Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2X2U9

Protein Details
Accession A0A1Y2X2U9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
440-469VLRSWKPNRRGTYHRKRRRWAKIRHVVDTTHydrophilic
603-625EGKIEARGKARTRKRKLEGSTQEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
445-463KPNRRGTYHRKRRRWAKIR
601-618PAEGKIEARGKARTRKRK
Subcellular Location(s) cyto 8.5cyto_mito 8.5, nucl 8, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSLVQPHALVALKLPSGNLRVLEVTPNTTISLGKYGSFPSNLIIHRPYHLTYELQDKQPGESFNRLRIVPASELYSDILSSDASASALEEETPAVNEGDDTDNAMSTGIEYSLVDPESGAVVARTDRVEIDASARQTLTTEEIEALKKDGTDAGRDIIARLLLSHTAIDQKTQYSLAKYKLLKTKKYIRRFSVLPMDVPMLAHWQLEVKDPSKILDMRDEMIALLGCWANVHFGGEDQCENSGAEEVDSHEQKGFESTAGRWLVVDDTGGLLVAAMAERMGILYSPENEAGGNHKEPTSPNVGQKEYSHNQKAITNQEDLPPGTSNEHDGSTRESAPGHDDSAEPKAPQSTRTSHGEGKSRCNDLKVPYASSNTLTVIHANQQPNLTFLREYGFDATNPAQPSDHPLASHLMTISWLQLIKPELDPTYTSEMPDVSPEVLRSWKPNRRGTYHRKRRRWAKIRHVVDTTRKGEFSGLVVASTMDPISIMRYAVPLLAGGAPIAIYSQAIEPLTALADCYSIARRAAWVSNPPEEAVGKTPLELEQWAGNEEFPLNPSLVLGAALQTSRVRKWQVLPGRTHPLMTSKGGAEGYVFTAWRVKPAEGKIEARGKARTRKRKLEGSTQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.17
4 0.19
5 0.21
6 0.2
7 0.19
8 0.2
9 0.21
10 0.25
11 0.23
12 0.24
13 0.23
14 0.23
15 0.22
16 0.2
17 0.2
18 0.16
19 0.2
20 0.17
21 0.17
22 0.17
23 0.2
24 0.23
25 0.23
26 0.22
27 0.2
28 0.25
29 0.25
30 0.29
31 0.29
32 0.27
33 0.28
34 0.31
35 0.3
36 0.28
37 0.29
38 0.26
39 0.25
40 0.34
41 0.36
42 0.36
43 0.39
44 0.36
45 0.37
46 0.39
47 0.4
48 0.35
49 0.4
50 0.39
51 0.41
52 0.45
53 0.42
54 0.39
55 0.38
56 0.38
57 0.31
58 0.29
59 0.26
60 0.22
61 0.23
62 0.22
63 0.2
64 0.15
65 0.12
66 0.11
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.09
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.09
86 0.11
87 0.11
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.12
93 0.09
94 0.07
95 0.08
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.09
101 0.1
102 0.09
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.07
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.11
116 0.12
117 0.11
118 0.15
119 0.17
120 0.18
121 0.19
122 0.19
123 0.17
124 0.16
125 0.17
126 0.16
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.14
131 0.16
132 0.16
133 0.16
134 0.13
135 0.12
136 0.12
137 0.14
138 0.13
139 0.15
140 0.15
141 0.15
142 0.16
143 0.17
144 0.17
145 0.14
146 0.13
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.13
155 0.14
156 0.15
157 0.14
158 0.15
159 0.15
160 0.18
161 0.18
162 0.17
163 0.22
164 0.24
165 0.3
166 0.31
167 0.37
168 0.43
169 0.49
170 0.5
171 0.53
172 0.6
173 0.63
174 0.71
175 0.73
176 0.69
177 0.68
178 0.65
179 0.63
180 0.62
181 0.54
182 0.44
183 0.37
184 0.33
185 0.27
186 0.26
187 0.2
188 0.12
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.15
195 0.17
196 0.15
197 0.17
198 0.17
199 0.18
200 0.21
201 0.22
202 0.18
203 0.21
204 0.22
205 0.21
206 0.21
207 0.2
208 0.15
209 0.14
210 0.13
211 0.07
212 0.07
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.07
223 0.08
224 0.09
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.08
235 0.11
236 0.11
237 0.12
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.13
242 0.12
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.15
247 0.15
248 0.15
249 0.13
250 0.13
251 0.13
252 0.11
253 0.11
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.03
260 0.03
261 0.02
262 0.02
263 0.02
264 0.02
265 0.02
266 0.02
267 0.02
268 0.02
269 0.02
270 0.03
271 0.04
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.1
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.14
285 0.17
286 0.2
287 0.19
288 0.23
289 0.26
290 0.27
291 0.27
292 0.28
293 0.33
294 0.29
295 0.34
296 0.32
297 0.29
298 0.29
299 0.31
300 0.33
301 0.31
302 0.3
303 0.25
304 0.23
305 0.24
306 0.25
307 0.23
308 0.21
309 0.15
310 0.14
311 0.12
312 0.12
313 0.12
314 0.11
315 0.12
316 0.11
317 0.11
318 0.13
319 0.15
320 0.15
321 0.13
322 0.12
323 0.12
324 0.15
325 0.15
326 0.13
327 0.11
328 0.11
329 0.12
330 0.16
331 0.16
332 0.13
333 0.12
334 0.16
335 0.15
336 0.17
337 0.2
338 0.2
339 0.23
340 0.27
341 0.31
342 0.32
343 0.35
344 0.41
345 0.39
346 0.43
347 0.44
348 0.43
349 0.4
350 0.38
351 0.37
352 0.32
353 0.39
354 0.33
355 0.31
356 0.29
357 0.3
358 0.29
359 0.27
360 0.24
361 0.17
362 0.16
363 0.13
364 0.12
365 0.11
366 0.15
367 0.19
368 0.19
369 0.2
370 0.2
371 0.2
372 0.21
373 0.21
374 0.18
375 0.12
376 0.12
377 0.12
378 0.11
379 0.12
380 0.14
381 0.13
382 0.12
383 0.15
384 0.16
385 0.19
386 0.18
387 0.18
388 0.15
389 0.14
390 0.21
391 0.22
392 0.21
393 0.17
394 0.18
395 0.2
396 0.2
397 0.21
398 0.14
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.09
403 0.08
404 0.08
405 0.07
406 0.09
407 0.11
408 0.11
409 0.12
410 0.14
411 0.13
412 0.14
413 0.15
414 0.16
415 0.22
416 0.2
417 0.2
418 0.18
419 0.18
420 0.17
421 0.17
422 0.15
423 0.09
424 0.09
425 0.1
426 0.11
427 0.14
428 0.15
429 0.2
430 0.28
431 0.34
432 0.42
433 0.5
434 0.54
435 0.58
436 0.67
437 0.72
438 0.74
439 0.79
440 0.81
441 0.83
442 0.87
443 0.9
444 0.92
445 0.91
446 0.9
447 0.9
448 0.9
449 0.86
450 0.82
451 0.77
452 0.71
453 0.69
454 0.67
455 0.59
456 0.51
457 0.45
458 0.4
459 0.35
460 0.3
461 0.23
462 0.19
463 0.16
464 0.13
465 0.13
466 0.13
467 0.12
468 0.12
469 0.1
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.08
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.06
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.06
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.04
491 0.03
492 0.04
493 0.05
494 0.07
495 0.07
496 0.08
497 0.08
498 0.08
499 0.09
500 0.08
501 0.07
502 0.05
503 0.06
504 0.06
505 0.08
506 0.09
507 0.11
508 0.12
509 0.12
510 0.13
511 0.16
512 0.19
513 0.22
514 0.27
515 0.3
516 0.34
517 0.35
518 0.33
519 0.32
520 0.3
521 0.28
522 0.24
523 0.23
524 0.19
525 0.18
526 0.18
527 0.17
528 0.18
529 0.16
530 0.15
531 0.14
532 0.14
533 0.16
534 0.15
535 0.14
536 0.14
537 0.14
538 0.13
539 0.11
540 0.12
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.09
545 0.08
546 0.08
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.08
551 0.09
552 0.12
553 0.16
554 0.17
555 0.23
556 0.26
557 0.29
558 0.35
559 0.43
560 0.5
561 0.54
562 0.59
563 0.61
564 0.66
565 0.62
566 0.58
567 0.5
568 0.45
569 0.42
570 0.38
571 0.34
572 0.25
573 0.28
574 0.27
575 0.25
576 0.2
577 0.17
578 0.17
579 0.16
580 0.15
581 0.12
582 0.19
583 0.19
584 0.24
585 0.25
586 0.25
587 0.3
588 0.34
589 0.43
590 0.42
591 0.45
592 0.47
593 0.52
594 0.54
595 0.51
596 0.55
597 0.54
598 0.59
599 0.67
600 0.7
601 0.72
602 0.79
603 0.83
604 0.85
605 0.85