Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2XDM0

Protein Details
Accession A0A1Y2XDM0    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
399-419ALEEKLKREKEERKRRLGMGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
207-224KEQPAKAEQKPNGIKGKD
254-283RNGTGKDAKATGKPRPSSASEEAPEKKVKK
403-419KLKREKEERKRRLGMGR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MPIGDLLAEISGGNPSSEPRPKTPTSTAVKRKADDDSHSTTSNKYPKSRQQDGSYPTSKTTREVKTDTIDRPKPTSASTAAKSSSLPHRTSSPSTNGRYQPPVPSVQRTSTSSTNGRPGSGPGLSTSQPKKSTDQIVSRPKLSASSLAAASKAPPAKSSPTTPTASDPSKAPKKGSYQEIMERAKKAQASMGKVGMIQHKSIGTAKKEQPAKAEQKPNGIKGKDGKPYLGNSRSSTTLARGGARPGTVARDAGRNGTGKDAKATGKPRPSSASEEAPEKKVKKSATATTGYTGTARPRPGATSGKPSASGKSGSSAYKAGGLLAPPRPSRRDRYEDEYDDDMDDFIEYDDDEEPDYRGGGYGGYDSDGSSDMEAGISDIDIEERRAEILGREEDKREQALEEKLKREKEERKRRLGMGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.1
3 0.18
4 0.26
5 0.3
6 0.34
7 0.42
8 0.45
9 0.52
10 0.56
11 0.57
12 0.59
13 0.65
14 0.69
15 0.72
16 0.75
17 0.7
18 0.67
19 0.65
20 0.61
21 0.57
22 0.54
23 0.51
24 0.49
25 0.49
26 0.47
27 0.42
28 0.45
29 0.46
30 0.46
31 0.45
32 0.5
33 0.57
34 0.66
35 0.73
36 0.72
37 0.71
38 0.74
39 0.73
40 0.73
41 0.67
42 0.59
43 0.53
44 0.5
45 0.44
46 0.4
47 0.43
48 0.4
49 0.43
50 0.45
51 0.46
52 0.49
53 0.55
54 0.58
55 0.59
56 0.58
57 0.55
58 0.55
59 0.54
60 0.48
61 0.43
62 0.4
63 0.36
64 0.36
65 0.35
66 0.35
67 0.33
68 0.32
69 0.31
70 0.3
71 0.34
72 0.33
73 0.33
74 0.3
75 0.34
76 0.38
77 0.43
78 0.44
79 0.43
80 0.45
81 0.47
82 0.53
83 0.53
84 0.52
85 0.53
86 0.5
87 0.48
88 0.43
89 0.46
90 0.42
91 0.44
92 0.43
93 0.41
94 0.43
95 0.4
96 0.42
97 0.37
98 0.39
99 0.37
100 0.36
101 0.4
102 0.36
103 0.34
104 0.3
105 0.28
106 0.27
107 0.23
108 0.21
109 0.15
110 0.17
111 0.17
112 0.23
113 0.25
114 0.28
115 0.3
116 0.32
117 0.34
118 0.36
119 0.43
120 0.43
121 0.47
122 0.5
123 0.57
124 0.57
125 0.56
126 0.51
127 0.44
128 0.38
129 0.32
130 0.26
131 0.18
132 0.18
133 0.17
134 0.17
135 0.17
136 0.15
137 0.15
138 0.16
139 0.16
140 0.14
141 0.14
142 0.16
143 0.21
144 0.24
145 0.27
146 0.27
147 0.3
148 0.31
149 0.31
150 0.32
151 0.32
152 0.31
153 0.28
154 0.25
155 0.29
156 0.34
157 0.35
158 0.34
159 0.33
160 0.38
161 0.43
162 0.46
163 0.41
164 0.38
165 0.41
166 0.47
167 0.46
168 0.42
169 0.38
170 0.33
171 0.32
172 0.29
173 0.24
174 0.21
175 0.21
176 0.22
177 0.23
178 0.23
179 0.21
180 0.21
181 0.23
182 0.23
183 0.2
184 0.16
185 0.15
186 0.14
187 0.15
188 0.18
189 0.2
190 0.17
191 0.24
192 0.27
193 0.32
194 0.36
195 0.36
196 0.36
197 0.4
198 0.44
199 0.45
200 0.49
201 0.45
202 0.5
203 0.52
204 0.53
205 0.52
206 0.45
207 0.4
208 0.39
209 0.44
210 0.41
211 0.39
212 0.35
213 0.31
214 0.34
215 0.39
216 0.37
217 0.32
218 0.28
219 0.29
220 0.29
221 0.28
222 0.26
223 0.2
224 0.19
225 0.18
226 0.18
227 0.17
228 0.17
229 0.17
230 0.16
231 0.15
232 0.12
233 0.13
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.14
238 0.14
239 0.15
240 0.17
241 0.16
242 0.15
243 0.21
244 0.22
245 0.19
246 0.2
247 0.21
248 0.2
249 0.25
250 0.29
251 0.3
252 0.36
253 0.37
254 0.38
255 0.39
256 0.41
257 0.42
258 0.42
259 0.41
260 0.35
261 0.4
262 0.4
263 0.39
264 0.42
265 0.36
266 0.35
267 0.34
268 0.33
269 0.34
270 0.37
271 0.4
272 0.41
273 0.42
274 0.41
275 0.38
276 0.38
277 0.31
278 0.26
279 0.21
280 0.19
281 0.2
282 0.2
283 0.2
284 0.2
285 0.21
286 0.26
287 0.31
288 0.3
289 0.34
290 0.36
291 0.36
292 0.38
293 0.37
294 0.34
295 0.29
296 0.28
297 0.2
298 0.21
299 0.22
300 0.21
301 0.22
302 0.2
303 0.18
304 0.19
305 0.18
306 0.16
307 0.14
308 0.14
309 0.17
310 0.2
311 0.25
312 0.25
313 0.3
314 0.34
315 0.38
316 0.46
317 0.5
318 0.53
319 0.54
320 0.59
321 0.64
322 0.63
323 0.63
324 0.57
325 0.49
326 0.42
327 0.36
328 0.27
329 0.18
330 0.14
331 0.09
332 0.07
333 0.06
334 0.05
335 0.06
336 0.07
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.08
345 0.08
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.05
364 0.05
365 0.04
366 0.06
367 0.07
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.1
373 0.11
374 0.12
375 0.18
376 0.24
377 0.27
378 0.3
379 0.32
380 0.36
381 0.39
382 0.39
383 0.34
384 0.29
385 0.3
386 0.37
387 0.44
388 0.46
389 0.5
390 0.55
391 0.59
392 0.62
393 0.66
394 0.67
395 0.68
396 0.73
397 0.76
398 0.79
399 0.82