG6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-44RPSVENSHTDKRQKPQKKYKKKYKAKDVDPTSPMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-35KRQKPQKKYKKKYKA
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030390  MeTrfase_TrmA_AS  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR001931  Ribosomal_S21e  
IPR018279  Ribosomal_S21e_CS  
IPR038579  Ribosomal_S21e_sf  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR002792  TRAM_dom  
IPR025795  tRNA_(uracil-5-)_MeTrfase  
IPR010280  U5_MeTrfase_fam  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0030697  F:S-adenosylmethionine-dependent tRNA (m5U54) methyltransferase activity  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01249  Ribosomal_S21e  
PF01938  TRAM  
PF05958  tRNA_U5-meth_tr  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00996  RIBOSOMAL_S21E  
PS51687  SAM_MT_RNA_M5U  
PS51622  SAM_MT_RNA_M5U_2  
PS50926  TRAM  
PS01230  TRMA_1  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences MSPIQMEEVKRPSVENSHTDKRQKPQKKYKKKYKAKDVDPTSPMGVLQFEVKEILGEIGLTEEYITNDLKEILNDKSVEEIYHREVKDVEILRLSSNGDGLAVIDHPVRNDGKQIVMVPFGLPGDIVNIRVFKSHPLYVESDLLSIVKPGDKRDDSLINCKYFGKCSGCQYQNVDYSEQLEFKRNTIANAYRFFAPVLSKDAKLPAISATQSSPIQYNYRTKLTPHFNVPNKKPENYYRPNMGFGAKGRPEWRETAGGEGSILDIEECSIGTPIVLKGMANERLRFEKDYEKYKRGATVLLRENTIMPNSEGQIEVDQGSKDTNDEISTVEVEDNNTKLVKTCVTESRAIVREYVNGFVFEFSAGEFFQNNNSILPLVTKYVEDNLQIPNSKPGEPNYLVDAYCGSGLFSITCSGGVSRVIGVEVSADSVKFARRNAENNKVENADFIVGKAEQIFANIDTPAERTSVILDPPRKGCDDVFLNQLSTYHPAKIVYISCNVHSQARDVEWFINNTEHGKDYHVESIKGFDFFPQTHHVDQVELYVPRKCSASNRIIKAKDHASVQINIANVDDEGRAVAGSNTTYALSGYIRARGEGDDSINRLAQQDGLLKNVWSYSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.4
3 0.44
4 0.51
5 0.58
6 0.66
7 0.68
8 0.7
9 0.76
10 0.78
11 0.81
12 0.83
13 0.86
14 0.89
15 0.94
16 0.95
17 0.96
18 0.96
19 0.96
20 0.96
21 0.96
22 0.94
23 0.93
24 0.9
25 0.88
26 0.79
27 0.72
28 0.61
29 0.51
30 0.41
31 0.31
32 0.24
33 0.15
34 0.16
35 0.13
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.07
43 0.07
44 0.06
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.07
51 0.09
52 0.1
53 0.09
54 0.1
55 0.11
56 0.11
57 0.12
58 0.14
59 0.15
60 0.19
61 0.19
62 0.18
63 0.2
64 0.2
65 0.2
66 0.19
67 0.21
68 0.22
69 0.3
70 0.29
71 0.27
72 0.27
73 0.28
74 0.34
75 0.32
76 0.29
77 0.24
78 0.25
79 0.24
80 0.25
81 0.24
82 0.16
83 0.14
84 0.12
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.07
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.13
95 0.15
96 0.14
97 0.18
98 0.18
99 0.18
100 0.2
101 0.22
102 0.2
103 0.19
104 0.19
105 0.15
106 0.15
107 0.13
108 0.11
109 0.08
110 0.06
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.11
115 0.12
116 0.12
117 0.14
118 0.15
119 0.16
120 0.21
121 0.22
122 0.22
123 0.25
124 0.28
125 0.29
126 0.31
127 0.26
128 0.22
129 0.19
130 0.18
131 0.14
132 0.11
133 0.1
134 0.1
135 0.11
136 0.13
137 0.21
138 0.22
139 0.24
140 0.28
141 0.35
142 0.35
143 0.43
144 0.47
145 0.4
146 0.4
147 0.4
148 0.37
149 0.32
150 0.35
151 0.31
152 0.29
153 0.33
154 0.42
155 0.42
156 0.44
157 0.46
158 0.46
159 0.46
160 0.45
161 0.4
162 0.31
163 0.31
164 0.29
165 0.27
166 0.22
167 0.23
168 0.21
169 0.21
170 0.28
171 0.25
172 0.25
173 0.28
174 0.33
175 0.31
176 0.33
177 0.35
178 0.28
179 0.28
180 0.27
181 0.23
182 0.18
183 0.15
184 0.18
185 0.19
186 0.18
187 0.19
188 0.21
189 0.21
190 0.19
191 0.18
192 0.14
193 0.14
194 0.14
195 0.14
196 0.12
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.16
203 0.19
204 0.24
205 0.26
206 0.29
207 0.29
208 0.3
209 0.36
210 0.4
211 0.4
212 0.41
213 0.46
214 0.5
215 0.58
216 0.61
217 0.63
218 0.59
219 0.57
220 0.54
221 0.54
222 0.56
223 0.54
224 0.54
225 0.52
226 0.49
227 0.49
228 0.46
229 0.39
230 0.31
231 0.26
232 0.29
233 0.22
234 0.23
235 0.23
236 0.24
237 0.25
238 0.25
239 0.26
240 0.22
241 0.21
242 0.22
243 0.21
244 0.18
245 0.16
246 0.14
247 0.11
248 0.07
249 0.07
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.1
266 0.17
267 0.18
268 0.19
269 0.2
270 0.23
271 0.25
272 0.25
273 0.24
274 0.25
275 0.28
276 0.37
277 0.41
278 0.41
279 0.41
280 0.4
281 0.41
282 0.33
283 0.33
284 0.26
285 0.28
286 0.31
287 0.31
288 0.3
289 0.27
290 0.27
291 0.24
292 0.22
293 0.15
294 0.09
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.07
320 0.08
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.07
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.12
330 0.17
331 0.2
332 0.22
333 0.22
334 0.27
335 0.28
336 0.28
337 0.26
338 0.21
339 0.22
340 0.21
341 0.22
342 0.16
343 0.13
344 0.13
345 0.12
346 0.12
347 0.08
348 0.07
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.1
357 0.1
358 0.09
359 0.1
360 0.09
361 0.09
362 0.1
363 0.09
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.1
369 0.11
370 0.11
371 0.12
372 0.12
373 0.14
374 0.15
375 0.16
376 0.2
377 0.21
378 0.22
379 0.22
380 0.22
381 0.27
382 0.28
383 0.28
384 0.25
385 0.25
386 0.23
387 0.22
388 0.2
389 0.13
390 0.12
391 0.1
392 0.07
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.06
413 0.06
414 0.05
415 0.06
416 0.07
417 0.1
418 0.11
419 0.12
420 0.17
421 0.21
422 0.29
423 0.37
424 0.46
425 0.49
426 0.5
427 0.52
428 0.48
429 0.44
430 0.36
431 0.3
432 0.21
433 0.16
434 0.13
435 0.12
436 0.1
437 0.1
438 0.1
439 0.09
440 0.08
441 0.09
442 0.1
443 0.08
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.08
448 0.1
449 0.1
450 0.09
451 0.09
452 0.08
453 0.11
454 0.13
455 0.15
456 0.2
457 0.23
458 0.27
459 0.3
460 0.32
461 0.31
462 0.31
463 0.28
464 0.28
465 0.3
466 0.28
467 0.3
468 0.28
469 0.27
470 0.25
471 0.26
472 0.2
473 0.2
474 0.2
475 0.16
476 0.16
477 0.16
478 0.17
479 0.2
480 0.21
481 0.2
482 0.24
483 0.24
484 0.25
485 0.28
486 0.28
487 0.28
488 0.26
489 0.25
490 0.23
491 0.23
492 0.24
493 0.22
494 0.24
495 0.23
496 0.24
497 0.23
498 0.21
499 0.2
500 0.2
501 0.2
502 0.18
503 0.16
504 0.18
505 0.18
506 0.19
507 0.26
508 0.27
509 0.26
510 0.25
511 0.29
512 0.27
513 0.27
514 0.24
515 0.18
516 0.2
517 0.19
518 0.22
519 0.24
520 0.26
521 0.27
522 0.29
523 0.27
524 0.24
525 0.24
526 0.24
527 0.23
528 0.21
529 0.22
530 0.24
531 0.25
532 0.25
533 0.26
534 0.24
535 0.26
536 0.33
537 0.42
538 0.46
539 0.53
540 0.61
541 0.64
542 0.65
543 0.64
544 0.6
545 0.53
546 0.47
547 0.45
548 0.4
549 0.39
550 0.39
551 0.35
552 0.3
553 0.26
554 0.24
555 0.18
556 0.14
557 0.13
558 0.1
559 0.08
560 0.08
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.08
567 0.09
568 0.09
569 0.09
570 0.1
571 0.09
572 0.1
573 0.09
574 0.14
575 0.15
576 0.19
577 0.19
578 0.2
579 0.21
580 0.21
581 0.24
582 0.22
583 0.25
584 0.24
585 0.26
586 0.28
587 0.28
588 0.27
589 0.25
590 0.23
591 0.19
592 0.18
593 0.23
594 0.21
595 0.23
596 0.24
597 0.23
598 0.23