Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V1ATE3

Protein Details
Accession A0A2V1ATE3    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
61-80PPATNMPRKRFDKKNAQTFSHydrophilic
371-395INTAATGKKKSKNKLRKKMGAMTDTHydrophilic
482-506DAASKSKLAARRKKEKDSNGSALDKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
377-388GKKKSKNKLRKK
465-497RKLVKKDREHESIKAAADAASKSKLAARRKKEK
Subcellular Location(s) E.R. 9, golg 6, vacu 4, extr 3, nucl 2, cyto 2, cyto_nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MKFNTVLAILSLAVFASAVPVHKAPVPGDPYDGDVEDNDVLALKQKTTDDEEDLLPETKEPPATNMPRKRFDKKNAQTFSVVHRSHEDALYFDNDASKHVLIPAAQRAQAASGTLSQLKARKAGKQTYSTQELESTLGKEAMNAMRANEGLAAQYGIFFDDSNYDYMQHLRPIGGGGGDSVFIEAKKPKEESKKSIESLIKDVLPSEQTRKVAFDDEENIPAELLGFNPEMDPRLREVMEALEDEAYVAEAGEGEVEDADFLDLLQSGEVDDEEDFYDDYEGDDWDLDNYQDEFDDEAYDSEHLEELDIPYNEGEAPEEVIEAAVPAVSNAWERDFMKFKKETKNAVNEWDSDNEFEDEEEDDVVGELPSINTAATGKKKSKNKLRKKMGAMTDTSSFSMSSSALFRTEGLTLLDDRYEQLNKKFEEEDPYMKEQEDFDMSKERPDFEDMLDDFLDNYELDRGGRKLVKKDREHESIKAAADAASKSKLAARRKKEKDSNGSALDKLGGSFGKMKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.05
3 0.06
4 0.07
5 0.08
6 0.1
7 0.11
8 0.13
9 0.16
10 0.19
11 0.18
12 0.25
13 0.28
14 0.26
15 0.29
16 0.28
17 0.28
18 0.28
19 0.27
20 0.2
21 0.16
22 0.18
23 0.15
24 0.14
25 0.11
26 0.09
27 0.09
28 0.14
29 0.15
30 0.13
31 0.16
32 0.17
33 0.2
34 0.26
35 0.3
36 0.28
37 0.3
38 0.3
39 0.29
40 0.31
41 0.28
42 0.22
43 0.19
44 0.17
45 0.16
46 0.19
47 0.17
48 0.2
49 0.28
50 0.37
51 0.47
52 0.55
53 0.6
54 0.67
55 0.73
56 0.77
57 0.77
58 0.78
59 0.79
60 0.79
61 0.82
62 0.78
63 0.75
64 0.7
65 0.62
66 0.6
67 0.59
68 0.5
69 0.41
70 0.39
71 0.39
72 0.37
73 0.37
74 0.29
75 0.2
76 0.22
77 0.22
78 0.2
79 0.16
80 0.16
81 0.14
82 0.15
83 0.18
84 0.15
85 0.14
86 0.14
87 0.15
88 0.13
89 0.17
90 0.23
91 0.23
92 0.23
93 0.23
94 0.23
95 0.22
96 0.22
97 0.18
98 0.12
99 0.1
100 0.12
101 0.13
102 0.14
103 0.15
104 0.19
105 0.2
106 0.25
107 0.26
108 0.31
109 0.37
110 0.45
111 0.48
112 0.51
113 0.55
114 0.56
115 0.59
116 0.54
117 0.47
118 0.4
119 0.34
120 0.29
121 0.25
122 0.19
123 0.14
124 0.14
125 0.13
126 0.12
127 0.15
128 0.15
129 0.17
130 0.16
131 0.15
132 0.15
133 0.15
134 0.15
135 0.12
136 0.1
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.07
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.14
154 0.15
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.09
162 0.08
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.07
171 0.1
172 0.12
173 0.15
174 0.17
175 0.24
176 0.34
177 0.41
178 0.45
179 0.5
180 0.55
181 0.53
182 0.58
183 0.55
184 0.46
185 0.44
186 0.4
187 0.31
188 0.24
189 0.24
190 0.18
191 0.17
192 0.16
193 0.16
194 0.18
195 0.19
196 0.2
197 0.21
198 0.21
199 0.22
200 0.21
201 0.18
202 0.19
203 0.19
204 0.2
205 0.19
206 0.18
207 0.14
208 0.13
209 0.11
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.09
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.03
235 0.03
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.02
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.04
258 0.03
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.04
270 0.05
271 0.04
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.05
303 0.06
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.02
314 0.03
315 0.03
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.09
320 0.1
321 0.14
322 0.21
323 0.21
324 0.28
325 0.33
326 0.38
327 0.45
328 0.5
329 0.54
330 0.54
331 0.62
332 0.57
333 0.58
334 0.55
335 0.46
336 0.43
337 0.38
338 0.32
339 0.24
340 0.23
341 0.17
342 0.15
343 0.13
344 0.11
345 0.09
346 0.09
347 0.08
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.05
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.05
361 0.1
362 0.15
363 0.22
364 0.28
365 0.36
366 0.44
367 0.54
368 0.64
369 0.7
370 0.76
371 0.82
372 0.86
373 0.88
374 0.88
375 0.87
376 0.83
377 0.77
378 0.69
379 0.61
380 0.53
381 0.45
382 0.38
383 0.29
384 0.21
385 0.16
386 0.15
387 0.11
388 0.09
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.1
393 0.11
394 0.11
395 0.12
396 0.11
397 0.11
398 0.11
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.11
403 0.12
404 0.14
405 0.18
406 0.2
407 0.24
408 0.31
409 0.31
410 0.35
411 0.36
412 0.35
413 0.38
414 0.39
415 0.4
416 0.38
417 0.42
418 0.4
419 0.38
420 0.36
421 0.29
422 0.28
423 0.26
424 0.21
425 0.19
426 0.26
427 0.26
428 0.31
429 0.32
430 0.3
431 0.28
432 0.31
433 0.31
434 0.24
435 0.32
436 0.26
437 0.28
438 0.26
439 0.24
440 0.2
441 0.18
442 0.18
443 0.09
444 0.1
445 0.08
446 0.09
447 0.09
448 0.13
449 0.13
450 0.19
451 0.25
452 0.29
453 0.38
454 0.47
455 0.57
456 0.62
457 0.68
458 0.7
459 0.73
460 0.73
461 0.67
462 0.63
463 0.58
464 0.5
465 0.44
466 0.36
467 0.29
468 0.27
469 0.24
470 0.22
471 0.19
472 0.18
473 0.18
474 0.23
475 0.28
476 0.36
477 0.45
478 0.52
479 0.6
480 0.69
481 0.8
482 0.84
483 0.88
484 0.87
485 0.87
486 0.85
487 0.81
488 0.75
489 0.65
490 0.56
491 0.47
492 0.37
493 0.28
494 0.22
495 0.15
496 0.15