FuNGI

A0A1Y2WL65

Protein Details

Accession

A0A1Y2WL65

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
523-543	SVTAKPKKKMMKKKKGDVDDD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
527-537	KPKKKMMKKKK

Subcellular Location(s)

cyto 11.5, mito 10, cyto_nucl 8.5, nucl 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000547 Clathrin_H-chain/VPS_repeat IPR001180 CNH_dom IPR032914 Vam6/VPS39/TRAP1 IPR019452 VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1 IPR019453 VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0043231 C:intracellular membrane-bounded organelle GO:0006886 P:intracellular protein transport GO:0016192 P:vesicle-mediated transport
Pfam	View protein in Pfam PF00780 CNH PF10366 Vps39_1 PF10367 Vps39_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50236 CHCR PS50219 CNH

Amino Acid Sequences

MLSAFTARPIIELRPRDKSKIETILAYGDRVLVGLNTGSLRIYRLNDLSQSSATNGTHSIADSQRDPNGRSSTNPTDLLREVEKFSARAIEQLAIIKESNTIISLSNYHVSLHDLQSYELIETIPRTKNATCFAVTSNIVKDAATGIPEIISRLAVAVKRRLLLWSWHESELNDDVTEVVLPEAIRTLTWANATKIVCGMNAGYILVDVLTLETRDIVGLGATATGGQGSRFGAASMGYMGLGGYMPKPLSTRLAEGQMLLAKDINSLFIDMDGKPLEKRQVPWQSAPESIGYSYPYILVLQPPAKGTLEVRNPETLSLLQTIELPGAAQLHFPPPTVSLAHAGKGFHISSDRVVWKMEATDYDTQVKELMDKANYDEAISVLGMLEDALLKDKTGTLREAKMLKAEVLFKKRKFAESLALFNEDDVHAPAQRVLRLYPRIIAGDLSAEPAQEETSEEEEEQEEDEKANGGKATRTDASVEVASPSKPGAFAKYWMGHRKTDSDTASIASSKRGGTDNEDTASVTAKPKKKMMKKKKGDVDDDGPLEGKDLIKAVRELNGYLAGTRARLQRWIDPATGKLKPRKTEANNGSMINLHENLDILLPNSPSESDEQLERELKQIFTVVDTALFRGLMFVTPTLAGSLFRIPNFCDPAVVNEHLLKHNRYNELVDFFYGKKLHREALTLLRKFGNAETDGESAKLDLNGQEDAEVVIPEQLRGPQRTVGYLQSLPPEMIDIILEFADWVLRRDPDQGMEVFLADSENAETLPRERVLRYLGAIDANLEIRYLQHIITELEDGTPDFHNRLVELLVQALKEGERDEAWSEQLKSLVAFLKSSQQYSLSKALSIIPRDDPAFYEARAIVFSNMGSHKQALEIYVFNMQDYVKAEEYCNHIHSLPSSRRESFAASSSIDEEDRDPNSKPSIYHMLLSLYLTPPAPNKPNLGPALSLLSRHGSRLPAESTLSLIPDDLPVTELESYFRGRIRAANSVVSESRIIEGLRKTQLVNTQALLLLGDGITGGQSGRSRKVVIGEERVCGVCHKRLGNSVVAVLPDNSVVHYGCLGRRGRSTSGSRNEVIAGSWGRHG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.53
3	0.56
4	0.59
5	0.59
6	0.59
7	0.6
8	0.57
9	0.49
10	0.46
11	0.48
12	0.44
13	0.39
14	0.3
15	0.21
16	0.19
17	0.16
18	0.15
19	0.07
20	0.07
21	0.07
22	0.08
23	0.08
24	0.08
25	0.09
26	0.09
27	0.11
28	0.14
29	0.17
30	0.21
31	0.24
32	0.27
33	0.3
34	0.32
35	0.33
36	0.31
37	0.29
38	0.25
39	0.27
40	0.24
41	0.22
42	0.2
43	0.18
44	0.18
45	0.17
46	0.2
47	0.19
48	0.22
49	0.24
50	0.26
51	0.31
52	0.34
53	0.36
54	0.38
55	0.41
56	0.4
57	0.41
58	0.46
59	0.48
60	0.48
61	0.5
62	0.44
63	0.43
64	0.42
65	0.42
66	0.37
67	0.32
68	0.29
69	0.3
70	0.31
71	0.26
72	0.26
73	0.27
74	0.24
75	0.24
76	0.24
77	0.21
78	0.2
79	0.24
80	0.24
81	0.2
82	0.2
83	0.18
84	0.17
85	0.16
86	0.15
87	0.12
88	0.11
89	0.1
90	0.12
91	0.14
92	0.15
93	0.17
94	0.17
95	0.17
96	0.16
97	0.19
98	0.21
99	0.22
100	0.22
101	0.21
102	0.21
103	0.22
104	0.22
105	0.18
106	0.15
107	0.13
108	0.1
109	0.12
110	0.18
111	0.2
112	0.21
113	0.25
114	0.26
115	0.31
116	0.35
117	0.36
118	0.31
119	0.3
120	0.3
121	0.32
122	0.31
123	0.29
124	0.26
125	0.24
126	0.22
127	0.2
128	0.18
129	0.15
130	0.15
131	0.13
132	0.11
133	0.09
134	0.1
135	0.1
136	0.11
137	0.09
138	0.08
139	0.07
140	0.07
141	0.1
142	0.12
143	0.17
144	0.22
145	0.25
146	0.25
147	0.26
148	0.27
149	0.27
150	0.31
151	0.33
152	0.35
153	0.36
154	0.37
155	0.38
156	0.36
157	0.38
158	0.33
159	0.28
160	0.2
161	0.16
162	0.14
163	0.13
164	0.13
165	0.09
166	0.06
167	0.06
168	0.06
169	0.06
170	0.07
171	0.07
172	0.07
173	0.09
174	0.1
175	0.1
176	0.14
177	0.18
178	0.18
179	0.24
180	0.24
181	0.23
182	0.24
183	0.23
184	0.19
185	0.16
186	0.15
187	0.1
188	0.1
189	0.09
190	0.07
191	0.07
192	0.07
193	0.05
194	0.05
195	0.03
196	0.04
197	0.04
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.05
216	0.06
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.08
223	0.07
224	0.07
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.04
232	0.06
233	0.07
234	0.07
235	0.09
236	0.1
237	0.15
238	0.17
239	0.2
240	0.21
241	0.25
242	0.25
243	0.24
244	0.24
245	0.22
246	0.2
247	0.16
248	0.15
249	0.11
250	0.12
251	0.11
252	0.11
253	0.09
254	0.09
255	0.09
256	0.08
257	0.1
258	0.09
259	0.12
260	0.11
261	0.12
262	0.12
263	0.15
264	0.2
265	0.21
266	0.24
267	0.31
268	0.4
269	0.44
270	0.48
271	0.5
272	0.47
273	0.45
274	0.44
275	0.35
276	0.26
277	0.23
278	0.19
279	0.15
280	0.12
281	0.11
282	0.1
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.09
287	0.12
288	0.13
289	0.14
290	0.15
291	0.16
292	0.16
293	0.16
294	0.17
295	0.21
296	0.26
297	0.28
298	0.29
299	0.3
300	0.3
301	0.29
302	0.29
303	0.22
304	0.17
305	0.16
306	0.14
307	0.11
308	0.11
309	0.11
310	0.09
311	0.09
312	0.07
313	0.05
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.07
318	0.1
319	0.11
320	0.11
321	0.11
322	0.11
323	0.13
324	0.13
325	0.14
326	0.16
327	0.16
328	0.17
329	0.18
330	0.17
331	0.16
332	0.18
333	0.17
334	0.12
335	0.13
336	0.12
337	0.12
338	0.17
339	0.18
340	0.16
341	0.17
342	0.16
343	0.15
344	0.15
345	0.15
346	0.11
347	0.14
348	0.16
349	0.17
350	0.21
351	0.2
352	0.19
353	0.2
354	0.18
355	0.15
356	0.14
357	0.15
358	0.13
359	0.13
360	0.15
361	0.17
362	0.17
363	0.16
364	0.14
365	0.11
366	0.1
367	0.1
368	0.07
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.03
373	0.03
374	0.03
375	0.03
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.06
380	0.08
381	0.1
382	0.11
383	0.14
384	0.16
385	0.18
386	0.22
387	0.24
388	0.23
389	0.23
390	0.22
391	0.2
392	0.19
393	0.23
394	0.25
395	0.32
396	0.39
397	0.37
398	0.43
399	0.44
400	0.45
401	0.42
402	0.39
403	0.39
404	0.36
405	0.39
406	0.34
407	0.34
408	0.31
409	0.27
410	0.26
411	0.17
412	0.14
413	0.11
414	0.1
415	0.08
416	0.08
417	0.11
418	0.11
419	0.12
420	0.13
421	0.13
422	0.18
423	0.2
424	0.21
425	0.2
426	0.2
427	0.19
428	0.19
429	0.18
430	0.12
431	0.11
432	0.1
433	0.1
434	0.09
435	0.08
436	0.08
437	0.08
438	0.07
439	0.06
440	0.07
441	0.06
442	0.08
443	0.09
444	0.09
445	0.09
446	0.1
447	0.1
448	0.09
449	0.08
450	0.07
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.07
457	0.07
458	0.08
459	0.09
460	0.12
461	0.12
462	0.13
463	0.14
464	0.13
465	0.15
466	0.14
467	0.13
468	0.1
469	0.1
470	0.1
471	0.09
472	0.08
473	0.06
474	0.07
475	0.07
476	0.1
477	0.1
478	0.12
479	0.16
480	0.2
481	0.25
482	0.32
483	0.34
484	0.32
485	0.33
486	0.35
487	0.33
488	0.35
489	0.31
490	0.25
491	0.23
492	0.22
493	0.21
494	0.18
495	0.16
496	0.11
497	0.11
498	0.09
499	0.1
500	0.11
501	0.11
502	0.15
503	0.19
504	0.2
505	0.19
506	0.19
507	0.18
508	0.16
509	0.16
510	0.12
511	0.12
512	0.17
513	0.21
514	0.23
515	0.28
516	0.37
517	0.45
518	0.56
519	0.64
520	0.69
521	0.73
522	0.8
523	0.82
524	0.8
525	0.75
526	0.69
527	0.61
528	0.53
529	0.45
530	0.36
531	0.28
532	0.21
533	0.18
534	0.13
535	0.09
536	0.05
537	0.06
538	0.06
539	0.07
540	0.08
541	0.08
542	0.11
543	0.11
544	0.11
545	0.11
546	0.12
547	0.12
548	0.1
549	0.11
550	0.07
551	0.08
552	0.1
553	0.12
554	0.11
555	0.16
556	0.17
557	0.21
558	0.26
559	0.28
560	0.27
561	0.25
562	0.27
563	0.27
564	0.29
565	0.29
566	0.31
567	0.33
568	0.34
569	0.38
570	0.45
571	0.44
572	0.51
573	0.51
574	0.5
575	0.48
576	0.46
577	0.42
578	0.34
579	0.3
580	0.21
581	0.17
582	0.12
583	0.09
584	0.09
585	0.09
586	0.08
587	0.07
588	0.06
589	0.07
590	0.06
591	0.06
592	0.07
593	0.07
594	0.07
595	0.09
596	0.1
597	0.09
598	0.1
599	0.11
600	0.13
601	0.14
602	0.14
603	0.15
604	0.15
605	0.15
606	0.14
607	0.14
608	0.12
609	0.11
610	0.11
611	0.08
612	0.09
613	0.09
614	0.09
615	0.08
616	0.07
617	0.06
618	0.06
619	0.06
620	0.05
621	0.05
622	0.05
623	0.05
624	0.06
625	0.06
626	0.06
627	0.06
628	0.05
629	0.06
630	0.1
631	0.11
632	0.11
633	0.12
634	0.13
635	0.17
636	0.2
637	0.19
638	0.16
639	0.15
640	0.18
641	0.21
642	0.2
643	0.17
644	0.16
645	0.18
646	0.2
647	0.23
648	0.22
649	0.23
650	0.27
651	0.28
652	0.28
653	0.29
654	0.27
655	0.27
656	0.25
657	0.21
658	0.19
659	0.17
660	0.19
661	0.19
662	0.17
663	0.18
664	0.2
665	0.22
666	0.21
667	0.23
668	0.22
669	0.31
670	0.39
671	0.35
672	0.35
673	0.33
674	0.32
675	0.31
676	0.29
677	0.23
678	0.15
679	0.16
680	0.17
681	0.18
682	0.18
683	0.17
684	0.16
685	0.12
686	0.11
687	0.1
688	0.07
689	0.07
690	0.08
691	0.08
692	0.08
693	0.08
694	0.07
695	0.08
696	0.08
697	0.06
698	0.05
699	0.07
700	0.07
701	0.07
702	0.08
703	0.11
704	0.14
705	0.16
706	0.18
707	0.2
708	0.2
709	0.22
710	0.24
711	0.22
712	0.22
713	0.21
714	0.21
715	0.19
716	0.19
717	0.17
718	0.15
719	0.14
720	0.1
721	0.09
722	0.07
723	0.05
724	0.05
725	0.05
726	0.05
727	0.04
728	0.04
729	0.06
730	0.06
731	0.07
732	0.09
733	0.09
734	0.11
735	0.14
736	0.15
737	0.15
738	0.17
739	0.16
740	0.16
741	0.15
742	0.15
743	0.11
744	0.1
745	0.09
746	0.06
747	0.06
748	0.05
749	0.05
750	0.04
751	0.05
752	0.05
753	0.07
754	0.1
755	0.11
756	0.13
757	0.13
758	0.15
759	0.18
760	0.19
761	0.18
762	0.16
763	0.16
764	0.15
765	0.14
766	0.13
767	0.11
768	0.1
769	0.09
770	0.08
771	0.07
772	0.06
773	0.09
774	0.09
775	0.08
776	0.08
777	0.09
778	0.1
779	0.11
780	0.11
781	0.1
782	0.09
783	0.09
784	0.09
785	0.09
786	0.1
787	0.1
788	0.09
789	0.11
790	0.11
791	0.11
792	0.12
793	0.11
794	0.1
795	0.1
796	0.11
797	0.11
798	0.11
799	0.11
800	0.1
801	0.09
802	0.09
803	0.09
804	0.09
805	0.08
806	0.1
807	0.12
808	0.12
809	0.14
810	0.18
811	0.18
812	0.18
813	0.18
814	0.17
815	0.15
816	0.16
817	0.18
818	0.15
819	0.14
820	0.14
821	0.22
822	0.23
823	0.24
824	0.23
825	0.23
826	0.24
827	0.28
828	0.33
829	0.25
830	0.24
831	0.23
832	0.27
833	0.28
834	0.29
835	0.27
836	0.23
837	0.25
838	0.25
839	0.25
840	0.21
841	0.2
842	0.2
843	0.17
844	0.18
845	0.16
846	0.16
847	0.16
848	0.15
849	0.13
850	0.12
851	0.11
852	0.12
853	0.14
854	0.15
855	0.16
856	0.16
857	0.15
858	0.16
859	0.17
860	0.14
861	0.14
862	0.13
863	0.13
864	0.17
865	0.17
866	0.15
867	0.16
868	0.14
869	0.15
870	0.17
871	0.19
872	0.17
873	0.18
874	0.19
875	0.21
876	0.27
877	0.28
878	0.27
879	0.24
880	0.22
881	0.23
882	0.25
883	0.31
884	0.32
885	0.36
886	0.39
887	0.39
888	0.4
889	0.41
890	0.42
891	0.36
892	0.32
893	0.28
894	0.24
895	0.24
896	0.23
897	0.23
898	0.19
899	0.17
900	0.16
901	0.17
902	0.19
903	0.2
904	0.2
905	0.22
906	0.26
907	0.27
908	0.25
909	0.28
910	0.34
911	0.32
912	0.32
913	0.3
914	0.28
915	0.27
916	0.27
917	0.23
918	0.15
919	0.15
920	0.14
921	0.14
922	0.15
923	0.21
924	0.25
925	0.25
926	0.29
927	0.31
928	0.38
929	0.39
930	0.38
931	0.32
932	0.29
933	0.33
934	0.28
935	0.26
936	0.2
937	0.23
938	0.21
939	0.22
940	0.24
941	0.2
942	0.21
943	0.25
944	0.26
945	0.24
946	0.26
947	0.24
948	0.24
949	0.22
950	0.21
951	0.16
952	0.14
953	0.12
954	0.11
955	0.11
956	0.09
957	0.09
958	0.08
959	0.1
960	0.11
961	0.11
962	0.11
963	0.13
964	0.15
965	0.16
966	0.18
967	0.17
968	0.18
969	0.23
970	0.26
971	0.32
972	0.32
973	0.35
974	0.34
975	0.38
976	0.37
977	0.34
978	0.31
979	0.23
980	0.22
981	0.18
982	0.17
983	0.17
984	0.2
985	0.24
986	0.27
987	0.28
988	0.28
989	0.3
990	0.37
991	0.36
992	0.35
993	0.3
994	0.27
995	0.26
996	0.25
997	0.21
998	0.14
999	0.11
1000	0.08
1001	0.07
1002	0.05
1003	0.04
1004	0.04
1005	0.04
1006	0.04
1007	0.07
1008	0.11
1009	0.15
1010	0.2
1011	0.23
1012	0.24
1013	0.26
1014	0.32
1015	0.38
1016	0.41
1017	0.47
1018	0.45
1019	0.44
1020	0.45
1021	0.44
1022	0.38
1023	0.34
1024	0.32
1025	0.28
1026	0.32
1027	0.34
1028	0.35
1029	0.41
1030	0.44
1031	0.45
1032	0.42
1033	0.38
1034	0.33
1035	0.31
1036	0.29
1037	0.22
1038	0.19
1039	0.15
1040	0.14
1041	0.12
1042	0.12
1043	0.12
1044	0.11
1045	0.13
1046	0.15
1047	0.16
1048	0.23
1049	0.25
1050	0.27
1051	0.33
1052	0.37
1053	0.39
1054	0.44
1055	0.51
1056	0.53
1057	0.59
1058	0.62
1059	0.57
1060	0.53
1061	0.51
1062	0.43
1063	0.36
1064	0.32
1065	0.25

A0A1Y2WL65

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer