Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2X826

Protein Details
Accession A0A1Y2X826    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
409-437QSEEQWQKHIKGRRHRRVLRSKKMTALIPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
418-431IKGRRHRRVLRSKK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 8.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR030666  IPP_transferase_euk  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
PF12874  zf-met  
Amino Acid Sequences MATMFPKEPIVAIIGTTGTGKSDLAIDLALKFNGEVINADAMQMYKGLPIITNQLRLEERKGVPHHLLGTVNPNEPTWNVDIFAREATRLIREIRSRGKLPIVVGGTHYYIHALLFDDKLISLKGANDDILKHRPVEENITHFPILDGPTDIMLKRLREVDPDAADRWHPDDRRKIRRALEIFLTTGKRASDIYSEQKRTKDLSKQTRGPWQSLIFWVYTEPEALQDRLNKRVDKMYESGLMDEVRLLHESRRERTERGEIVDLTRGIWQSIGYKQMEPFLEAERNEASSGEKNRLEKAGLEDIKTATRQYAKYQLRWIRYKTITALKDHDAMDFLFLLDSSSAENFSTGVLEPASRICLAFLNGNALARPTEVSNTAREVLTTYNEANIAPKAPLKVKTCDLCKVSLQSEEQWQKHIKGRRHRRVLRSKKMTALIPIDSDRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.11
4 0.1
5 0.08
6 0.09
7 0.08
8 0.08
9 0.09
10 0.09
11 0.09
12 0.1
13 0.1
14 0.11
15 0.13
16 0.12
17 0.11
18 0.1
19 0.11
20 0.11
21 0.11
22 0.1
23 0.1
24 0.14
25 0.13
26 0.14
27 0.13
28 0.12
29 0.12
30 0.12
31 0.1
32 0.07
33 0.08
34 0.09
35 0.08
36 0.1
37 0.18
38 0.21
39 0.27
40 0.26
41 0.3
42 0.33
43 0.35
44 0.38
45 0.38
46 0.36
47 0.39
48 0.42
49 0.43
50 0.42
51 0.43
52 0.4
53 0.35
54 0.34
55 0.27
56 0.32
57 0.3
58 0.3
59 0.27
60 0.25
61 0.23
62 0.23
63 0.25
64 0.19
65 0.17
66 0.15
67 0.15
68 0.17
69 0.17
70 0.19
71 0.16
72 0.14
73 0.14
74 0.15
75 0.16
76 0.17
77 0.19
78 0.23
79 0.26
80 0.33
81 0.4
82 0.45
83 0.45
84 0.45
85 0.47
86 0.43
87 0.4
88 0.39
89 0.33
90 0.27
91 0.26
92 0.25
93 0.21
94 0.19
95 0.17
96 0.12
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.1
107 0.09
108 0.08
109 0.07
110 0.08
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.11
115 0.13
116 0.18
117 0.22
118 0.21
119 0.19
120 0.21
121 0.24
122 0.25
123 0.3
124 0.28
125 0.3
126 0.31
127 0.35
128 0.32
129 0.28
130 0.27
131 0.22
132 0.2
133 0.15
134 0.13
135 0.09
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.13
141 0.13
142 0.14
143 0.17
144 0.17
145 0.19
146 0.23
147 0.25
148 0.25
149 0.27
150 0.26
151 0.23
152 0.23
153 0.21
154 0.21
155 0.22
156 0.21
157 0.25
158 0.34
159 0.43
160 0.53
161 0.57
162 0.6
163 0.59
164 0.66
165 0.63
166 0.56
167 0.51
168 0.42
169 0.38
170 0.35
171 0.31
172 0.22
173 0.2
174 0.17
175 0.13
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.14
180 0.23
181 0.29
182 0.34
183 0.36
184 0.37
185 0.38
186 0.37
187 0.39
188 0.38
189 0.4
190 0.47
191 0.52
192 0.57
193 0.58
194 0.64
195 0.61
196 0.54
197 0.48
198 0.39
199 0.32
200 0.28
201 0.26
202 0.17
203 0.15
204 0.14
205 0.11
206 0.09
207 0.08
208 0.06
209 0.07
210 0.08
211 0.09
212 0.11
213 0.15
214 0.17
215 0.23
216 0.27
217 0.26
218 0.26
219 0.3
220 0.3
221 0.28
222 0.28
223 0.25
224 0.25
225 0.25
226 0.24
227 0.19
228 0.18
229 0.14
230 0.12
231 0.1
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.14
237 0.17
238 0.2
239 0.27
240 0.28
241 0.29
242 0.32
243 0.38
244 0.35
245 0.35
246 0.35
247 0.28
248 0.27
249 0.29
250 0.25
251 0.18
252 0.18
253 0.15
254 0.12
255 0.11
256 0.1
257 0.1
258 0.12
259 0.16
260 0.15
261 0.16
262 0.17
263 0.21
264 0.2
265 0.19
266 0.19
267 0.17
268 0.19
269 0.18
270 0.2
271 0.16
272 0.17
273 0.16
274 0.15
275 0.14
276 0.16
277 0.18
278 0.21
279 0.24
280 0.24
281 0.26
282 0.27
283 0.26
284 0.22
285 0.24
286 0.29
287 0.27
288 0.27
289 0.27
290 0.26
291 0.27
292 0.26
293 0.21
294 0.15
295 0.18
296 0.19
297 0.21
298 0.3
299 0.34
300 0.37
301 0.46
302 0.5
303 0.53
304 0.58
305 0.58
306 0.57
307 0.54
308 0.53
309 0.49
310 0.51
311 0.46
312 0.43
313 0.44
314 0.37
315 0.39
316 0.37
317 0.32
318 0.24
319 0.21
320 0.19
321 0.15
322 0.12
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.09
342 0.1
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.12
348 0.14
349 0.13
350 0.16
351 0.16
352 0.17
353 0.16
354 0.15
355 0.14
356 0.12
357 0.13
358 0.09
359 0.11
360 0.14
361 0.16
362 0.18
363 0.21
364 0.22
365 0.21
366 0.2
367 0.19
368 0.17
369 0.19
370 0.19
371 0.16
372 0.16
373 0.17
374 0.17
375 0.17
376 0.17
377 0.15
378 0.14
379 0.16
380 0.19
381 0.23
382 0.31
383 0.33
384 0.37
385 0.43
386 0.5
387 0.52
388 0.55
389 0.53
390 0.49
391 0.49
392 0.48
393 0.44
394 0.41
395 0.4
396 0.35
397 0.43
398 0.48
399 0.45
400 0.46
401 0.48
402 0.47
403 0.53
404 0.58
405 0.57
406 0.59
407 0.69
408 0.74
409 0.81
410 0.86
411 0.89
412 0.91
413 0.94
414 0.94
415 0.92
416 0.87
417 0.84
418 0.8
419 0.73
420 0.68
421 0.62
422 0.54
423 0.48