Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2XBH6

Protein Details
Accession A0A1Y2XBH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
389-409GYSMHGKKQVKKGQWKSGTDQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
305-310RRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPKGKWIDKKTAQHFTLVHRPQNDPLIHDADAPSMVLNPTPLPNASKVRKLNDLASELGSDAEHIRANEGEAANYGVFFDDTEYDYMQHLRDLNSGSGGEVVFIEADNGPSNKNKGKGKQKQSLEDALKKLDVADEERKRAELFDEDFLPSKNLRHITYQAQQDIPDAIGGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDDDEDVFAELAKDGRELDDIEFDEDFDEDDGWESDDTAKPAKEYKDRSEVPNLVPVVNEQDGEAVKNEEWLEDFKKFKKDQGKPGAKVSFAAAPSQSDMQSSLMTTTTNGGRRKKRKGALTSQSGYSMTSSSLFRTEQLGILDARFEKIEEQYNEDEFDDDDEDGGASMSQISTASSVTGSVRGDFDNILDDFLGGYSMHGKKQVKKGQWKSGTDQLDEIRRELGPAKIRGKYGKPQTSRLASASASR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.62
3 0.63
4 0.6
5 0.57
6 0.51
7 0.53
8 0.51
9 0.57
10 0.51
11 0.43
12 0.41
13 0.39
14 0.36
15 0.34
16 0.31
17 0.23
18 0.22
19 0.19
20 0.14
21 0.11
22 0.11
23 0.09
24 0.1
25 0.1
26 0.12
27 0.14
28 0.15
29 0.17
30 0.22
31 0.31
32 0.35
33 0.42
34 0.46
35 0.49
36 0.55
37 0.55
38 0.55
39 0.52
40 0.5
41 0.43
42 0.38
43 0.34
44 0.27
45 0.24
46 0.18
47 0.13
48 0.11
49 0.1
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.13
55 0.17
56 0.17
57 0.15
58 0.14
59 0.16
60 0.14
61 0.14
62 0.12
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.07
68 0.09
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.13
73 0.14
74 0.13
75 0.14
76 0.14
77 0.14
78 0.17
79 0.19
80 0.18
81 0.18
82 0.18
83 0.16
84 0.15
85 0.13
86 0.11
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.05
93 0.06
94 0.08
95 0.09
96 0.1
97 0.13
98 0.17
99 0.2
100 0.27
101 0.32
102 0.39
103 0.5
104 0.59
105 0.67
106 0.71
107 0.74
108 0.75
109 0.73
110 0.74
111 0.69
112 0.65
113 0.58
114 0.5
115 0.44
116 0.36
117 0.31
118 0.24
119 0.18
120 0.17
121 0.25
122 0.27
123 0.3
124 0.31
125 0.31
126 0.3
127 0.29
128 0.25
129 0.2
130 0.19
131 0.18
132 0.19
133 0.2
134 0.2
135 0.2
136 0.2
137 0.16
138 0.15
139 0.17
140 0.19
141 0.19
142 0.22
143 0.25
144 0.3
145 0.35
146 0.39
147 0.36
148 0.34
149 0.32
150 0.29
151 0.27
152 0.2
153 0.14
154 0.09
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.13
167 0.13
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.03
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.05
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.13
221 0.17
222 0.22
223 0.26
224 0.3
225 0.38
226 0.4
227 0.42
228 0.45
229 0.44
230 0.39
231 0.39
232 0.35
233 0.26
234 0.24
235 0.21
236 0.18
237 0.15
238 0.14
239 0.09
240 0.1
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.08
245 0.07
246 0.1
247 0.1
248 0.08
249 0.09
250 0.11
251 0.13
252 0.15
253 0.18
254 0.2
255 0.28
256 0.28
257 0.34
258 0.42
259 0.47
260 0.54
261 0.62
262 0.68
263 0.63
264 0.7
265 0.66
266 0.56
267 0.49
268 0.4
269 0.33
270 0.24
271 0.23
272 0.15
273 0.13
274 0.15
275 0.15
276 0.14
277 0.1
278 0.11
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.13
288 0.19
289 0.25
290 0.32
291 0.42
292 0.51
293 0.6
294 0.67
295 0.7
296 0.73
297 0.76
298 0.79
299 0.78
300 0.78
301 0.71
302 0.62
303 0.57
304 0.48
305 0.39
306 0.29
307 0.2
308 0.12
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.13
313 0.12
314 0.13
315 0.15
316 0.15
317 0.16
318 0.16
319 0.16
320 0.14
321 0.14
322 0.16
323 0.13
324 0.13
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.13
329 0.21
330 0.2
331 0.25
332 0.27
333 0.28
334 0.29
335 0.27
336 0.25
337 0.17
338 0.18
339 0.14
340 0.11
341 0.1
342 0.09
343 0.08
344 0.08
345 0.07
346 0.06
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.05
353 0.05
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.07
358 0.08
359 0.11
360 0.11
361 0.11
362 0.13
363 0.13
364 0.14
365 0.13
366 0.13
367 0.14
368 0.14
369 0.13
370 0.12
371 0.11
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.06
376 0.06
377 0.13
378 0.15
379 0.16
380 0.24
381 0.29
382 0.36
383 0.46
384 0.55
385 0.58
386 0.67
387 0.75
388 0.79
389 0.83
390 0.81
391 0.77
392 0.77
393 0.72
394 0.62
395 0.57
396 0.51
397 0.5
398 0.46
399 0.41
400 0.34
401 0.29
402 0.29
403 0.28
404 0.3
405 0.3
406 0.36
407 0.42
408 0.44
409 0.49
410 0.54
411 0.58
412 0.6
413 0.63
414 0.65
415 0.64
416 0.67
417 0.71
418 0.71
419 0.69
420 0.61
421 0.54