Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2XBS5

Protein Details
Accession A0A1Y2XBS5    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MADQPRRRRNRPDSKQMWDESHydrophilic
45-86RDREDGRRDRDRRYRSRSRSPRPDRRDKHRDRREPERARDQNBasic
95-120YNDRRGRDRDRDRDRERDRRRDRDEGBasic
275-295AGAVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-12RRRNRP
22-83ERRGRHEPDTRDRRDDRDRGDRGRDREDGRRDRDRRYRSRSRSPRPDRRDKHRDRREPERAR
98-144RRGRDRDRDRDRERDRRRDRDEGAPRGPGRDRSPRRSASPARSPPSR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MADQPRRRRNRPDSKQMWDESERRGRHEPDTRDRRDDRDRGDRGRDREDGRRDRDRRYRSRSRSPRPDRRDKHRDRREPERARDQNIVWAKEGDYNDRRGRDRDRDRDRERDRRRDRDEGAPRGPGRDRSPRRSASPARSPPSRLDRHTHSHSNSPLPTRPRPNNGKPDTGASSLQFKVGSRPQQQQQQHEEETPSHGNGSRSATGSKHDAQEESNSRRGRTETPDRGGDAMDEDKEDDDDVVVEEDDSLSAMQAMMGFGGFGTTKGTHVVGNNAGAVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.87
3 0.79
4 0.75
5 0.71
6 0.64
7 0.62
8 0.63
9 0.56
10 0.53
11 0.57
12 0.53
13 0.56
14 0.61
15 0.61
16 0.63
17 0.71
18 0.71
19 0.73
20 0.73
21 0.71
22 0.72
23 0.7
24 0.67
25 0.67
26 0.68
27 0.66
28 0.73
29 0.73
30 0.68
31 0.67
32 0.65
33 0.6
34 0.62
35 0.66
36 0.65
37 0.65
38 0.7
39 0.67
40 0.71
41 0.76
42 0.77
43 0.77
44 0.77
45 0.8
46 0.79
47 0.86
48 0.88
49 0.89
50 0.9
51 0.9
52 0.92
53 0.9
54 0.93
55 0.9
56 0.9
57 0.9
58 0.9
59 0.9
60 0.9
61 0.91
62 0.86
63 0.88
64 0.89
65 0.87
66 0.85
67 0.85
68 0.79
69 0.73
70 0.71
71 0.61
72 0.58
73 0.54
74 0.48
75 0.38
76 0.33
77 0.29
78 0.3
79 0.3
80 0.29
81 0.26
82 0.31
83 0.34
84 0.37
85 0.39
86 0.38
87 0.44
88 0.47
89 0.54
90 0.58
91 0.64
92 0.7
93 0.73
94 0.79
95 0.8
96 0.81
97 0.8
98 0.81
99 0.8
100 0.8
101 0.81
102 0.79
103 0.74
104 0.73
105 0.73
106 0.69
107 0.62
108 0.57
109 0.51
110 0.46
111 0.44
112 0.38
113 0.35
114 0.38
115 0.43
116 0.44
117 0.52
118 0.52
119 0.54
120 0.58
121 0.59
122 0.56
123 0.6
124 0.6
125 0.57
126 0.56
127 0.54
128 0.51
129 0.53
130 0.5
131 0.43
132 0.4
133 0.41
134 0.45
135 0.49
136 0.49
137 0.42
138 0.43
139 0.42
140 0.41
141 0.38
142 0.34
143 0.33
144 0.33
145 0.37
146 0.39
147 0.42
148 0.46
149 0.53
150 0.58
151 0.64
152 0.62
153 0.6
154 0.53
155 0.52
156 0.47
157 0.4
158 0.33
159 0.23
160 0.24
161 0.2
162 0.2
163 0.17
164 0.14
165 0.16
166 0.21
167 0.28
168 0.28
169 0.34
170 0.38
171 0.46
172 0.51
173 0.53
174 0.54
175 0.53
176 0.5
177 0.46
178 0.42
179 0.34
180 0.35
181 0.29
182 0.22
183 0.17
184 0.18
185 0.17
186 0.18
187 0.22
188 0.19
189 0.19
190 0.2
191 0.2
192 0.2
193 0.24
194 0.24
195 0.23
196 0.22
197 0.21
198 0.21
199 0.29
200 0.34
201 0.34
202 0.38
203 0.37
204 0.36
205 0.38
206 0.39
207 0.36
208 0.37
209 0.42
210 0.43
211 0.47
212 0.49
213 0.48
214 0.45
215 0.41
216 0.33
217 0.25
218 0.18
219 0.14
220 0.12
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.03
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.11
254 0.12
255 0.13
256 0.15
257 0.19
258 0.18
259 0.19
260 0.2
261 0.2
262 0.2
263 0.19
264 0.23
265 0.25
266 0.27
267 0.31
268 0.36
269 0.45
270 0.54
271 0.63
272 0.68
273 0.73
274 0.76
275 0.8
276 0.82
277 0.78
278 0.72
279 0.65
280 0.57
281 0.55
282 0.51
283 0.46
284 0.41