Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2WKC4

Protein Details
Accession A0A1Y2WKC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-99QIEPVPKPVRAPKKPKPQLHTPAPRQVIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-87RAPKKPK
165-171RKPKPKS
Subcellular Location(s) cyto 12.5, nucl 11, cyto_mito 8, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSVFQLSKLLPLPEAELKQVIDYAATLSKSEAAEHFRNLLGESPEAIDFIASFNSKRQDPKTTSTSSRSSSQIEPVPKPVRAPKKPKPQLHTPAPRQVINHGPVPGTVYNKDVESDYIARRSSPAVTSASAGSGSGKKPPHQKSATPPPPKLPPSAAGQLISDVRKPKPKSTPASRSSTPAPKAKVHISGGTAMHGASTALSDLDNAIRLLETATNPTLGTDVSARKCNCVAARHPLLAAAPNCMNCGKVICVKEGLGPCTFCGTPLLSPAEIQLMIRELRDERGREKMAVDREAHKKADVSRTPAPFSKPKETSGETSEAQARALEHRDRLLGFQAQNARRTTVRDEAADFDVSGAMTGFGGNIWATPEERARELKRQQKILREIEWNARPDYERRRQVVSIDVVGGKVVRKMAAVGRPESPEDDLQTDTALQEVNNINLDNTNKGNGVGGAFSKNPLLGSLVKPVFDVKGKGAKLEGRDPKATRWRRVQDDLDDNETIILDGGAYGSRPSQGTSSDTVVDEPTCG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.27
3 0.26
4 0.25
5 0.25
6 0.25
7 0.2
8 0.14
9 0.12
10 0.13
11 0.14
12 0.14
13 0.14
14 0.13
15 0.17
16 0.17
17 0.19
18 0.2
19 0.23
20 0.26
21 0.28
22 0.29
23 0.27
24 0.27
25 0.26
26 0.27
27 0.22
28 0.2
29 0.19
30 0.19
31 0.18
32 0.17
33 0.16
34 0.11
35 0.09
36 0.09
37 0.11
38 0.1
39 0.1
40 0.15
41 0.2
42 0.23
43 0.3
44 0.34
45 0.41
46 0.46
47 0.52
48 0.55
49 0.57
50 0.6
51 0.59
52 0.59
53 0.53
54 0.51
55 0.48
56 0.45
57 0.4
58 0.41
59 0.41
60 0.43
61 0.41
62 0.47
63 0.48
64 0.45
65 0.47
66 0.5
67 0.55
68 0.58
69 0.66
70 0.67
71 0.73
72 0.82
73 0.86
74 0.84
75 0.84
76 0.84
77 0.85
78 0.85
79 0.81
80 0.81
81 0.76
82 0.71
83 0.62
84 0.56
85 0.54
86 0.46
87 0.42
88 0.34
89 0.3
90 0.28
91 0.31
92 0.29
93 0.24
94 0.22
95 0.2
96 0.19
97 0.19
98 0.2
99 0.16
100 0.15
101 0.16
102 0.19
103 0.2
104 0.23
105 0.23
106 0.22
107 0.22
108 0.23
109 0.21
110 0.18
111 0.19
112 0.17
113 0.17
114 0.18
115 0.18
116 0.17
117 0.14
118 0.13
119 0.12
120 0.13
121 0.13
122 0.18
123 0.2
124 0.24
125 0.34
126 0.4
127 0.48
128 0.49
129 0.54
130 0.58
131 0.67
132 0.72
133 0.7
134 0.66
135 0.61
136 0.65
137 0.62
138 0.55
139 0.47
140 0.39
141 0.37
142 0.39
143 0.36
144 0.28
145 0.26
146 0.24
147 0.24
148 0.22
149 0.2
150 0.19
151 0.21
152 0.29
153 0.32
154 0.38
155 0.45
156 0.52
157 0.59
158 0.65
159 0.72
160 0.69
161 0.74
162 0.67
163 0.62
164 0.59
165 0.57
166 0.52
167 0.47
168 0.45
169 0.41
170 0.43
171 0.43
172 0.42
173 0.36
174 0.34
175 0.29
176 0.29
177 0.26
178 0.23
179 0.2
180 0.14
181 0.12
182 0.1
183 0.08
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.03
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.09
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.12
210 0.14
211 0.21
212 0.21
213 0.22
214 0.22
215 0.25
216 0.25
217 0.25
218 0.26
219 0.28
220 0.31
221 0.3
222 0.29
223 0.27
224 0.24
225 0.24
226 0.21
227 0.15
228 0.13
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.13
233 0.09
234 0.1
235 0.09
236 0.13
237 0.14
238 0.14
239 0.15
240 0.15
241 0.19
242 0.19
243 0.19
244 0.15
245 0.15
246 0.14
247 0.15
248 0.15
249 0.11
250 0.11
251 0.1
252 0.09
253 0.11
254 0.13
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.09
260 0.09
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.07
267 0.1
268 0.14
269 0.15
270 0.16
271 0.22
272 0.23
273 0.23
274 0.24
275 0.26
276 0.26
277 0.28
278 0.29
279 0.28
280 0.33
281 0.35
282 0.35
283 0.3
284 0.28
285 0.29
286 0.36
287 0.33
288 0.34
289 0.37
290 0.38
291 0.41
292 0.41
293 0.41
294 0.38
295 0.41
296 0.43
297 0.39
298 0.39
299 0.42
300 0.42
301 0.41
302 0.38
303 0.37
304 0.28
305 0.28
306 0.29
307 0.23
308 0.21
309 0.18
310 0.15
311 0.14
312 0.18
313 0.18
314 0.16
315 0.17
316 0.18
317 0.18
318 0.18
319 0.19
320 0.19
321 0.17
322 0.2
323 0.27
324 0.29
325 0.33
326 0.33
327 0.32
328 0.28
329 0.31
330 0.31
331 0.3
332 0.29
333 0.26
334 0.26
335 0.27
336 0.28
337 0.26
338 0.21
339 0.15
340 0.13
341 0.11
342 0.1
343 0.06
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.03
348 0.03
349 0.04
350 0.03
351 0.04
352 0.05
353 0.05
354 0.06
355 0.08
356 0.11
357 0.13
358 0.15
359 0.21
360 0.24
361 0.32
362 0.4
363 0.47
364 0.51
365 0.58
366 0.61
367 0.65
368 0.69
369 0.66
370 0.63
371 0.6
372 0.57
373 0.56
374 0.56
375 0.49
376 0.42
377 0.37
378 0.34
379 0.35
380 0.42
381 0.43
382 0.46
383 0.46
384 0.5
385 0.5
386 0.5
387 0.51
388 0.44
389 0.36
390 0.3
391 0.27
392 0.22
393 0.21
394 0.2
395 0.13
396 0.11
397 0.11
398 0.09
399 0.09
400 0.11
401 0.16
402 0.21
403 0.24
404 0.25
405 0.27
406 0.29
407 0.3
408 0.3
409 0.28
410 0.24
411 0.23
412 0.22
413 0.2
414 0.18
415 0.17
416 0.16
417 0.12
418 0.11
419 0.09
420 0.07
421 0.12
422 0.13
423 0.13
424 0.15
425 0.15
426 0.15
427 0.17
428 0.19
429 0.17
430 0.17
431 0.18
432 0.16
433 0.16
434 0.17
435 0.14
436 0.14
437 0.12
438 0.12
439 0.13
440 0.13
441 0.14
442 0.14
443 0.14
444 0.13
445 0.12
446 0.14
447 0.14
448 0.16
449 0.24
450 0.25
451 0.24
452 0.25
453 0.25
454 0.25
455 0.25
456 0.26
457 0.22
458 0.29
459 0.29
460 0.3
461 0.32
462 0.33
463 0.35
464 0.43
465 0.47
466 0.44
467 0.52
468 0.53
469 0.58
470 0.65
471 0.69
472 0.67
473 0.69
474 0.72
475 0.73
476 0.79
477 0.76
478 0.75
479 0.75
480 0.71
481 0.66
482 0.57
483 0.49
484 0.41
485 0.34
486 0.25
487 0.16
488 0.11
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.06
495 0.07
496 0.09
497 0.1
498 0.12
499 0.13
500 0.16
501 0.19
502 0.23
503 0.25
504 0.25
505 0.25
506 0.25
507 0.25