Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V1APU2

Protein Details
Accession A0A2V1APU2    Localization Confidence Low Confidence Score 7.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
508-527ISIYNKKEKKWSVDHKQVTLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 13.333, nucl 9.5, cyto_mito 8.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013915  Pre-mRNA_splic_Prp19  
IPR038959  Prp19  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0070534  P:protein K63-linked ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF08606  Prp19  
CDD cd16656  RING-Ubox_PRP19  
Amino Acid Sequences MLCSLSGEEAQEPVVSPKSGCIFEKRLIESYISTTGKDPVSEESLAVEELIGVKSKDPVIVPPKPAAFNSIPTMLAAFQNEWDALVLETFTLRKELHNTKQELSASLYQYDAAVRVAGKALKERDEAREALAELSKTFASSDKENGMEVDEKADTGSAPSEEAPAVEKSESIETSGSTSGDLESRIEPVDTYRDSQSGSPRDDDSEGSRELQRERNTAPRSDAELEDESATVPMPADHAQDILAGQERLFGIHKNLRLTVPGAVSGKFEVHYEVEPHNLSPRVRNYIAVSGHGHIAIYDETSIYLHPEGKHIRKKSRINCVGFTGSSLQLVISCANSLLYVYTMRGATERAIRHRQGEIYWIMPHPCVPMTIGVNRDRWVVFNSNREIHNPGFILTRICAEALHVDGRLLALGTYAGQIVIFDIVNNEKVASINTRYNRVTKIEFAFNGYWLFAASYNDSTKGSVQLFDLRKNTLLHEFPYDGKTEFSIDRSSSVLATIVKGTKHVNISIYNKKEKKWSVDHKQVTLPEPLIQVERSGNVNVPFQSYKPTFAGLSKTALYHFTVESL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.15
4 0.19
5 0.23
6 0.26
7 0.27
8 0.31
9 0.33
10 0.38
11 0.45
12 0.45
13 0.44
14 0.43
15 0.42
16 0.37
17 0.36
18 0.39
19 0.32
20 0.29
21 0.27
22 0.3
23 0.29
24 0.27
25 0.24
26 0.2
27 0.24
28 0.23
29 0.22
30 0.19
31 0.19
32 0.18
33 0.16
34 0.12
35 0.07
36 0.08
37 0.09
38 0.09
39 0.08
40 0.09
41 0.12
42 0.13
43 0.15
44 0.15
45 0.22
46 0.29
47 0.35
48 0.38
49 0.4
50 0.43
51 0.43
52 0.42
53 0.41
54 0.35
55 0.33
56 0.33
57 0.3
58 0.26
59 0.24
60 0.25
61 0.19
62 0.18
63 0.16
64 0.13
65 0.11
66 0.13
67 0.13
68 0.12
69 0.11
70 0.1
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.06
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.09
79 0.09
80 0.12
81 0.2
82 0.28
83 0.37
84 0.45
85 0.49
86 0.48
87 0.54
88 0.52
89 0.46
90 0.43
91 0.4
92 0.33
93 0.29
94 0.28
95 0.22
96 0.21
97 0.19
98 0.14
99 0.09
100 0.08
101 0.07
102 0.08
103 0.1
104 0.12
105 0.12
106 0.18
107 0.2
108 0.23
109 0.26
110 0.28
111 0.31
112 0.34
113 0.34
114 0.29
115 0.29
116 0.26
117 0.24
118 0.24
119 0.18
120 0.14
121 0.15
122 0.13
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.13
127 0.15
128 0.19
129 0.2
130 0.2
131 0.21
132 0.2
133 0.19
134 0.18
135 0.16
136 0.16
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.09
142 0.07
143 0.08
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.13
157 0.13
158 0.12
159 0.11
160 0.1
161 0.12
162 0.13
163 0.11
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.13
177 0.13
178 0.15
179 0.15
180 0.16
181 0.17
182 0.19
183 0.25
184 0.26
185 0.27
186 0.27
187 0.26
188 0.27
189 0.27
190 0.26
191 0.22
192 0.21
193 0.19
194 0.19
195 0.2
196 0.2
197 0.22
198 0.28
199 0.27
200 0.27
201 0.29
202 0.36
203 0.37
204 0.37
205 0.37
206 0.32
207 0.34
208 0.33
209 0.31
210 0.25
211 0.24
212 0.23
213 0.2
214 0.18
215 0.13
216 0.11
217 0.1
218 0.06
219 0.05
220 0.04
221 0.05
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.08
234 0.07
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.11
239 0.16
240 0.18
241 0.18
242 0.19
243 0.19
244 0.19
245 0.2
246 0.18
247 0.14
248 0.14
249 0.14
250 0.13
251 0.13
252 0.12
253 0.11
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.1
260 0.1
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.14
265 0.15
266 0.15
267 0.17
268 0.2
269 0.23
270 0.23
271 0.25
272 0.23
273 0.26
274 0.26
275 0.24
276 0.22
277 0.17
278 0.17
279 0.16
280 0.14
281 0.08
282 0.09
283 0.07
284 0.05
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.08
293 0.08
294 0.13
295 0.18
296 0.26
297 0.33
298 0.38
299 0.45
300 0.52
301 0.6
302 0.63
303 0.69
304 0.71
305 0.67
306 0.63
307 0.6
308 0.53
309 0.44
310 0.38
311 0.29
312 0.2
313 0.16
314 0.14
315 0.1
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.04
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.09
335 0.14
336 0.17
337 0.22
338 0.28
339 0.3
340 0.32
341 0.33
342 0.33
343 0.28
344 0.29
345 0.24
346 0.2
347 0.2
348 0.19
349 0.18
350 0.16
351 0.16
352 0.13
353 0.12
354 0.11
355 0.09
356 0.11
357 0.13
358 0.16
359 0.2
360 0.21
361 0.23
362 0.23
363 0.24
364 0.22
365 0.2
366 0.21
367 0.24
368 0.24
369 0.29
370 0.33
371 0.34
372 0.35
373 0.36
374 0.36
375 0.3
376 0.3
377 0.23
378 0.2
379 0.18
380 0.18
381 0.17
382 0.14
383 0.14
384 0.11
385 0.11
386 0.1
387 0.09
388 0.1
389 0.1
390 0.11
391 0.1
392 0.09
393 0.09
394 0.09
395 0.08
396 0.07
397 0.05
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.05
408 0.05
409 0.04
410 0.06
411 0.07
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.08
416 0.08
417 0.1
418 0.12
419 0.15
420 0.21
421 0.23
422 0.29
423 0.31
424 0.34
425 0.36
426 0.36
427 0.36
428 0.35
429 0.37
430 0.37
431 0.35
432 0.37
433 0.34
434 0.31
435 0.29
436 0.23
437 0.18
438 0.13
439 0.13
440 0.09
441 0.1
442 0.11
443 0.14
444 0.15
445 0.17
446 0.17
447 0.17
448 0.17
449 0.2
450 0.19
451 0.16
452 0.17
453 0.24
454 0.27
455 0.31
456 0.33
457 0.3
458 0.32
459 0.32
460 0.33
461 0.31
462 0.31
463 0.27
464 0.3
465 0.3
466 0.29
467 0.3
468 0.29
469 0.23
470 0.21
471 0.2
472 0.19
473 0.18
474 0.18
475 0.2
476 0.19
477 0.2
478 0.2
479 0.2
480 0.17
481 0.16
482 0.16
483 0.12
484 0.13
485 0.16
486 0.17
487 0.16
488 0.18
489 0.2
490 0.23
491 0.25
492 0.26
493 0.26
494 0.3
495 0.38
496 0.45
497 0.51
498 0.56
499 0.56
500 0.57
501 0.63
502 0.63
503 0.64
504 0.65
505 0.69
506 0.69
507 0.76
508 0.8
509 0.75
510 0.75
511 0.7
512 0.63
513 0.57
514 0.48
515 0.4
516 0.35
517 0.33
518 0.29
519 0.25
520 0.24
521 0.2
522 0.21
523 0.2
524 0.2
525 0.22
526 0.22
527 0.26
528 0.24
529 0.28
530 0.28
531 0.26
532 0.33
533 0.31
534 0.33
535 0.3
536 0.32
537 0.28
538 0.29
539 0.35
540 0.29
541 0.31
542 0.28
543 0.27
544 0.26
545 0.27
546 0.26
547 0.22