FuNGI

A0A1Y2WXG7

Protein Details

Accession

A0A1Y2WXG7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
471-496	SSSADNKPKPKPVLAKKRKEPPSIFM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
477-505	KPKPKPVLAKKRKEPPSIFMKPNPKARRM

Subcellular Location(s)

mito 15, nucl 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010684 RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A
Gene Ontology	GO:0070449 C:elongin complex GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF06881 Elongin_A

Amino Acid Sequences

MVQSLVDLCTTVCIRNVRGKFSLIHFPNHCLSHLIIFPPHQKSYYTKFFFPFSILHPAPSSQFLLHAVLDPPTNFVINSNKMAPNLDILDVGTMSYKVLRPILMRIDNAAQLREVEERSPHIQGDDAECWQRLINRHFPNQVKKHNFQPRNPTLWYKVYEKYKKIDVEEKRIALEKLTSSLKTIKKEKQEKTSSIINYDAKILGPAPGRRKGVGGREVNGPGGLRWGGGSRTKTTSAQSIMQKARREAAEISRRNKLMTPTGQLPVRQGQISQAPLGMREEHRIKSLPAIPAPRRIQAPQSRTGERWEREQKEREARLLKMKNGTTTEKVTIISDDEFDEDDQFNNDDDEAQEGGGLNVDELEDLFDDDTPSTSSAPKTTKVPPQNKPSTTQSASSPNPTRTSGLSGLAKMKQGLSWKNKPTRVETSTQKPVSKPTASSPPPSKPTAASPPPQNSMPSKAPSSYSTAGAGSSSADNKPKPKPVLAKKRKEPPSIFMKPNPKARRMS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.33
3	0.37
4	0.39
5	0.4
6	0.42
7	0.41
8	0.42
9	0.49
10	0.42
11	0.47
12	0.43
13	0.46
14	0.48
15	0.46
16	0.42
17	0.34
18	0.32
19	0.28
20	0.28
21	0.26
22	0.23
23	0.26
24	0.33
25	0.36
26	0.37
27	0.34
28	0.34
29	0.38
30	0.44
31	0.5
32	0.47
33	0.46
34	0.46
35	0.47
36	0.46
37	0.42
38	0.36
39	0.3
40	0.35
41	0.31
42	0.3
43	0.29
44	0.29
45	0.28
46	0.29
47	0.27
48	0.17
49	0.18
50	0.18
51	0.19
52	0.18
53	0.18
54	0.16
55	0.15
56	0.17
57	0.15
58	0.16
59	0.15
60	0.15
61	0.12
62	0.14
63	0.2
64	0.22
65	0.25
66	0.28
67	0.29
68	0.29
69	0.31
70	0.28
71	0.25
72	0.23
73	0.2
74	0.15
75	0.13
76	0.13
77	0.11
78	0.11
79	0.08
80	0.07
81	0.06
82	0.08
83	0.09
84	0.11
85	0.12
86	0.14
87	0.15
88	0.2
89	0.28
90	0.29
91	0.28
92	0.29
93	0.3
94	0.32
95	0.31
96	0.27
97	0.19
98	0.16
99	0.18
100	0.18
101	0.16
102	0.14
103	0.15
104	0.18
105	0.21
106	0.22
107	0.21
108	0.18
109	0.19
110	0.19
111	0.23
112	0.2
113	0.2
114	0.2
115	0.2
116	0.2
117	0.19
118	0.22
119	0.23
120	0.27
121	0.34
122	0.38
123	0.44
124	0.51
125	0.57
126	0.63
127	0.65
128	0.7
129	0.68
130	0.65
131	0.7
132	0.73
133	0.74
134	0.7
135	0.72
136	0.69
137	0.67
138	0.67
139	0.61
140	0.55
141	0.53
142	0.5
143	0.44
144	0.43
145	0.47
146	0.51
147	0.5
148	0.49
149	0.51
150	0.5
151	0.5
152	0.52
153	0.48
154	0.5
155	0.52
156	0.49
157	0.44
158	0.43
159	0.39
160	0.31
161	0.27
162	0.18
163	0.16
164	0.18
165	0.17
166	0.16
167	0.24
168	0.27
169	0.31
170	0.38
171	0.4
172	0.48
173	0.58
174	0.62
175	0.65
176	0.68
177	0.64
178	0.62
179	0.63
180	0.54
181	0.46
182	0.44
183	0.35
184	0.28
185	0.27
186	0.23
187	0.15
188	0.14
189	0.12
190	0.11
191	0.14
192	0.18
193	0.22
194	0.27
195	0.28
196	0.28
197	0.3
198	0.31
199	0.34
200	0.38
201	0.35
202	0.31
203	0.34
204	0.34
205	0.32
206	0.29
207	0.22
208	0.13
209	0.12
210	0.1
211	0.06
212	0.06
213	0.07
214	0.08
215	0.12
216	0.14
217	0.15
218	0.18
219	0.2
220	0.21
221	0.21
222	0.23
223	0.21
224	0.25
225	0.25
226	0.29
227	0.32
228	0.36
229	0.37
230	0.34
231	0.35
232	0.29
233	0.29
234	0.24
235	0.28
236	0.33
237	0.36
238	0.38
239	0.4
240	0.4
241	0.38
242	0.38
243	0.32
244	0.29
245	0.26
246	0.27
247	0.25
248	0.28
249	0.29
250	0.27
251	0.27
252	0.23
253	0.22
254	0.18
255	0.15
256	0.14
257	0.16
258	0.17
259	0.15
260	0.13
261	0.12
262	0.12
263	0.13
264	0.13
265	0.11
266	0.15
267	0.18
268	0.17
269	0.2
270	0.2
271	0.19
272	0.22
273	0.26
274	0.24
275	0.24
276	0.3
277	0.3
278	0.38
279	0.39
280	0.37
281	0.34
282	0.33
283	0.38
284	0.39
285	0.42
286	0.41
287	0.44
288	0.44
289	0.43
290	0.47
291	0.47
292	0.41
293	0.45
294	0.47
295	0.47
296	0.52
297	0.57
298	0.59
299	0.6
300	0.61
301	0.58
302	0.53
303	0.5
304	0.53
305	0.51
306	0.48
307	0.45
308	0.44
309	0.41
310	0.41
311	0.42
312	0.35
313	0.34
314	0.32
315	0.27
316	0.26
317	0.23
318	0.19
319	0.17
320	0.14
321	0.11
322	0.1
323	0.1
324	0.1
325	0.1
326	0.11
327	0.1
328	0.1
329	0.1
330	0.1
331	0.1
332	0.09
333	0.09
334	0.07
335	0.07
336	0.09
337	0.08
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.05
350	0.04
351	0.04
352	0.05
353	0.05
354	0.06
355	0.06
356	0.07
357	0.07
358	0.08
359	0.09
360	0.1
361	0.11
362	0.16
363	0.18
364	0.2
365	0.23
366	0.29
367	0.37
368	0.45
369	0.54
370	0.57
371	0.65
372	0.72
373	0.7
374	0.7
375	0.67
376	0.66
377	0.59
378	0.53
379	0.46
380	0.45
381	0.45
382	0.47
383	0.46
384	0.41
385	0.42
386	0.42
387	0.39
388	0.33
389	0.37
390	0.3
391	0.3
392	0.28
393	0.28
394	0.3
395	0.3
396	0.3
397	0.25
398	0.24
399	0.21
400	0.26
401	0.32
402	0.37
403	0.44
404	0.52
405	0.6
406	0.65
407	0.67
408	0.67
409	0.67
410	0.63
411	0.61
412	0.59
413	0.59
414	0.64
415	0.66
416	0.62
417	0.54
418	0.56
419	0.57
420	0.53
421	0.46
422	0.42
423	0.48
424	0.47
425	0.54
426	0.54
427	0.55
428	0.56
429	0.56
430	0.52
431	0.44
432	0.48
433	0.5
434	0.5
435	0.48
436	0.52
437	0.55
438	0.57
439	0.57
440	0.54
441	0.47
442	0.48
443	0.47
444	0.43
445	0.4
446	0.38
447	0.39
448	0.38
449	0.41
450	0.36
451	0.32
452	0.29
453	0.26
454	0.24
455	0.21
456	0.19
457	0.13
458	0.14
459	0.15
460	0.17
461	0.22
462	0.26
463	0.32
464	0.39
465	0.47
466	0.49
467	0.55
468	0.62
469	0.68
470	0.75
471	0.8
472	0.84
473	0.84
474	0.9
475	0.9
476	0.9
477	0.84
478	0.8
479	0.79
480	0.78
481	0.75
482	0.74
483	0.75
484	0.72
485	0.78
486	0.78

A0A1Y2WXG7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer