Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y2XCR9

Protein Details
Accession A0A1Y2XCR9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-73ASSPEKGRRHTPKFLKTHSATHydrophilic
598-617LGSFRKGTYKPVRVPRDPKGHydrophilic
652-687PLPRYEERRAREARRQRRSRERRSQDINARGRRREYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
659-685RRAREARRQRRSRERRSQDINARGRRR
Subcellular Location(s) plas 24, mito 1, E.R. 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010640  Low_temperature_requirement_A  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF06772  LtrA  
Amino Acid Sequences MSHQDLDYASHRLQLVGSRVVESEDAGHRVIPTQHQHHHQHHHHAHSYDEAEASSPEKGRRHTPKFLKTHSATNFELFYDLWFVANLNVFTSKHDISDISKFSSFIGYMVLLWTTWLLTTLYDVRFTADSVWERCCKAIHLGVMIGFAEIGAAFDPNDQIVSVFRAMSLFLAVSRFVLALQYGMVLFQIRTYAHGKRAMFITALFHFIAAAIYFGVSFRYNLGKTSRVFLVWYIGGGVEMALHLRMSQLSHVLTFLGTHLGERLNLLTLIILGEGCIILAKSITLLVKDTYLKDPSYSTWSSNLIGLVTAGTALIYIIFQLYFDWMHDEHSMSRRHQVMWTAVHLPFHIALTLLVEGANQFIVWDRILETSNAALSKVVDLQSQFVDMTSEEVSEKLASVIEPFLEKYPPADVVETMESVNETLENIADIPNSFWKEGSTPDNSTLTHYQNDLTDLMNTMLNAVYAAFEIDPPEGEEDGPKPEYWQSEAAVAVAKRFRLVYIYAFACAGIVLLMLTIMHIISKRRGWTPFNIFRTAACISISIVLALLTLVVADQAAVFRGDRRTAFYGSPWMLPTITIGYFVVLVLTHLPHPSGFCLGSFRKGTYKPVRVPRDPKGLQTPPPILRNNHHLMDYEDGHVRSSSGEYDTMSPPLPRYEERRAREARRQRRSRERRSQDINARGRRREYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.27
3 0.28
4 0.28
5 0.26
6 0.26
7 0.27
8 0.26
9 0.21
10 0.2
11 0.18
12 0.19
13 0.18
14 0.18
15 0.17
16 0.21
17 0.23
18 0.26
19 0.31
20 0.37
21 0.43
22 0.52
23 0.6
24 0.65
25 0.73
26 0.73
27 0.76
28 0.76
29 0.77
30 0.75
31 0.67
32 0.6
33 0.55
34 0.49
35 0.39
36 0.32
37 0.24
38 0.18
39 0.17
40 0.17
41 0.15
42 0.17
43 0.21
44 0.25
45 0.29
46 0.38
47 0.48
48 0.54
49 0.62
50 0.68
51 0.73
52 0.78
53 0.81
54 0.81
55 0.73
56 0.75
57 0.7
58 0.66
59 0.58
60 0.51
61 0.46
62 0.36
63 0.34
64 0.24
65 0.19
66 0.16
67 0.14
68 0.11
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.14
73 0.13
74 0.11
75 0.14
76 0.14
77 0.17
78 0.22
79 0.21
80 0.18
81 0.2
82 0.2
83 0.21
84 0.28
85 0.28
86 0.27
87 0.27
88 0.26
89 0.26
90 0.27
91 0.23
92 0.16
93 0.15
94 0.11
95 0.1
96 0.11
97 0.1
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.06
102 0.05
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.09
107 0.14
108 0.15
109 0.16
110 0.16
111 0.17
112 0.17
113 0.18
114 0.17
115 0.17
116 0.2
117 0.21
118 0.26
119 0.27
120 0.27
121 0.28
122 0.27
123 0.24
124 0.24
125 0.26
126 0.24
127 0.22
128 0.22
129 0.22
130 0.21
131 0.19
132 0.14
133 0.09
134 0.07
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.07
176 0.07
177 0.1
178 0.14
179 0.17
180 0.21
181 0.27
182 0.27
183 0.27
184 0.29
185 0.27
186 0.23
187 0.21
188 0.2
189 0.14
190 0.17
191 0.15
192 0.13
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.07
197 0.06
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.12
207 0.12
208 0.15
209 0.18
210 0.21
211 0.21
212 0.24
213 0.24
214 0.2
215 0.2
216 0.18
217 0.19
218 0.14
219 0.13
220 0.1
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.02
265 0.02
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.04
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.07
274 0.09
275 0.1
276 0.12
277 0.14
278 0.16
279 0.15
280 0.15
281 0.16
282 0.15
283 0.2
284 0.2
285 0.18
286 0.18
287 0.19
288 0.19
289 0.19
290 0.17
291 0.11
292 0.1
293 0.08
294 0.06
295 0.04
296 0.04
297 0.03
298 0.02
299 0.02
300 0.02
301 0.02
302 0.02
303 0.02
304 0.02
305 0.02
306 0.03
307 0.03
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.06
312 0.06
313 0.08
314 0.09
315 0.1
316 0.11
317 0.16
318 0.19
319 0.18
320 0.22
321 0.22
322 0.22
323 0.23
324 0.24
325 0.22
326 0.21
327 0.22
328 0.21
329 0.2
330 0.2
331 0.18
332 0.16
333 0.13
334 0.11
335 0.09
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.05
353 0.06
354 0.07
355 0.07
356 0.08
357 0.07
358 0.08
359 0.08
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.09
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.06
382 0.07
383 0.05
384 0.05
385 0.04
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.07
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.09
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.09
400 0.11
401 0.12
402 0.12
403 0.11
404 0.09
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.05
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.1
419 0.11
420 0.11
421 0.11
422 0.11
423 0.12
424 0.15
425 0.18
426 0.19
427 0.19
428 0.21
429 0.23
430 0.23
431 0.26
432 0.27
433 0.25
434 0.22
435 0.21
436 0.19
437 0.18
438 0.2
439 0.16
440 0.13
441 0.11
442 0.1
443 0.11
444 0.1
445 0.09
446 0.08
447 0.07
448 0.06
449 0.06
450 0.05
451 0.04
452 0.04
453 0.05
454 0.04
455 0.04
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.08
461 0.08
462 0.08
463 0.09
464 0.09
465 0.13
466 0.14
467 0.13
468 0.13
469 0.15
470 0.17
471 0.18
472 0.19
473 0.16
474 0.17
475 0.17
476 0.16
477 0.17
478 0.15
479 0.15
480 0.15
481 0.14
482 0.13
483 0.13
484 0.13
485 0.12
486 0.14
487 0.14
488 0.17
489 0.18
490 0.18
491 0.17
492 0.17
493 0.14
494 0.12
495 0.1
496 0.04
497 0.03
498 0.03
499 0.02
500 0.03
501 0.02
502 0.02
503 0.03
504 0.03
505 0.03
506 0.05
507 0.08
508 0.11
509 0.15
510 0.19
511 0.23
512 0.28
513 0.31
514 0.39
515 0.47
516 0.53
517 0.54
518 0.55
519 0.5
520 0.45
521 0.46
522 0.39
523 0.29
524 0.2
525 0.16
526 0.13
527 0.15
528 0.14
529 0.09
530 0.08
531 0.07
532 0.07
533 0.06
534 0.05
535 0.03
536 0.03
537 0.02
538 0.02
539 0.02
540 0.02
541 0.03
542 0.03
543 0.04
544 0.05
545 0.05
546 0.09
547 0.12
548 0.15
549 0.16
550 0.22
551 0.25
552 0.27
553 0.28
554 0.27
555 0.32
556 0.3
557 0.32
558 0.27
559 0.24
560 0.21
561 0.2
562 0.2
563 0.15
564 0.14
565 0.13
566 0.12
567 0.11
568 0.11
569 0.11
570 0.09
571 0.06
572 0.06
573 0.06
574 0.08
575 0.09
576 0.09
577 0.1
578 0.1
579 0.12
580 0.13
581 0.15
582 0.14
583 0.13
584 0.19
585 0.21
586 0.27
587 0.27
588 0.28
589 0.32
590 0.34
591 0.43
592 0.47
593 0.54
594 0.57
595 0.65
596 0.72
597 0.75
598 0.8
599 0.79
600 0.79
601 0.72
602 0.69
603 0.69
604 0.66
605 0.64
606 0.64
607 0.63
608 0.58
609 0.63
610 0.63
611 0.57
612 0.56
613 0.58
614 0.56
615 0.5
616 0.46
617 0.4
618 0.37
619 0.38
620 0.36
621 0.3
622 0.29
623 0.26
624 0.26
625 0.25
626 0.22
627 0.18
628 0.18
629 0.17
630 0.14
631 0.15
632 0.15
633 0.19
634 0.21
635 0.22
636 0.22
637 0.21
638 0.2
639 0.24
640 0.27
641 0.27
642 0.33
643 0.42
644 0.5
645 0.54
646 0.62
647 0.66
648 0.7
649 0.76
650 0.8
651 0.79
652 0.81
653 0.86
654 0.87
655 0.89
656 0.92
657 0.93
658 0.93
659 0.92
660 0.91
661 0.9
662 0.9
663 0.89
664 0.88
665 0.87
666 0.86
667 0.85
668 0.8