Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A8N0X9

Protein Details
Accession A8N0X9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-56PPPNTATNSNPPPKKRKKSNQKSKNRANQQPSTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-47PPKKRKKSNQKSKN
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG cci:CC1G_12189  -  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MSGRPLVSYADITEPYEAPEPPPPPNTATNSNPPPKKRKKSNQKSKNRANQQPSTTTTQSRGSNNVSGFEESRELTHEEIWDDSALIDAWNAANEEYEAFHGSGQGWKRQPVTKAPLWYNIPPSTQTQGFIPAQDTSHGQNDDEHVVADEVNGVEGDHGHGLEPPPAPTYDPTALGSLDSTPMASQDEAFSRALNAMYWSGYWTAVYHCHRKLTPQQPSSQAKPTTAEDAAEDIVEEAEQEGQDQDEEMADDQEEESPEFVTTQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.21
4 0.2
5 0.18
6 0.24
7 0.26
8 0.28
9 0.31
10 0.31
11 0.32
12 0.37
13 0.41
14 0.41
15 0.44
16 0.49
17 0.54
18 0.61
19 0.64
20 0.66
21 0.71
22 0.75
23 0.8
24 0.82
25 0.84
26 0.87
27 0.91
28 0.95
29 0.95
30 0.95
31 0.96
32 0.95
33 0.95
34 0.93
35 0.91
36 0.89
37 0.86
38 0.8
39 0.75
40 0.69
41 0.65
42 0.58
43 0.5
44 0.45
45 0.43
46 0.42
47 0.38
48 0.38
49 0.35
50 0.37
51 0.35
52 0.34
53 0.3
54 0.28
55 0.26
56 0.23
57 0.21
58 0.16
59 0.16
60 0.15
61 0.15
62 0.13
63 0.14
64 0.13
65 0.12
66 0.13
67 0.13
68 0.11
69 0.09
70 0.08
71 0.07
72 0.06
73 0.06
74 0.05
75 0.04
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.04
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.11
91 0.13
92 0.18
93 0.18
94 0.2
95 0.24
96 0.27
97 0.29
98 0.32
99 0.37
100 0.35
101 0.39
102 0.38
103 0.41
104 0.41
105 0.4
106 0.38
107 0.33
108 0.29
109 0.25
110 0.26
111 0.23
112 0.2
113 0.19
114 0.14
115 0.17
116 0.17
117 0.15
118 0.14
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.13
123 0.1
124 0.13
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.14
129 0.14
130 0.13
131 0.11
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.03
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.06
149 0.09
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.12
156 0.17
157 0.15
158 0.16
159 0.17
160 0.16
161 0.16
162 0.15
163 0.14
164 0.09
165 0.09
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.09
175 0.12
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.1
182 0.1
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.09
192 0.16
193 0.21
194 0.27
195 0.29
196 0.34
197 0.34
198 0.4
199 0.49
200 0.52
201 0.57
202 0.55
203 0.59
204 0.63
205 0.69
206 0.68
207 0.66
208 0.58
209 0.49
210 0.48
211 0.44
212 0.4
213 0.34
214 0.3
215 0.22
216 0.22
217 0.2
218 0.17
219 0.14
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.12