Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1E248

Protein Details
Accession A0A0D1E248    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-100VAPWGSMERRRRNRGDRRLVEFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 10, cyto 10, cyto_mito 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001247  ExoRNase_PH_dom1  
IPR036345  ExoRNase_PH_dom2_sf  
IPR027408  PNPase/RNase_PH_dom_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0000177  C:cytoplasmic exosome (RNase complex)  
GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0004527  F:exonuclease activity  
GO:0071028  P:nuclear mRNA surveillance  
GO:0071031  P:nuclear mRNA surveillance of mRNA 3'-end processing  
GO:0034427  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic, 3'-5'  
GO:0071051  P:polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing  
GO:0016075  P:rRNA catabolic process  
GO:0006364  P:rRNA processing  
GO:0030847  P:termination of RNA polymerase II transcription, exosome-dependent  
GO:0034475  P:U4 snRNA 3'-end processing  
KEGG uma:UMAG_03227  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01138  RNase_PH  
CDD cd11370  RNase_PH_RRP41  
Amino Acid Sequences MSRVELLNAGGFRIDGRKQFELRSIGIQLGGSQDTAADGCAQITQGLTIVSATVFGPREARSGANVMHDRASVNVEVSVAPWGSMERRRRNRGDRRLVEFANSIKSTFEPVIHTHLYPRSQIDIFVQVHQQDGGVLPAAINASTLALLDAGIAMQDFVASVSCGIHSTSAMLDLSNTEEQDLPHVTVAVLPRTKQITLASLETRLHVERFEQIFTLAIQAVAVLHNEMELAVRDRTKTLVHAMTGRTIESETAVHHDQDAEHDSPDHDDIMLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.27
4 0.32
5 0.35
6 0.37
7 0.43
8 0.42
9 0.41
10 0.4
11 0.35
12 0.29
13 0.28
14 0.25
15 0.19
16 0.17
17 0.15
18 0.11
19 0.09
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.07
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.06
35 0.05
36 0.05
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.08
41 0.09
42 0.09
43 0.12
44 0.12
45 0.14
46 0.15
47 0.16
48 0.14
49 0.16
50 0.17
51 0.22
52 0.24
53 0.23
54 0.23
55 0.22
56 0.21
57 0.19
58 0.2
59 0.13
60 0.11
61 0.1
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.07
70 0.1
71 0.17
72 0.26
73 0.35
74 0.44
75 0.52
76 0.6
77 0.7
78 0.78
79 0.82
80 0.84
81 0.8
82 0.78
83 0.76
84 0.68
85 0.6
86 0.51
87 0.41
88 0.36
89 0.29
90 0.22
91 0.16
92 0.16
93 0.17
94 0.15
95 0.15
96 0.12
97 0.13
98 0.18
99 0.18
100 0.18
101 0.18
102 0.21
103 0.21
104 0.2
105 0.19
106 0.18
107 0.16
108 0.17
109 0.16
110 0.19
111 0.18
112 0.18
113 0.19
114 0.16
115 0.16
116 0.15
117 0.13
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.04
122 0.04
123 0.03
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.02
141 0.02
142 0.02
143 0.02
144 0.02
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.1
167 0.12
168 0.13
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.11
174 0.12
175 0.15
176 0.15
177 0.14
178 0.18
179 0.2
180 0.2
181 0.2
182 0.19
183 0.18
184 0.2
185 0.23
186 0.21
187 0.21
188 0.22
189 0.2
190 0.22
191 0.19
192 0.17
193 0.14
194 0.14
195 0.19
196 0.2
197 0.2
198 0.18
199 0.17
200 0.17
201 0.17
202 0.18
203 0.1
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.09
218 0.11
219 0.13
220 0.14
221 0.15
222 0.17
223 0.18
224 0.19
225 0.22
226 0.23
227 0.24
228 0.28
229 0.29
230 0.31
231 0.31
232 0.28
233 0.23
234 0.2
235 0.18
236 0.15
237 0.14
238 0.11
239 0.16
240 0.18
241 0.17
242 0.17
243 0.18
244 0.17
245 0.2
246 0.25
247 0.2
248 0.19
249 0.2
250 0.2
251 0.22
252 0.23
253 0.2