Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V1ATA3

Protein Details
Accession A0A2V1ATA3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
68-93FLSNYLKQSHQRKMKKKDDPPFLADLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12, mito 3, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005378  Vps35  
IPR042491  Vps35_C  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0030906  C:retromer, cargo-selective complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF03635  Vps35  
Amino Acid Sequences MASSSPNVQQCLSNIRLHSKHMKDNLSEGQLLPALKNCSNFLNELRTSQLSPKEYYELYIAVFDSLEFLSNYLKQSHQRKMKKKDDPPFLADLYELVQYSGNIVPRLYMMIVIGTTYMSTNSESTKEIMKDMIEMCKGVQHPIRGLFLRNYLSQRSKDLLPVEKEEDFEDTVDFLMTNFIEMNKLWVRLQHQGHSSERELRYRERKELKVLVGSNLVRLSQAIDDFPTDEKDFGENYYKDTIYPIVTEQIIQCKDHLAQSYLIDVLIQIFPDNFHFATMDDLLNNVFLKLHPALQKSELISNLVDRFVTNLKYEADLKEATDGTDGLGDDKEIEKTTHEPSVPADSIFGSFWSFYDNLDQLQPSLPPEEICSILRSLIKLALNLQPDNYENLNKIFEYAMKTLKKSRAEDGPKERSESSLWYELLVAPVNELTSIKDLLKLEYFRQLFEQIPDPFFKRQLSLEIVDKLLISPHEQTLENNDDIDDIFAYLLILIEEQDYKVDTQKDLGIKKSIKLEGGEKVVSDDFLERQEKICKCLHLISHDDPAKALSSLLFVRKKYLSRCPDNIIYTYPTLILKITNLLRVSAYKSSRSKNQSSGSLKQAEQSLTNNFKSLAVVIDELYQQHQTFYAEYILKLYLNAASIADQLKQETMAYELFQQSFVVFEENLSVSKPAKNAPTISNALANSRYFSKENYESLITKITLYGSKLLKKQDQCQSPEEENEPSLYQDGKRVLECLQKALRVADSSMDALLSLRLFVEILNRCVIFNVYGNWLIDARYINGLIDLIRNNLANLKEQDASRASEDDKDVRILRLVELYFDRTLEHIADQQQSEGRLEGVIV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.4
3 0.41
4 0.46
5 0.53
6 0.52
7 0.57
8 0.6
9 0.63
10 0.56
11 0.61
12 0.61
13 0.55
14 0.5
15 0.42
16 0.36
17 0.33
18 0.31
19 0.25
20 0.24
21 0.25
22 0.25
23 0.27
24 0.26
25 0.27
26 0.29
27 0.31
28 0.3
29 0.33
30 0.31
31 0.31
32 0.34
33 0.33
34 0.33
35 0.36
36 0.4
37 0.36
38 0.37
39 0.39
40 0.38
41 0.36
42 0.35
43 0.31
44 0.25
45 0.21
46 0.2
47 0.17
48 0.13
49 0.12
50 0.1
51 0.1
52 0.09
53 0.1
54 0.08
55 0.09
56 0.11
57 0.14
58 0.16
59 0.17
60 0.21
61 0.28
62 0.36
63 0.45
64 0.53
65 0.61
66 0.7
67 0.78
68 0.85
69 0.87
70 0.89
71 0.89
72 0.89
73 0.86
74 0.81
75 0.75
76 0.65
77 0.55
78 0.45
79 0.35
80 0.26
81 0.21
82 0.15
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.12
87 0.14
88 0.16
89 0.15
90 0.14
91 0.14
92 0.14
93 0.16
94 0.13
95 0.11
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.08
107 0.09
108 0.11
109 0.13
110 0.14
111 0.16
112 0.21
113 0.21
114 0.2
115 0.21
116 0.19
117 0.21
118 0.22
119 0.25
120 0.2
121 0.19
122 0.18
123 0.22
124 0.22
125 0.24
126 0.26
127 0.23
128 0.27
129 0.3
130 0.34
131 0.31
132 0.33
133 0.31
134 0.32
135 0.32
136 0.32
137 0.33
138 0.35
139 0.39
140 0.38
141 0.39
142 0.38
143 0.36
144 0.37
145 0.38
146 0.39
147 0.37
148 0.4
149 0.4
150 0.38
151 0.37
152 0.33
153 0.3
154 0.23
155 0.2
156 0.15
157 0.12
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.08
169 0.14
170 0.14
171 0.16
172 0.16
173 0.19
174 0.23
175 0.3
176 0.34
177 0.34
178 0.36
179 0.39
180 0.42
181 0.43
182 0.42
183 0.43
184 0.42
185 0.42
186 0.41
187 0.45
188 0.52
189 0.52
190 0.59
191 0.59
192 0.6
193 0.62
194 0.65
195 0.6
196 0.57
197 0.53
198 0.45
199 0.43
200 0.39
201 0.34
202 0.28
203 0.24
204 0.17
205 0.15
206 0.15
207 0.1
208 0.11
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.11
213 0.12
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.14
219 0.14
220 0.15
221 0.22
222 0.18
223 0.2
224 0.24
225 0.23
226 0.22
227 0.22
228 0.22
229 0.15
230 0.16
231 0.13
232 0.12
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.19
237 0.19
238 0.19
239 0.18
240 0.18
241 0.19
242 0.21
243 0.22
244 0.17
245 0.17
246 0.17
247 0.18
248 0.16
249 0.15
250 0.11
251 0.09
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.05
257 0.06
258 0.08
259 0.1
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.11
265 0.12
266 0.11
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.07
273 0.05
274 0.05
275 0.09
276 0.09
277 0.14
278 0.17
279 0.19
280 0.21
281 0.23
282 0.26
283 0.23
284 0.25
285 0.21
286 0.18
287 0.17
288 0.17
289 0.16
290 0.13
291 0.12
292 0.09
293 0.11
294 0.12
295 0.13
296 0.11
297 0.12
298 0.13
299 0.15
300 0.16
301 0.15
302 0.16
303 0.14
304 0.14
305 0.15
306 0.14
307 0.12
308 0.11
309 0.1
310 0.08
311 0.09
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.11
323 0.14
324 0.16
325 0.16
326 0.15
327 0.16
328 0.22
329 0.21
330 0.18
331 0.16
332 0.13
333 0.14
334 0.13
335 0.12
336 0.07
337 0.06
338 0.06
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.1
343 0.1
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.08
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.09
355 0.1
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.1
360 0.12
361 0.12
362 0.11
363 0.11
364 0.13
365 0.13
366 0.12
367 0.14
368 0.16
369 0.18
370 0.18
371 0.17
372 0.15
373 0.15
374 0.17
375 0.16
376 0.13
377 0.11
378 0.13
379 0.13
380 0.12
381 0.12
382 0.1
383 0.1
384 0.13
385 0.14
386 0.2
387 0.2
388 0.22
389 0.26
390 0.32
391 0.35
392 0.33
393 0.35
394 0.38
395 0.43
396 0.49
397 0.53
398 0.55
399 0.5
400 0.51
401 0.48
402 0.4
403 0.35
404 0.29
405 0.24
406 0.2
407 0.19
408 0.17
409 0.17
410 0.16
411 0.16
412 0.14
413 0.1
414 0.06
415 0.06
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.06
421 0.07
422 0.07
423 0.1
424 0.1
425 0.11
426 0.14
427 0.14
428 0.14
429 0.21
430 0.21
431 0.18
432 0.19
433 0.2
434 0.18
435 0.18
436 0.23
437 0.17
438 0.18
439 0.19
440 0.21
441 0.2
442 0.21
443 0.2
444 0.16
445 0.15
446 0.17
447 0.19
448 0.18
449 0.2
450 0.19
451 0.19
452 0.17
453 0.17
454 0.13
455 0.11
456 0.09
457 0.08
458 0.08
459 0.09
460 0.11
461 0.11
462 0.11
463 0.16
464 0.19
465 0.17
466 0.16
467 0.15
468 0.13
469 0.13
470 0.13
471 0.08
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.04
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.05
486 0.06
487 0.09
488 0.1
489 0.1
490 0.11
491 0.15
492 0.19
493 0.21
494 0.22
495 0.25
496 0.25
497 0.28
498 0.32
499 0.3
500 0.26
501 0.26
502 0.27
503 0.24
504 0.26
505 0.24
506 0.18
507 0.18
508 0.17
509 0.15
510 0.13
511 0.1
512 0.08
513 0.12
514 0.13
515 0.12
516 0.14
517 0.22
518 0.22
519 0.25
520 0.27
521 0.25
522 0.26
523 0.3
524 0.3
525 0.27
526 0.32
527 0.3
528 0.36
529 0.37
530 0.35
531 0.3
532 0.29
533 0.25
534 0.19
535 0.17
536 0.09
537 0.08
538 0.1
539 0.17
540 0.19
541 0.19
542 0.23
543 0.26
544 0.3
545 0.33
546 0.41
547 0.43
548 0.47
549 0.51
550 0.53
551 0.54
552 0.53
553 0.49
554 0.42
555 0.36
556 0.29
557 0.25
558 0.21
559 0.15
560 0.13
561 0.12
562 0.1
563 0.08
564 0.12
565 0.13
566 0.16
567 0.16
568 0.16
569 0.17
570 0.18
571 0.21
572 0.23
573 0.24
574 0.27
575 0.32
576 0.35
577 0.43
578 0.48
579 0.49
580 0.51
581 0.53
582 0.55
583 0.57
584 0.57
585 0.55
586 0.53
587 0.48
588 0.43
589 0.42
590 0.33
591 0.29
592 0.27
593 0.28
594 0.28
595 0.29
596 0.27
597 0.24
598 0.23
599 0.22
600 0.2
601 0.14
602 0.1
603 0.1
604 0.09
605 0.1
606 0.11
607 0.11
608 0.12
609 0.12
610 0.11
611 0.11
612 0.11
613 0.11
614 0.11
615 0.12
616 0.15
617 0.14
618 0.14
619 0.15
620 0.15
621 0.14
622 0.13
623 0.13
624 0.09
625 0.09
626 0.09
627 0.08
628 0.08
629 0.1
630 0.11
631 0.12
632 0.11
633 0.11
634 0.11
635 0.11
636 0.1
637 0.09
638 0.1
639 0.09
640 0.09
641 0.12
642 0.14
643 0.14
644 0.14
645 0.14
646 0.12
647 0.12
648 0.12
649 0.11
650 0.08
651 0.08
652 0.1
653 0.1
654 0.11
655 0.11
656 0.12
657 0.12
658 0.14
659 0.16
660 0.17
661 0.21
662 0.24
663 0.27
664 0.28
665 0.33
666 0.34
667 0.34
668 0.34
669 0.3
670 0.29
671 0.29
672 0.26
673 0.22
674 0.21
675 0.24
676 0.2
677 0.22
678 0.27
679 0.28
680 0.3
681 0.32
682 0.33
683 0.3
684 0.31
685 0.33
686 0.26
687 0.22
688 0.21
689 0.18
690 0.17
691 0.18
692 0.22
693 0.23
694 0.29
695 0.33
696 0.39
697 0.45
698 0.48
699 0.55
700 0.58
701 0.61
702 0.6
703 0.6
704 0.6
705 0.56
706 0.55
707 0.49
708 0.42
709 0.35
710 0.32
711 0.29
712 0.22
713 0.2
714 0.18
715 0.16
716 0.19
717 0.22
718 0.23
719 0.23
720 0.23
721 0.26
722 0.31
723 0.32
724 0.34
725 0.33
726 0.33
727 0.34
728 0.34
729 0.33
730 0.27
731 0.26
732 0.21
733 0.19
734 0.18
735 0.16
736 0.14
737 0.11
738 0.1
739 0.11
740 0.09
741 0.07
742 0.06
743 0.06
744 0.06
745 0.07
746 0.14
747 0.17
748 0.19
749 0.23
750 0.23
751 0.23
752 0.24
753 0.25
754 0.19
755 0.17
756 0.17
757 0.17
758 0.2
759 0.2
760 0.21
761 0.2
762 0.18
763 0.19
764 0.18
765 0.16
766 0.15
767 0.15
768 0.14
769 0.14
770 0.14
771 0.12
772 0.14
773 0.14
774 0.14
775 0.15
776 0.15
777 0.15
778 0.2
779 0.2
780 0.23
781 0.25
782 0.26
783 0.28
784 0.28
785 0.33
786 0.31
787 0.33
788 0.28
789 0.28
790 0.26
791 0.28
792 0.31
793 0.31
794 0.3
795 0.32
796 0.32
797 0.3
798 0.32
799 0.29
800 0.27
801 0.28
802 0.26
803 0.25
804 0.26
805 0.29
806 0.26
807 0.25
808 0.24
809 0.19
810 0.21
811 0.18
812 0.17
813 0.18
814 0.22
815 0.27
816 0.27
817 0.28
818 0.29
819 0.29
820 0.29
821 0.24
822 0.2