FuNGI

A0A1Y2WXX2

Protein Details

Accession

A0A1Y2WXX2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1061-1086	SLLGIVKSKKPEKKPEPEPAKQDDKP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1068-1081	SKKPEKKPEPEPAK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 13, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C IPR019515 VPS54_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54 PF10475 Vps54_N

Amino Acid Sequences

MFSNSEARKSVDSLPPLSPTARTEFPFHRKGSVASHHTARRGSTASSIHSIRSIGGHLDTSSGLSQTVHETGQNAISTLLQPPIVRTGLLPHTSAPASSAHKPPTARDIPPVTLTNIPHVDSSDFKPYLTQVGALYEQLRRVKESDDDGSEHVFGRGRVEEFASAADDGRLKPGSRPSSSRKVSGSSIRSISPIDSPAVRPMRRRSSSSFSRKGANQGPPPLSTIPNVYFDEDFHLENPRIFDVVSERSEVVRPPPGSTGDKNAPNGDASAPRKTLATNAILQEKLSWYMDTIEMHLISSISTASTTFFTALGSLRELHSEAAESVQKIKALRQELENLDQEIATNGLEIVQKQRRRENLQQLNDAVKQLKEIVQSVAACEALVDSGEIEKALESIDFLEKLIAGERIPHPEKVENQNYRLCDLRDAVALQGVNSDISTLRFRIGKALETKFIDTLLGDLKTHVDTVSPQEVLLRWSSSAMRSRGALSREPTGHPAYLASTSGLRSKLMPILDGLHRSKHVTIAIASYREVVLREIRQLIKRPLPTSNDDDNESVMSASTMSSKRLTQQEKSSILARNLRALDEQDAEALFVKMYISVTEALRRLSTQVKVLFDVASSLGQEPLDLDAGLKSPPPLKSPPLNSANRDLQEDIHLTMDLNNLYGQAVDISQEKIVKVLRVRSEQSTHLPLIWFLRYFTLNLYFANECEAISGRSGTSLKNIVNSQIKEFIQLHGDAEKQKLAQGMESDQWSAKDFTEENNILLKRILDSSTKDSEAWSEGSKIWLPFSEADSKQSANGRPRAESNGATKERTRSAIVDGETFILPNSAILCLEGMSHFLHLISGIPSMASDVSSSLIAYLQLFNSRCTQLILGAGATRSAGLKNITTRHLALASQALAFISTLIPHVREFVRRHAGSGPNVNNTNVANLMGEFDKVKRLFQEHQNSIYDKLVEIMSARASAHAKSMKALDWDQKTEATVNLYMETLVKETVTLHRVLTKHLPEGTVRLIMTPVFDSYKSQVGKTLQGLEPKTEIGVNRMESDIEYLISRLNKIDGFGDTGDSLLGIVKSKKPEKKPEPEPAKQDDKPESPKPGSEEKSGNAADTGEAKEKATESK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.4
3	0.4
4	0.38
5	0.33
6	0.29
7	0.3
8	0.31
9	0.31
10	0.34
11	0.41
12	0.48
13	0.53
14	0.52
15	0.5
16	0.47
17	0.48
18	0.5
19	0.51
20	0.49
21	0.46
22	0.53
23	0.53
24	0.55
25	0.55
26	0.48
27	0.43
28	0.4
29	0.36
30	0.35
31	0.33
32	0.33
33	0.36
34	0.36
35	0.32
36	0.31
37	0.29
38	0.24
39	0.22
40	0.19
41	0.15
42	0.16
43	0.16
44	0.15
45	0.16
46	0.15
47	0.15
48	0.14
49	0.13
50	0.12
51	0.1
52	0.11
53	0.14
54	0.15
55	0.14
56	0.14
57	0.15
58	0.16
59	0.2
60	0.19
61	0.16
62	0.14
63	0.14
64	0.15
65	0.16
66	0.16
67	0.14
68	0.13
69	0.15
70	0.19
71	0.19
72	0.18
73	0.16
74	0.21
75	0.26
76	0.28
77	0.27
78	0.23
79	0.26
80	0.26
81	0.26
82	0.21
83	0.19
84	0.22
85	0.26
86	0.32
87	0.32
88	0.36
89	0.38
90	0.39
91	0.45
92	0.46
93	0.42
94	0.43
95	0.45
96	0.43
97	0.47
98	0.46
99	0.39
100	0.38
101	0.37
102	0.36
103	0.33
104	0.31
105	0.26
106	0.26
107	0.25
108	0.24
109	0.27
110	0.29
111	0.27
112	0.26
113	0.27
114	0.26
115	0.28
116	0.25
117	0.23
118	0.14
119	0.18
120	0.19
121	0.19
122	0.2
123	0.17
124	0.22
125	0.25
126	0.26
127	0.25
128	0.25
129	0.27
130	0.29
131	0.33
132	0.33
133	0.32
134	0.33
135	0.32
136	0.32
137	0.3
138	0.26
139	0.22
140	0.19
141	0.15
142	0.16
143	0.18
144	0.17
145	0.18
146	0.19
147	0.18
148	0.17
149	0.17
150	0.15
151	0.12
152	0.12
153	0.12
154	0.12
155	0.11
156	0.15
157	0.17
158	0.16
159	0.19
160	0.28
161	0.34
162	0.37
163	0.44
164	0.48
165	0.56
166	0.59
167	0.6
168	0.53
169	0.5
170	0.51
171	0.53
172	0.49
173	0.44
174	0.43
175	0.39
176	0.37
177	0.34
178	0.3
179	0.24
180	0.21
181	0.18
182	0.17
183	0.18
184	0.25
185	0.33
186	0.34
187	0.38
188	0.45
189	0.54
190	0.56
191	0.6
192	0.58
193	0.59
194	0.67
195	0.71
196	0.7
197	0.62
198	0.64
199	0.61
200	0.61
201	0.6
202	0.58
203	0.55
204	0.54
205	0.55
206	0.49
207	0.51
208	0.45
209	0.38
210	0.31
211	0.29
212	0.24
213	0.26
214	0.26
215	0.25
216	0.23
217	0.21
218	0.26
219	0.23
220	0.21
221	0.17
222	0.21
223	0.19
224	0.21
225	0.22
226	0.17
227	0.16
228	0.15
229	0.15
230	0.15
231	0.19
232	0.19
233	0.19
234	0.19
235	0.2
236	0.21
237	0.21
238	0.2
239	0.23
240	0.23
241	0.23
242	0.25
243	0.28
244	0.32
245	0.33
246	0.37
247	0.36
248	0.39
249	0.4
250	0.38
251	0.34
252	0.3
253	0.29
254	0.24
255	0.25
256	0.24
257	0.26
258	0.25
259	0.25
260	0.25
261	0.24
262	0.25
263	0.22
264	0.22
265	0.21
266	0.23
267	0.27
268	0.26
269	0.26
270	0.24
271	0.21
272	0.2
273	0.17
274	0.14
275	0.11
276	0.13
277	0.15
278	0.14
279	0.14
280	0.13
281	0.12
282	0.12
283	0.12
284	0.1
285	0.08
286	0.08
287	0.06
288	0.04
289	0.05
290	0.05
291	0.06
292	0.07
293	0.07
294	0.08
295	0.07
296	0.07
297	0.08
298	0.09
299	0.09
300	0.09
301	0.1
302	0.09
303	0.1
304	0.11
305	0.1
306	0.1
307	0.1
308	0.09
309	0.1
310	0.12
311	0.11
312	0.13
313	0.14
314	0.15
315	0.15
316	0.18
317	0.21
318	0.24
319	0.25
320	0.26
321	0.31
322	0.32
323	0.36
324	0.35
325	0.3
326	0.26
327	0.24
328	0.21
329	0.15
330	0.12
331	0.07
332	0.06
333	0.04
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.15
338	0.22
339	0.26
340	0.3
341	0.36
342	0.42
343	0.5
344	0.59
345	0.62
346	0.65
347	0.67
348	0.67
349	0.63
350	0.59
351	0.52
352	0.44
353	0.34
354	0.24
355	0.19
356	0.17
357	0.17
358	0.15
359	0.15
360	0.14
361	0.15
362	0.15
363	0.15
364	0.15
365	0.12
366	0.1
367	0.08
368	0.07
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.03
373	0.03
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.08
390	0.07
391	0.06
392	0.1
393	0.11
394	0.19
395	0.2
396	0.21
397	0.23
398	0.26
399	0.31
400	0.36
401	0.44
402	0.4
403	0.42
404	0.45
405	0.43
406	0.41
407	0.39
408	0.31
409	0.23
410	0.21
411	0.18
412	0.16
413	0.15
414	0.14
415	0.13
416	0.12
417	0.1
418	0.09
419	0.08
420	0.07
421	0.06
422	0.06
423	0.05
424	0.07
425	0.08
426	0.08
427	0.09
428	0.11
429	0.11
430	0.16
431	0.17
432	0.19
433	0.25
434	0.26
435	0.29
436	0.29
437	0.3
438	0.25
439	0.24
440	0.19
441	0.12
442	0.11
443	0.1
444	0.09
445	0.08
446	0.08
447	0.09
448	0.09
449	0.09
450	0.08
451	0.06
452	0.07
453	0.11
454	0.13
455	0.12
456	0.12
457	0.12
458	0.13
459	0.14
460	0.14
461	0.1
462	0.08
463	0.09
464	0.1
465	0.12
466	0.18
467	0.18
468	0.17
469	0.17
470	0.2
471	0.22
472	0.24
473	0.25
474	0.21
475	0.24
476	0.25
477	0.25
478	0.27
479	0.25
480	0.22
481	0.19
482	0.17
483	0.14
484	0.12
485	0.12
486	0.09
487	0.07
488	0.08
489	0.11
490	0.11
491	0.1
492	0.1
493	0.11
494	0.13
495	0.13
496	0.12
497	0.1
498	0.13
499	0.14
500	0.18
501	0.17
502	0.16
503	0.16
504	0.17
505	0.17
506	0.16
507	0.15
508	0.12
509	0.12
510	0.13
511	0.14
512	0.14
513	0.13
514	0.12
515	0.11
516	0.11
517	0.1
518	0.09
519	0.1
520	0.1
521	0.12
522	0.14
523	0.17
524	0.2
525	0.24
526	0.27
527	0.3
528	0.32
529	0.32
530	0.33
531	0.34
532	0.35
533	0.37
534	0.38
535	0.33
536	0.32
537	0.31
538	0.27
539	0.23
540	0.19
541	0.12
542	0.07
543	0.06
544	0.04
545	0.04
546	0.07
547	0.08
548	0.09
549	0.1
550	0.11
551	0.15
552	0.22
553	0.26
554	0.26
555	0.31
556	0.37
557	0.38
558	0.39
559	0.39
560	0.34
561	0.33
562	0.35
563	0.29
564	0.27
565	0.26
566	0.25
567	0.21
568	0.19
569	0.19
570	0.15
571	0.14
572	0.1
573	0.09
574	0.09
575	0.09
576	0.08
577	0.05
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.05
584	0.06
585	0.07
586	0.1
587	0.1
588	0.1
589	0.11
590	0.11
591	0.12
592	0.14
593	0.15
594	0.17
595	0.19
596	0.19
597	0.2
598	0.21
599	0.19
600	0.15
601	0.14
602	0.1
603	0.07
604	0.07
605	0.06
606	0.06
607	0.06
608	0.06
609	0.06
610	0.06
611	0.06
612	0.05
613	0.05
614	0.05
615	0.06
616	0.06
617	0.06
618	0.06
619	0.09
620	0.1
621	0.14
622	0.16
623	0.2
624	0.26
625	0.29
626	0.36
627	0.41
628	0.44
629	0.42
630	0.46
631	0.46
632	0.41
633	0.39
634	0.32
635	0.25
636	0.23
637	0.22
638	0.17
639	0.13
640	0.11
641	0.1
642	0.1
643	0.11
644	0.08
645	0.08
646	0.07
647	0.07
648	0.06
649	0.06
650	0.05
651	0.04
652	0.04
653	0.05
654	0.06
655	0.06
656	0.07
657	0.08
658	0.08
659	0.1
660	0.11
661	0.13
662	0.14
663	0.19
664	0.23
665	0.27
666	0.29
667	0.31
668	0.33
669	0.33
670	0.34
671	0.33
672	0.28
673	0.25
674	0.23
675	0.2
676	0.19
677	0.18
678	0.14
679	0.11
680	0.12
681	0.12
682	0.12
683	0.13
684	0.14
685	0.14
686	0.13
687	0.16
688	0.14
689	0.14
690	0.16
691	0.14
692	0.1
693	0.11
694	0.12
695	0.09
696	0.09
697	0.1
698	0.07
699	0.09
700	0.1
701	0.09
702	0.11
703	0.14
704	0.14
705	0.17
706	0.18
707	0.2
708	0.26
709	0.27
710	0.26
711	0.28
712	0.28
713	0.28
714	0.29
715	0.25
716	0.21
717	0.2
718	0.19
719	0.15
720	0.17
721	0.15
722	0.15
723	0.15
724	0.13
725	0.14
726	0.16
727	0.14
728	0.14
729	0.14
730	0.15
731	0.16
732	0.17
733	0.16
734	0.14
735	0.15
736	0.15
737	0.15
738	0.13
739	0.13
740	0.13
741	0.13
742	0.21
743	0.21
744	0.2
745	0.25
746	0.25
747	0.22
748	0.23
749	0.21
750	0.14
751	0.15
752	0.16
753	0.13
754	0.16
755	0.21
756	0.24
757	0.25
758	0.24
759	0.23
760	0.22
761	0.22
762	0.2
763	0.15
764	0.14
765	0.13
766	0.15
767	0.18
768	0.16
769	0.15
770	0.14
771	0.15
772	0.14
773	0.17
774	0.23
775	0.21
776	0.24
777	0.25
778	0.25
779	0.25
780	0.29
781	0.31
782	0.31
783	0.36
784	0.36
785	0.36
786	0.38
787	0.41
788	0.39
789	0.37
790	0.35
791	0.38
792	0.39
793	0.39
794	0.39
795	0.37
796	0.37
797	0.36
798	0.33
799	0.24
800	0.26
801	0.29
802	0.27
803	0.24
804	0.22
805	0.21
806	0.19
807	0.18
808	0.14
809	0.09
810	0.08
811	0.07
812	0.07
813	0.05
814	0.05
815	0.05
816	0.06
817	0.05
818	0.06
819	0.06
820	0.07
821	0.07
822	0.07
823	0.07
824	0.07
825	0.07
826	0.06
827	0.07
828	0.06
829	0.06
830	0.06
831	0.06
832	0.06
833	0.07
834	0.07
835	0.06
836	0.05
837	0.05
838	0.06
839	0.06
840	0.06
841	0.06
842	0.06
843	0.06
844	0.07
845	0.08
846	0.08
847	0.13
848	0.14
849	0.15
850	0.19
851	0.2
852	0.19
853	0.2
854	0.2
855	0.15
856	0.16
857	0.15
858	0.12
859	0.12
860	0.11
861	0.1
862	0.09
863	0.08
864	0.07
865	0.07
866	0.09
867	0.09
868	0.12
869	0.17
870	0.2
871	0.23
872	0.25
873	0.25
874	0.25
875	0.25
876	0.22
877	0.19
878	0.19
879	0.17
880	0.14
881	0.13
882	0.11
883	0.1
884	0.1
885	0.09
886	0.06
887	0.05
888	0.07
889	0.07
890	0.09
891	0.09
892	0.12
893	0.14
894	0.21
895	0.24
896	0.31
897	0.4
898	0.39
899	0.41
900	0.45
901	0.48
902	0.46
903	0.52
904	0.48
905	0.44
906	0.45
907	0.44
908	0.39
909	0.33
910	0.3
911	0.21
912	0.18
913	0.12
914	0.1
915	0.12
916	0.1
917	0.1
918	0.1
919	0.1
920	0.18
921	0.18
922	0.19
923	0.21
924	0.26
925	0.32
926	0.41
927	0.51
928	0.48
929	0.53
930	0.56
931	0.54
932	0.51
933	0.46
934	0.37
935	0.26
936	0.23
937	0.18
938	0.14
939	0.13
940	0.12
941	0.1
942	0.11
943	0.11
944	0.12
945	0.13
946	0.14
947	0.19
948	0.22
949	0.22
950	0.23
951	0.25
952	0.25
953	0.28
954	0.32
955	0.33
956	0.34
957	0.38
958	0.37
959	0.36
960	0.34
961	0.31
962	0.29
963	0.24
964	0.21
965	0.18
966	0.17
967	0.17
968	0.15
969	0.15
970	0.14
971	0.12
972	0.1
973	0.09
974	0.08
975	0.1
976	0.15
977	0.17
978	0.17
979	0.17
980	0.22
981	0.23
982	0.28
983	0.34
984	0.33
985	0.35
986	0.36
987	0.37
988	0.33
989	0.36
990	0.35
991	0.3
992	0.26
993	0.21
994	0.2
995	0.18
996	0.19
997	0.16
998	0.15
999	0.14
1000	0.14
1001	0.17
1002	0.19
1003	0.26
1004	0.26
1005	0.25
1006	0.29
1007	0.29
1008	0.34
1009	0.35
1010	0.39
1011	0.35
1012	0.4
1013	0.42
1014	0.38
1015	0.37
1016	0.32
1017	0.3
1018	0.25
1019	0.23
1020	0.19
1021	0.23
1022	0.22
1023	0.22
1024	0.22
1025	0.22
1026	0.19
1027	0.22
1028	0.19
1029	0.14
1030	0.13
1031	0.11
1032	0.15
1033	0.16
1034	0.16
1035	0.14
1036	0.17
1037	0.16
1038	0.17
1039	0.19
1040	0.17
1041	0.19
1042	0.19
1043	0.19
1044	0.16
1045	0.16
1046	0.14
1047	0.12
1048	0.1
1049	0.09
1050	0.09
1051	0.1
1052	0.14
1053	0.18
1054	0.28
1055	0.37
1056	0.46
1057	0.53
1058	0.64
1059	0.71
1060	0.79
1061	0.84
1062	0.86
1063	0.87
1064	0.86
1065	0.85
1066	0.82
1067	0.81
1068	0.73
1069	0.71
1070	0.68
1071	0.66
1072	0.66
1073	0.66
1074	0.66
1075	0.6
1076	0.61
1077	0.59
1078	0.61
1079	0.57
1080	0.56
1081	0.53
1082	0.47
1083	0.51
1084	0.47
1085	0.42
1086	0.33
1087	0.29
1088	0.24
1089	0.22
1090	0.24
1091	0.21
1092	0.22
1093	0.21
1094	0.23

A0A1Y2WXX2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer