Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V1AYX8

Protein Details
Accession A0A2V1AYX8    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-32MAIQCKPRPPPQQQKDGTKKKKKTLGDTQPIVHydrophilic
179-201SLHSEDNKRRREKNKSKKAASANHydrophilic
222-277KPPPAALKKKPYQECKKEKDQNHKKSDKDADSVKKDAKNTKKKSLKAKKPTLTTSTHydrophilic
285-336EKPGGGDPSKPKKKQTKAKKSKGKGSPSTEQTQATHKKTPSQSNKSTTKKTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-22KKKK
186-199KRRREKNKSKKAAS
222-271KPPPAALKKKPYQECKKEKDQNHKKSDKDADSVKKDAKNTKKKSLKAKKP
285-309EKPGGGDPSKPKKKQTKAKKSKGKG
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MAIQCKPRPPPQQQKDGTKKKKKTLGDTQPIVNYEDPDLKVVIRLLPPNMSEEAFLSQIPKEYQPTINGTRGLRRFYFQRGSASTKPFEEPNFSRAYFQFQEKQDADHFKSEMEQIVFEDPASGDRVKCEMMKPLFGTVIETTSEKSEGKILQETLYKKFISQRSADATDIDMVKLIKSLHSEDNKRRREKNKSKKAASANTKPESAPETLSSREQSKTIVKPPPAALKKKPYQECKKEKDQNHKKSDKDADSVKKDAKNTKKKSLKAKKPTLTTSTKSLNITPEKPGGGDPSKPKKKQTKAKKSKGKGSPSTEQTQATHKKTPSQSNKSTTKKTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.88
3 0.9
4 0.9
5 0.89
6 0.9
7 0.89
8 0.89
9 0.86
10 0.85
11 0.85
12 0.85
13 0.84
14 0.79
15 0.74
16 0.69
17 0.63
18 0.56
19 0.46
20 0.36
21 0.29
22 0.3
23 0.26
24 0.23
25 0.22
26 0.19
27 0.2
28 0.19
29 0.2
30 0.18
31 0.2
32 0.21
33 0.23
34 0.24
35 0.25
36 0.26
37 0.22
38 0.19
39 0.18
40 0.18
41 0.16
42 0.15
43 0.13
44 0.12
45 0.15
46 0.17
47 0.17
48 0.18
49 0.21
50 0.24
51 0.26
52 0.32
53 0.33
54 0.35
55 0.37
56 0.36
57 0.41
58 0.41
59 0.43
60 0.37
61 0.35
62 0.35
63 0.38
64 0.43
65 0.37
66 0.4
67 0.4
68 0.47
69 0.5
70 0.51
71 0.46
72 0.41
73 0.4
74 0.36
75 0.33
76 0.33
77 0.3
78 0.29
79 0.31
80 0.29
81 0.3
82 0.28
83 0.34
84 0.29
85 0.31
86 0.34
87 0.31
88 0.38
89 0.36
90 0.38
91 0.36
92 0.4
93 0.38
94 0.34
95 0.33
96 0.25
97 0.26
98 0.24
99 0.22
100 0.17
101 0.14
102 0.12
103 0.13
104 0.13
105 0.11
106 0.11
107 0.07
108 0.08
109 0.1
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.11
114 0.12
115 0.13
116 0.13
117 0.18
118 0.18
119 0.21
120 0.21
121 0.2
122 0.2
123 0.19
124 0.2
125 0.12
126 0.12
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.11
132 0.09
133 0.09
134 0.11
135 0.11
136 0.13
137 0.14
138 0.14
139 0.15
140 0.19
141 0.21
142 0.21
143 0.23
144 0.21
145 0.2
146 0.26
147 0.27
148 0.27
149 0.26
150 0.26
151 0.28
152 0.31
153 0.3
154 0.24
155 0.21
156 0.19
157 0.17
158 0.14
159 0.1
160 0.08
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.08
166 0.12
167 0.17
168 0.23
169 0.29
170 0.37
171 0.47
172 0.55
173 0.59
174 0.64
175 0.66
176 0.72
177 0.77
178 0.79
179 0.8
180 0.82
181 0.8
182 0.8
183 0.8
184 0.78
185 0.75
186 0.72
187 0.7
188 0.62
189 0.59
190 0.51
191 0.44
192 0.38
193 0.31
194 0.23
195 0.17
196 0.17
197 0.18
198 0.2
199 0.2
200 0.2
201 0.19
202 0.18
203 0.19
204 0.23
205 0.26
206 0.31
207 0.36
208 0.35
209 0.38
210 0.41
211 0.48
212 0.49
213 0.5
214 0.49
215 0.53
216 0.58
217 0.63
218 0.68
219 0.68
220 0.72
221 0.77
222 0.81
223 0.79
224 0.83
225 0.83
226 0.83
227 0.84
228 0.84
229 0.84
230 0.84
231 0.84
232 0.75
233 0.74
234 0.76
235 0.69
236 0.63
237 0.61
238 0.59
239 0.57
240 0.6
241 0.57
242 0.51
243 0.52
244 0.56
245 0.58
246 0.6
247 0.63
248 0.69
249 0.72
250 0.75
251 0.81
252 0.83
253 0.83
254 0.84
255 0.87
256 0.84
257 0.82
258 0.82
259 0.78
260 0.75
261 0.67
262 0.62
263 0.57
264 0.53
265 0.48
266 0.44
267 0.44
268 0.43
269 0.42
270 0.4
271 0.38
272 0.34
273 0.33
274 0.32
275 0.31
276 0.28
277 0.32
278 0.38
279 0.45
280 0.55
281 0.58
282 0.67
283 0.7
284 0.77
285 0.82
286 0.83
287 0.84
288 0.85
289 0.92
290 0.94
291 0.93
292 0.92
293 0.91
294 0.9
295 0.88
296 0.85
297 0.83
298 0.79
299 0.74
300 0.68
301 0.61
302 0.53
303 0.53
304 0.54
305 0.5
306 0.52
307 0.49
308 0.54
309 0.59
310 0.68
311 0.7
312 0.7
313 0.74
314 0.75
315 0.83
316 0.83