Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V1ATW5

Protein Details
Accession A0A2V1ATW5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
210-232EKAKTNVKKPVPTKTKKPRRGQQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
211-230KAKTNVKKPVPTKTKKPRRG
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034158  SF3B4_RRM1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12334  RRM1_SF3B4  
Amino Acid Sequences MNVFKKASDSDRNFQSSLYIGNLDPQVDEPLLYELFIQLGPVKSLYLPKDRISRKHQGFGFIEFRTPEDAGYALEILRGIRLYGRILKMKKTDPKHGTSSTSSAGAGDEVGLSIGARLFVKNLNQMVDDKYLKETFGKFGNLIENPSIVRDEEGNSKGHGFVEYDSFEASDEAIERMNGAILMNNRVTVEYAYKEGKSRHGDSVERLLAEKAKTNVKKPVPTKTKKPRRGQQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.44
3 0.34
4 0.29
5 0.24
6 0.19
7 0.14
8 0.18
9 0.19
10 0.17
11 0.17
12 0.16
13 0.16
14 0.15
15 0.15
16 0.11
17 0.13
18 0.13
19 0.12
20 0.11
21 0.08
22 0.09
23 0.09
24 0.08
25 0.08
26 0.09
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.16
32 0.2
33 0.24
34 0.27
35 0.31
36 0.4
37 0.45
38 0.51
39 0.54
40 0.61
41 0.58
42 0.63
43 0.6
44 0.58
45 0.55
46 0.53
47 0.5
48 0.4
49 0.37
50 0.29
51 0.28
52 0.24
53 0.22
54 0.16
55 0.12
56 0.12
57 0.1
58 0.1
59 0.09
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.05
64 0.06
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.07
69 0.09
70 0.13
71 0.17
72 0.23
73 0.24
74 0.29
75 0.33
76 0.39
77 0.45
78 0.45
79 0.52
80 0.51
81 0.54
82 0.55
83 0.53
84 0.5
85 0.44
86 0.42
87 0.32
88 0.28
89 0.23
90 0.17
91 0.14
92 0.1
93 0.08
94 0.05
95 0.04
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.02
100 0.02
101 0.02
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.04
106 0.06
107 0.07
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.12
112 0.13
113 0.15
114 0.18
115 0.17
116 0.15
117 0.17
118 0.16
119 0.16
120 0.17
121 0.15
122 0.13
123 0.16
124 0.16
125 0.13
126 0.14
127 0.18
128 0.17
129 0.17
130 0.16
131 0.13
132 0.12
133 0.13
134 0.12
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.14
140 0.16
141 0.16
142 0.16
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.15
147 0.1
148 0.09
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.08
168 0.09
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.13
174 0.14
175 0.13
176 0.14
177 0.13
178 0.16
179 0.18
180 0.19
181 0.23
182 0.24
183 0.31
184 0.35
185 0.37
186 0.4
187 0.43
188 0.45
189 0.45
190 0.52
191 0.46
192 0.4
193 0.37
194 0.32
195 0.31
196 0.3
197 0.31
198 0.25
199 0.33
200 0.37
201 0.41
202 0.49
203 0.53
204 0.61
205 0.61
206 0.68
207 0.69
208 0.73
209 0.79
210 0.81
211 0.85
212 0.85