Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2WPB3

Protein Details
Accession A0A1Y2WPB3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
310-335TGDGDERSKLKRRKQVRADRPSSANLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
319-323LKRRK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 15, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MATMLFNPQTPQSPSQFSPTTGDQVSSMNSSMTSITTALPTPAHSVNGSAQPADMSHDATMSDAYSTKRKYPFDDTGDHEQKKVNLENRRVGIENLHLDVGEKYLLCSTPYPPSYPSLSSDFFEMFGLTGIAAEVARTKPNGEKNALRKTYKGQIKTLGLSGHFDAVKKDIDAPDGLLALVGLDEDTWVSREVSGKEIEKGLSQTHLAHLPRATTMAKGPIPKAAWDSSVLGDLAPGVLTKKGGHDPATRQTAPSTPAASAPGITPKLNKPLTPQIDRARRIGKKRSYQDSSFEGYGEGYGDDDTGGYSTGDGDERSKLKRRKQVRADRPSSANLFADR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.43
3 0.43
4 0.39
5 0.39
6 0.38
7 0.38
8 0.32
9 0.31
10 0.25
11 0.24
12 0.24
13 0.21
14 0.18
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.12
19 0.11
20 0.11
21 0.09
22 0.1
23 0.11
24 0.11
25 0.12
26 0.12
27 0.13
28 0.16
29 0.16
30 0.17
31 0.16
32 0.18
33 0.2
34 0.25
35 0.24
36 0.2
37 0.19
38 0.17
39 0.17
40 0.19
41 0.16
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.11
52 0.17
53 0.2
54 0.26
55 0.33
56 0.35
57 0.39
58 0.46
59 0.52
60 0.5
61 0.53
62 0.53
63 0.56
64 0.63
65 0.58
66 0.51
67 0.45
68 0.42
69 0.42
70 0.42
71 0.39
72 0.39
73 0.44
74 0.5
75 0.5
76 0.5
77 0.46
78 0.4
79 0.35
80 0.31
81 0.28
82 0.22
83 0.2
84 0.17
85 0.16
86 0.16
87 0.14
88 0.1
89 0.08
90 0.07
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.12
96 0.18
97 0.2
98 0.21
99 0.21
100 0.23
101 0.25
102 0.25
103 0.26
104 0.24
105 0.24
106 0.22
107 0.22
108 0.2
109 0.17
110 0.16
111 0.13
112 0.08
113 0.07
114 0.06
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.03
120 0.03
121 0.05
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.13
127 0.19
128 0.24
129 0.26
130 0.31
131 0.38
132 0.48
133 0.52
134 0.48
135 0.43
136 0.44
137 0.49
138 0.48
139 0.43
140 0.36
141 0.36
142 0.37
143 0.37
144 0.35
145 0.27
146 0.21
147 0.2
148 0.18
149 0.14
150 0.13
151 0.12
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.11
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.06
165 0.05
166 0.04
167 0.03
168 0.03
169 0.02
170 0.02
171 0.02
172 0.02
173 0.02
174 0.03
175 0.04
176 0.05
177 0.06
178 0.09
179 0.1
180 0.12
181 0.14
182 0.14
183 0.15
184 0.16
185 0.16
186 0.14
187 0.14
188 0.12
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.16
194 0.16
195 0.16
196 0.16
197 0.16
198 0.15
199 0.17
200 0.16
201 0.11
202 0.12
203 0.16
204 0.17
205 0.19
206 0.19
207 0.22
208 0.22
209 0.22
210 0.24
211 0.2
212 0.19
213 0.18
214 0.19
215 0.15
216 0.16
217 0.14
218 0.11
219 0.09
220 0.08
221 0.06
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.1
229 0.13
230 0.16
231 0.2
232 0.25
233 0.3
234 0.37
235 0.44
236 0.41
237 0.38
238 0.37
239 0.36
240 0.33
241 0.31
242 0.25
243 0.17
244 0.18
245 0.19
246 0.18
247 0.16
248 0.14
249 0.17
250 0.17
251 0.18
252 0.2
253 0.22
254 0.31
255 0.32
256 0.32
257 0.33
258 0.41
259 0.48
260 0.5
261 0.53
262 0.54
263 0.62
264 0.63
265 0.63
266 0.62
267 0.62
268 0.65
269 0.68
270 0.68
271 0.69
272 0.75
273 0.79
274 0.77
275 0.73
276 0.7
277 0.65
278 0.61
279 0.51
280 0.43
281 0.33
282 0.26
283 0.22
284 0.18
285 0.12
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.07
298 0.08
299 0.09
300 0.11
301 0.16
302 0.19
303 0.25
304 0.35
305 0.42
306 0.5
307 0.59
308 0.68
309 0.73
310 0.81
311 0.86
312 0.88
313 0.91
314 0.88
315 0.86
316 0.8
317 0.76
318 0.68
319 0.61