Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2XFL0

Protein Details
Accession A0A1Y2XFL0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-49PSSPPSGESTRKRRHKAVEPTPAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-41RKRRHK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR039601  Rrn5  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR017884  SANT_dom  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51293  SANT  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MDLDDDPEYRPADSGSDNEPSRPPPPSSPPSGESTRKRRHKAVEPTPAVSLPKRQRGGFNFQYLNLLNEEIGDAAAGIIRDESLDLAPAQVGIVSWTPSEKQAFFSALGRLGRDDIAGIAARVGTKSPLEIRQYLVLLDEAERARRENDGKRHRALRPVDVPAAVELSTELCAALEQAADGIALRCEKYEAALEQKRWQGRWLVTTQLARVLEHQQRANSNRGNDVTAETNDLPPFAELFALRNWLQLSERVFMNSSVVPDGNWRGISEEPPSIRATALADFHSLALSVTRRLVSATLYVASSRVRVKRAGDRRNRTSDLVKIKDVQAAVASVGMAENSRKFWARAARRLRLAVYDDEQDDRNEEISGMTDQEYLSGREGDGHEDLDTEAEDIIENNISDEDEERNAPSEIDNNNETDSSSTFSSPLLSYDEVETALGFPPTPHPSSHPPQELPTDLPSISPSSSEPSFSDSDSAANSNSDVPVKDPSEEEEQDDEEKDPPALALDLHEALTYTASYDHASTARSRDALRARIRMEHELWADAERFDARTAAREEARLWRVVYDGRGRVKEEDEEEEEDEKGEEGPEIGRRSALVDLGANWREHIEYYSEWEVTGGKRRDAEDSNTDAKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.27
4 0.27
5 0.29
6 0.31
7 0.32
8 0.34
9 0.36
10 0.36
11 0.36
12 0.45
13 0.48
14 0.53
15 0.56
16 0.55
17 0.57
18 0.6
19 0.62
20 0.62
21 0.66
22 0.69
23 0.73
24 0.77
25 0.79
26 0.81
27 0.83
28 0.84
29 0.84
30 0.84
31 0.79
32 0.75
33 0.69
34 0.62
35 0.55
36 0.46
37 0.45
38 0.43
39 0.47
40 0.49
41 0.49
42 0.56
43 0.59
44 0.66
45 0.63
46 0.63
47 0.56
48 0.52
49 0.55
50 0.46
51 0.42
52 0.33
53 0.26
54 0.17
55 0.15
56 0.15
57 0.09
58 0.08
59 0.06
60 0.05
61 0.04
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.07
70 0.06
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.05
79 0.06
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.1
84 0.11
85 0.14
86 0.18
87 0.17
88 0.19
89 0.21
90 0.23
91 0.23
92 0.24
93 0.23
94 0.24
95 0.24
96 0.22
97 0.2
98 0.19
99 0.18
100 0.16
101 0.14
102 0.09
103 0.1
104 0.1
105 0.09
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.11
114 0.14
115 0.2
116 0.24
117 0.25
118 0.27
119 0.29
120 0.29
121 0.26
122 0.23
123 0.18
124 0.14
125 0.13
126 0.16
127 0.13
128 0.15
129 0.16
130 0.17
131 0.17
132 0.21
133 0.27
134 0.31
135 0.41
136 0.49
137 0.55
138 0.6
139 0.67
140 0.65
141 0.68
142 0.63
143 0.61
144 0.57
145 0.56
146 0.51
147 0.44
148 0.41
149 0.32
150 0.29
151 0.2
152 0.14
153 0.09
154 0.07
155 0.08
156 0.07
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.11
177 0.12
178 0.2
179 0.25
180 0.27
181 0.31
182 0.37
183 0.39
184 0.37
185 0.37
186 0.34
187 0.32
188 0.35
189 0.32
190 0.31
191 0.32
192 0.32
193 0.3
194 0.29
195 0.27
196 0.22
197 0.22
198 0.26
199 0.26
200 0.29
201 0.31
202 0.28
203 0.34
204 0.37
205 0.41
206 0.38
207 0.34
208 0.34
209 0.33
210 0.32
211 0.27
212 0.25
213 0.21
214 0.18
215 0.2
216 0.16
217 0.17
218 0.16
219 0.15
220 0.14
221 0.11
222 0.11
223 0.07
224 0.07
225 0.05
226 0.07
227 0.08
228 0.11
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.13
234 0.14
235 0.17
236 0.15
237 0.16
238 0.15
239 0.16
240 0.15
241 0.16
242 0.13
243 0.11
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.1
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.1
252 0.11
253 0.11
254 0.13
255 0.13
256 0.15
257 0.14
258 0.16
259 0.17
260 0.15
261 0.14
262 0.13
263 0.12
264 0.11
265 0.12
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.08
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.12
291 0.14
292 0.15
293 0.18
294 0.21
295 0.3
296 0.39
297 0.47
298 0.53
299 0.58
300 0.63
301 0.68
302 0.68
303 0.61
304 0.53
305 0.5
306 0.48
307 0.43
308 0.37
309 0.32
310 0.3
311 0.3
312 0.27
313 0.21
314 0.13
315 0.1
316 0.09
317 0.07
318 0.06
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.03
323 0.04
324 0.04
325 0.05
326 0.07
327 0.08
328 0.08
329 0.12
330 0.21
331 0.27
332 0.36
333 0.43
334 0.47
335 0.49
336 0.5
337 0.47
338 0.41
339 0.37
340 0.3
341 0.24
342 0.2
343 0.18
344 0.18
345 0.18
346 0.16
347 0.14
348 0.13
349 0.11
350 0.09
351 0.09
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.08
360 0.09
361 0.09
362 0.1
363 0.09
364 0.09
365 0.11
366 0.11
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.1
371 0.11
372 0.11
373 0.08
374 0.08
375 0.06
376 0.05
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.07
389 0.08
390 0.09
391 0.09
392 0.11
393 0.11
394 0.11
395 0.1
396 0.14
397 0.13
398 0.16
399 0.17
400 0.16
401 0.16
402 0.16
403 0.16
404 0.12
405 0.12
406 0.1
407 0.11
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.11
412 0.1
413 0.11
414 0.12
415 0.11
416 0.12
417 0.12
418 0.13
419 0.11
420 0.11
421 0.1
422 0.08
423 0.08
424 0.07
425 0.06
426 0.06
427 0.1
428 0.14
429 0.16
430 0.16
431 0.2
432 0.27
433 0.34
434 0.41
435 0.42
436 0.4
437 0.41
438 0.44
439 0.41
440 0.37
441 0.33
442 0.27
443 0.21
444 0.2
445 0.19
446 0.17
447 0.15
448 0.13
449 0.12
450 0.14
451 0.14
452 0.16
453 0.15
454 0.17
455 0.18
456 0.18
457 0.19
458 0.14
459 0.15
460 0.14
461 0.15
462 0.11
463 0.1
464 0.11
465 0.1
466 0.11
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.16
471 0.17
472 0.17
473 0.17
474 0.2
475 0.25
476 0.26
477 0.27
478 0.24
479 0.24
480 0.25
481 0.25
482 0.23
483 0.17
484 0.17
485 0.14
486 0.12
487 0.1
488 0.1
489 0.09
490 0.08
491 0.08
492 0.1
493 0.1
494 0.11
495 0.11
496 0.1
497 0.1
498 0.1
499 0.09
500 0.06
501 0.06
502 0.07
503 0.08
504 0.08
505 0.1
506 0.1
507 0.12
508 0.14
509 0.17
510 0.19
511 0.2
512 0.21
513 0.26
514 0.32
515 0.39
516 0.44
517 0.47
518 0.46
519 0.51
520 0.54
521 0.53
522 0.48
523 0.46
524 0.41
525 0.36
526 0.34
527 0.3
528 0.27
529 0.2
530 0.2
531 0.14
532 0.14
533 0.13
534 0.14
535 0.12
536 0.17
537 0.2
538 0.24
539 0.25
540 0.25
541 0.27
542 0.34
543 0.37
544 0.33
545 0.31
546 0.27
547 0.27
548 0.28
549 0.32
550 0.31
551 0.34
552 0.38
553 0.41
554 0.43
555 0.44
556 0.44
557 0.43
558 0.39
559 0.38
560 0.35
561 0.36
562 0.36
563 0.34
564 0.31
565 0.26
566 0.23
567 0.17
568 0.14
569 0.11
570 0.08
571 0.08
572 0.1
573 0.16
574 0.18
575 0.18
576 0.18
577 0.18
578 0.2
579 0.2
580 0.19
581 0.15
582 0.13
583 0.15
584 0.22
585 0.25
586 0.23
587 0.22
588 0.22
589 0.21
590 0.21
591 0.2
592 0.17
593 0.15
594 0.22
595 0.25
596 0.24
597 0.23
598 0.23
599 0.23
600 0.23
601 0.32
602 0.29
603 0.29
604 0.33
605 0.34
606 0.41
607 0.43
608 0.46
609 0.43
610 0.47