Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2WTI4

Protein Details
Accession A0A1Y2WTI4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-126YREIDEKMDKRRRARREAREKAEQEEBasic
798-819SEKIWHLTTRPQRKPRALEAIKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-121KRRRARREAREK
Subcellular Location(s) mito_nucl 10.333, mito 10, nucl 9.5, cyto_mito 8.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MTGRRDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEDQIKEALAKRAAQLGFGDAAGKKDEEDDNDDRYQDPDNEVGLFAGGVYDKDDDEADRIYREIDEKMDKRRRARREAREKAEQEEYERKNPKIQQQFADLKRGLESVTEEEWAALPEVGDLTGKNRRSKQARQQRFYAVPDSVLAAAGSAGELGTTIVEDGVASTTGGSSNQDGTMTNFAKIGQARDKVLQVRLDQASQSGSATSVDPKGYLTSLAKTQLPESAAQVGDINRVRELLESVIKTNPNNGPGWIAAARLEELAGKIVAARNVIARGCEHCPKNEDVWLESIRLNEGRNAKVIAAQAIHKNNRSVRLWVEAMKLEDDTRSKKRVIRHALDHIPESEALWKEAVNLEEDPDDARLLLAKATELIPLSVDLWLALARLETPENAQKVLNKARKHCPTSHEIWIAAARLQEQLGQGEKVNVMKRAAQVLVKESAMPKREEWIAEAEKCEQEGAIITCGAIIRETLGYGLDEDDDRKDTWLDDARGSINRGMYETARAIYAYALRVFPTSKTIWLAAADLERNHGSKEDLWQVLEKAVNAVPRSEVLWMMLAKEKWQAGEIDNARRVLARAFQQNPNNEDIWLAAVKLEAENGHIEQARGLLKTARQEAPTDRVWMKSAAFERQLDDLDAALDLVQQALNLFPASAKLWMMKGQIYEDLGQPLQAREAYSTGVKAVPKSVPLWLLYSRLEEKLGQLPKARSVLDRARLAVPKSAELWCESVRVERRAQNTKQAESLMERALRDVPKADQGILWSEKIWHLTTRPQRKPRALEAIKEVDNDPTLLVAVARIFWGERRLEKAQNWFEKALVRDSDLGDSWAWYYKFLLEHGTQEKREEVVSKCVSVEPRHGEVWQAIAKNPKNARKSVEEILKLVAAELH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.3
3 0.26
4 0.23
5 0.18
6 0.15
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.29
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.28
37 0.3
38 0.3
39 0.37
40 0.36
41 0.31
42 0.28
43 0.24
44 0.21
45 0.2
46 0.21
47 0.14
48 0.16
49 0.16
50 0.16
51 0.13
52 0.16
53 0.19
54 0.2
55 0.27
56 0.28
57 0.32
58 0.34
59 0.34
60 0.31
61 0.3
62 0.3
63 0.25
64 0.24
65 0.21
66 0.2
67 0.2
68 0.2
69 0.18
70 0.14
71 0.11
72 0.08
73 0.07
74 0.06
75 0.05
76 0.07
77 0.08
78 0.07
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.11
83 0.14
84 0.13
85 0.13
86 0.14
87 0.14
88 0.15
89 0.16
90 0.16
91 0.18
92 0.27
93 0.3
94 0.41
95 0.5
96 0.55
97 0.62
98 0.7
99 0.75
100 0.76
101 0.83
102 0.83
103 0.85
104 0.89
105 0.87
106 0.89
107 0.82
108 0.76
109 0.73
110 0.63
111 0.58
112 0.57
113 0.55
114 0.54
115 0.57
116 0.54
117 0.53
118 0.58
119 0.61
120 0.62
121 0.63
122 0.57
123 0.6
124 0.69
125 0.63
126 0.66
127 0.58
128 0.48
129 0.43
130 0.39
131 0.3
132 0.22
133 0.22
134 0.17
135 0.17
136 0.17
137 0.15
138 0.15
139 0.15
140 0.15
141 0.13
142 0.09
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.1
150 0.17
151 0.22
152 0.28
153 0.33
154 0.42
155 0.5
156 0.6
157 0.67
158 0.71
159 0.78
160 0.76
161 0.77
162 0.76
163 0.73
164 0.67
165 0.6
166 0.5
167 0.39
168 0.34
169 0.3
170 0.22
171 0.16
172 0.12
173 0.08
174 0.07
175 0.06
176 0.05
177 0.04
178 0.03
179 0.02
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.12
203 0.19
204 0.19
205 0.18
206 0.17
207 0.17
208 0.21
209 0.22
210 0.24
211 0.23
212 0.25
213 0.27
214 0.29
215 0.33
216 0.33
217 0.35
218 0.34
219 0.29
220 0.32
221 0.32
222 0.3
223 0.26
224 0.23
225 0.21
226 0.17
227 0.16
228 0.1
229 0.09
230 0.08
231 0.09
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.12
238 0.11
239 0.13
240 0.12
241 0.13
242 0.15
243 0.17
244 0.18
245 0.18
246 0.18
247 0.19
248 0.19
249 0.17
250 0.17
251 0.18
252 0.16
253 0.16
254 0.17
255 0.14
256 0.18
257 0.2
258 0.19
259 0.15
260 0.16
261 0.16
262 0.15
263 0.15
264 0.12
265 0.14
266 0.14
267 0.16
268 0.19
269 0.21
270 0.2
271 0.24
272 0.24
273 0.23
274 0.23
275 0.21
276 0.2
277 0.18
278 0.21
279 0.16
280 0.14
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.09
285 0.09
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.05
291 0.06
292 0.08
293 0.09
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.13
302 0.17
303 0.23
304 0.23
305 0.24
306 0.27
307 0.3
308 0.31
309 0.31
310 0.29
311 0.23
312 0.26
313 0.25
314 0.23
315 0.21
316 0.19
317 0.17
318 0.17
319 0.16
320 0.16
321 0.19
322 0.18
323 0.19
324 0.19
325 0.18
326 0.19
327 0.19
328 0.16
329 0.13
330 0.15
331 0.18
332 0.24
333 0.27
334 0.26
335 0.29
336 0.3
337 0.35
338 0.35
339 0.31
340 0.27
341 0.29
342 0.29
343 0.27
344 0.27
345 0.23
346 0.22
347 0.2
348 0.18
349 0.14
350 0.14
351 0.15
352 0.18
353 0.21
354 0.23
355 0.26
356 0.29
357 0.35
358 0.43
359 0.5
360 0.5
361 0.52
362 0.57
363 0.59
364 0.57
365 0.52
366 0.42
367 0.34
368 0.28
369 0.22
370 0.18
371 0.13
372 0.12
373 0.11
374 0.1
375 0.1
376 0.12
377 0.12
378 0.1
379 0.09
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.08
385 0.08
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.05
392 0.04
393 0.05
394 0.06
395 0.07
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.05
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.03
409 0.03
410 0.04
411 0.05
412 0.05
413 0.07
414 0.11
415 0.12
416 0.13
417 0.13
418 0.14
419 0.19
420 0.28
421 0.32
422 0.31
423 0.36
424 0.45
425 0.52
426 0.55
427 0.53
428 0.48
429 0.48
430 0.49
431 0.5
432 0.43
433 0.35
434 0.31
435 0.28
436 0.24
437 0.19
438 0.15
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.09
443 0.08
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.08
448 0.09
449 0.09
450 0.11
451 0.12
452 0.13
453 0.13
454 0.14
455 0.15
456 0.17
457 0.17
458 0.15
459 0.14
460 0.15
461 0.16
462 0.14
463 0.13
464 0.13
465 0.16
466 0.17
467 0.18
468 0.16
469 0.17
470 0.18
471 0.18
472 0.17
473 0.19
474 0.2
475 0.2
476 0.2
477 0.2
478 0.18
479 0.18
480 0.17
481 0.1
482 0.07
483 0.08
484 0.08
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.07
491 0.05
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.06
504 0.07
505 0.08
506 0.08
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.12
511 0.17
512 0.17
513 0.16
514 0.17
515 0.18
516 0.19
517 0.21
518 0.19
519 0.14
520 0.13
521 0.13
522 0.13
523 0.12
524 0.12
525 0.12
526 0.11
527 0.09
528 0.09
529 0.09
530 0.08
531 0.09
532 0.09
533 0.09
534 0.09
535 0.09
536 0.1
537 0.1
538 0.1
539 0.13
540 0.12
541 0.13
542 0.14
543 0.14
544 0.14
545 0.14
546 0.14
547 0.1
548 0.11
549 0.11
550 0.09
551 0.11
552 0.11
553 0.11
554 0.11
555 0.11
556 0.11
557 0.11
558 0.15
559 0.18
560 0.18
561 0.18
562 0.19
563 0.19
564 0.2
565 0.19
566 0.15
567 0.11
568 0.12
569 0.14
570 0.13
571 0.13
572 0.12
573 0.11
574 0.12
575 0.11
576 0.1
577 0.07
578 0.1
579 0.09
580 0.1
581 0.13
582 0.13
583 0.13
584 0.16
585 0.16
586 0.14
587 0.15
588 0.15
589 0.12
590 0.21
591 0.23
592 0.26
593 0.28
594 0.28
595 0.27
596 0.26
597 0.26
598 0.19
599 0.19
600 0.18
601 0.23
602 0.28
603 0.34
604 0.39
605 0.44
606 0.45
607 0.44
608 0.4
609 0.32
610 0.27
611 0.21
612 0.17
613 0.13
614 0.1
615 0.07
616 0.06
617 0.07
618 0.06
619 0.07
620 0.05
621 0.06
622 0.08
623 0.08
624 0.1
625 0.11
626 0.11
627 0.1
628 0.13
629 0.13
630 0.12
631 0.13
632 0.12
633 0.14
634 0.19
635 0.24
636 0.25
637 0.24
638 0.26
639 0.29
640 0.32
641 0.32
642 0.32
643 0.28
644 0.26
645 0.26
646 0.25
647 0.22
648 0.23
649 0.24
650 0.24
651 0.26
652 0.25
653 0.25
654 0.25
655 0.26
656 0.21
657 0.18
658 0.13
659 0.1
660 0.1
661 0.08
662 0.06
663 0.05
664 0.04
665 0.04
666 0.04
667 0.04
668 0.04
669 0.04
670 0.05
671 0.05
672 0.05
673 0.04
674 0.06
675 0.07
676 0.08
677 0.08
678 0.09
679 0.1
680 0.14
681 0.15
682 0.16
683 0.16
684 0.16
685 0.17
686 0.18
687 0.18
688 0.16
689 0.17
690 0.15
691 0.16
692 0.15
693 0.14
694 0.14
695 0.13
696 0.13
697 0.11
698 0.12
699 0.13
700 0.13
701 0.13
702 0.12
703 0.14
704 0.15
705 0.14
706 0.17
707 0.17
708 0.18
709 0.19
710 0.2
711 0.19
712 0.19
713 0.22
714 0.2
715 0.22
716 0.2
717 0.24
718 0.24
719 0.22
720 0.23
721 0.2
722 0.21
723 0.26
724 0.29
725 0.28
726 0.31
727 0.32
728 0.35
729 0.38
730 0.37
731 0.3
732 0.34
733 0.39
734 0.4
735 0.41
736 0.39
737 0.41
738 0.44
739 0.44
740 0.41
741 0.35
742 0.29
743 0.3
744 0.29
745 0.24
746 0.22
747 0.25
748 0.2
749 0.2
750 0.19
751 0.24
752 0.28
753 0.31
754 0.35
755 0.37
756 0.44
757 0.51
758 0.54
759 0.57
760 0.56
761 0.55
762 0.52
763 0.48
764 0.42
765 0.37
766 0.38
767 0.32
768 0.29
769 0.26
770 0.25
771 0.3
772 0.28
773 0.26
774 0.25
775 0.22
776 0.26
777 0.28
778 0.27
779 0.22
780 0.22
781 0.27
782 0.27
783 0.25
784 0.19
785 0.19
786 0.2
787 0.22
788 0.23
789 0.19
790 0.2
791 0.29
792 0.39
793 0.48
794 0.57
795 0.63
796 0.71
797 0.77
798 0.81
799 0.8
800 0.82
801 0.75
802 0.7
803 0.68
804 0.66
805 0.58
806 0.53
807 0.45
808 0.36
809 0.33
810 0.28
811 0.2
812 0.13
813 0.11
814 0.1
815 0.09
816 0.07
817 0.06
818 0.06
819 0.06
820 0.07
821 0.07
822 0.09
823 0.14
824 0.17
825 0.2
826 0.27
827 0.32
828 0.38
829 0.42
830 0.51
831 0.56
832 0.6
833 0.62
834 0.56
835 0.52
836 0.51
837 0.49
838 0.45
839 0.37
840 0.31
841 0.29
842 0.3
843 0.31
844 0.26
845 0.25
846 0.19
847 0.18
848 0.17
849 0.2
850 0.19
851 0.16
852 0.17
853 0.19
854 0.2
855 0.2
856 0.25
857 0.2
858 0.27
859 0.34
860 0.4
861 0.38
862 0.39
863 0.4
864 0.36
865 0.36
866 0.35
867 0.3
868 0.33
869 0.35
870 0.33
871 0.33
872 0.36
873 0.39
874 0.37
875 0.42
876 0.38
877 0.4
878 0.4
879 0.39
880 0.38
881 0.33
882 0.36
883 0.33
884 0.28
885 0.27
886 0.35
887 0.38
888 0.44
889 0.52
890 0.55
891 0.56
892 0.59
893 0.62
894 0.6
895 0.63
896 0.63
897 0.64
898 0.58
899 0.54
900 0.51
901 0.46
902 0.38