FuNGI

A0A1Y2X2S0

Protein Details

Accession

A0A1Y2X2S0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
596-620	RHTIPDRSKKPDKKQVQQSKGQESQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 12.333, cyto 10, cyto_mito 5.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR019039 T4-Rnl1-like_N IPR012387 Trl1_fun IPR015966 tRNA_lig_kin_fungi IPR015965 tRNA_lig_PDEase
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0051730 F:GTP-dependent polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity GO:0008081 F:phosphoric diester hydrolase activity GO:0003972 F:RNA ligase (ATP) activity GO:0006388 P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation
Pfam	View protein in Pfam PF09511 RNA_lig_T4_1 PF08302 tRNA_lig_CPD PF08303 tRNA_lig_kinase

Amino Acid Sequences

MATPKVPYREQDPQEVANLVRALGNKANKGFKAKKTTYEVKGSPDGLTVDSWRLQDWDYKKRNLPTYARGLFTTKNRKGEHEIAIRGYDKFFNIGEVHETKWENILTKTQGPYELTLKENGCIIFISGLEDGSLLICSKHSTGDRSDVEVSHASAGERWVDKQLATIGKTREEFAQELRKRNVTAVAELCDDEFEEHILAYGPEKAGLYLHGINVNVPEFVTYSSTLVQQFADEWGFRKVSLKTFDDANAVKTFLEAVAESGAHEGRDVEGFVIRCKMSPKPNELPYGDWFFKYKFEEPYLLYRQWRECTKALIAGKPPKFKKHVKITEEYLMYARKRLAADPKLGAAYNQNHGIIALRDDFLAYKHMKGSEAANIENESGGNAFESVTRDVVLVPIATIGCGKTTVGIALTHLFGWGIIQNDNIQGKQRPVKMVQSVLSLLMEHPVVIADRNNSERREREQIIKDIKLQNKEAHLIALNFAHGDIDEIRRVTRERVLKRGDNHQTIQAASDEAKVIGIMENFINRFQPCDPENSPDDGFDLVIDLDPTQDSRANVERVVRELNRKFPSLVPKIPTAEEMDEAVKAAIEDYKPDLRHTIPDRSKKPDKKQVQQSKGQESQPPKKKALEYMSISVPAQDIKVALESAFKGTDAETQRFYRQLQQTRRVQPLFHVTLMHRVAAKEHPELWQKYTSLHAANQSVDGKLGECNIQLERVVYDDRIMAIVVRILDEEEKWTCVNKVPHITVGTRDDTVKPKESNDLLQRWLEVGSGADTGIGERVIEGNNIVKGSVRGVLSK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.49
3	0.41
4	0.36
5	0.32
6	0.24
7	0.22
8	0.21
9	0.22
10	0.26
11	0.31
12	0.31
13	0.37
14	0.43
15	0.44
16	0.52
17	0.56
18	0.58
19	0.64
20	0.63
21	0.66
22	0.68
23	0.74
24	0.71
25	0.72
26	0.66
27	0.62
28	0.63
29	0.56
30	0.48
31	0.41
32	0.35
33	0.27
34	0.26
35	0.22
36	0.2
37	0.21
38	0.21
39	0.19
40	0.19
41	0.19
42	0.26
43	0.31
44	0.38
45	0.42
46	0.49
47	0.56
48	0.62
49	0.69
50	0.7
51	0.7
52	0.67
53	0.7
54	0.67
55	0.62
56	0.56
57	0.51
58	0.48
59	0.51
60	0.54
61	0.5
62	0.55
63	0.54
64	0.58
65	0.63
66	0.64
67	0.64
68	0.61
69	0.58
70	0.51
71	0.53
72	0.49
73	0.42
74	0.37
75	0.29
76	0.22
77	0.2
78	0.18
79	0.18
80	0.17
81	0.17
82	0.21
83	0.21
84	0.22
85	0.24
86	0.25
87	0.23
88	0.26
89	0.26
90	0.23
91	0.23
92	0.27
93	0.26
94	0.31
95	0.32
96	0.3
97	0.32
98	0.32
99	0.33
100	0.31
101	0.3
102	0.27
103	0.3
104	0.29
105	0.26
106	0.27
107	0.24
108	0.2
109	0.17
110	0.15
111	0.11
112	0.1
113	0.12
114	0.09
115	0.09
116	0.08
117	0.08
118	0.07
119	0.07
120	0.07
121	0.05
122	0.05
123	0.06
124	0.07
125	0.08
126	0.13
127	0.15
128	0.18
129	0.21
130	0.29
131	0.3
132	0.33
133	0.35
134	0.3
135	0.32
136	0.29
137	0.27
138	0.2
139	0.19
140	0.15
141	0.13
142	0.14
143	0.15
144	0.14
145	0.15
146	0.17
147	0.17
148	0.17
149	0.18
150	0.23
151	0.23
152	0.24
153	0.28
154	0.27
155	0.31
156	0.32
157	0.31
158	0.28
159	0.27
160	0.26
161	0.26
162	0.35
163	0.36
164	0.42
165	0.45
166	0.46
167	0.43
168	0.43
169	0.44
170	0.35
171	0.35
172	0.31
173	0.29
174	0.27
175	0.26
176	0.24
177	0.18
178	0.16
179	0.11
180	0.09
181	0.07
182	0.06
183	0.06
184	0.06
185	0.07
186	0.06
187	0.07
188	0.08
189	0.07
190	0.08
191	0.08
192	0.08
193	0.08
194	0.09
195	0.12
196	0.11
197	0.12
198	0.13
199	0.13
200	0.14
201	0.15
202	0.15
203	0.11
204	0.09
205	0.08
206	0.07
207	0.08
208	0.1
209	0.09
210	0.09
211	0.1
212	0.13
213	0.13
214	0.13
215	0.12
216	0.1
217	0.1
218	0.11
219	0.11
220	0.09
221	0.1
222	0.13
223	0.13
224	0.13
225	0.16
226	0.17
227	0.22
228	0.27
229	0.28
230	0.26
231	0.28
232	0.29
233	0.3
234	0.28
235	0.25
236	0.2
237	0.18
238	0.17
239	0.15
240	0.14
241	0.09
242	0.09
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.07
249	0.07
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.07
256	0.06
257	0.08
258	0.09
259	0.1
260	0.13
261	0.12
262	0.12
263	0.15
264	0.2
265	0.25
266	0.31
267	0.38
268	0.43
269	0.47
270	0.52
271	0.5
272	0.48
273	0.44
274	0.45
275	0.38
276	0.31
277	0.28
278	0.23
279	0.25
280	0.26
281	0.26
282	0.22
283	0.24
284	0.26
285	0.27
286	0.34
287	0.36
288	0.34
289	0.32
290	0.32
291	0.33
292	0.35
293	0.36
294	0.33
295	0.29
296	0.3
297	0.3
298	0.32
299	0.31
300	0.3
301	0.33
302	0.37
303	0.41
304	0.45
305	0.47
306	0.47
307	0.51
308	0.55
309	0.58
310	0.6
311	0.65
312	0.63
313	0.65
314	0.63
315	0.62
316	0.56
317	0.47
318	0.37
319	0.32
320	0.26
321	0.23
322	0.19
323	0.17
324	0.17
325	0.19
326	0.26
327	0.26
328	0.29
329	0.28
330	0.29
331	0.26
332	0.25
333	0.23
334	0.19
335	0.18
336	0.17
337	0.17
338	0.16
339	0.15
340	0.15
341	0.15
342	0.11
343	0.1
344	0.08
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.08
349	0.07
350	0.11
351	0.1
352	0.1
353	0.11
354	0.12
355	0.12
356	0.13
357	0.14
358	0.15
359	0.16
360	0.15
361	0.14
362	0.14
363	0.14
364	0.13
365	0.11
366	0.07
367	0.05
368	0.05
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.05
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.08
377	0.08
378	0.07
379	0.08
380	0.07
381	0.05
382	0.04
383	0.05
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.06
398	0.07
399	0.06
400	0.06
401	0.06
402	0.05
403	0.05
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.07
409	0.09
410	0.1
411	0.1
412	0.11
413	0.12
414	0.15
415	0.2
416	0.22
417	0.23
418	0.25
419	0.29
420	0.29
421	0.31
422	0.28
423	0.25
424	0.22
425	0.19
426	0.17
427	0.13
428	0.1
429	0.08
430	0.07
431	0.05
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.05
436	0.06
437	0.06
438	0.08
439	0.13
440	0.16
441	0.18
442	0.22
443	0.24
444	0.28
445	0.34
446	0.35
447	0.39
448	0.41
449	0.47
450	0.49
451	0.47
452	0.48
453	0.48
454	0.5
455	0.45
456	0.42
457	0.38
458	0.34
459	0.35
460	0.29
461	0.23
462	0.21
463	0.17
464	0.15
465	0.12
466	0.1
467	0.08
468	0.08
469	0.06
470	0.05
471	0.06
472	0.06
473	0.08
474	0.09
475	0.09
476	0.1
477	0.11
478	0.13
479	0.14
480	0.19
481	0.25
482	0.28
483	0.36
484	0.42
485	0.45
486	0.48
487	0.55
488	0.57
489	0.53
490	0.51
491	0.46
492	0.41
493	0.37
494	0.34
495	0.25
496	0.18
497	0.13
498	0.13
499	0.1
500	0.08
501	0.08
502	0.07
503	0.06
504	0.07
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.08
509	0.09
510	0.09
511	0.11
512	0.1
513	0.12
514	0.12
515	0.17
516	0.16
517	0.23
518	0.24
519	0.26
520	0.29
521	0.31
522	0.3
523	0.25
524	0.25
525	0.19
526	0.17
527	0.12
528	0.1
529	0.06
530	0.06
531	0.06
532	0.05
533	0.05
534	0.05
535	0.06
536	0.07
537	0.09
538	0.09
539	0.13
540	0.18
541	0.19
542	0.2
543	0.24
544	0.23
545	0.23
546	0.29
547	0.28
548	0.32
549	0.34
550	0.41
551	0.4
552	0.41
553	0.4
554	0.39
555	0.47
556	0.44
557	0.46
558	0.4
559	0.41
560	0.41
561	0.4
562	0.37
563	0.31
564	0.25
565	0.21
566	0.19
567	0.16
568	0.14
569	0.13
570	0.12
571	0.08
572	0.07
573	0.06
574	0.08
575	0.07
576	0.09
577	0.12
578	0.18
579	0.19
580	0.2
581	0.22
582	0.21
583	0.29
584	0.32
585	0.39
586	0.42
587	0.52
588	0.55
589	0.62
590	0.71
591	0.73
592	0.78
593	0.78
594	0.79
595	0.8
596	0.86
597	0.88
598	0.86
599	0.85
600	0.83
601	0.81
602	0.78
603	0.71
604	0.66
605	0.64
606	0.67
607	0.67
608	0.66
609	0.6
610	0.6
611	0.59
612	0.61
613	0.59
614	0.57
615	0.51
616	0.49
617	0.48
618	0.43
619	0.4
620	0.32
621	0.26
622	0.18
623	0.13
624	0.1
625	0.08
626	0.07
627	0.09
628	0.09
629	0.08
630	0.1
631	0.1
632	0.12
633	0.12
634	0.11
635	0.1
636	0.11
637	0.18
638	0.2
639	0.22
640	0.25
641	0.27
642	0.3
643	0.32
644	0.33
645	0.36
646	0.4
647	0.47
648	0.53
649	0.59
650	0.66
651	0.71
652	0.79
653	0.71
654	0.62
655	0.58
656	0.58
657	0.53
658	0.44
659	0.4
660	0.31
661	0.38
662	0.39
663	0.35
664	0.27
665	0.23
666	0.25
667	0.28
668	0.31
669	0.26
670	0.26
671	0.31
672	0.38
673	0.4
674	0.41
675	0.4
676	0.36
677	0.34
678	0.37
679	0.35
680	0.3
681	0.3
682	0.31
683	0.29
684	0.29
685	0.32
686	0.3
687	0.25
688	0.23
689	0.21
690	0.16
691	0.14
692	0.15
693	0.12
694	0.12
695	0.14
696	0.14
697	0.15
698	0.14
699	0.14
700	0.13
701	0.14
702	0.16
703	0.14
704	0.14
705	0.13
706	0.13
707	0.13
708	0.12
709	0.1
710	0.09
711	0.1
712	0.1
713	0.09
714	0.09
715	0.1
716	0.11
717	0.11
718	0.15
719	0.14
720	0.16
721	0.16
722	0.18
723	0.18
724	0.24
725	0.3
726	0.33
727	0.4
728	0.41
729	0.45
730	0.47
731	0.47
732	0.45
733	0.45
734	0.4
735	0.34
736	0.33
737	0.33
738	0.37
739	0.41
740	0.43
741	0.39
742	0.38
743	0.45
744	0.46
745	0.5
746	0.51
747	0.5
748	0.47
749	0.46
750	0.45
751	0.38
752	0.35
753	0.26
754	0.17
755	0.14
756	0.12
757	0.1
758	0.09
759	0.09
760	0.08
761	0.09
762	0.09
763	0.08
764	0.06
765	0.06
766	0.08
767	0.09
768	0.1
769	0.11
770	0.13
771	0.16
772	0.16
773	0.15
774	0.15
775	0.15
776	0.16
777	0.2

A0A1Y2X2S0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer