Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y2X9X4

Protein Details
Accession A0A1Y2X9X4    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-67APDNSRRRSGRVVRAPQKFSPHydrophilic
71-94SSHNDNASSKRKRGRDRDEEDAENHydrophilic
117-150EEQTSSRSKKSKSKQKSRAKKPAAKRAKVNGSAPHydrophilic
1085-1110TGPDAGKLRKRLNRNKTKLGNNYRDVHydrophilic
1122-1142LRGGKKKSAAKAKGKEPAKKPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-144RSKKSKSKQKSRAKKPAAKRAK
1123-1142RGGKKKSAAKAKGKEPAKKP
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, mito 2, plas 1, pero 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR039662  Cohesin_Scc3/SA  
IPR020839  SCD  
IPR013721  STAG  
Pfam View protein in Pfam  
PF08514  STAG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51425  SCD  
Amino Acid Sequences MSPSRLPLMETDDNNATSSPASASASASASASASASASASASASASAPDNSRRRSGRVVRAPQKFSPEANSSHNDNASSKRKRGRDRDEEDAENESPAEDDEDELSDPEDQDDNEEEEQTSSRSKKSKSKQKSRAKKPAAKRAKVNGSAPVETGTASLAPAVRLPNRPKKTARVVIVHPDGDGLYADVFGSGDSSDDVAAHWFQRYQQDDAKALTEVINCVLLAAGCEQQLTEDDIRDPDNSANRLSELEDAYQQTSISDYPLISRAKSSKNFRELLIGFFESLISVLHQTDVLYTDEDLLDNIQRWVGIMSSSSLRPFRHTATTVGLAILTSLIEVTEQLDERITKSNQALQTESNRRGKNKNLIENTKKALDTANRNREFIDSKVKDLFDIVFVHRYRDIDPKIRAECVEALGTWICTLPTVYMAPEYLRYLGWLLSDVSVTTRIEVLKQLGRVLKRDAEKLAHFIDRFRPRLVEMATKDSDVSVRVTAIGVVDILRASGMLEPEEVDSVNKLLFDSEVRIRKAVVGFFSALVQELIENKVDEIGGSDALDEVFGDEDEDEYDSLRKDWINIKALAENLAVYDAQLDEEQEEIRHGLDVAADVVNANMPDSRITLATQVLYEKIPEVNNWQILAGYLLFDHSTSTKSRASSKTNSIEAATKRAVAPEPREEAILLEVLAAAVRESLMPSSEHDKHKKKVGRLEMDAQDDAGMKLAALIPRLLNKFGSDPALAAIVLRLEHFLDLEVFQQLRQNSATYDKLLDEIATQFNRHVDQGLLNEATAAFIHARQYEELEELTDNKLAVLWDNTLNSLRTVDKICELSARGNLDRATLTELSQILMKLSKLVSISDCVDVLETPGTSTDSDRPAIKVLISIVHRGLLTESNEDLDDPEDEVVAFAIKACQFYFMWKVKRLRSIVENNEDISDADVDQLVLLRKEFITNLIQTFSSRGFNDDLRLFAVGSACDLCCLFVFLRPIIEDPQGSKYKKLRPLLEEMPPALITQEIIPIFDAAEQAYAKRANKQLNDPTDDEDPLDDELPPEDDEDEELTEQERFAAELKAEKILCELTGKLVLAILAKVIDHTGPDAGKLRKRLNRNKTKLGNNYRDVVAYLDEDHLRELRGGKKKSAAKAKGKEPAKKPALSAELVIDDDDDDEHQIRLEDPFEEEPEPEPEEGTVEDLRRRELLDDPIEDDSEEERPPAGEPMEDDEVIGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.32
3 0.24
4 0.18
5 0.17
6 0.13
7 0.12
8 0.13
9 0.13
10 0.14
11 0.15
12 0.16
13 0.15
14 0.14
15 0.13
16 0.11
17 0.11
18 0.1
19 0.08
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.08
32 0.1
33 0.11
34 0.14
35 0.23
36 0.3
37 0.33
38 0.41
39 0.44
40 0.47
41 0.56
42 0.63
43 0.65
44 0.68
45 0.75
46 0.77
47 0.82
48 0.83
49 0.77
50 0.75
51 0.68
52 0.59
53 0.55
54 0.5
55 0.45
56 0.45
57 0.46
58 0.42
59 0.44
60 0.43
61 0.38
62 0.36
63 0.41
64 0.45
65 0.48
66 0.51
67 0.55
68 0.62
69 0.7
70 0.79
71 0.81
72 0.82
73 0.81
74 0.83
75 0.81
76 0.76
77 0.68
78 0.62
79 0.52
80 0.41
81 0.34
82 0.24
83 0.17
84 0.14
85 0.14
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.11
90 0.12
91 0.12
92 0.12
93 0.11
94 0.11
95 0.12
96 0.13
97 0.11
98 0.14
99 0.16
100 0.19
101 0.18
102 0.19
103 0.17
104 0.17
105 0.18
106 0.17
107 0.21
108 0.2
109 0.25
110 0.31
111 0.36
112 0.46
113 0.56
114 0.65
115 0.7
116 0.79
117 0.84
118 0.88
119 0.94
120 0.95
121 0.95
122 0.95
123 0.93
124 0.92
125 0.93
126 0.92
127 0.89
128 0.86
129 0.85
130 0.84
131 0.81
132 0.73
133 0.71
134 0.65
135 0.58
136 0.5
137 0.42
138 0.32
139 0.25
140 0.23
141 0.15
142 0.1
143 0.08
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.1
148 0.14
149 0.18
150 0.26
151 0.35
152 0.44
153 0.49
154 0.56
155 0.59
156 0.64
157 0.7
158 0.7
159 0.69
160 0.64
161 0.63
162 0.65
163 0.65
164 0.57
165 0.46
166 0.38
167 0.31
168 0.25
169 0.2
170 0.12
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.11
190 0.13
191 0.22
192 0.25
193 0.28
194 0.33
195 0.36
196 0.37
197 0.38
198 0.37
199 0.29
200 0.26
201 0.24
202 0.19
203 0.15
204 0.14
205 0.13
206 0.11
207 0.1
208 0.1
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.1
218 0.14
219 0.13
220 0.13
221 0.14
222 0.15
223 0.17
224 0.17
225 0.18
226 0.17
227 0.22
228 0.22
229 0.22
230 0.22
231 0.21
232 0.22
233 0.21
234 0.21
235 0.16
236 0.16
237 0.18
238 0.18
239 0.18
240 0.18
241 0.16
242 0.13
243 0.13
244 0.11
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.16
250 0.17
251 0.16
252 0.2
253 0.24
254 0.31
255 0.39
256 0.46
257 0.49
258 0.56
259 0.57
260 0.54
261 0.57
262 0.5
263 0.44
264 0.4
265 0.32
266 0.24
267 0.22
268 0.22
269 0.13
270 0.12
271 0.09
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.08
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.1
300 0.11
301 0.13
302 0.16
303 0.17
304 0.21
305 0.23
306 0.25
307 0.29
308 0.3
309 0.3
310 0.3
311 0.32
312 0.28
313 0.25
314 0.22
315 0.15
316 0.13
317 0.11
318 0.06
319 0.04
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.04
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.11
331 0.17
332 0.17
333 0.18
334 0.2
335 0.26
336 0.28
337 0.3
338 0.3
339 0.27
340 0.36
341 0.4
342 0.45
343 0.47
344 0.48
345 0.49
346 0.53
347 0.57
348 0.58
349 0.59
350 0.61
351 0.62
352 0.68
353 0.7
354 0.7
355 0.65
356 0.59
357 0.5
358 0.41
359 0.37
360 0.33
361 0.38
362 0.43
363 0.51
364 0.49
365 0.49
366 0.5
367 0.48
368 0.45
369 0.37
370 0.38
371 0.28
372 0.29
373 0.33
374 0.32
375 0.29
376 0.27
377 0.25
378 0.16
379 0.17
380 0.16
381 0.19
382 0.19
383 0.21
384 0.21
385 0.22
386 0.22
387 0.28
388 0.31
389 0.32
390 0.35
391 0.4
392 0.4
393 0.4
394 0.38
395 0.32
396 0.29
397 0.23
398 0.2
399 0.14
400 0.13
401 0.12
402 0.12
403 0.09
404 0.08
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.09
416 0.1
417 0.09
418 0.08
419 0.09
420 0.09
421 0.09
422 0.08
423 0.08
424 0.08
425 0.07
426 0.08
427 0.07
428 0.07
429 0.09
430 0.09
431 0.08
432 0.09
433 0.08
434 0.09
435 0.11
436 0.13
437 0.14
438 0.15
439 0.17
440 0.2
441 0.21
442 0.23
443 0.24
444 0.27
445 0.26
446 0.28
447 0.27
448 0.27
449 0.27
450 0.28
451 0.27
452 0.25
453 0.23
454 0.23
455 0.29
456 0.32
457 0.34
458 0.32
459 0.3
460 0.27
461 0.32
462 0.32
463 0.3
464 0.25
465 0.29
466 0.29
467 0.28
468 0.27
469 0.23
470 0.21
471 0.15
472 0.14
473 0.08
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.06
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.03
486 0.03
487 0.03
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.06
493 0.06
494 0.07
495 0.06
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.06
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.08
506 0.14
507 0.19
508 0.2
509 0.2
510 0.2
511 0.22
512 0.23
513 0.21
514 0.16
515 0.13
516 0.13
517 0.13
518 0.13
519 0.1
520 0.09
521 0.07
522 0.06
523 0.05
524 0.05
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.05
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.03
541 0.03
542 0.03
543 0.03
544 0.03
545 0.03
546 0.03
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.04
551 0.05
552 0.06
553 0.06
554 0.07
555 0.07
556 0.08
557 0.14
558 0.19
559 0.22
560 0.23
561 0.24
562 0.24
563 0.24
564 0.23
565 0.18
566 0.13
567 0.08
568 0.08
569 0.07
570 0.05
571 0.05
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.05
578 0.05
579 0.05
580 0.05
581 0.05
582 0.05
583 0.05
584 0.05
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.05
589 0.05
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.04
595 0.04
596 0.03
597 0.04
598 0.04
599 0.05
600 0.06
601 0.06
602 0.07
603 0.07
604 0.08
605 0.08
606 0.08
607 0.07
608 0.08
609 0.07
610 0.07
611 0.07
612 0.08
613 0.08
614 0.08
615 0.11
616 0.13
617 0.14
618 0.14
619 0.13
620 0.11
621 0.11
622 0.11
623 0.07
624 0.05
625 0.04
626 0.04
627 0.04
628 0.04
629 0.05
630 0.05
631 0.06
632 0.07
633 0.11
634 0.13
635 0.14
636 0.21
637 0.25
638 0.3
639 0.34
640 0.4
641 0.41
642 0.4
643 0.39
644 0.34
645 0.35
646 0.3
647 0.29
648 0.22
649 0.19
650 0.17
651 0.18
652 0.19
653 0.17
654 0.2
655 0.21
656 0.23
657 0.23
658 0.23
659 0.21
660 0.2
661 0.17
662 0.13
663 0.08
664 0.05
665 0.04
666 0.04
667 0.04
668 0.03
669 0.03
670 0.02
671 0.02
672 0.03
673 0.03
674 0.03
675 0.04
676 0.05
677 0.06
678 0.13
679 0.18
680 0.25
681 0.33
682 0.39
683 0.41
684 0.5
685 0.54
686 0.53
687 0.56
688 0.59
689 0.58
690 0.55
691 0.59
692 0.54
693 0.52
694 0.46
695 0.38
696 0.29
697 0.22
698 0.18
699 0.12
700 0.08
701 0.04
702 0.05
703 0.07
704 0.07
705 0.07
706 0.08
707 0.08
708 0.12
709 0.14
710 0.14
711 0.13
712 0.13
713 0.14
714 0.14
715 0.16
716 0.12
717 0.11
718 0.1
719 0.11
720 0.09
721 0.08
722 0.07
723 0.05
724 0.05
725 0.05
726 0.05
727 0.05
728 0.05
729 0.05
730 0.05
731 0.05
732 0.06
733 0.06
734 0.07
735 0.07
736 0.07
737 0.11
738 0.11
739 0.12
740 0.12
741 0.12
742 0.12
743 0.16
744 0.17
745 0.14
746 0.16
747 0.14
748 0.14
749 0.13
750 0.12
751 0.09
752 0.1
753 0.12
754 0.12
755 0.12
756 0.12
757 0.13
758 0.14
759 0.13
760 0.12
761 0.09
762 0.11
763 0.11
764 0.14
765 0.13
766 0.12
767 0.11
768 0.1
769 0.1
770 0.08
771 0.07
772 0.05
773 0.05
774 0.07
775 0.08
776 0.1
777 0.1
778 0.11
779 0.12
780 0.12
781 0.12
782 0.11
783 0.1
784 0.1
785 0.11
786 0.11
787 0.09
788 0.08
789 0.09
790 0.08
791 0.09
792 0.09
793 0.09
794 0.1
795 0.1
796 0.12
797 0.12
798 0.13
799 0.12
800 0.13
801 0.11
802 0.12
803 0.14
804 0.14
805 0.15
806 0.16
807 0.16
808 0.16
809 0.17
810 0.17
811 0.18
812 0.21
813 0.18
814 0.2
815 0.2
816 0.19
817 0.18
818 0.16
819 0.18
820 0.14
821 0.14
822 0.14
823 0.14
824 0.14
825 0.14
826 0.14
827 0.1
828 0.11
829 0.1
830 0.09
831 0.09
832 0.11
833 0.1
834 0.11
835 0.12
836 0.13
837 0.15
838 0.14
839 0.14
840 0.12
841 0.12
842 0.1
843 0.1
844 0.09
845 0.07
846 0.06
847 0.07
848 0.08
849 0.08
850 0.1
851 0.13
852 0.15
853 0.16
854 0.17
855 0.18
856 0.19
857 0.19
858 0.17
859 0.14
860 0.12
861 0.16
862 0.16
863 0.17
864 0.15
865 0.16
866 0.16
867 0.15
868 0.15
869 0.14
870 0.15
871 0.15
872 0.15
873 0.14
874 0.15
875 0.14
876 0.13
877 0.11
878 0.09
879 0.08
880 0.08
881 0.07
882 0.07
883 0.07
884 0.06
885 0.05
886 0.04
887 0.04
888 0.07
889 0.07
890 0.09
891 0.09
892 0.12
893 0.11
894 0.15
895 0.23
896 0.27
897 0.32
898 0.39
899 0.45
900 0.48
901 0.56
902 0.55
903 0.51
904 0.52
905 0.56
906 0.57
907 0.57
908 0.53
909 0.46
910 0.44
911 0.4
912 0.32
913 0.24
914 0.16
915 0.1
916 0.08
917 0.08
918 0.07
919 0.06
920 0.08
921 0.08
922 0.08
923 0.08
924 0.09
925 0.09
926 0.11
927 0.11
928 0.12
929 0.15
930 0.17
931 0.18
932 0.18
933 0.18
934 0.17
935 0.19
936 0.18
937 0.17
938 0.15
939 0.17
940 0.18
941 0.19
942 0.23
943 0.22
944 0.21
945 0.18
946 0.19
947 0.16
948 0.15
949 0.15
950 0.1
951 0.1
952 0.11
953 0.09
954 0.09
955 0.09
956 0.09
957 0.07
958 0.1
959 0.09
960 0.11
961 0.14
962 0.14
963 0.16
964 0.16
965 0.18
966 0.19
967 0.2
968 0.18
969 0.17
970 0.25
971 0.3
972 0.31
973 0.36
974 0.4
975 0.47
976 0.55
977 0.6
978 0.6
979 0.57
980 0.64
981 0.63
982 0.63
983 0.58
984 0.5
985 0.45
986 0.38
987 0.33
988 0.25
989 0.19
990 0.12
991 0.09
992 0.13
993 0.1
994 0.1
995 0.11
996 0.11
997 0.11
998 0.11
999 0.11
1000 0.06
1001 0.09
1002 0.09
1003 0.08
1004 0.12
1005 0.17
1006 0.17
1007 0.24
1008 0.3
1009 0.35
1010 0.4
1011 0.49
1012 0.54
1013 0.57
1014 0.61
1015 0.56
1016 0.54
1017 0.49
1018 0.45
1019 0.36
1020 0.27
1021 0.22
1022 0.17
1023 0.16
1024 0.12
1025 0.1
1026 0.1
1027 0.12
1028 0.12
1029 0.11
1030 0.1
1031 0.09
1032 0.11
1033 0.12
1034 0.12
1035 0.11
1036 0.11
1037 0.11
1038 0.11
1039 0.1
1040 0.09
1041 0.08
1042 0.07
1043 0.09
1044 0.1
1045 0.1
1046 0.15
1047 0.17
1048 0.22
1049 0.22
1050 0.21
1051 0.21
1052 0.2
1053 0.2
1054 0.17
1055 0.16
1056 0.13
1057 0.16
1058 0.16
1059 0.14
1060 0.14
1061 0.14
1062 0.12
1063 0.12
1064 0.1
1065 0.07
1066 0.07
1067 0.07
1068 0.08
1069 0.07
1070 0.07
1071 0.08
1072 0.11
1073 0.1
1074 0.13
1075 0.2
1076 0.25
1077 0.3
1078 0.37
1079 0.45
1080 0.5
1081 0.6
1082 0.69
1083 0.73
1084 0.79
1085 0.82
1086 0.86
1087 0.86
1088 0.88
1089 0.88
1090 0.88
1091 0.86
1092 0.79
1093 0.74
1094 0.64
1095 0.56
1096 0.47
1097 0.37
1098 0.28
1099 0.2
1100 0.18
1101 0.17
1102 0.17
1103 0.16
1104 0.18
1105 0.17
1106 0.16
1107 0.17
1108 0.2
1109 0.26
1110 0.34
1111 0.38
1112 0.4
1113 0.48
1114 0.54
1115 0.62
1116 0.68
1117 0.69
1118 0.7
1119 0.75
1120 0.79
1121 0.79
1122 0.8
1123 0.81
1124 0.76
1125 0.77
1126 0.74
1127 0.68
1128 0.61
1129 0.6
1130 0.56
1131 0.48
1132 0.43
1133 0.35
1134 0.29
1135 0.27
1136 0.26
1137 0.17
1138 0.13
1139 0.12
1140 0.11
1141 0.09
1142 0.1
1143 0.1
1144 0.1
1145 0.11
1146 0.11
1147 0.12
1148 0.13
1149 0.14
1150 0.12
1151 0.15
1152 0.18
1153 0.2
1154 0.21
1155 0.21
1156 0.22
1157 0.24
1158 0.26
1159 0.21
1160 0.19
1161 0.16
1162 0.17
1163 0.16
1164 0.17
1165 0.17
1166 0.17
1167 0.22
1168 0.22
1169 0.25
1170 0.25
1171 0.26
1172 0.24
1173 0.26
1174 0.31
1175 0.33
1176 0.34
1177 0.34
1178 0.35
1179 0.34
1180 0.32
1181 0.28
1182 0.22
1183 0.18
1184 0.17
1185 0.14
1186 0.13
1187 0.13
1188 0.14
1189 0.17
1190 0.16
1191 0.14
1192 0.16
1193 0.21
1194 0.25
1195 0.24