FuNGI

A0A1Y2X938

Protein Details

Accession

A0A1Y2X938

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-39	AAAVKKGSRGRDPKNQRSDNS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
218-221	KRKK

Subcellular Location(s)

plas 18, cyto 4.5, cyto_nucl 4, nucl 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDADFDAVRKLQAERNAAAAVKKGSRGRDPKNQRSDNSTKAKLTESFDTELYDRDGDDKYAGYLTSIPAADGEDEEMEDADNSRRLVGQYTATRAQIDEFAHGNGVEEDDPFAGRGENSTRIIDRETDYQKRRFDRVLTPTRADAFNRQGGAAEEGDTYRDIMERRELEREEERVKRAIQAKREGKETDGNHEATLKDGDKENTDAGSTEAATTGRKRKKRWDVASTAVDEPSSESTEGKTKRSRWDQAPSLPTPGAPDGAKKRSRWDQAPSATPVGASGLATPMHTSSLGVGAVKADISGPGGVLGDEELNALLPGEEQGYKILDPPSGYPTGHAPLHRVAATPLPPNYGGFMMQDPESTRLGGSQMPKEIPGVGELQFFKQEDMAYFGKLADGSDENSLSVEELKERKIMRLLLKIKNGTPPMRKTALRQLTDNARQFGAGALFNQILPLLMEKTLEDQERHLLVKVIDRILWKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLSKAAGLATMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCRSKKSWQARHTGVKIVQQIPILMGCAVLPHLKGLVDCIGPNLNDEQTKVRTVTSLAIAALAEASNPYGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGYIIPLMDEEYANYYTSQVMDILLREFSSPDEEMKKVVLKVVSQCAGTEGVTAGYLKEHVLDEFFKSFWVRRMALDKRNYRQVVETTVDIGQKVGVSEILERIVGNLKDESEAYRKMTVETVEKVVASLGAADIGERLEERLIDGILHSFQEQSVEDVIMLNGFGTVVNALGTRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSATIRQQAADLISRIAIVMKQCGEDALMGKLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILSALRSIVTVVGISQMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHIALGVVGLGCEDAMVHLLNLLWPNLFETSPHVIDRIVEAIEAIRMAVGPGLVLNYVWAGLFHPARKVRQPYWRLYNDAYVQAADAMVPYYPNLSEDGIDRPELAIVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.32
3	0.34
4	0.36
5	0.35
6	0.34
7	0.33
8	0.3
9	0.28
10	0.33
11	0.35
12	0.38
13	0.47
14	0.55
15	0.59
16	0.65
17	0.73
18	0.77
19	0.83
20	0.85
21	0.79
22	0.79
23	0.78
24	0.77
25	0.76
26	0.71
27	0.63
28	0.58
29	0.58
30	0.54
31	0.51
32	0.48
33	0.43
34	0.4
35	0.38
36	0.38
37	0.34
38	0.31
39	0.29
40	0.22
41	0.18
42	0.18
43	0.18
44	0.16
45	0.17
46	0.15
47	0.14
48	0.15
49	0.14
50	0.13
51	0.13
52	0.13
53	0.16
54	0.15
55	0.14
56	0.13
57	0.14
58	0.13
59	0.12
60	0.13
61	0.09
62	0.09
63	0.1
64	0.09
65	0.09
66	0.08
67	0.09
68	0.1
69	0.13
70	0.13
71	0.13
72	0.15
73	0.16
74	0.19
75	0.2
76	0.25
77	0.27
78	0.33
79	0.36
80	0.35
81	0.35
82	0.32
83	0.31
84	0.28
85	0.25
86	0.21
87	0.19
88	0.18
89	0.19
90	0.18
91	0.18
92	0.13
93	0.14
94	0.11
95	0.1
96	0.11
97	0.1
98	0.11
99	0.1
100	0.1
101	0.09
102	0.09
103	0.12
104	0.14
105	0.19
106	0.21
107	0.24
108	0.25
109	0.26
110	0.28
111	0.28
112	0.27
113	0.31
114	0.36
115	0.43
116	0.49
117	0.54
118	0.59
119	0.62
120	0.64
121	0.6
122	0.58
123	0.58
124	0.62
125	0.65
126	0.64
127	0.61
128	0.59
129	0.57
130	0.54
131	0.47
132	0.44
133	0.4
134	0.39
135	0.36
136	0.33
137	0.31
138	0.3
139	0.3
140	0.23
141	0.18
142	0.14
143	0.13
144	0.14
145	0.14
146	0.12
147	0.1
148	0.11
149	0.11
150	0.12
151	0.2
152	0.23
153	0.26
154	0.32
155	0.33
156	0.36
157	0.4
158	0.44
159	0.44
160	0.45
161	0.45
162	0.43
163	0.43
164	0.44
165	0.47
166	0.48
167	0.49
168	0.54
169	0.59
170	0.58
171	0.63
172	0.57
173	0.52
174	0.54
175	0.48
176	0.45
177	0.42
178	0.39
179	0.34
180	0.35
181	0.31
182	0.25
183	0.27
184	0.21
185	0.17
186	0.2
187	0.21
188	0.22
189	0.24
190	0.23
191	0.2
192	0.19
193	0.17
194	0.15
195	0.14
196	0.12
197	0.1
198	0.09
199	0.09
200	0.11
201	0.16
202	0.25
203	0.33
204	0.4
205	0.45
206	0.55
207	0.66
208	0.75
209	0.79
210	0.79
211	0.77
212	0.78
213	0.78
214	0.71
215	0.61
216	0.5
217	0.4
218	0.3
219	0.25
220	0.2
221	0.17
222	0.13
223	0.12
224	0.14
225	0.22
226	0.24
227	0.28
228	0.33
229	0.36
230	0.46
231	0.55
232	0.61
233	0.61
234	0.68
235	0.69
236	0.7
237	0.72
238	0.64
239	0.59
240	0.51
241	0.43
242	0.37
243	0.3
244	0.24
245	0.18
246	0.23
247	0.26
248	0.35
249	0.4
250	0.38
251	0.44
252	0.51
253	0.59
254	0.58
255	0.58
256	0.59
257	0.59
258	0.64
259	0.6
260	0.53
261	0.45
262	0.39
263	0.31
264	0.23
265	0.17
266	0.12
267	0.08
268	0.08
269	0.08
270	0.08
271	0.09
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.07
277	0.08
278	0.09
279	0.08
280	0.08
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.06
285	0.05
286	0.04
287	0.06
288	0.06
289	0.05
290	0.05
291	0.06
292	0.05
293	0.05
294	0.06
295	0.04
296	0.04
297	0.05
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.07
309	0.09
310	0.09
311	0.12
312	0.13
313	0.12
314	0.13
315	0.15
316	0.18
317	0.19
318	0.19
319	0.17
320	0.18
321	0.21
322	0.23
323	0.21
324	0.2
325	0.2
326	0.23
327	0.23
328	0.2
329	0.17
330	0.19
331	0.22
332	0.23
333	0.22
334	0.21
335	0.21
336	0.21
337	0.21
338	0.17
339	0.15
340	0.12
341	0.12
342	0.11
343	0.1
344	0.11
345	0.11
346	0.14
347	0.14
348	0.13
349	0.12
350	0.11
351	0.12
352	0.14
353	0.16
354	0.17
355	0.19
356	0.19
357	0.2
358	0.2
359	0.19
360	0.16
361	0.14
362	0.13
363	0.1
364	0.14
365	0.14
366	0.14
367	0.16
368	0.16
369	0.15
370	0.14
371	0.14
372	0.11
373	0.15
374	0.15
375	0.13
376	0.13
377	0.13
378	0.12
379	0.12
380	0.11
381	0.08
382	0.08
383	0.09
384	0.1
385	0.1
386	0.1
387	0.1
388	0.1
389	0.08
390	0.08
391	0.07
392	0.09
393	0.11
394	0.12
395	0.16
396	0.17
397	0.19
398	0.21
399	0.26
400	0.27
401	0.35
402	0.41
403	0.43
404	0.49
405	0.49
406	0.47
407	0.48
408	0.48
409	0.45
410	0.45
411	0.42
412	0.42
413	0.45
414	0.44
415	0.42
416	0.48
417	0.5
418	0.45
419	0.43
420	0.41
421	0.45
422	0.52
423	0.51
424	0.42
425	0.33
426	0.31
427	0.29
428	0.26
429	0.19
430	0.12
431	0.09
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.09
436	0.08
437	0.06
438	0.06
439	0.06
440	0.05
441	0.05
442	0.06
443	0.06
444	0.09
445	0.12
446	0.13
447	0.13
448	0.13
449	0.16
450	0.17
451	0.18
452	0.16
453	0.15
454	0.14
455	0.18
456	0.2
457	0.17
458	0.17
459	0.18
460	0.18
461	0.18
462	0.17
463	0.13
464	0.13
465	0.16
466	0.17
467	0.19
468	0.21
469	0.2
470	0.21
471	0.23
472	0.23
473	0.2
474	0.16
475	0.14
476	0.13
477	0.14
478	0.13
479	0.12
480	0.09
481	0.09
482	0.09
483	0.09
484	0.06
485	0.04
486	0.03
487	0.04
488	0.05
489	0.05
490	0.06
491	0.06
492	0.06
493	0.07
494	0.09
495	0.1
496	0.12
497	0.12
498	0.14
499	0.14
500	0.14
501	0.14
502	0.12
503	0.1
504	0.07
505	0.07
506	0.05
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.05
511	0.05
512	0.05
513	0.05
514	0.05
515	0.05
516	0.05
517	0.06
518	0.07
519	0.09
520	0.1
521	0.11
522	0.13
523	0.14
524	0.15
525	0.15
526	0.14
527	0.11
528	0.11
529	0.11
530	0.11
531	0.1
532	0.1
533	0.09
534	0.08
535	0.09
536	0.08
537	0.07
538	0.06
539	0.05
540	0.04
541	0.04
542	0.03
543	0.03
544	0.03
545	0.03
546	0.02
547	0.03
548	0.03
549	0.04
550	0.06
551	0.08
552	0.11
553	0.16
554	0.2
555	0.23
556	0.28
557	0.37
558	0.45
559	0.52
560	0.55
561	0.58
562	0.6
563	0.65
564	0.62
565	0.57
566	0.5
567	0.45
568	0.44
569	0.37
570	0.33
571	0.26
572	0.24
573	0.19
574	0.17
575	0.13
576	0.08
577	0.06
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.05
582	0.05
583	0.04
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.06
588	0.07
589	0.07
590	0.07
591	0.08
592	0.09
593	0.08
594	0.09
595	0.09
596	0.08
597	0.08
598	0.1
599	0.12
600	0.12
601	0.13
602	0.13
603	0.12
604	0.11
605	0.12
606	0.13
607	0.11
608	0.1
609	0.08
610	0.08
611	0.08
612	0.07
613	0.06
614	0.04
615	0.03
616	0.03
617	0.03
618	0.03
619	0.03
620	0.03
621	0.03
622	0.04
623	0.05
624	0.05
625	0.06
626	0.06
627	0.06
628	0.07
629	0.07
630	0.07
631	0.06
632	0.05
633	0.05
634	0.06
635	0.08
636	0.13
637	0.22
638	0.24
639	0.25
640	0.31
641	0.34
642	0.36
643	0.36
644	0.37
645	0.32
646	0.3
647	0.3
648	0.24
649	0.2
650	0.18
651	0.15
652	0.08
653	0.05
654	0.04
655	0.03
656	0.04
657	0.03
658	0.04
659	0.05
660	0.05
661	0.04
662	0.07
663	0.08
664	0.08
665	0.08
666	0.08
667	0.08
668	0.08
669	0.08
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.06
674	0.06
675	0.06
676	0.06
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.09
681	0.09
682	0.1
683	0.12
684	0.13
685	0.13
686	0.14
687	0.16
688	0.13
689	0.15
690	0.14
691	0.13
692	0.16
693	0.19
694	0.19
695	0.17
696	0.17
697	0.16
698	0.15
699	0.14
700	0.11
701	0.07
702	0.06
703	0.06
704	0.06
705	0.05
706	0.04
707	0.05
708	0.04
709	0.05
710	0.06
711	0.05
712	0.07
713	0.08
714	0.1
715	0.1
716	0.1
717	0.1
718	0.11
719	0.12
720	0.16
721	0.2
722	0.18
723	0.2
724	0.28
725	0.34
726	0.4
727	0.48
728	0.5
729	0.5
730	0.58
731	0.57
732	0.5
733	0.46
734	0.4
735	0.36
736	0.31
737	0.27
738	0.2
739	0.21
740	0.2
741	0.16
742	0.15
743	0.1
744	0.09
745	0.08
746	0.07
747	0.05
748	0.05
749	0.06
750	0.07
751	0.07
752	0.07
753	0.07
754	0.07
755	0.12
756	0.11
757	0.12
758	0.12
759	0.12
760	0.12
761	0.13
762	0.15
763	0.14
764	0.16
765	0.16
766	0.18
767	0.18
768	0.18
769	0.2
770	0.19
771	0.19
772	0.19
773	0.19
774	0.17
775	0.17
776	0.16
777	0.14
778	0.12
779	0.08
780	0.06
781	0.04
782	0.04
783	0.03
784	0.03
785	0.04
786	0.04
787	0.04
788	0.04
789	0.04
790	0.04
791	0.04
792	0.05
793	0.06
794	0.06
795	0.06
796	0.06
797	0.06
798	0.07
799	0.07
800	0.07
801	0.06
802	0.06
803	0.08
804	0.08
805	0.09
806	0.09
807	0.08
808	0.08
809	0.08
810	0.08
811	0.07
812	0.06
813	0.04
814	0.03
815	0.03
816	0.03
817	0.03
818	0.03
819	0.03
820	0.04
821	0.04
822	0.04
823	0.08
824	0.09
825	0.12
826	0.12
827	0.13
828	0.14
829	0.2
830	0.3
831	0.29
832	0.31
833	0.3
834	0.33
835	0.33
836	0.32
837	0.29
838	0.22
839	0.22
840	0.21
841	0.22
842	0.25
843	0.26
844	0.27
845	0.3
846	0.32
847	0.37
848	0.41
849	0.39
850	0.33
851	0.33
852	0.32
853	0.29
854	0.26
855	0.19
856	0.15
857	0.12
858	0.12
859	0.1
860	0.1
861	0.09
862	0.08
863	0.1
864	0.1
865	0.1
866	0.1
867	0.11
868	0.11
869	0.1
870	0.11
871	0.09
872	0.09
873	0.08
874	0.08
875	0.09
876	0.08
877	0.07
878	0.06
879	0.05
880	0.04
881	0.05
882	0.06
883	0.06
884	0.06
885	0.06
886	0.06
887	0.06
888	0.06
889	0.05
890	0.05
891	0.04
892	0.04
893	0.04
894	0.05
895	0.05
896	0.05
897	0.05
898	0.05
899	0.05
900	0.05
901	0.05
902	0.05
903	0.04
904	0.04
905	0.05
906	0.06
907	0.06
908	0.07
909	0.09
910	0.12
911	0.13
912	0.13
913	0.15
914	0.16
915	0.18
916	0.2
917	0.2
918	0.23
919	0.25
920	0.26
921	0.28
922	0.29
923	0.33
924	0.37
925	0.46
926	0.45
927	0.51
928	0.53
929	0.59
930	0.62
931	0.64
932	0.61
933	0.61
934	0.57
935	0.53
936	0.5
937	0.42
938	0.35
939	0.28
940	0.23
941	0.14
942	0.11
943	0.08
944	0.08
945	0.08
946	0.09
947	0.1
948	0.11
949	0.14
950	0.17
951	0.2
952	0.22
953	0.23
954	0.23
955	0.26
956	0.25
957	0.24
958	0.24
959	0.22
960	0.21
961	0.19
962	0.18
963	0.19
964	0.19
965	0.19
966	0.15
967	0.18
968	0.22
969	0.22
970	0.24
971	0.22
972	0.27
973	0.33
974	0.43
975	0.49
976	0.5
977	0.59
978	0.65
979	0.72
980	0.67
981	0.6
982	0.51
983	0.41
984	0.36
985	0.28
986	0.2
987	0.11
988	0.13
989	0.13
990	0.12
991	0.11
992	0.11
993	0.11
994	0.1
995	0.1
996	0.07
997	0.07
998	0.08
999	0.1
1000	0.12
1001	0.12
1002	0.13
1003	0.14
1004	0.16
1005	0.19
1006	0.26
1007	0.31
1008	0.35
1009	0.38
1010	0.42
1011	0.42
1012	0.41
1013	0.38
1014	0.29
1015	0.25
1016	0.19
1017	0.15
1018	0.11
1019	0.09
1020	0.08
1021	0.07
1022	0.06
1023	0.04
1024	0.04
1025	0.04
1026	0.05
1027	0.05
1028	0.06
1029	0.09
1030	0.1
1031	0.1
1032	0.11
1033	0.16
1034	0.16
1035	0.18
1036	0.18
1037	0.17
1038	0.18
1039	0.18
1040	0.19
1041	0.2
1042	0.23
1043	0.25
1044	0.26
1045	0.25
1046	0.28
1047	0.27
1048	0.26
1049	0.2
1050	0.17
1051	0.14
1052	0.14
1053	0.15
1054	0.11
1055	0.11
1056	0.11
1057	0.11
1058	0.13
1059	0.12
1060	0.13
1061	0.11
1062	0.11
1063	0.11
1064	0.1
1065	0.1
1066	0.09
1067	0.08
1068	0.07
1069	0.08
1070	0.08
1071	0.08
1072	0.08
1073	0.08
1074	0.08
1075	0.07
1076	0.06
1077	0.07
1078	0.1
1079	0.1
1080	0.1
1081	0.11
1082	0.14
1083	0.19
1084	0.21
1085	0.23
1086	0.2
1087	0.2
1088	0.22
1089	0.27
1090	0.3
1091	0.27
1092	0.27
1093	0.26
1094	0.26
1095	0.25
1096	0.23
1097	0.18
1098	0.11
1099	0.1
1100	0.08
1101	0.06
1102	0.05
1103	0.05
1104	0.05
1105	0.04
1106	0.04
1107	0.04
1108	0.03
1109	0.04
1110	0.05
1111	0.05
1112	0.06
1113	0.06
1114	0.08
1115	0.1
1116	0.1
1117	0.09
1118	0.09
1119	0.11
1120	0.13
1121	0.13
1122	0.11
1123	0.16
1124	0.21
1125	0.24
1126	0.24
1127	0.23
1128	0.21
1129	0.22
1130	0.23
1131	0.2
1132	0.14
1133	0.11
1134	0.11
1135	0.11
1136	0.11
1137	0.1
1138	0.08
1139	0.06
1140	0.05
1141	0.06
1142	0.06
1143	0.05
1144	0.05
1145	0.05
1146	0.06
1147	0.06
1148	0.06
1149	0.06
1150	0.06
1151	0.06
1152	0.06
1153	0.06
1154	0.06
1155	0.12
1156	0.16
1157	0.17
1158	0.25
1159	0.31
1160	0.36
1161	0.45
1162	0.53
1163	0.55
1164	0.62
1165	0.67
1166	0.69
1167	0.74
1168	0.74
1169	0.71
1170	0.66
1171	0.66
1172	0.59
1173	0.55
1174	0.47
1175	0.37
1176	0.31
1177	0.26
1178	0.22
1179	0.14
1180	0.11
1181	0.08
1182	0.07
1183	0.07
1184	0.07
1185	0.08
1186	0.08
1187	0.09
1188	0.11
1189	0.11
1190	0.12
1191	0.14
1192	0.19
1193	0.19
1194	0.19
1195	0.19
1196	0.17

A0A1Y2X938

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer