Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V1AWD5

Protein Details
Accession A0A2V1AWD5    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-31LSAEIAKKRKAAKEKSNIKKPKVETHydrophilic
282-314AVVKVNKKTKSNGKPFKQTKFKVRGKRYQYTLVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-28KKRKAAKEKSNIKKPK
286-307VNKKTKSNGKPFKQTKFKVRGK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 11.833, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR039979  PRPF18  
IPR002675  Ribosomal_L38e  
IPR038464  Ribosomal_L38e_sf  
Gene Ontology GO:0005840  C:ribosome  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
PF01781  Ribosomal_L38e  
Amino Acid Sequences MGLSGLLSAEIAKKRKAAKEKSNIKKPKVETSTSEDSKKDDGPDEPHTVTDEQKLLDSVSEDRLEKSLKAFEGDDSTLSKEDQLRKLDLLVKTEQRNDAYKAYLDEENAVSPTITLEDIGAIETKKRQLELQIRRSLKGIISLWEALPQEPPEPYTIGMLKEVKRDIIKLLYRLRTGKLDESIILSLATIIYYIQLQDFVKANESYMKLSIGNVAYPIGIRDVGIHARAALSKITGEDKSTIANVMKDETTRKWILSVKLQKEIKDIKEFVELARRADIKSAVVKVNKKTKSNGKPFKQTKFKVRGKRYQYTLVVDDVSKAKKLQQSLPPSLKIQSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.45
3 0.55
4 0.59
5 0.64
6 0.72
7 0.8
8 0.86
9 0.89
10 0.9
11 0.86
12 0.85
13 0.78
14 0.78
15 0.74
16 0.68
17 0.63
18 0.62
19 0.65
20 0.61
21 0.6
22 0.5
23 0.46
24 0.45
25 0.42
26 0.37
27 0.3
28 0.3
29 0.32
30 0.37
31 0.4
32 0.37
33 0.34
34 0.34
35 0.32
36 0.3
37 0.28
38 0.24
39 0.19
40 0.19
41 0.19
42 0.16
43 0.16
44 0.16
45 0.13
46 0.15
47 0.18
48 0.17
49 0.18
50 0.2
51 0.21
52 0.2
53 0.21
54 0.21
55 0.19
56 0.21
57 0.2
58 0.19
59 0.22
60 0.22
61 0.21
62 0.17
63 0.19
64 0.17
65 0.16
66 0.18
67 0.19
68 0.25
69 0.3
70 0.32
71 0.32
72 0.32
73 0.35
74 0.39
75 0.35
76 0.32
77 0.31
78 0.33
79 0.35
80 0.38
81 0.38
82 0.34
83 0.36
84 0.35
85 0.32
86 0.28
87 0.26
88 0.24
89 0.23
90 0.22
91 0.19
92 0.17
93 0.16
94 0.14
95 0.14
96 0.12
97 0.09
98 0.08
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.05
109 0.07
110 0.08
111 0.12
112 0.12
113 0.13
114 0.14
115 0.21
116 0.31
117 0.4
118 0.47
119 0.52
120 0.53
121 0.53
122 0.53
123 0.46
124 0.37
125 0.32
126 0.23
127 0.17
128 0.18
129 0.18
130 0.17
131 0.19
132 0.19
133 0.14
134 0.14
135 0.13
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.1
145 0.13
146 0.15
147 0.15
148 0.18
149 0.18
150 0.18
151 0.17
152 0.17
153 0.16
154 0.19
155 0.19
156 0.21
157 0.27
158 0.28
159 0.3
160 0.3
161 0.31
162 0.27
163 0.28
164 0.25
165 0.21
166 0.19
167 0.17
168 0.17
169 0.16
170 0.13
171 0.11
172 0.08
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.06
183 0.06
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.12
188 0.12
189 0.13
190 0.15
191 0.16
192 0.15
193 0.14
194 0.15
195 0.12
196 0.12
197 0.15
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.08
210 0.09
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.14
227 0.14
228 0.15
229 0.13
230 0.14
231 0.13
232 0.13
233 0.14
234 0.14
235 0.17
236 0.17
237 0.22
238 0.22
239 0.22
240 0.24
241 0.28
242 0.3
243 0.37
244 0.45
245 0.42
246 0.5
247 0.53
248 0.5
249 0.52
250 0.56
251 0.51
252 0.49
253 0.46
254 0.39
255 0.42
256 0.41
257 0.35
258 0.38
259 0.33
260 0.27
261 0.32
262 0.31
263 0.26
264 0.28
265 0.28
266 0.22
267 0.26
268 0.28
269 0.28
270 0.34
271 0.39
272 0.44
273 0.52
274 0.56
275 0.55
276 0.59
277 0.64
278 0.68
279 0.74
280 0.77
281 0.76
282 0.8
283 0.85
284 0.87
285 0.87
286 0.84
287 0.83
288 0.83
289 0.84
290 0.84
291 0.86
292 0.85
293 0.84
294 0.86
295 0.81
296 0.8
297 0.75
298 0.7
299 0.63
300 0.55
301 0.48
302 0.39
303 0.36
304 0.31
305 0.29
306 0.25
307 0.23
308 0.27
309 0.29
310 0.35
311 0.4
312 0.44
313 0.51
314 0.6
315 0.66
316 0.63
317 0.61