Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2WXC8

Protein Details
Accession A0A1Y2WXC8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-28VAVPPPPPTPKIKRPPPPGIQTNGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
402-410PPKPKARKR
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 7.5, cyto_mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MAPVVAVPPPPPTPKIKRPPPPGIQTNGVSSSQSSPSPNMTAKRPPPAVAKQQQQQQASNSTTTNGTNGNTHRPGVARSRRDTSNQVPGRNQRNNASLRSATLAPDTSLYKSFEPRPDVVTDSYILKKYSGHPPSLIVHLHPTHFRFDMQDSVFPYKSPMRAFLDHVRSRTVPHDMLQDLNEAGVAFYEGCLIVQVHDHKTAAQVKDIARPASKTTSEKPSSIHNYNPYITPSPYVPFPKESTENGLQEGDVKPPQNDSGDKENMPAPPAPTDGQKGKVQAEVKIFTVVLHPTPQSLHMDLMIKACTPRGSGDAKANGDSNGVPPTPISAVPPTPTAANMPPPGKKIKREKMELDGSNIYAAEAQILLATSAPLHLEVPKNKEDAVALLWKRMDDPKHSDAPPKPKARKRTVAERAADEALAAEQEKYMLTYDERRSANTGGAQTGADGADGDGQSGAATFEPRFERFKVLADIKSAHKAKKEQEKIQQAENERKLQIQKQEQAALLQRQQAEQEKSRREEAQRQAQIRQQQQQQQEAQRRAIAQQQAQAQQQAQAQAQAQAQAQAQAQAAQSPPNAQIPQMAQSSHGHPVQSGLSNNVMSAQAAHRFPQQVSQAPVSSPVVRQNTPQNMSSPMVGNAPMQQTNSGMGASPQRPSSVVQSHGPMSAPMAVSMSARGSQQSHPSNTPRMPSATPQMSHGTPINRPMPTPRMSQASPPPNMMAQNSHMNQMLLGNQNMSHNMPNQLVAAQIAQQQRQRIAHQQQMQAMQNGMMNGQNPQMHNQVLQNQLMRQQMMGMNMQNPNMLNAAQQAQQAQLAQRYQQQINSMQQQHQQMQGQIPNQQMGNQNFMGAGNGMSPAQMAAMQQMHMQQQQGQHPGNQPNALAIQIRQRQQQLYRANIAHFAERFGGPQNLPPEVHEQFKQNCLKKAQESLQREIMQRRQQMAQNMQNGMQNGMQAGMQNGMPNGMQGGMPNGMNGMNGMMQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.63
3 0.69
4 0.75
5 0.8
6 0.87
7 0.87
8 0.87
9 0.84
10 0.79
11 0.75
12 0.67
13 0.62
14 0.55
15 0.46
16 0.37
17 0.32
18 0.3
19 0.26
20 0.26
21 0.25
22 0.23
23 0.27
24 0.31
25 0.35
26 0.35
27 0.38
28 0.45
29 0.49
30 0.56
31 0.55
32 0.54
33 0.57
34 0.61
35 0.66
36 0.65
37 0.68
38 0.65
39 0.7
40 0.74
41 0.7
42 0.65
43 0.59
44 0.58
45 0.52
46 0.48
47 0.4
48 0.34
49 0.32
50 0.28
51 0.25
52 0.2
53 0.19
54 0.22
55 0.25
56 0.32
57 0.33
58 0.33
59 0.33
60 0.32
61 0.36
62 0.4
63 0.47
64 0.46
65 0.49
66 0.54
67 0.56
68 0.6
69 0.63
70 0.6
71 0.61
72 0.58
73 0.58
74 0.6
75 0.65
76 0.7
77 0.69
78 0.67
79 0.62
80 0.64
81 0.63
82 0.59
83 0.57
84 0.48
85 0.42
86 0.41
87 0.36
88 0.29
89 0.28
90 0.25
91 0.19
92 0.2
93 0.2
94 0.18
95 0.21
96 0.22
97 0.22
98 0.26
99 0.32
100 0.37
101 0.4
102 0.4
103 0.4
104 0.4
105 0.41
106 0.37
107 0.33
108 0.28
109 0.26
110 0.28
111 0.27
112 0.25
113 0.22
114 0.23
115 0.25
116 0.34
117 0.35
118 0.34
119 0.33
120 0.36
121 0.38
122 0.4
123 0.36
124 0.27
125 0.29
126 0.29
127 0.3
128 0.31
129 0.3
130 0.3
131 0.3
132 0.29
133 0.25
134 0.26
135 0.31
136 0.29
137 0.31
138 0.31
139 0.35
140 0.35
141 0.32
142 0.33
143 0.3
144 0.32
145 0.3
146 0.32
147 0.32
148 0.35
149 0.4
150 0.45
151 0.51
152 0.5
153 0.5
154 0.49
155 0.43
156 0.43
157 0.41
158 0.38
159 0.3
160 0.28
161 0.32
162 0.28
163 0.3
164 0.28
165 0.26
166 0.19
167 0.17
168 0.16
169 0.1
170 0.09
171 0.06
172 0.06
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.1
182 0.14
183 0.16
184 0.19
185 0.19
186 0.18
187 0.25
188 0.31
189 0.28
190 0.27
191 0.29
192 0.29
193 0.36
194 0.39
195 0.36
196 0.31
197 0.32
198 0.32
199 0.34
200 0.36
201 0.34
202 0.35
203 0.43
204 0.44
205 0.43
206 0.4
207 0.43
208 0.47
209 0.46
210 0.46
211 0.42
212 0.44
213 0.44
214 0.44
215 0.39
216 0.35
217 0.32
218 0.28
219 0.24
220 0.21
221 0.25
222 0.27
223 0.26
224 0.26
225 0.28
226 0.31
227 0.33
228 0.33
229 0.36
230 0.37
231 0.36
232 0.34
233 0.32
234 0.26
235 0.25
236 0.24
237 0.2
238 0.17
239 0.18
240 0.16
241 0.18
242 0.2
243 0.2
244 0.22
245 0.23
246 0.28
247 0.31
248 0.31
249 0.31
250 0.32
251 0.29
252 0.29
253 0.26
254 0.19
255 0.17
256 0.19
257 0.19
258 0.18
259 0.22
260 0.23
261 0.25
262 0.26
263 0.27
264 0.26
265 0.31
266 0.3
267 0.29
268 0.31
269 0.29
270 0.27
271 0.25
272 0.24
273 0.19
274 0.19
275 0.16
276 0.13
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.13
281 0.14
282 0.15
283 0.15
284 0.14
285 0.14
286 0.16
287 0.17
288 0.18
289 0.16
290 0.13
291 0.13
292 0.13
293 0.12
294 0.1
295 0.11
296 0.13
297 0.15
298 0.17
299 0.23
300 0.27
301 0.28
302 0.28
303 0.28
304 0.24
305 0.22
306 0.2
307 0.15
308 0.13
309 0.12
310 0.1
311 0.09
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.12
316 0.11
317 0.13
318 0.14
319 0.15
320 0.14
321 0.13
322 0.13
323 0.14
324 0.13
325 0.16
326 0.19
327 0.21
328 0.23
329 0.25
330 0.33
331 0.35
332 0.42
333 0.48
334 0.53
335 0.58
336 0.63
337 0.64
338 0.63
339 0.68
340 0.6
341 0.54
342 0.46
343 0.38
344 0.32
345 0.28
346 0.2
347 0.12
348 0.1
349 0.06
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.03
356 0.04
357 0.03
358 0.03
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.07
363 0.12
364 0.16
365 0.21
366 0.23
367 0.23
368 0.23
369 0.23
370 0.21
371 0.17
372 0.15
373 0.18
374 0.16
375 0.17
376 0.18
377 0.17
378 0.18
379 0.21
380 0.22
381 0.19
382 0.26
383 0.29
384 0.35
385 0.36
386 0.42
387 0.43
388 0.51
389 0.54
390 0.57
391 0.61
392 0.61
393 0.7
394 0.71
395 0.75
396 0.71
397 0.73
398 0.73
399 0.72
400 0.68
401 0.6
402 0.55
403 0.45
404 0.4
405 0.29
406 0.19
407 0.11
408 0.09
409 0.07
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.13
419 0.15
420 0.22
421 0.22
422 0.23
423 0.25
424 0.25
425 0.25
426 0.22
427 0.2
428 0.14
429 0.14
430 0.13
431 0.1
432 0.1
433 0.08
434 0.05
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.03
446 0.04
447 0.04
448 0.08
449 0.1
450 0.12
451 0.14
452 0.15
453 0.19
454 0.18
455 0.21
456 0.23
457 0.24
458 0.24
459 0.23
460 0.24
461 0.22
462 0.29
463 0.29
464 0.25
465 0.26
466 0.29
467 0.34
468 0.42
469 0.48
470 0.47
471 0.53
472 0.61
473 0.59
474 0.59
475 0.57
476 0.49
477 0.51
478 0.48
479 0.42
480 0.33
481 0.33
482 0.31
483 0.31
484 0.35
485 0.33
486 0.34
487 0.33
488 0.35
489 0.33
490 0.33
491 0.32
492 0.28
493 0.24
494 0.22
495 0.2
496 0.18
497 0.2
498 0.23
499 0.24
500 0.27
501 0.32
502 0.34
503 0.36
504 0.38
505 0.4
506 0.38
507 0.44
508 0.45
509 0.48
510 0.5
511 0.49
512 0.49
513 0.49
514 0.52
515 0.48
516 0.47
517 0.42
518 0.43
519 0.45
520 0.47
521 0.49
522 0.49
523 0.53
524 0.49
525 0.44
526 0.39
527 0.36
528 0.32
529 0.32
530 0.29
531 0.22
532 0.24
533 0.27
534 0.29
535 0.29
536 0.29
537 0.23
538 0.23
539 0.22
540 0.21
541 0.16
542 0.15
543 0.14
544 0.16
545 0.16
546 0.15
547 0.14
548 0.14
549 0.14
550 0.14
551 0.14
552 0.12
553 0.12
554 0.12
555 0.12
556 0.11
557 0.11
558 0.11
559 0.11
560 0.1
561 0.12
562 0.13
563 0.14
564 0.12
565 0.14
566 0.14
567 0.18
568 0.17
569 0.16
570 0.15
571 0.16
572 0.19
573 0.2
574 0.2
575 0.16
576 0.15
577 0.16
578 0.16
579 0.17
580 0.15
581 0.13
582 0.13
583 0.13
584 0.13
585 0.12
586 0.11
587 0.08
588 0.09
589 0.09
590 0.11
591 0.12
592 0.13
593 0.15
594 0.17
595 0.17
596 0.22
597 0.23
598 0.23
599 0.26
600 0.27
601 0.25
602 0.23
603 0.26
604 0.22
605 0.2
606 0.17
607 0.2
608 0.22
609 0.22
610 0.24
611 0.3
612 0.35
613 0.37
614 0.37
615 0.32
616 0.31
617 0.32
618 0.3
619 0.24
620 0.17
621 0.15
622 0.15
623 0.14
624 0.13
625 0.15
626 0.14
627 0.13
628 0.13
629 0.13
630 0.13
631 0.13
632 0.1
633 0.08
634 0.08
635 0.13
636 0.14
637 0.15
638 0.15
639 0.15
640 0.16
641 0.17
642 0.22
643 0.21
644 0.23
645 0.23
646 0.25
647 0.25
648 0.25
649 0.24
650 0.18
651 0.14
652 0.14
653 0.12
654 0.1
655 0.09
656 0.09
657 0.09
658 0.09
659 0.09
660 0.08
661 0.08
662 0.09
663 0.11
664 0.13
665 0.21
666 0.26
667 0.29
668 0.33
669 0.37
670 0.42
671 0.41
672 0.41
673 0.35
674 0.33
675 0.31
676 0.3
677 0.34
678 0.33
679 0.31
680 0.32
681 0.33
682 0.29
683 0.3
684 0.3
685 0.25
686 0.22
687 0.28
688 0.3
689 0.26
690 0.27
691 0.3
692 0.33
693 0.32
694 0.34
695 0.32
696 0.32
697 0.33
698 0.38
699 0.42
700 0.44
701 0.43
702 0.4
703 0.38
704 0.34
705 0.35
706 0.3
707 0.24
708 0.19
709 0.26
710 0.25
711 0.26
712 0.25
713 0.23
714 0.22
715 0.2
716 0.21
717 0.16
718 0.15
719 0.14
720 0.14
721 0.15
722 0.16
723 0.17
724 0.15
725 0.14
726 0.17
727 0.17
728 0.17
729 0.16
730 0.15
731 0.14
732 0.12
733 0.1
734 0.09
735 0.14
736 0.16
737 0.2
738 0.22
739 0.25
740 0.29
741 0.31
742 0.33
743 0.38
744 0.42
745 0.46
746 0.51
747 0.52
748 0.52
749 0.54
750 0.53
751 0.45
752 0.38
753 0.31
754 0.25
755 0.21
756 0.17
757 0.13
758 0.11
759 0.1
760 0.14
761 0.15
762 0.15
763 0.18
764 0.21
765 0.2
766 0.22
767 0.24
768 0.27
769 0.28
770 0.3
771 0.29
772 0.27
773 0.31
774 0.32
775 0.29
776 0.22
777 0.22
778 0.21
779 0.21
780 0.23
781 0.19
782 0.21
783 0.23
784 0.23
785 0.22
786 0.2
787 0.18
788 0.17
789 0.15
790 0.11
791 0.12
792 0.14
793 0.15
794 0.15
795 0.15
796 0.15
797 0.16
798 0.17
799 0.17
800 0.19
801 0.18
802 0.19
803 0.24
804 0.29
805 0.3
806 0.31
807 0.33
808 0.34
809 0.39
810 0.46
811 0.44
812 0.42
813 0.46
814 0.49
815 0.48
816 0.48
817 0.44
818 0.38
819 0.4
820 0.41
821 0.38
822 0.37
823 0.36
824 0.33
825 0.3
826 0.31
827 0.33
828 0.31
829 0.34
830 0.29
831 0.27
832 0.25
833 0.25
834 0.21
835 0.14
836 0.12
837 0.07
838 0.08
839 0.07
840 0.07
841 0.07
842 0.06
843 0.06
844 0.06
845 0.06
846 0.09
847 0.1
848 0.11
849 0.12
850 0.15
851 0.19
852 0.2
853 0.21
854 0.2
855 0.25
856 0.31
857 0.37
858 0.36
859 0.38
860 0.44
861 0.49
862 0.5
863 0.45
864 0.39
865 0.34
866 0.32
867 0.29
868 0.23
869 0.18
870 0.24
871 0.29
872 0.32
873 0.36
874 0.39
875 0.44
876 0.48
877 0.55
878 0.53
879 0.53
880 0.57
881 0.54
882 0.51
883 0.5
884 0.47
885 0.44
886 0.36
887 0.32
888 0.27
889 0.25
890 0.25
891 0.23
892 0.26
893 0.21
894 0.26
895 0.28
896 0.28
897 0.28
898 0.29
899 0.32
900 0.3
901 0.34
902 0.31
903 0.35
904 0.35
905 0.43
906 0.51
907 0.5
908 0.54
909 0.56
910 0.61
911 0.59
912 0.64
913 0.64
914 0.65
915 0.65
916 0.64
917 0.67
918 0.65
919 0.64
920 0.63
921 0.64
922 0.62
923 0.62
924 0.6
925 0.57
926 0.58
927 0.62
928 0.64
929 0.62
930 0.6
931 0.57
932 0.55
933 0.52
934 0.47
935 0.41
936 0.32
937 0.24
938 0.18
939 0.16
940 0.14
941 0.12
942 0.12
943 0.11
944 0.1
945 0.11
946 0.11
947 0.12
948 0.11
949 0.11
950 0.1
951 0.09
952 0.09
953 0.08
954 0.11
955 0.12
956 0.12
957 0.12
958 0.12
959 0.12
960 0.11
961 0.11