FuNGI

A0A1Y2WR27

Protein Details

Accession

A0A1Y2WR27

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-47	GAPPLRRPRNTANPLVPRKKPLNRPPPSAAVR	Hydrophilic
199-221	VVKDTNPKAKQQKEQKKPGLQIH	Hydrophilic
525-545	TESIRKKKKTAHDSRSNTPLP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
16-47	GAPPLRRPRNTANPLVPRKKPLNRPPPSAAVR
426-440	RKLFGKSLKKALKKR
489-519	SKGTNTPQGKKAAAEAAKKGKSLKRAGSPLG
526-550	ESIRKKKKTAHDSRSNTPLPRRGKP
571-589	GKKKRLSPSVKGGKQSTKG

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

SPSAGPNGQRPTPPPGAPPLRRPRNTANPLVPRKKPLNRPPPSAAVRGSTPNAPPRPGGRPQQFQTQGKPAQPNFDVLRAQNGGWSQPAPPGAQDYPLYVTKKSLKEGLRFHVMRFAPHGGKLARPDGPGVDPTNQDEFTRPVTLHRRDPRQPPPGREVKEEAPVEENPVDTAEAERLAQLKAEREAQRAADDAQKAPVVKDTNPKAKQQKEQKKPGLQIHYAPRTEEQKKQAEIRYEEALPWHLEDADGKNVWVGQYEAPLSDCKVAFKIHNGGFRMIPLEKWYKFQSKRGSFKIMTIEEAEKAMNKKVALGRWAVRDNQRQEAERAMAESRAIVNGRVAVKQESGTFKQASRQEKMDHDDIDVSGDEFQDDDETAGYEPDRDEDTKQANNRIRRDQLNANLFGDADEIKVEKEEDEEKKEELERKLFGKSLKKALKKRDKQFQYDSDSSNDRDPFASSEDESDSDSENEKDDEEKKPDKDKEAGGSSKGTNTPQGKKAAAEAAKKGKSLKRAGSPLGSDSSGTESIRKKKKTAHDSRSNTPLPRRGKPGAGSTSDGEGTAGEMSDGAGGKKKRLSPSVKGGKQSTKGTPAGSRGGSPSPPQGTANKGPSDGPRAGSPNAAPQGSAPGGILYPITAQEIIDALPPPPQGITIGILLKKFQDRVDKPGCMQRKDWLKLVKENANFNTTEKLLRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.48
3	0.54
4	0.56
5	0.63
6	0.66
7	0.7
8	0.71
9	0.75
10	0.75
11	0.76
12	0.78
13	0.76
14	0.75
15	0.75
16	0.82
17	0.83
18	0.78
19	0.75
20	0.77
21	0.78
22	0.79
23	0.79
24	0.79
25	0.79
26	0.82
27	0.81
28	0.81
29	0.76
30	0.7
31	0.62
32	0.54
33	0.49
34	0.46
35	0.42
36	0.37
37	0.37
38	0.41
39	0.43
40	0.41
41	0.41
42	0.42
43	0.46
44	0.49
45	0.54
46	0.54
47	0.59
48	0.6
49	0.68
50	0.72
51	0.69
52	0.68
53	0.67
54	0.64
55	0.61
56	0.66
57	0.57
58	0.56
59	0.52
60	0.52
61	0.45
62	0.44
63	0.41
64	0.32
65	0.38
66	0.32
67	0.31
68	0.27
69	0.26
70	0.22
71	0.21
72	0.21
73	0.15
74	0.17
75	0.19
76	0.17
77	0.17
78	0.21
79	0.2
80	0.22
81	0.22
82	0.21
83	0.23
84	0.28
85	0.29
86	0.24
87	0.29
88	0.33
89	0.36
90	0.37
91	0.4
92	0.41
93	0.47
94	0.52
95	0.53
96	0.56
97	0.53
98	0.5
99	0.51
100	0.46
101	0.4
102	0.38
103	0.38
104	0.3
105	0.3
106	0.35
107	0.28
108	0.31
109	0.33
110	0.33
111	0.3
112	0.29
113	0.29
114	0.26
115	0.26
116	0.27
117	0.25
118	0.24
119	0.22
120	0.25
121	0.28
122	0.26
123	0.24
124	0.23
125	0.23
126	0.23
127	0.24
128	0.2
129	0.24
130	0.33
131	0.37
132	0.45
133	0.51
134	0.57
135	0.61
136	0.71
137	0.73
138	0.74
139	0.76
140	0.73
141	0.73
142	0.74
143	0.7
144	0.66
145	0.62
146	0.54
147	0.55
148	0.5
149	0.42
150	0.36
151	0.33
152	0.32
153	0.27
154	0.23
155	0.15
156	0.15
157	0.14
158	0.1
159	0.11
160	0.08
161	0.08
162	0.08
163	0.09
164	0.09
165	0.09
166	0.11
167	0.11
168	0.13
169	0.15
170	0.23
171	0.25
172	0.26
173	0.28
174	0.27
175	0.27
176	0.26
177	0.25
178	0.22
179	0.22
180	0.2
181	0.19
182	0.2
183	0.19
184	0.18
185	0.22
186	0.19
187	0.2
188	0.28
189	0.33
190	0.42
191	0.44
192	0.52
193	0.56
194	0.6
195	0.66
196	0.69
197	0.73
198	0.73
199	0.81
200	0.82
201	0.8
202	0.81
203	0.8
204	0.76
205	0.68
206	0.64
207	0.62
208	0.6
209	0.53
210	0.47
211	0.43
212	0.43
213	0.44
214	0.44
215	0.42
216	0.42
217	0.44
218	0.49
219	0.5
220	0.49
221	0.48
222	0.45
223	0.41
224	0.35
225	0.32
226	0.27
227	0.25
228	0.18
229	0.15
230	0.13
231	0.09
232	0.09
233	0.1
234	0.12
235	0.13
236	0.13
237	0.12
238	0.12
239	0.12
240	0.12
241	0.11
242	0.1
243	0.07
244	0.08
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.1
249	0.1
250	0.12
251	0.11
252	0.11
253	0.12
254	0.13
255	0.13
256	0.16
257	0.23
258	0.23
259	0.28
260	0.29
261	0.29
262	0.27
263	0.27
264	0.26
265	0.19
266	0.16
267	0.15
268	0.19
269	0.18
270	0.21
271	0.25
272	0.32
273	0.35
274	0.41
275	0.48
276	0.51
277	0.57
278	0.59
279	0.62
280	0.53
281	0.53
282	0.53
283	0.43
284	0.36
285	0.31
286	0.27
287	0.2
288	0.2
289	0.17
290	0.12
291	0.13
292	0.13
293	0.12
294	0.11
295	0.15
296	0.17
297	0.19
298	0.19
299	0.21
300	0.22
301	0.24
302	0.27
303	0.27
304	0.3
305	0.36
306	0.37
307	0.4
308	0.4
309	0.37
310	0.36
311	0.35
312	0.3
313	0.22
314	0.21
315	0.14
316	0.12
317	0.11
318	0.1
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.07
323	0.06
324	0.09
325	0.11
326	0.11
327	0.12
328	0.11
329	0.12
330	0.12
331	0.15
332	0.15
333	0.16
334	0.19
335	0.19
336	0.18
337	0.23
338	0.28
339	0.3
340	0.29
341	0.3
342	0.3
343	0.32
344	0.36
345	0.33
346	0.28
347	0.24
348	0.22
349	0.19
350	0.17
351	0.14
352	0.1
353	0.07
354	0.06
355	0.06
356	0.05
357	0.05
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.06
369	0.08
370	0.08
371	0.09
372	0.13
373	0.17
374	0.2
375	0.22
376	0.29
377	0.34
378	0.39
379	0.43
380	0.45
381	0.47
382	0.46
383	0.48
384	0.46
385	0.48
386	0.46
387	0.43
388	0.38
389	0.33
390	0.3
391	0.25
392	0.2
393	0.12
394	0.07
395	0.06
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.06
400	0.05
401	0.07
402	0.13
403	0.15
404	0.19
405	0.21
406	0.21
407	0.22
408	0.26
409	0.29
410	0.27
411	0.27
412	0.25
413	0.25
414	0.27
415	0.28
416	0.3
417	0.32
418	0.33
419	0.4
420	0.46
421	0.52
422	0.58
423	0.66
424	0.72
425	0.74
426	0.78
427	0.79
428	0.78
429	0.77
430	0.77
431	0.73
432	0.71
433	0.65
434	0.58
435	0.51
436	0.47
437	0.41
438	0.38
439	0.31
440	0.23
441	0.2
442	0.19
443	0.18
444	0.17
445	0.18
446	0.13
447	0.14
448	0.15
449	0.15
450	0.15
451	0.14
452	0.13
453	0.12
454	0.13
455	0.12
456	0.12
457	0.11
458	0.11
459	0.13
460	0.15
461	0.19
462	0.24
463	0.29
464	0.32
465	0.41
466	0.44
467	0.45
468	0.47
469	0.45
470	0.44
471	0.45
472	0.43
473	0.36
474	0.36
475	0.32
476	0.31
477	0.3
478	0.25
479	0.25
480	0.29
481	0.33
482	0.36
483	0.39
484	0.37
485	0.35
486	0.37
487	0.37
488	0.37
489	0.34
490	0.35
491	0.4
492	0.41
493	0.41
494	0.44
495	0.41
496	0.43
497	0.47
498	0.48
499	0.47
500	0.5
501	0.52
502	0.51
503	0.48
504	0.43
505	0.38
506	0.32
507	0.24
508	0.19
509	0.2
510	0.18
511	0.17
512	0.2
513	0.24
514	0.33
515	0.42
516	0.44
517	0.44
518	0.5
519	0.61
520	0.67
521	0.71
522	0.73
523	0.75
524	0.78
525	0.8
526	0.81
527	0.75
528	0.69
529	0.64
530	0.62
531	0.57
532	0.56
533	0.58
534	0.53
535	0.54
536	0.53
537	0.55
538	0.52
539	0.49
540	0.46
541	0.4
542	0.38
543	0.33
544	0.29
545	0.2
546	0.14
547	0.12
548	0.09
549	0.07
550	0.05
551	0.05
552	0.05
553	0.06
554	0.07
555	0.07
556	0.13
557	0.13
558	0.17
559	0.23
560	0.28
561	0.33
562	0.42
563	0.49
564	0.5
565	0.61
566	0.68
567	0.68
568	0.68
569	0.68
570	0.66
571	0.65
572	0.63
573	0.57
574	0.53
575	0.51
576	0.48
577	0.46
578	0.42
579	0.41
580	0.36
581	0.32
582	0.29
583	0.3
584	0.3
585	0.28
586	0.31
587	0.29
588	0.3
589	0.31
590	0.31
591	0.35
592	0.4
593	0.44
594	0.39
595	0.37
596	0.38
597	0.39
598	0.43
599	0.38
600	0.32
601	0.3
602	0.32
603	0.32
604	0.33
605	0.3
606	0.31
607	0.33
608	0.31
609	0.27
610	0.23
611	0.28
612	0.25
613	0.25
614	0.16
615	0.13
616	0.13
617	0.13
618	0.12
619	0.07
620	0.07
621	0.07
622	0.09
623	0.08
624	0.08
625	0.09
626	0.09
627	0.09
628	0.11
629	0.11
630	0.1
631	0.13
632	0.14
633	0.14
634	0.13
635	0.13
636	0.12
637	0.13
638	0.15
639	0.15
640	0.19
641	0.21
642	0.21
643	0.21
644	0.24
645	0.27
646	0.27
647	0.28
648	0.34
649	0.36
650	0.45
651	0.52
652	0.53
653	0.52
654	0.6
655	0.63
656	0.57
657	0.55
658	0.55
659	0.57
660	0.57
661	0.61
662	0.6
663	0.58
664	0.62
665	0.68
666	0.69
667	0.63
668	0.67
669	0.63
670	0.58
671	0.53
672	0.46
673	0.43
674	0.36
675	0.38

A0A1Y2WR27

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer