Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V1AZM4

Protein Details
Accession A0A2V1AZM4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-59PKQPSRFKSKGSAKKPQPEVPEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-52RFKSKGSAKK
Subcellular Location(s) cyto 15, cyto_nucl 11.333, cyto_pero 10.333, nucl 6.5, pero 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013929  RNA_pol_II_AP1_C  
IPR013930  RNA_pol_II_AP1_N  
IPR039913  RPAP1/Rba50  
Gene Ontology GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08620  RPAP1_C  
PF08621  RPAP1_N  
Amino Acid Sequences MSLLGDIVEHGTAEATLPELSEHSQKTGFPELRKFDIPKQPSRFKSKGSAKKPQPEVPEEPKAPAKESTSTSQSEPVSEAQRIHEENLKKIMQLSPDQFISERDELLQGLDPKLLEGLKKRAEKKDSKHVHAEGHDGWIGGGKNGVELPHLDTDEVNKALGIKSVKFDDKPVEHQIMESVESDEEHDGPEEEGDDEIAPDDYQIAPPEEHPPIEMHFPKPKVASEDPDMDINDPEFLDKLHEKYYPELPKETNKLAWMKDQGPQKRSTTYEAISDMRFDFKGNLIELDDSKADIPTHLGLHHHSADPHMAGYTLVELAHLARSVVPTQRSIAIQTIGRILHKLGLHKYDIMPLQDDGDGNPVAEEVATLMNEFELMMWDLIDQLRLTETLTEAADEKKTRNLSVRNYAIEALWLWKQGGGKPKDSRRTEEEVIAEQLQQM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.06
4 0.07
5 0.07
6 0.08
7 0.11
8 0.17
9 0.18
10 0.2
11 0.22
12 0.23
13 0.28
14 0.36
15 0.39
16 0.38
17 0.46
18 0.48
19 0.52
20 0.57
21 0.56
22 0.55
23 0.6
24 0.62
25 0.63
26 0.67
27 0.71
28 0.73
29 0.78
30 0.73
31 0.68
32 0.71
33 0.72
34 0.73
35 0.73
36 0.76
37 0.76
38 0.82
39 0.84
40 0.81
41 0.77
42 0.74
43 0.73
44 0.71
45 0.71
46 0.62
47 0.58
48 0.58
49 0.52
50 0.47
51 0.42
52 0.38
53 0.33
54 0.36
55 0.37
56 0.35
57 0.36
58 0.35
59 0.37
60 0.33
61 0.3
62 0.28
63 0.26
64 0.26
65 0.26
66 0.25
67 0.22
68 0.28
69 0.28
70 0.28
71 0.31
72 0.29
73 0.31
74 0.37
75 0.35
76 0.29
77 0.3
78 0.31
79 0.28
80 0.32
81 0.31
82 0.28
83 0.28
84 0.29
85 0.27
86 0.25
87 0.28
88 0.22
89 0.2
90 0.17
91 0.17
92 0.16
93 0.17
94 0.19
95 0.15
96 0.14
97 0.15
98 0.14
99 0.13
100 0.15
101 0.14
102 0.12
103 0.15
104 0.22
105 0.29
106 0.36
107 0.42
108 0.48
109 0.57
110 0.63
111 0.65
112 0.69
113 0.7
114 0.68
115 0.7
116 0.65
117 0.61
118 0.54
119 0.52
120 0.42
121 0.36
122 0.31
123 0.23
124 0.2
125 0.18
126 0.16
127 0.11
128 0.12
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.07
134 0.07
135 0.1
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.14
141 0.16
142 0.16
143 0.13
144 0.1
145 0.11
146 0.11
147 0.14
148 0.13
149 0.11
150 0.13
151 0.16
152 0.19
153 0.18
154 0.2
155 0.23
156 0.24
157 0.28
158 0.31
159 0.3
160 0.28
161 0.27
162 0.27
163 0.22
164 0.2
165 0.16
166 0.12
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.17
201 0.17
202 0.17
203 0.22
204 0.23
205 0.24
206 0.25
207 0.24
208 0.26
209 0.26
210 0.26
211 0.24
212 0.26
213 0.25
214 0.25
215 0.24
216 0.19
217 0.17
218 0.14
219 0.11
220 0.07
221 0.07
222 0.05
223 0.05
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.12
228 0.14
229 0.15
230 0.18
231 0.26
232 0.29
233 0.29
234 0.3
235 0.3
236 0.33
237 0.37
238 0.36
239 0.29
240 0.27
241 0.29
242 0.27
243 0.3
244 0.28
245 0.26
246 0.29
247 0.35
248 0.38
249 0.38
250 0.4
251 0.38
252 0.38
253 0.39
254 0.39
255 0.35
256 0.3
257 0.29
258 0.27
259 0.27
260 0.23
261 0.23
262 0.18
263 0.16
264 0.15
265 0.13
266 0.12
267 0.12
268 0.14
269 0.13
270 0.13
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.14
275 0.12
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.09
280 0.08
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.16
288 0.17
289 0.17
290 0.15
291 0.16
292 0.17
293 0.16
294 0.15
295 0.11
296 0.09
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.08
310 0.1
311 0.15
312 0.16
313 0.16
314 0.18
315 0.2
316 0.2
317 0.21
318 0.21
319 0.19
320 0.19
321 0.18
322 0.2
323 0.18
324 0.18
325 0.17
326 0.15
327 0.17
328 0.18
329 0.22
330 0.23
331 0.26
332 0.27
333 0.29
334 0.29
335 0.3
336 0.31
337 0.27
338 0.25
339 0.21
340 0.21
341 0.2
342 0.19
343 0.14
344 0.15
345 0.14
346 0.12
347 0.11
348 0.09
349 0.08
350 0.08
351 0.07
352 0.04
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.05
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.09
368 0.1
369 0.08
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.09
375 0.1
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.12
380 0.14
381 0.19
382 0.19
383 0.2
384 0.25
385 0.28
386 0.31
387 0.38
388 0.43
389 0.46
390 0.54
391 0.59
392 0.54
393 0.54
394 0.51
395 0.43
396 0.37
397 0.29
398 0.23
399 0.19
400 0.17
401 0.15
402 0.16
403 0.19
404 0.21
405 0.31
406 0.32
407 0.39
408 0.47
409 0.57
410 0.65
411 0.68
412 0.71
413 0.68
414 0.72
415 0.67
416 0.63
417 0.57
418 0.51
419 0.5
420 0.44